Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5389
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5389, 308 aa
1>>>pF1KE5389 308 - 308 aa - 308 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4899+/-0.0012; mu= 14.6733+/- 0.070
mean_var=169.3138+/-57.149, 0's: 0 Z-trim(103.2): 390 B-trim: 898 in 2/49
Lambda= 0.098566
statistics sampled from 6782 (7292) to 6782 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 2.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 2022 300.5 1.1e-81
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1759 263.1 1.9e-70
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1746 261.3 7.1e-70
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1364 206.9 1.6e-53
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1304 198.4 5.9e-51
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1206 184.5 9.2e-47
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1181 180.9 1.1e-45
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1180 180.8 1.2e-45
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1151 176.6 2.1e-44
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1151 176.6 2.1e-44
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1149 176.4 2.5e-44
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1145 175.8 3.8e-44
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1133 174.1 1.2e-43
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1108 170.5 1.5e-42
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1102 169.7 2.6e-42
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1093 168.5 6.7e-42
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1087 167.5 1.1e-41
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1087 167.6 1.2e-41
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1086 167.4 1.2e-41
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1083 167.0 1.7e-41
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1082 166.8 1.9e-41
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1077 166.2 3.2e-41
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1072 165.4 5e-41
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1071 165.3 5.5e-41
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1066 164.6 9.1e-41
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1055 163.0 2.7e-40
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1053 162.8 3.6e-40
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1052 162.6 3.6e-40
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1051 162.4 4e-40
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1047 161.9 5.9e-40
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1041 161.0 1.1e-39
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1041 161.1 1.1e-39
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1033 159.9 2.3e-39
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1028 159.2 3.8e-39
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1016 157.4 1.3e-38
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1012 156.9 1.9e-38
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1012 156.9 1.9e-38
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1012 156.9 1.9e-38
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1009 156.5 2.5e-38
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1008 156.3 2.7e-38
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1008 156.3 2.7e-38
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 999 155.0 6.7e-38
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 996 154.6 9e-38
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 978 152.0 5.3e-37
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 971 151.0 1.1e-36
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 971 151.1 1.1e-36
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 930 145.2 6.1e-35
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 926 144.7 9.2e-35
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 919 143.7 1.8e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 916 143.2 2.4e-34
>>CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 (308 aa)
initn: 2022 init1: 2022 opt: 2022 Z-score: 1580.2 bits: 300.5 E(32554): 1.1e-81
Smith-Waterman score: 2022; 100.0% identity (100.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRIREHSSEGKSKAISTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRIREHSSEGKSKAISTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASMRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASMRK
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LLSQHMFC
::::::::
CCDS32 LLSQHMFC
>>CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 (307 aa)
initn: 1794 init1: 1759 opt: 1759 Z-score: 1378.0 bits: 263.1 E(32554): 1.9e-70
Smith-Waterman score: 1759; 84.6% identity (96.1% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
::..: ::. :::::::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
:::::::.:::::::::.::::::::: ::.::::.::::::::::::.:: .:::::::
CCDS32 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
:::::::::::: :.::::.:::. :.::::::.:::.::.:::.:::::::::::::::
CCDS32 DRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRIREHSSEGKSKAISTC
::::::::::.::::::::: ::::..::::::::::::::::::: :::.:.::.:::
CCDS32 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRIRGSSSEAKNKAMSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASMRK
::::.::.::::.::::: ::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:
CCDS32 ITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVKASMKK
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LLSQHMFC
....:.
CCDS32 VFNKHIA
>>CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 (316 aa)
initn: 1779 init1: 1737 opt: 1746 Z-score: 1367.9 bits: 261.3 E(32554): 7.1e-70
Smith-Waterman score: 1746; 83.8% identity (95.8% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
:. : :::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS32 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
.::::::.:::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::.:: .:::::::
CCDS32 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
::::::::::: ::.::::::::. :.::::::.:::.::.:::.:::::::::::::::
CCDS32 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRIREHSSEGKSKAISTC
: ::::::::. :::::::: ::::..::::::::::::::::..:. .::::.::.:::
CCDS32 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAASEGKNKAMSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASMRK
::..:::.:::::::::: :::.:.::::.::::::::::::::.::::::::::.::..
CCDS32 TTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPADKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKTSMKR
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LLSQHMFC
:::.:. :
CCDS32 LLSRHVVCQVDFIIRN
310
>>CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 1354 init1: 1026 opt: 1364 Z-score: 1074.4 bits: 206.9 E(32554): 1.6e-53
Smith-Waterman score: 1364; 61.6% identity (87.4% similar) in 310 aa overlap (1-308:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
::: : : ::::.: ::.:....::..::. : :::.:::::.::: ::. :: ::.:.:
CCDS32 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
:.:.:::::: :: :..:.::.::. :.:.::. .::.:::::::.::.:::::.:::.
CCDS32 FLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
::: ::::::::.:::: : : : . :.:::::::.:::::..:::::::.::..:::
CCDS32 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRIREHSSEGKS--KAIS
. ::...::.::: ::.:. .:::.:..::..:: ::: .: ...::. :.. .:.:
CCDS32 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCTTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASM
:: .:: :. :::::.:.::. ::..: :::::.::::::::.::.::::::.::::.:
CCDS32 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAAM
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 RKLLSQHMFC
::.......:
CCDS32 RKVVTKYILCEEK
310
>>CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 (313 aa)
initn: 1294 init1: 980 opt: 1304 Z-score: 1028.3 bits: 198.4 E(32554): 5.9e-51
Smith-Waterman score: 1304; 60.3% identity (85.5% similar) in 310 aa overlap (1-308:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
::: : : ::::.: ::.:. ..::..::. : :::.:::::.::: ::. :: ::.:.:
CCDS32 METANYTKVTEFVLTGLSQTPEVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTISLDPHLTSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
:.:.:::.:: :: :..:.::.::. :.:.::. .::.::::::: ::.:::::.::::
CCDS32 FLLANLAFLDIWYSSITAPEMLIDFFVERKIISFDGCIAQLFFLHFAGASEMFLLTVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
: : ::::::::.:::: : : : . : :::::::.:::::..:::::::.::..:::
CCDS32 DLYTAICRPLHYATIMNQRLCCILVALSWRGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRIREHSSEGKS--KAIS
. ::...::.::: ::.:. .:::.:..:...:: ::: .: ... :. :.. .:.:
CCDS32 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCLIALLMSYAFLLALFKKLSGSGENTNRAMS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCTTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASM
:: .:: :. :::::.:.::. ::..: :::::.:.:.:::: ::.::::::.::::.:
CCDS32 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFNTLIFPLRNPIIYTLRNKEVKAAM
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 RKLLSQHMFC
:::......:
CCDS32 RKLVTKYILCKEK
310
>>CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 1205 init1: 1069 opt: 1206 Z-score: 953.0 bits: 184.5 E(32554): 9.2e-47
Smith-Waterman score: 1206; 55.6% identity (83.4% similar) in 302 aa overlap (1-301:1-302)
10 20 30 40 50
pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLT-APL
:. .. . ::::.::::..: . ::..:.: :.::. :. ::.::. :... : .:.
CCDS32 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMA
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