Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5385
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5385, 307 aa
1>>>pF1KE5385 307 - 307 aa - 307 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5053+/-0.000626; mu= 20.2197+/- 0.039
mean_var=93.0840+/-27.024, 0's: 0 Z-trim(105.2): 318 B-trim: 1534 in 2/49
Lambda= 0.132934
statistics sampled from 12971 (13412) to 12971 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.472), E-opt: 0.2 (0.157), width: 16
Scan time: 4.220
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 983 199.7 6.1e-51
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 964 196.1 7.7e-50
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 891 182.1 1.3e-45
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 891 182.1 1.3e-45
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 883 180.6 3.6e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 865 177.1 4e-44
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 840 172.3 1.1e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 830 170.4 4.2e-42
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 823 169.1 1.1e-41
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 823 169.1 1.1e-41
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 823 169.1 1.1e-41
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 808 166.2 7.8e-41
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 806 165.8 1e-40
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 799 164.4 2.6e-40
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 779 160.6 3.8e-39
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 775 159.8 6.2e-39
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 766 158.1 2.1e-38
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 745 154.1 3.4e-37
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 724 150.0 5.4e-36
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 505 108.1 2.4e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 490 105.2 1.8e-22
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 209 51.3 3e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 197 49.0 1.5e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 188 47.3 5.2e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 187 47.1 5.5e-05
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 182 46.2 0.00012
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 182 46.3 0.00013
XP_011509323 (OMIM: 602886) PREDICTED: G-protein c ( 293) 170 43.8 0.00051
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 171 44.1 0.00052
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 171 44.1 0.00052
NP_001499 (OMIM: 602886) G-protein coupled recepto ( 453) 170 44.0 0.00066
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 167 43.3 0.00083
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 168 43.7 0.00088
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 165 42.8 0.001
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 165 42.8 0.001
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 165 42.8 0.001
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 165 42.9 0.0011
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 164 42.7 0.0012
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 164 42.8 0.0014
XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 164 43.0 0.0017
XP_016855648 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 164 43.0 0.0017
XP_016855646 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 164 43.0 0.0017
XP_011542343 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 164 43.0 0.0017
XP_011542348 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 164 43.0 0.0017
XP_011542346 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 164 43.0 0.0017
NP_000731 (OMIM: 100100,118494) muscarinic acetylc ( 590) 164 43.0 0.0017
XP_016855650 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 164 43.0 0.0017
XP_016855647 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 164 43.0 0.0017
XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 164 43.0 0.0017
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 983; 49.7% identity (77.3% similar) in 304 aa overlap (5-307:7-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTP
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::::.:::: :... :.:::.: .:. . .:::. :::::. ::.::::::::::..:
NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
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300
pF1KE5 KNAFYKLFEN
:.: :....
NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 964; 47.5% identity (79.4% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-301)
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pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
: ..: : ::::.:. :. :::: :: ::::: .::.::: ::.: ..::.::::::
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:::.::: :::: .:::. . ... . . .. .. : .. .:.:: :::: ::.::
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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pF1KE5 FYKLFEN
.
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
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pF1KE5 FYKLFEN
. :.
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
:. : . ..::.:. :.:.:. : :: :: .:: ::.::: .:. ...:: ::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVISHFYCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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pF1KE5 FYKLFEN
. :.
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 904 init1: 880 opt: 891 Z-score: 940.0 bits: 182.1 E(85289): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 891; 43.4% identity (77.6% similar) in 304 aa overlap (1-304:11-314)
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pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTK
:. : . ..::.:. :.:.:. : :: :: .:: ::.::: .:. ..
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pF1KE5 LDSHLHTPMYFSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIIS
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 EFFILSAMAYDRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCG
. :.:..::::..::.:.:: : . :...:: .::. .. .....:. :. . :.::.
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 SNVISHFYCDDVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KE5 AEGRKKAFSTCGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIY
..:: ::::::::::.::..::.... .:..: :.: . : ::.:.::.: :::::.::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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300
pF1KE5 SLRNEEVKNAFYKLFEN
::::. .:.:. :.
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 884 init1: 861 opt: 883 Z-score: 931.9 bits: 180.6 E(85289): 3.6e-45
Smith-Waterman score: 883; 44.7% identity (74.3% similar) in 304 aa overlap (2-304:3-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPM
: :.: .: :::. .. :.. :: .:::::. ... ::..:.: ..::::::::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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pF1KE5 YFSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTI-KIFTLTFCGSNVISHFY
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYM-TGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFF
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDDVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGRKKAF
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NP_001 CDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNEEVK
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NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 NAFYKLFEN
.:. .:
NP_001 DALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 871 init1: 817 opt: 865 Z-score: 913.1 bits: 177.1 E(85289): 4e-44
Smith-Waterman score: 865; 44.1% identity (74.8% similar) in 306 aa overlap (1-305:1-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRP-ELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVISHFYC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DDVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGRKKAFS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNEEVKN
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 AFYKLFEN
:. . :
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 852 init1: 828 opt: 840 Z-score: 887.4 bits: 172.3 E(85289): 1.1e-42
Smith-Waterman score: 840; 40.9% identity (77.1% similar) in 301 aa overlap (5-305:2-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMAY
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NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAY
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVISHFYCD
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NP_001 DRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCE
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 DVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGRKKAFST
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NP_001 IPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNEEVKNA
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NP_001 CSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAG
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FYKLFEN
. :.:
NP_001 IRKVFAFLKH
300
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 845 init1: 820 opt: 830 Z-score: 876.9 bits: 170.4 E(85289): 4.2e-42
Smith-Waterman score: 830; 43.9% identity (73.8% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMAY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVISHFYCD
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 DVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGRKKAFST
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
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pF1KE5 CGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNEEVKNA
:::::::: .:::....:::::... : . .::..: :.::::::.:::.:::.:
NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FYKLFEN
. .:.
NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 846 init1: 823 opt: 823 Z-score: 869.6 bits: 169.1 E(85289): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 823; 42.0% identity (73.4% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
:: : : ..::::. :. . .. :: .:::.:..::.:: ...: .:::.::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMAY
: . .:..::.. .: . :..::.:......: . .::::: : : . :: .:..:::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVISHFYCD
:::::.:. : : .:: :: :. ... . ... . : : : .: .. :.:. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 DVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGRKKAFST
. .. . : ... :. .. :. :.. : .::.::. :. .: ...: ::::::: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
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. ::.
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310
307 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]