Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5388
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5388, 308 aa
1>>>pF1KE5388 308 - 308 aa - 308 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5344+/-0.00131; mu= 14.5779+/- 0.077
mean_var=154.2390+/-50.029, 0's: 0 Z-trim(102.6): 387 B-trim: 859 in 2/45
Lambda= 0.103271
statistics sampled from 6536 (7007) to 6536 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 1.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 1995 309.9 1.6e-84
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 1040 167.6 1.1e-41
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 1029 166.0 3.3e-41
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 1029 166.0 3.4e-41
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 1024 165.3 5.6e-41
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 977 158.3 7.2e-39
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 975 158.0 8.8e-39
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 963 156.2 3.2e-38
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 960 155.7 4.3e-38
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 950 154.3 1.2e-37
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 949 154.1 1.3e-37
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 945 153.5 2e-37
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 941 152.9 2.9e-37
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 937 152.3 4.5e-37
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 935 152.0 5.5e-37
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 933 151.7 6.7e-37
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 932 151.6 7.6e-37
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 930 151.2 9.1e-37
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 930 151.3 9.2e-37
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 926 150.7 1.4e-36
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 924 150.4 1.8e-36
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 923 150.2 1.9e-36
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 922 150.1 2.1e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 920 149.8 2.6e-36
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 919 149.6 2.9e-36
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 918 149.5 3.2e-36
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 913 148.7 5.3e-36
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 911 148.4 6.5e-36
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 911 148.4 6.7e-36
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 911 148.5 6.9e-36
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 909 148.1 8.1e-36
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 907 147.8 9.8e-36
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 907 147.9 1e-35
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 902 147.1 1.7e-35
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 901 147.0 1.9e-35
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 894 145.9 3.8e-35
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 890 145.3 5.7e-35
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 889 145.1 6.3e-35
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 886 144.7 8.7e-35
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 881 144.0 1.4e-34
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 880 143.8 1.6e-34
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 880 143.8 1.6e-34
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 874 142.9 3e-34
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 870 142.4 4.7e-34
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 869 142.2 5e-34
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 869 142.2 5.1e-34
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 869 142.2 5.1e-34
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 868 142.0 5.6e-34
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 867 141.9 6.1e-34
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 867 141.9 6.2e-34
>>CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 (308 aa)
initn: 1995 init1: 1995 opt: 1995 Z-score: 1631.1 bits: 309.9 E(32554): 1.6e-84
Smith-Waterman score: 1995; 100.0% identity (100.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVRET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVRET
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LLKKWKGK
::::::::
CCDS31 LLKKWKGK
>>CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1110 init1: 1040 opt: 1040 Z-score: 862.1 bits: 167.6 E(32554): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 1040; 52.0% identity (78.1% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
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CCDS30 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
:.: ::: :. ::.:..:: :: ::....::::..::::.:: ::: :: .::.::::
CCDS30 HFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLLQIYFFHSLGATECYLLTAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
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CCDS30 DRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISLISRLPFCGPNRIQHVFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFST
. : ..::::.:. :: ::: ::.. :. . ::: :: :.::::::.:. ::.::
CCDS30 FPPVLSLACTDTSINVLVDFVINSCKILATFLLILCSYVQIICTVLRIPSAAGKRKAIST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVRET
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CCDS30 CASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRNKEIKEA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LLKKWKGK
. .. :
CCDS30 VRRQLKRIGILA
310
>>CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1081 init1: 547 opt: 1029 Z-score: 853.2 bits: 166.0 E(32554): 3.3e-41
Smith-Waterman score: 1029; 52.7% identity (80.5% similar) in 298 aa overlap (4-301:2-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
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CCDS31 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
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CCDS31 FFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSF
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
:: .::: :::: .::.: :.:: :: .:... :: ... : .: . :::::::
CCDS31 DRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCR-KEINHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFST
::: . .:: ::. .: . :.....::::: .: ::::::::::::::..::.:::::
CCDS31 IAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVRET
:.::.::: : .::..:..:: . ...:: :.. :: :::::.::::::.:::..:.:.
CCDS31 CASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLITVVTPLLNPFIYSLRNEKVQEV
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LLKKWKGK
:
CCDS31 LRETVNRIMTLIQRKT
300 310
>>CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 (327 aa)
initn: 1022 init1: 767 opt: 1029 Z-score: 853.0 bits: 166.0 E(32554): 3.4e-41
Smith-Waterman score: 1029; 50.8% identity (79.3% similar) in 295 aa overlap (11-301:12-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPM
.:.:::::. ::. :: :.:. :.:... :. :.: . . :: ::
CCDS77 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLG----RSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLL
::::.:.:::::::.:...:: :: ..: ..: ::: .:. :.:: ..::::: ::
CCDS77 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AAMAYDRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAIN
:.::::: .:::::::: .:.:. : .:.: :::. :: : . ::::::.::: ::
CCDS77 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HFFCDIAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRS
:::::..: . :.::. ...::. :..:. ..:. .: .::: : .....::::.::
CCDS77 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAFSTCSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNK
::::::.::::::.:.:....:...: . .:.: : : :: .:..:.:::.:: :::.
CCDS77 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 EVRETLLKKWKGK
::...:
CCDS77 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 1043 init1: 761 opt: 1024 Z-score: 849.2 bits: 165.3 E(32554): 5.6e-41
Smith-Waterman score: 1024; 51.2% identity (76.6% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
:. :.: :.:.::::: ... ..:..::: :::::. :: :..:: .. :: :::
CCDS43 MELENQTRVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPLHKPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
:::.:::::: :: ...::: : . . ...:::: :..:.:: ..: ::: :::::::
CCDS43 FFLANLSFLETWYISVTVPKLLFSFWSVNNSISFTLCMIQLYFFIALMCTECVLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
:: .::: :::: .::: : .::::::. :: . .:: :::::: .:::::::
CCDS43 DRYVAICRPLHYPTIMSHGLCFRLALGSWAIGFGISLAKIYFISCLSFCGPNVINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFST
:.: . :.::. . .::: :..:.:..: .:: .:: :..::: .: .:..:::::
CCDS43 ISPVLNLSCTDMSITELVDFILALVIFLFPLFITVLSYGCILATILCMP--TGKQKAFST
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVRET
:.:::.:: :.:.. .:...: . :... : . .. ..::: :::::: :::.::.:.
CCDS43 CASHLVVVTIFYSAIIFMYARPRVIHAFNMNKIISIFYAIVTPSLNPFIYCLRNREVKEA
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LLKKWKGK
: :
CCDS43 LKKLAYCQASRSD
300 310
>>CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 994 init1: 971 opt: 977 Z-score: 811.3 bits: 158.3 E(32554): 7.2e-39
Smith-Waterman score: 977; 48.5% identity (79.5% similar) in 297 aa overlap (5-301:3-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
:.: ::.:::. .. :. ::...:: :.:.:.::. :. :. .. .:.::::
CCDS31 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
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CCDS31 FFLRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSY
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CCDS31 DRCMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICD
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CCDS31 SSPMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFST
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CCDS31 CSSHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQA
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.
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CCDS31 MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIPMY
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CCDS31 FFLCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVARTVICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLILTIMSF
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CCDS31 VGPSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQKTFST
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CCDS31 CASHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNKEVKGA
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: :
CCDS31 LRKAMTCPKTGHAK
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CCDS32 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
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pF1KE5 AYDRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAI-NHF
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300
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.:.:
CCDS32 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
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CCDS31 SWPLLRLSCGDTHLLKLVAFMLSTLVLLGSLALTSVSYACILATVLRAPTAAERRKAFST
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