Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5386
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5386, 307 aa
1>>>pF1KE5386 307 - 307 aa - 307 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9018+/-0.00143; mu= 7.0603+/- 0.083
mean_var=164.8492+/-52.256, 0's: 0 Z-trim(101.3): 360 B-trim: 363 in 1/46
Lambda= 0.099892
statistics sampled from 6052 (6473) to 6052 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 1.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 1403 215.2 5.3e-56
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 985 154.9 7.3e-38
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 938 148.2 7.9e-36
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 925 146.3 2.9e-35
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 919 145.4 5.2e-35
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 912 144.4 1.1e-34
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 909 144.0 1.4e-34
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 906 143.6 2e-34
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 905 143.4 2.1e-34
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 904 143.3 2.3e-34
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 901 142.8 3.2e-34
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 899 142.5 3.9e-34
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 899 142.6 4.1e-34
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 895 142.0 5.8e-34
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 894 141.8 6.4e-34
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 893 141.7 7e-34
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 888 141.0 1.2e-33
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 887 140.8 1.3e-33
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 886 140.7 1.4e-33
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 884 140.4 1.7e-33
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 883 140.2 1.9e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 883 140.2 1.9e-33
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 883 140.2 1.9e-33
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 883 140.2 1.9e-33
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 883 140.2 1.9e-33
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 880 139.8 2.6e-33
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 880 139.8 2.6e-33
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 878 139.5 3.1e-33
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 877 139.4 3.4e-33
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 876 139.2 3.8e-33
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 876 139.2 3.8e-33
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 875 139.1 4.2e-33
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 875 139.1 4.2e-33
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 875 139.1 4.2e-33
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 875 139.1 4.3e-33
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 873 138.8 5.1e-33
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 872 138.6 5.7e-33
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 871 138.5 6.7e-33
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 870 138.4 7e-33
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 870 138.4 7e-33
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 869 138.2 7.7e-33
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 869 138.2 7.7e-33
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 869 138.2 7.7e-33
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 869 138.2 7.8e-33
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 870 138.4 7.8e-33
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 869 138.2 8e-33
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 868 138.1 8.6e-33
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 867 137.9 9.4e-33
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 866 137.8 1e-32
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 866 137.8 1e-32
>>CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 (316 aa)
initn: 1443 init1: 1384 opt: 1403 Z-score: 1118.9 bits: 215.2 E(32554): 5.3e-56
Smith-Waterman score: 1403; 67.0% identity (88.6% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVISDPRLHSLMYFF
: :.:...::::::.: .::::::.: .:: ::.:.. :::..:..:. .:.::: ::::
CCDS46 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LGNLSYLDICYSTVTLPKMLQNFLSTHKAISFLGCISQLHFFHFLGSTESMLFAVMAFDL
::::: ::: ::.:::::.: :.. ...::::::::.::::::::::::..:.:.::::
CCDS46 LGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAIMAFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SVAICKPLRYTVIMNPQLCTQMAITIWVIGFFHALLHSVMTSRLNFCGSNRIHHFLCDIK
::::.:::::::::::.: .: . :.:.::.::.:::::..:.::::....::. :.:
CCDS46 FVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFFYDVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLKLACGNTELNQWLLSTVTGTIAMGPFFLTLLSYFYIITYLFFKTRSCSMLCKALSTC
:::.:::..: ::::::: :::.:.:: ::::::: ::.: .:.::.::: .: ::::::
CCDS46 PLLELACSDTLLNQWLLSIVTGSISMGAFFLTLLSCFYVIGFLLFKNRSCRILHKALSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 ASHFMVVILFYAPVLFTYIHPALESFMDQDRIVAIMYTVVTPVLNPLIYTLRNKEVKGAL
::::::: :::.:: ::::.:: . : ::::.::::..::::::::::::::::: ::
CCDS46 ASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIYTLRNKEVMMAL
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GRVIRRL
... :
CCDS46 KKIFGRKLFKDWQQHH
310
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 1054 init1: 721 opt: 985 Z-score: 793.2 bits: 154.9 E(32554): 7.3e-38
Smith-Waterman score: 985; 45.2% identity (79.1% similar) in 301 aa overlap (3-303:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVISDPRLHSLMY
: :..:::..:: ....::: .::..:. :: .. :: ... ...::.::. ::
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLGNLSYLDICYSTVTLPKMLQNFLSTHKAISFLGCISQLHFFHFLGSTESMLFAVMAF
.:::::...::::.: ..:.:. ..:: .:.::..::. :: : :. ..: .:.:.::.
CCDS46 YFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DLSVAICKPLRYTVIMNPQLCTQMAITIWVIGFFHALLHSVMTSRLNFCGSNRIHHFLCD
: .:::.::::.::.. ::.:.: . :. ::.....:.:.: : :::.:.:..:.::
CCDS46 DRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IKPLLKLACGNTELNQWLLSTVTGTIAMGPFFLTLLSYFYIITYLFFKTRSCSMLCKALS
: ::: :.:::: .:. : .. :. ::. .:::. ::. .. . .: ::.:
CCDS46 IPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTIL-RIQSSEGRRKAFS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHFMVVILFYAPVLFTYIHPALESFMDQDRIVAIMYTVVTPVLNPLIYTLRNKEVKG
:::::. .:.:::. ..:::..: . .::.:...:.::::.:::.:::::::..:
CCDS46 TCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKE
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 ALGRVIRRL
:. .
CCDS46 AVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
300 310 320
>>CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 (314 aa)
initn: 946 init1: 673 opt: 938 Z-score: 756.8 bits: 148.2 E(32554): 7.9e-36
Smith-Waterman score: 938; 44.7% identity (77.3% similar) in 304 aa overlap (3-306:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVISDPRLHSLMY
: ::...:::::. : : . ...::..:. .. :: ..... : .::. ::
CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLGNLSYLDICYSTVTLPKMLQNFLSTHKAISFLGCISQLHFFHFLGSTESMLFAVMAF
.::.:::. :.:.:.::.::.:::. . .: . :..:..:: ..:. ::.:...::.
CCDS11 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DLSVAICKPLRYTVIMNPQLCTQMAITIWVIGFFHALLHSVMTSRLNFCGSNRIHHFLCD
: :::: ::.::.::.:.:: .. ::. :::.::... .:: ::..: : ::.::
CCDS11 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IKPLLKLACGNTELNQWLLSTVTGTIAMGPFFLTLLSYFYIITYLFFKTRSCSMLCKALS
.. ::::: ..:..:.:.. . : : . ::.: : :: :.. .. :. : . .:::.:
CCDS11 MSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSIL-KVPSSKGICKAFS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHFMVVILFYAPVLFTYIHPALESFMDQDRIVAIMYTVVTPVLNPLIYTLRNKEVKG
::.::. :: :::. :. :. . .: .: ..:.:::::::.:::.::.:::...::
CCDS11 TCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKG
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 ALGRVIRRL
::.:::..
CCDS11 ALSRVIHQKKTFFSL
300 310
>>CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 929 init1: 699 opt: 925 Z-score: 746.7 bits: 146.3 E(32554): 2.9e-35
Smith-Waterman score: 925; 44.9% identity (78.7% similar) in 305 aa overlap (4-307:7-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVISDPRLHSLM
..:.. :.:::... .:: ::..:: .:.....:: ... . ::::::. :
CCDS35 METKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFAIFLIMYLLTAVGNVLIILAIYSDPRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLGNLSYLDICYSTVTLPKMLQNFLSTHKAISFLGCISQLHFFHFLGSTESMLFAVMA
::::.:::..:::..:: .:::: :::: : ::..::. :..:: .:.:.:.:.: ::
CCDS35 YFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKIISYVGCLIQMYFFMAFGNTDSYLLASMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FDLSVAICKPLRYTVIMNPQLCTQMAITIWVIGFFHALLHSVMTSRLNFCGSNRIHHFLC
.: ::::.::.: :.:.: : : . :. .:.:.. .. :::.::.:. :.::.:
CCDS35 IDRLVAICNPLHYDVVMKPWHCLLMLLGSCSISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DIKPLLKLACGNTELNQWLLSTVTGTIAMGPFFLTLLSYFYIITYLFFKTRSCSMLCKAL
: .:.:::.:..: .: .. : : .. . ::. :..::. ::. .. . : . ::.
CCDS35 DTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFLCTIFSYLQIIVTVL-RIPSAAGKWKAF
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHFMVVILFYAPVLFTYIHP-ALESFMDQDRIVAIMYTVVTPVLNPLIYTLRNKEV
:::.::. ::.:::. :...:..: .. : : . :....:::::::.:::.::.::::..
CCDS35 STCGSHLTVVVLFYGSVIYVYFRPLSMYSVM-KGRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDM
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 KGALGRVIRRL
: .: .. .:.
CCDS35 KRGLKKLRHRIYS
300 310
>>CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 908 init1: 657 opt: 919 Z-score: 742.0 bits: 145.4 E(32554): 5.2e-35
Smith-Waterman score: 919; 46.6% identity (76.7% similar) in 305 aa overlap (3-306:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGN-GAVLMIVISDPRLHSLM
: ::.:::.:::..: ::: .::. ::.:: ..: :: : .:.: : : .::. :
CCDS31 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRI-DSQLHTPM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLGNLSYLDICYSTVTLPKMLQNFLSTHKAISFLGCISQLHFFHFLGSTESMLFAVMA
::::.:::..:.: ::. :::: ..:: .:.::: ::. :..:: :..:: .::..::
CCDS31 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FDLSVAICKPLRYTVIMNPQLCTQMAITIWVIGFFHALLHSVMTSRLNFCGSNRIHHFLC
.: .:::.:: :..::. . .:: .. :... .... .: :.:: :: ::::.:
CCDS31 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DIKPLLKLACGNTELNQWLLSTVTGTIAMGPFFLTLLSYFYIITYLFFKTRSCSMLCKAL
: ::.::.:..: :.. . : ..:. .: ... : :: :.. . .:. .: .:.
CCDS31 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVL-FSIFSMHSGEGRHRAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHFMVVILFYAPVLFTYIHPALESFMDQDRIVAIMYTVVTPVLNPLIYTLRNKEVK
::::::. ..::::: ..::..:. ..::......:::: :.::::::.::.::::
CCDS31 STCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVK
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 GALGRVIRRL
::. :: :
CCDS31 KALANVISRKRTSSFL
300 310
>>CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 802 init1: 666 opt: 912 Z-score: 736.4 bits: 144.4 E(32554): 1.1e-34
Smith-Waterman score: 912; 44.1% identity (77.3% similar) in 304 aa overlap (3-306:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLNTTSVTEFLLLGVTDIQELQPFLFVVFLTIYFISVTGNGAVLMIVISDPRLHSLMY
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CCDS31 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
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CCDS31 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
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CCDS31 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
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CCDS31 VPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVML--RSHSREGRSKALS
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CCDS31 TCASHIAVVTLIFVPCIYVYTRP-FRTF-PMDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIM
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300
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CCDS31 AMKKLWRRKKDPIGPLEHRPLH
300 310
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CCDS35 YFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKVISYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMA
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CCDS35 STCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMK
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CCDS35 RGLKKLQDRIYR
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CCDS35 FFLSILSFADICYTTVIVPKMLVNFLSEKKTISYAECLAQMYFFLVFGNIDSYLLAAMAI
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CCDS35 NRCVAICNPFHYVTVMNRRCCVLLLAFPITFSYFHSLLHVLLVNRLTFCTSNVIHHFFCD
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CCDS35 VNPVLKLSCSSTFVNEIVAMTEGLASVMAPFVCIIISYLRILIAVL-KIPSAAGKHKAFS
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CCDS35 TCSSHLTVVILFYGSISYVYLQP-LSSYTVKDRIATINYTVLTSVLNPFIYSLRNKDMKR
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CCDS35 GLQKLINKIKSQMSRFSTKTNKICGP
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CCDS41 FFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIMAY
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CCDS41 DRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFCD
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300 310
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CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]