Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5380
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5380, 305 aa
1>>>pF1KE5380 305 - 305 aa - 305 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2746+/-0.000481; mu= 15.7308+/- 0.030
mean_var=124.3933+/-38.081, 0's: 0 Z-trim(108.7): 360 B-trim: 974 in 1/49
Lambda= 0.114994
statistics sampled from 16295 (16813) to 16295 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16
Scan time: 5.570
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1015 180.5 3.8e-45
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 797 144.3 3e-34
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 791 143.3 5.8e-34
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 788 142.8 8.3e-34
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 786 142.5 1.1e-33
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 786 142.5 1.1e-33
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 786 142.5 1.1e-33
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 785 142.3 1.2e-33
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 779 141.3 2.3e-33
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 766 139.2 1e-32
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 762 138.5 1.7e-32
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 762 138.5 1.7e-32
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 752 136.8 5.3e-32
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 751 136.6 5.7e-32
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 746 135.8 1e-31
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 746 135.8 1e-31
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 746 135.9 1.1e-31
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 742 135.2 1.6e-31
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 734 133.9 4.1e-31
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 723 132.1 1.5e-30
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 554 104.0 4.1e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 516 97.7 3.2e-20
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 230 50.3 6.4e-06
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 228 49.9 8e-06
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 212 47.3 5.3e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 208 46.6 8.2e-05
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 200 45.3 0.00021
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 197 44.8 0.00029
NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 196 44.7 0.00035
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 196 44.8 0.00036
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 196 44.8 0.00036
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 196 44.8 0.00036
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 196 44.8 0.00036
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 196 44.8 0.00036
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 195 44.5 0.00039
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 195 44.5 0.00039
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 194 44.4 0.00045
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 194 44.4 0.00045
NP_001471 (OMIM: 600377) galanin receptor type 1 [ ( 349) 193 44.2 0.00046
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 190 43.6 0.00061
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 190 43.6 0.00063
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 190 43.7 0.00068
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 190 43.7 0.00068
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 190 43.7 0.00071
NP_001727 (OMIM: 113995) C5a anaphylatoxin chemota ( 350) 189 43.5 0.00073
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 190 43.8 0.00074
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 188 43.3 0.00081
NP_000902 (OMIM: 165195) delta-type opioid recepto ( 372) 188 43.4 0.00085
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 189 43.7 0.00088
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 189 43.7 0.00094
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1033 init1: 1014 opt: 1015 Z-score: 931.5 bits: 180.5 E(85289): 3.8e-45
Smith-Waterman score: 1015; 49.1% identity (79.2% similar) in 293 aa overlap (2-294:7-299)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFL
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDR
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLP
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 RVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTA
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NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 HITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQLR
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NP_001 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 KWDAHSSVKF
NP_001 SRKDISGDK
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 797; 39.5% identity (73.2% similar) in 306 aa overlap (1-302:10-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSP
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pF1KE5 GFDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFY
..:::.:::.:: ::..: . :. ...... : . :. . .:: : .: : .. :.
NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDLPRVIKLACTDTYRLD-IMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQH-RPLDKSSKA
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIIC-FIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT
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230 240 250 260 270 280
pF1KE5 LSTLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKS--LDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDM
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NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
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290 300
pF1KE5 KTAIRQLRKWDAHSSVKF
: : ... . . ::
NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
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Smith-Waterman score: 791; 36.3% identity (74.9% similar) in 303 aa overlap (1-300:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLL
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVFL
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pF1KE5 IAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPR
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pF1KE5 VIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQH-RPLDKSSKALSTLTA
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NP_001 LLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTCSS
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pF1KE5 HITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSL--DKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQ
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NP_001 HLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGIRK
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300
pF1KE5 LRKWDAHSSVKF
. . :
NP_001 VFAFLKH
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 783 init1: 594 opt: 788 Z-score: 727.9 bits: 142.8 E(85289): 8.3e-34
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHS
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pF1KE5 PMYFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIA
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE5 MGFDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVA-WGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDS
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFC-HLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
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pF1KE5 FYCDLPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTI-QHRPLDKSSK
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NP_001 FFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
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pF1KE5 ALSTLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLD--KFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKD
...: ::. .: ::: : . .: : .: : ::.:.::.:.:: :::.:::::::
NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
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290 300
pF1KE5 MKTAIRQLRKWDAHSSVKF
.. :...: :.
NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 786; 40.2% identity (74.3% similar) in 296 aa overlap (2-294:9-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
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pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQH-RPLDKSSKALST
: :..:::.:: .. ....: :: . : :...:: :. :: . . . .::. :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 LTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSL--DKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300
pF1KE5 IRQLRKWDAHSSVKF
..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 780 init1: 602 opt: 786 Z-score: 726.1 bits: 142.5 E(85289): 1.1e-33
Smith-Waterman score: 786; 40.2% identity (74.3% similar) in 296 aa overlap (2-294:9-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQH-RPLDKSSKALST
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSL--DKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 IRQLRKWDAHSSVKF
..:
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 780 init1: 602 opt: 786 Z-score: 726.1 bits: 142.5 E(85289): 1.1e-33
Smith-Waterman score: 786; 40.2% identity (74.3% similar) in 296 aa overlap (2-294:9-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQH-RPLDKSSKALST
: :..:::.:: .. ....: :: . : :...:: :. :: . . . .::. :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 LTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSL--DKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 IRQLRKWDAHSSVKF
..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 780 init1: 559 opt: 785 Z-score: 725.2 bits: 142.3 E(85289): 1.2e-33
Smith-Waterman score: 785; 40.5% identity (72.6% similar) in 296 aa overlap (3-294:10-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
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pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
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pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
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pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLD--IMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALS
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSY-IVRAVLQIRSASGRQKAFG
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pF1KE5 TLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDK--FLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKT
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NP_001 TCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKG
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pF1KE5 AIRQLRKWDAHSSVKF
:. .:
NP_001 ALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 779; 38.9% identity (72.8% similar) in 298 aa overlap (2-296:10-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPM
.: ::.::.:: .. :: .:.:.: . :: ... . :::::.::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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pF1KE5 YFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMG
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE5 FDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KE5 DLPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKS-SKALS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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pF1KE5 TLTAHITVVLLFFGPCVFIY--AWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKT
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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290 300
pF1KE5 AIRQLRKWDAHSSVKF
:...:.:
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 765 init1: 538 opt: 766 Z-score: 708.3 bits: 139.2 E(85289): 1e-32
Smith-Waterman score: 766; 39.1% identity (72.8% similar) in 294 aa overlap (2-294:9-302)
10 20 30 40 50
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISY-TIILMTIQHRPLDKSSKALST
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NP_003 KVATRNFP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]