Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5382
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5382, 305 aa
1>>>pF1KE5382 305 - 305 aa - 305 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8927+/-0.00124; mu= 11.8819+/- 0.072
mean_var=184.0170+/-67.829, 0's: 0 Z-trim(102.0): 385 B-trim: 397 in 1/48
Lambda= 0.094546
statistics sampled from 6308 (6778) to 6308 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.208), width: 16
Scan time: 2.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1983 283.9 1.1e-76
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 1397 204.0 1.3e-52
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1389 202.9 2.7e-52
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1207 178.0 7.8e-45
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1201 177.2 1.4e-44
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 1167 172.6 3.5e-43
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1133 167.9 8.6e-42
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1093 162.5 3.8e-40
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1061 158.1 7.8e-39
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1059 157.9 9.5e-39
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1056 157.4 1.2e-38
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1051 156.8 2e-38
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1045 155.9 3.6e-38
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1036 154.7 8.3e-38
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1025 153.2 2.4e-37
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1025 153.2 2.4e-37
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1023 152.9 2.8e-37
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1020 152.5 3.8e-37
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1017 152.1 5.1e-37
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1016 152.0 5.5e-37
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1014 151.7 6.6e-37
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1012 151.4 8e-37
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1011 151.3 8.8e-37
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1009 151.0 1.1e-36
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1008 150.9 1.2e-36
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1005 150.5 1.6e-36
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1002 150.1 2.1e-36
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1001 149.9 2.3e-36
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 999 149.7 2.7e-36
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 991 148.6 5.8e-36
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 989 148.3 7.1e-36
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 989 148.3 7.1e-36
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 988 148.2 7.8e-36
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 984 147.6 1.1e-35
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 984 147.6 1.1e-35
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 982 147.4 1.4e-35
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 981 147.2 1.5e-35
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 974 146.3 3.1e-35
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 974 146.3 3.1e-35
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 973 146.2 3.5e-35
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 972 146.0 3.7e-35
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 964 144.9 7.5e-35
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 964 144.9 7.7e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 962 144.6 9.2e-35
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 962 144.7 9.4e-35
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 957 143.9 1.5e-34
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 954 143.5 1.9e-34
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 953 143.4 2.1e-34
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 949 142.8 3.1e-34
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 949 142.8 3.1e-34
>>CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 1983 init1: 1983 opt: 1983 Z-score: 1490.4 bits: 283.9 E(32554): 1.1e-76
Smith-Waterman score: 1983; 100.0% identity (100.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSNTNGSAITEFILLGLTDCPELQSLLFVLFLVVYLVTLLGNLGMIMLMRLDSRLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MSNTNGSAITEFILLGLTDCPELQSLLFVLFLVVYLVTLLGNLGMIMLMRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLTNLAFVDLCYTSNATPQMSTNIVSEKTISFAGCFTQCYIFIALLLTEFYMLAAMAYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FFLTNLAFVDLCYTSNATPQMSTNIVSEKTISFAGCFTQCYIFIALLLTEFYMLAAMAYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAIYDPLRYSVKTSRRVCICLATFPYVYGFSDGLFQAILTFRLTFCRSSVINHFYCAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RYVAIYDPLRYSVKTSRRVCICLATFPYVYGFSDGLFQAILTFRLTFCRSSVINHFYCAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PPLIKLSCSDTYVKEHAMFISAGFNLSSSLTIVLVSYAFILAAILRIKSAEGRHKAFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PPLIKLSCSDTYVKEHAMFISAGFNLSSSLTIVLVSYAFILAAILRIKSAEGRHKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GSHMMAVTLFYGTLFCMYIRPPTDKTVEESKIIAVFYTFVSPVLNPLIYSLRNKDVKQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSHMMAVTLFYGTLFCMYIRPPTDKTVEESKIIAVFYTFVSPVLNPLIYSLRNKDVKQAL
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KNVLR
:::::
CCDS53 KNVLR
>>CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1050 init1: 1050 opt: 1397 Z-score: 1058.3 bits: 204.0 E(32554): 1.3e-52
Smith-Waterman score: 1397; 66.7% identity (87.9% similar) in 306 aa overlap (1-305:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSNTNGSAITEFILLGLTDCPELQSLLFVLFLVVYLVTLLGNLGMIMLMRLDSRLHTPMY
: . : . .:::::::::: : :...:: .::..::.:: ::: ::.:.: .:.:.::::
CCDS53 MFSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSHLQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLTNLAFVDLCYTSNATPQMSTNIVSE-KTISFAGCFTQCYIFIALLLTEFYMLAAMAY
::: .:.:::.::.::.::.: :..:: ::::.::::::: .::::..::::.::.::
CCDS53 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYILASMAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAIYDPLRYSVKTSRRVCICLATFPYVYGFSDGLFQAILTFRLTFCRSSVINHFYCA
:::::: .::.:: . :. .:.::.:.::.::: .:. :..:::.:.:: : :::::::
CCDS53 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICVCLVTIPYMYGFLSGFSQSLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DPPLIKLSCSDTYVKEHAMFISAGFNLSSSLTIVLVSYAFILAAILRIKSAEGRHKAFST
::::: :.:::: ::. :::. ::::::::: :.:.:: ::.:::.::.:::::::::::
CCDS53 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFNLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHMMAVTLFYGTLFCMYIRPPTDKTVEESKIIAVFYTFVSPVLNPLIYSLRNKDVKQA
:.::. ::::::::::::.:::..:.:::::: ::::::.::.:::::::::: :: :
CCDS53 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKITAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNTDVILA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 LKNVLR
.....:
CCDS53 MQQMIRGKSFHKIAV
310
>>CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1042 init1: 1042 opt: 1389 Z-score: 1052.4 bits: 202.9 E(32554): 2.7e-52
Smith-Waterman score: 1389; 67.0% identity (87.9% similar) in 306 aa overlap (1-305:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSNTNGSAITEFILLGLTDCPELQSLLFVLFLVVYLVTLLGNLGMIMLMRLDSRLHTPMY
: . : . .:::::::::: : :...:: .::..::.:: ::: ::.:.: .:.:.::::
CCDS53 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSQLQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLTNLAFVDLCYTSNATPQMSTNIVSE-KTISFAGCFTQCYIFIALLLTEFYMLAAMAY
::: .:.:::.::.::.::.: :..:: ::::.::::::: .::::..::::.::.::
CCDS53 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAIYDPLRYSVKTSRRVCICLATFPYVYGFSDGLFQAILTFRLTFCRSSVINHFYCA
:::::: .::.:: . :. .:: :.: ::.::: .:: :..:::.:.:: : :::::::
CCDS53 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DPPLIKLSCSDTYVKEHAMFISAGFNLSSSLTIVLVSYAFILAAILRIKSAEGRHKAFST
::::: :.:::: ::. :::. :::.::::: :.:.:: ::.:::.::.:::::::::::
CCDS53 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHMMAVTLFYGTLFCMYIRPPTDKTVEESKIIAVFYTFVSPVLNPLIYSLRNKDVKQA
:.::. ::::::::::::.:::..:.:::::::::::::.::.::::::::::.:: :
CCDS53 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNRDVILA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 LKNVLR
.....:
CCDS53 IQQMIRGKSFCKIAV
310
>>CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 (307 aa)
initn: 1232 init1: 913 opt: 1207 Z-score: 918.4 bits: 178.0 E(32554): 7.8e-45
Smith-Waterman score: 1207; 57.8% identity (86.4% similar) in 301 aa overlap (5-304:3-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSNTNGSAITEFILLGLTDCPELQSLLFVLFLVVYLVTLLGNLGMIMLMRLDSRLHTPMY
: . .:::::::::. : : :.:..:::::..:..::.::..:.... .:..:::
CCDS31 MLNFTDVTEFILLGLTSRREWQVLFFIIFLVVYIITMVGNIGMMVLIKVSPQLNNPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLTNLAFVDLCYTSNATPQMSTNIVSEK-TISFAGCFTQCYIFIALLLTEFYMLAAMAY
:::..:.:::. ..::.::.: :..:.: ::..:::..::..::::. .:...:::::.
CCDS31 FFLSHLSFVDVWFSSNVTPKMLENLLSDKKTITYAGCLVQCFFFIALVHVEIFILAAMAF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAIYDPLRYSVKTSRRVCICLATFPYVYGFSDGLFQAILTFRLTFCRSSVINHFYCA
:::.:: .:: :. : :: ::: : ::::.::: .: .. :. : :: . :::::::
CCDS31 DRYMAIGNPLLYGSKMSRVVCIRLITFPYIYGFLTSLAATLWTYGLYFCGKIEINHFYCA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DPPLIKLSCSDTYVKEHAMFISAGFNLSSSLTIVLVSYAFILAAILRIKSAEGRHKAFST
::::::..:. :.:::..:.: ::.:.. :::....:: ::: ::::..:::::.:::::
CCDS31 DPPLIKMACAGTFVKEYTMIILAGINFTYSLTVIIISYLFILIAILRMRSAEGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHMMAVTLFYGTLFCMYIRPPTDKTVEESKIIAVFYTFVSPVLNPLIYSLRNKDVKQA
::::. :: .:::::. ::.: ::...::..:..::::: : :.:::.::::::::::.:
CCDS31 CGSHLTAVIIFYGTLIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKKA
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 LKNVLR
. .:.
CCDS31 MMKVISRSC
300
>>CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 884 init1: 884 opt: 1201 Z-score: 913.9 bits: 177.2 E(32554): 1.4e-44
Smith-Waterman score: 1201; 60.3% identity (84.5% similar) in 297 aa overlap (5-300:4-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSNTNGSAITEFILLGLTDCPELQSLLFVLFLVVYLVTLLGNLGMIMLMRLDSRLHTPMY
: . .:::::::::. ::: :::.:::..:.::. ::::::.:.. .. :: :::
CCDS31 MRRNCTLVTEFILLGLTSRRELQILLFTLFLAIYMVTVAGNLGMIVLIQANAWLHMPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLTNLAFVDLCYTSNATPQMSTNIVSEK-TISFAGCFTQCYIFIALLLTEFYMLAAMAY
:::..:.:::::..::.::.: ..::: .::. .:..:::.::::. .:.:.::.::.
CCDS31 FFLSHLSFVDLCFSSNVTPKMLEIFLSEKKSISYPACLVQCYLFIALVHVEIYILAVMAF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAIYDPLRYSVKTSRRVCICLATFPYVYGFSDGLFQAILTFRLTFCRSSVINHFYCA
:::.:: .:: :. . :. :: : : ::::: ::.... :. :.:: . :::::::
CCDS31 DRYMAICNPLLYGSRMSKSVCSFLITVPYVYGALTGLMETMWTYNLAFCGPNEINHFYCA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DPPLIKLSCSDTYVKEHAMFISAGFNLSSSLTIVLVSYAFILAAILRIKSAEGRHKAFST
:::::::.::::: :: .::: ::.::: :: :. .:: .:. :::.:.:.:::.:::::
CCDS31 DPPLIKLACSDTYNKELSMFIVAGWNLSFSLFIICISYLYIFPAILKIRSTEGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHMMAVTLFYGTLFCMYIRPPTDKTVEESKIIAVFYTFVSPVLNPLIYSLRNKDVKQA
::::. :::.::.::: ::.:::. ..::..:..::::: : :.:: .:::::::.::.:
CCDS31 CGSHLTAVTIFYATLFFMYLRPPSKESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNLIIYSLRNKNVKEA
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 LKNVLR
:
CCDS31 LIKELSMKIYFS
300 310
>>CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1186 init1: 852 opt: 1167 Z-score: 888.8 bits: 172.6 E(32554): 3.5e-43
Smith-Waterman score: 1167; 55.5% identity (86.4% similar) in 301 aa overlap (5-304:3-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSNTNGSAITEFILLGLTDCPELQSLLFVLFLVVYLVTLLGNLGMIMLMRLDSRLHTPMY
: . .::: ::::: ::: :.::.::.::..:::::.:::.:. .. .:..:::
CCDS31 MPNFTDVTEFTLLGLTCRQELQVLFFVVFLAVYMITLLGNIGMIILISISPQLQSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
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CCDS31 DRYMAGCNPLLYGSKMSRTVCVRLISVPYVYGFSVSLICTLWTYGLYFCGNFEINHFYCA
120 130 140 150 160 170
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CCDS31 DPPLIQIACGRVHIKEITMIVIAGINFTYSLSVVLISYTLIVVAVLRMRSADGRRKAFST
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CCDS31 CGSHLTAVSMFYGTPIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKEA
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300
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.....
CCDS31 VNKAITKTYVRQ
300 310
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CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
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CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
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CCDS41 LKKIIINKN
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CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
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300
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CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
310
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CCDS31 DRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCD
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CCDS31 APPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFST
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CCDS31 FKKTVGKAKASIGFIF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]