Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5385
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5385, 307 aa
1>>>pF1KE5385 307 - 307 aa - 307 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9575+/-0.00148; mu= 11.9456+/- 0.086
mean_var=166.1020+/-60.542, 0's: 0 Z-trim(100.2): 373 B-trim: 724 in 2/45
Lambda= 0.099515
statistics sampled from 5552 (6041) to 5552 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.506), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16
Scan time: 1.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1995 299.6 2e-81
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1307 200.8 1.1e-51
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1180 182.6 3.4e-46
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1180 182.6 3.4e-46
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1167 180.7 1.2e-45
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1065 166.1 3.2e-41
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1025 160.3 1.7e-39
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1021 159.8 2.5e-39
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1015 158.9 4.5e-39
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1014 158.8 5.1e-39
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1013 158.6 5.7e-39
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1010 158.2 7.5e-39
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1006 157.6 1.1e-38
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1003 157.2 1.5e-38
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1002 157.0 1.7e-38
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1000 156.8 2e-38
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 990 155.3 5.5e-38
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 989 155.2 6.4e-38
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 988 155.0 6.7e-38
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 983 154.3 1.1e-37
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 983 154.3 1.1e-37
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 981 154.0 1.3e-37
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 981 154.0 1.4e-37
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 977 153.4 2e-37
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 976 153.3 2.2e-37
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 975 153.2 2.4e-37
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 972 152.7 3.3e-37
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 969 152.3 4.4e-37
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 968 152.2 4.9e-37
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 965 151.7 6.6e-37
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 964 151.6 7.3e-37
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 963 151.4 8.1e-37
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 962 151.3 8.9e-37
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 954 150.1 1.9e-36
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 954 150.2 2.2e-36
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 953 150.0 2.2e-36
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 950 149.6 2.9e-36
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 949 149.4 3.2e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 949 149.5 3.3e-36
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 947 149.2 4.1e-36
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 946 149.0 4.4e-36
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 941 148.3 7.2e-36
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 937 147.7 1.1e-35
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 933 147.1 1.6e-35
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 933 147.1 1.6e-35
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 930 146.7 2.2e-35
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 927 146.3 3e-35
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 926 146.1 3.2e-35
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 926 146.2 3.4e-35
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 925 146.0 3.5e-35
>>CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 (307 aa)
initn: 1995 init1: 1995 opt: 1995 Z-score: 1575.3 bits: 299.6 E(32554): 2e-81
Smith-Waterman score: 1995; 100.0% identity (100.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVISHFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVISHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGRKKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNEEVKNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNEEVKNA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FYKLFEN
:::::::
CCDS31 FYKLFEN
>>CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 1333 init1: 1300 opt: 1307 Z-score: 1041.3 bits: 200.8 E(32554): 1.1e-51
Smith-Waterman score: 1307; 64.3% identity (86.4% similar) in 308 aa overlap (3-307:6-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGQHN---LTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSH
.:: .: .:::::: .: : :: ::::.::.:::.::.::: :.::: :::.
CCDS31 MNHVVKHNHTAVTKVTEFILMGITDNPGLQAPLFGLFLIIYLVTVIGNLGMVILTYLDSK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LHTPMYFSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFI
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CCDS31 LHTPMYFFLRHLSITDLGYSTVIAPKMLVNFIVHKNTISYNWYATQLAFFEIFIISELFI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LSAMAYDRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVI
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CCDS31 LSAMAYDRYVAICKPLLYVIIMAEKVLWVLVIVPYLYSTFVSLFLTIKLFKLSFCGSNII
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SHFYCDDVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGR
:.:::: .::. .:::...:.::. ..:: ::. :. :::.:::.::.:: .:.: .::
CCDS31 SYFYCDCIPLMSILCSDTNELELIILIFSGCNLLFSLSIVLISYMFILVAILRMNSRKGR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KKAFSTCGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRN
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CCDS31 YKAFSTCSSHLTVVIMFYGTLLFIYLQPKSSHTLAIDKMASVFYTLLIPMLNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 EEVKNAFYKLFEN
.:::.:. . . :
CCDS31 KEVKDALKRTLTNRFKIPI
310
>>CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1180 init1: 1180 opt: 1180 Z-score: 942.8 bits: 182.6 E(32554): 3.4e-46
Smith-Waterman score: 1180; 57.3% identity (85.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
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CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSRLQNPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMAY
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CCDS31 FFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVISHFYCD
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CCDS31 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNIINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGRKKAFST
.::: . ::.. : . .. .. ::. :.. :::::. :.:.: ...: :::::::::
CCDS31 IAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLVFSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNEEVKNA
:.::. .:.::::..::::.::...: .::::::::::::::::::::::::::..:. :
CCDS31 CASHMIAVTVFYGTMLFMYLQPQTNHSLDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNNDVNVA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FYKLFEN
. :..::
CCDS31 LKKFMENPCYSFKSM
310
>>CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1186 init1: 1018 opt: 1180 Z-score: 942.8 bits: 182.6 E(32554): 3.4e-46
Smith-Waterman score: 1180; 57.1% identity (85.4% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
:. .:.: .::::: .. :::::::: ::::.: .:..::: .: ::..::.:.::::
CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSRLQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMAY
: ..:::...::::::: ::.: ::.: ..: :.: ::.::. ::.::.:: ..:. :::
CCDS31 FFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLALMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVISHFYCD
::::::::::::.:..:.::: .::.. :::. :.. . .:....:.::.:.:::::
CCDS31 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNIINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGRKKAFST
.:::: . ::.. : . .. .. :...:..::::::. :.:.: .. :.:::::::::
CCDS31 NVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTD-KMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNEEVKN
:.::. .:..:::.:::::.:: :.: .::: :::::::::::::::::::::::..::.
CCDS31 CASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKT
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 AFYKLFEN
:. ... :
CCDS31 ALQRFMTNLCYSFKTM
310
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1212 init1: 1158 opt: 1167 Z-score: 932.9 bits: 180.7 E(32554): 1.2e-45
Smith-Waterman score: 1167; 57.7% identity (83.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
:.. : : :::::. :: . ::..::: .:: :::.:::::: .:.: . :. :.::::
CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMAY
: . .:::::. :.:: ::.:.::. .:.::. :::.::. :: :.::: ..:..:::
CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVISHFYCD
::::::::::::.:.:. .: ::.. : :: ..::. :: : :..: ::...:::::
CCDS41 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGRKKAFST
:.::: . ::... .: . . . .:::.:::.::::.:. :: .:::::::.:::::
CCDS41 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 CGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNEEVKNA
::::. .:..:::.:.:::.::.:.: .:::::::::::..:::::::::::.:.:::.:
CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FYKLFEN
. :.. :
CCDS41 LKKIIINKN
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1057 init1: 1057 opt: 1065 Z-score: 853.6 bits: 166.1 E(32554): 3.2e-41
Smith-Waterman score: 1065; 55.0% identity (79.3% similar) in 300 aa overlap (5-303:3-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
: : .:::::. :: :::::::: ::: :::::.:::: :: : ::: ::::::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMY
10 20 30 40 50
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pF1KE5 FSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMAY
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310
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