Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5386
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5386, 307 aa
1>>>pF1KE5386 307 - 307 aa - 307 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0222+/-0.000577; mu= 17.8268+/- 0.035
mean_var=100.9099+/-25.254, 0's: 0 Z-trim(106.5): 264 B-trim: 839 in 1/46
Lambda= 0.127675
statistics sampled from 14318 (14638) to 14318 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.505), E-opt: 0.2 (0.172), width: 16
Scan time: 5.680
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 919 180.6 3.5e-45
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XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 901 177.3 3.6e-44
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 899 176.9 4.5e-44
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 880 173.4 5.1e-43
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NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 870 171.6 1.8e-42
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 856 169.0 1.1e-41
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NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 831 164.4 2.6e-40
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XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 824 163.1 6.6e-40
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 824 163.1 6.6e-40
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 812 160.9 3e-39
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 812 160.9 3e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 808 160.2 5e-39
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 803 159.3 9.8e-39
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 801 158.8 1.2e-38
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 553 113.2 7e-25
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 537 110.3 5.4e-24
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 175 43.7 0.00076
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 168 42.4 0.0019
NP_003599 (OMIM: 604620) psychosine receptor [Homo ( 337) 166 41.9 0.0021
NP_005277 (OMIM: 600731) neuropeptides B/W recepto ( 333) 162 41.2 0.0035
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 161 41.1 0.0042
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 157 40.3 0.0065
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 158 40.6 0.0067
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 157 40.5 0.0081
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 919; 46.6% identity (76.7% similar) in 305 aa overlap (3-306:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGN-GAVLMIVISDPRLHSLM
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pF1KE5 YFFLGNLSYLDICYSTVTLPKMLQNFLSTHKAISFLGCISQLHFFHFLGSTESMLFAVMA
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NP_003 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
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pF1KE5 FDLSVAICKPLRYTVIMNPQLCTQMAITIWVIGFFHALLHSVMTSRLNFCGSNRIHHFLC
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NP_003 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
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pF1KE5 DIKPLLKLACGNTELNQWLLSTVTGTIAMGPFFLTLLSYFYIITYLFFKTRSCSMLCKAL
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NP_003 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVL-FSIFSMHSGEGRHRAF
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pF1KE5 STCASHFMVVILFYAPVLFTYIHPALESFMDQDRIVAIMYTVVTPVLNPLIYTLRNKEVK
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NP_003 STCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVK
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300
pF1KE5 GALGRVIRRL
::. :: :
NP_003 KALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 901; 43.3% identity (76.1% similar) in 305 aa overlap (3-307:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVISDPRLHSLMY
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pF1KE5 DLSVAICKPLRYTVIMNPQLCTQMAITIWVIGFFHALLHSVMTSRLNFCGSNRIHHFLCD
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300
pF1KE5 ALGRVIRRL
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NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVISDPRLHSLMY
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pF1KE5 FFLGNLSYLDICYSTVTLPKMLQNFLSTHKAISFLGCISQLHFFHFLGSTESMLFAVMAF
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pF1KE5 IKPLLKLACGNTELNQWLLSTVTGTIAMGPFFLTLLSYFYIITYLFFKTRSCSMLCKALS
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::.::. ::.:::. .. .:..: ..: .....::::::.:::.::.:::. .::
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pF1KE5 ALGRVIRRL
:: .:. :.
XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVI
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pF1KE5 SDPRLHSLMYFFLGNLSYLDICYSTVTLPKMLQNFLSTHKAISFLGCISQLHFFHFLGST
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: . ::.:::.::. ::.:::. .. .:..: ..: .....::::::.:::.:
XP_011 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFI
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pF1KE5 YTLRNKEVKGALGRVIRRL
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XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 899; 44.6% identity (74.3% similar) in 303 aa overlap (3-305:7-308)
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pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVISDPRLHSL
: : ::::.::: ::: ::..:::.: : . :: ...... ::.:..
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:::::.:::..:.:: . .:::: :::: .:.::. :: :..:: ...:::...:.:
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVL-KIRSFSGRKKT
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pF1KE5 LSTCASHFMVVILFYAPVLFTYIHPALESFMDQDRIVAIMYTVVTPVLNPLIYTLRNKEV
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NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
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pF1KE5 KGALGRVIRRL
: : .:.:
NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
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pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVISDPRLHSLMY
: . .::::::... : : .:: .::..:...:.:: ... . :: :::. .:
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pF1KE5 DLSVAICKPLRYTVIMNPQLCTQMAITIWVIGFFHALLHSVMTSRLNFCGSNRIHHFLCD
: :::: ::.::. :.:.:: . ::.. ...:.:... .:..:::: .::...:.
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pF1KE5 IKPLLKLACGNTELNQWLLSTVTGTIAMGPFFLTLLSYFYIITYLFFKTRSCSMLCKALS
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NP_002 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAIL-RIPSVSKKYKAFS
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pF1KE5 TCASHFMVVILFYAPVLFTYIHPALESFMDQDRIVAIMYTVVTPVLNPLIYTLRNKEVKG
:::::. .: :::. . ..:..: :... .: ....::.::::..::.::.::::...:
NP_002 TCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKP-LHTYSVKDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHG
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300
pF1KE5 ALGRVIRRL
::::.. .
NP_002 ALGRLLDKHFKRLT
300 310
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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Smith-Waterman score: 873; 43.5% identity (75.2% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVISDPRLHSLMYFF
: : ...:::.:::.:. ..: ..::::..::.:.:.: ... . ..: : : ::.
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pF1KE5 LGNLSYLDICYSTVTLPKMLQNFLSTHKAISFLGCISQLHFFHFLGSTESMLFAVMAFDL
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLKLACGNTELNQWLLSTVTGTIAMGPFFLTLLSYFYIITYLFFKTRSCSMLCKALSTC
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NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSL--RTHSLEARHKALSTC
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 ASHFMVVILFYAPVLFTYIHPALESFMDQDRIVAIMYTVVTPVLNPLIYTLRNKEVKGAL
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NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPA--ATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAI
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 GRVIRRL
.. :
NP_001 RKLCSRKDISGDK
300
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 883 init1: 650 opt: 870 Z-score: 883.4 bits: 171.6 E(85289): 1.8e-42
Smith-Waterman score: 870; 44.1% identity (76.0% similar) in 304 aa overlap (3-306:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVISDPRLHSLMY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLGNLSYLDICYSTVTLPKMLQNFLSTHKAISFLGCISQLHFFHFLGSTESMLFAVMAF
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DLSVAICKPLRYTVIMNPQLCTQMAITIWVIGFFHALLHSVMTSRLNFCGSNRIHHFLCD
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IKPLLKLACGNTELNQWLLSTVTGTIAMGPFFLTLLSYFYIITYLFFKTRSCSMLCKALS
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLM-GMSSTKGKYKAFS
190 200 210 220 230
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pF1KE5 TCASHFMVVILFYAPVLFTYIHPALESFMDQDRIVAIMYTVVTPVLNPLIYTLRNKEVKG
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NP_001 TCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKG
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300
pF1KE5 ALGRVIRRL
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NP_001 ALERLLSRADSCP
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 853 init1: 604 opt: 856 Z-score: 869.4 bits: 169.0 E(85289): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 856; 40.3% identity (75.2% similar) in 303 aa overlap (2-304:7-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVISDPRLHS
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LMYFFLGNLSYLDICYSTVTLPKMLQNFLSTHKAISFLGCISQLHFFHFLGSTESMLFAV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MAFDLSVAICKPLRYTVIMNPQLCTQMAITIWVIGFFHALLHSVMTSRLNFCGSNRIHHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 LCDIKPLLKLACGNTELNQWLLSTVTGTIAMGPFFLTLLSYFYIITYLFFKTRSCSMLCK
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAIL-RMQSTTGLQK
190 200 210 220 230
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pF1KE5 ALSTCASHFMVVILFYAPVLFTYIHPALESFMDQDRIVAIMYTVVTPVLNPLIYTLRNKE
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NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 VKGALGRVIRRL
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NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 852 init1: 572 opt: 855 Z-score: 868.4 bits: 168.8 E(85289): 1.2e-41
Smith-Waterman score: 855; 42.7% identity (74.5% similar) in 302 aa overlap (3-304:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVISDPRLHSLMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLGNLSYLDICYSTVTLPKMLQNFLSTHKAISFLGCISQLHFFHFLGSTESMLFAVMAF
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DLSVAICKPLRYTVIMNPQLCTQMAITIWVIGFFHALLHSVMTSRLNFCGSNRIHHFLCD
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 IKPLLKLACGNTELNQWLLSTVTGTIAMGPFFLTLLSYFYIITYLFFKTRSCSMLCKALS
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVL-QIRSASGRQKAFG
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHFMVVILFYAPVLFTYIHPALESFMDQDRIVAIMYTVVTPVLNPLIYTLRNKEVKG
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NP_001 TCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKG
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 ALGRVIRRL
::::..
NP_001 ALGRLLLGKRELGKE
300 310
307 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 00:16:03 2016 done: Tue Nov 8 00:16:04 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]