FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5380, 305 aa
1>>>pF1KE5380 305 - 305 aa - 305 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7759+/-0.00125; mu= 12.7589+/- 0.073
mean_var=167.4353+/-55.392, 0's: 0 Z-trim(102.8): 404 B-trim: 794 in 2/44
Lambda= 0.099118
statistics sampled from 6583 (7107) to 6583 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 2004 299.5 2e-81
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CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1994 298.1 5.5e-81
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1274 195.2 5.8e-50
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1269 194.5 8.9e-50
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1244 190.9 1.1e-48
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CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1230 188.9 4.3e-48
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1225 188.2 6.9e-48
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1225 188.2 7.4e-48
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1217 187.0 1.6e-47
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1215 186.7 1.9e-47
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1211 186.2 2.8e-47
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1211 186.2 2.8e-47
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1211 186.2 2.8e-47
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1208 185.7 3.8e-47
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1178 181.4 7.4e-46
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1155 178.2 7.3e-45
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1107 171.3 8.4e-43
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CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1085 168.1 7.4e-42
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1082 167.7 1e-41
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1070 166.0 3.3e-41
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CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1034 160.9 1.2e-39
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1017 158.4 6.3e-39
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1015 158.1 7.7e-39
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1013 157.8 9.3e-39
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1012 157.7 1.1e-38
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1010 157.5 1.4e-38
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1008 157.2 1.6e-38
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1006 156.8 1.9e-38
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1003 156.4 2.5e-38
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1000 156.0 3.4e-38
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 999 155.8 3.7e-38
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 998 155.7 4.1e-38
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 993 155.0 6.8e-38
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 987 154.1 1.2e-37
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 985 153.9 1.5e-37
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 956 149.7 2.7e-36
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 901 141.8 6.2e-34
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 882 139.1 4.1e-33
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 879 138.7 5.5e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 878 138.6 6.2e-33
>>CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 (305 aa)
initn: 2004 init1: 2004 opt: 2004 Z-score: 1575.2 bits: 299.5 E(32554): 2e-81
Smith-Waterman score: 2004; 99.7% identity (99.7% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQLRKWDAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQLRKWDAH
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSVKF
:::::
CCDS32 SSVKF
>>CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 (305 aa)
initn: 1996 init1: 1996 opt: 1996 Z-score: 1569.0 bits: 298.4 E(32554): 4.5e-81
Smith-Waterman score: 1996; 99.3% identity (99.7% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS32 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKSSKALSTLTAHITVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQLRKWDAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS32 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRRLRKWDAH
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSVKF
:::::
CCDS32 SSVKF
>>CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 (305 aa)
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Smith-Waterman score: 1994; 99.3% identity (99.7% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
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pF1KE5 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
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pF1KE5 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVV
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pF1KE5 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQLRKWDAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQLRKWDAH
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSVKF
:::::
CCDS30 SSVKF
>>CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 (348 aa)
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Smith-Waterman score: 1274; 59.9% identity (88.4% similar) in 294 aa overlap (2-295:33-326)
10 20 30
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGI
::::..::::.:.::: :::. : ..: .:
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40 50 60 70 80 90
pF1KE5 VFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCL
..::.::..::.:::.::.::::::::::.::. ..: ..::::.::. .::.::: .::
CCDS32 LLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLANLSFIDVCVASFATPKMIADFLVERKTISFDACL
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100 110 120 130 140 150
pF1KE5 VQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVS
.:::..:.: :::::.:..:..:::.:::::::: :.: .:: .. ..: .::.:..:
CCDS32 AQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHTTS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 QLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISY
::::.:.:::::::.::::.:::: : :::: ::: ......:.:: :.. ::.::..::
CCDS32 QLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVVSY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVI
:.::.:...: . .:: :::::::::: ::::::.:::.::: :.:: :::::...
CCDS32 TVILVTVRNRSSASMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYTIF
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280 290 300
pF1KE5 TPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQLRKWDAHSSVKF
: .:::.:::::::..:.:. .:.
CCDS32 TLILNPVIYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
310 320 330 340
>>CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 (311 aa)
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Smith-Waterman score: 1269; 60.1% identity (85.4% similar) in 301 aa overlap (1-301:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
::.::..::::.: :: :.: .: . : :.::.::.. . ::::.::::
CCDS32 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
:::.:::.::. :. ..:::..::: .::.:::.::..:::.:: : ::::..:.::..
CCDS32 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIERKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
::.:::::::::.::: :: .....:..: :::::.:::.: ::::::::::::.::
CCDS32 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTL
:: ::.::: :::...::...:::.... :. :::::::::. .. : . ::::::::
CCDS32 LPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQ
:::::::.::::::...: ::: .::::.:::.: :::::::::.:::.:.:.:. .
CCDS32 TAHITVVILFFGPCIYFYIWPFSRLPVDKFLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWK
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 LRKWDAHSSVKF
::. ..:
CCDS32 LRNRHVNSWKN
310
>>CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 (323 aa)
initn: 1261 init1: 1236 opt: 1244 Z-score: 987.6 bits: 190.9 E(32554): 1.1e-48
Smith-Waterman score: 1244; 57.1% identity (88.1% similar) in 294 aa overlap (1-294:8-301)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
.:.::..::: .::.:: : : .: :.: ::.:::::..::.::. ::::::
CCDS32 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
:::.:::..:. .: ..::::.::.: ...:::.::..:::..:.: :.:::.:..:..
CCDS32 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
70 80 90 100 110 120
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300
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.
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.:.
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310
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