Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5379
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5379, 305 aa
1>>>pF1KE5379 305 - 305 aa - 305 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7544+/-0.0013; mu= 13.0655+/- 0.076
mean_var=184.4417+/-68.344, 0's: 0 Z-trim(101.4): 377 B-trim: 386 in 1/44
Lambda= 0.094438
statistics sampled from 6043 (6489) to 6043 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.535), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 2.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 2010 287.3 1e-77
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1208 178.0 8.1e-45
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1204 177.4 1.2e-44
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1196 176.4 2.5e-44
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1195 176.3 3e-44
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1184 174.7 7.8e-44
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1171 173.0 2.7e-43
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1164 172.0 5.1e-43
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1162 171.7 6.2e-43
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1157 171.1 1e-42
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1154 170.7 1.4e-42
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1139 168.6 5.4e-42
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 1118 165.7 4e-41
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1109 164.5 9.3e-41
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1105 164.0 1.4e-40
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1080 160.6 1.4e-39
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1072 159.5 3.1e-39
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1036 154.6 9.2e-38
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1036 154.6 9.3e-38
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 1036 154.6 9.4e-38
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1031 153.9 1.5e-37
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1015 151.7 6.7e-37
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1013 151.4 8e-37
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1007 150.6 1.4e-36
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1005 150.3 1.7e-36
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1003 150.1 2e-36
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 995 149.0 4.4e-36
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 994 148.9 4.9e-36
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 989 148.2 7.8e-36
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 987 147.9 9.4e-36
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 986 147.7 1e-35
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 983 147.3 1.4e-35
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 976 146.5 2.8e-35
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 974 146.2 3.4e-35
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 971 145.7 4.2e-35
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 965 144.9 7.5e-35
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 958 143.9 1.5e-34
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 958 143.9 1.5e-34
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 958 143.9 1.5e-34
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 955 143.5 1.9e-34
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 946 142.3 4.5e-34
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 943 141.9 6e-34
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 938 141.2 9.8e-34
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 929 140.0 2.2e-33
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 922 139.0 4.3e-33
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 913 137.8 1e-32
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 897 135.6 4.6e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 880 133.3 2.3e-31
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 859 130.4 1.7e-30
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 856 130.0 2.2e-30
>>CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 2010 init1: 2010 opt: 2010 Z-score: 1508.7 bits: 287.3 E(32554): 1e-77
Smith-Waterman score: 2010; 99.7% identity (99.7% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVATNNVTEIIFVGFSQNWSEQRVISVMFLLMYTAVVLGNGLIVVTILASKVLTSPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MVATNNVTEIIFVGFSQNWSEQRVISVMFLLMYTAVVLGNGLIVVTILASKVLTSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSYLSFVEICYCSVMAPKLIFDSFIKRKVISLKGCLTQMFSLHFFGGTEAFLLMVMAYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSYLSFVEICYCSVMAPKLIFDSFIKRKVISLKGCLTQMFSLHFFGGTEAFLLMVMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYMAIMNQRMCGLLVGIAWGGGLLHSVGQTFLIFQLPFCGPNIMDHYFCDVH
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YVAICKPLHYMAIMNQRMCGLLVRIAWGGGLLHSVGQTFLIFQLPFCGPNIMDHYFCDVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PVLELACADTFFISLLIITNGGSISVVSFFVLMASYLIILHFLRSHNLEGQHKALSTCAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PVLELACADTFFISLLIITNGGSISVVSFFVLMASYLIILHFLRSHNLEGQHKALSTCAS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HVTVVDLFFIPCSLVYIRPCVTLPADKIVAVFYTVVTPLLNPVIYSFRNAEVKNAMRRFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HVTVVDLFFIPCSLVYIRPCVTLPADKIVAVFYTVVTPLLNPVIYSFRNAEVKNAMRRFI
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GGKVI
:::::
CCDS31 GGKVI
>>CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1220 init1: 1193 opt: 1208 Z-score: 918.1 bits: 178.0 E(32554): 8.1e-45
Smith-Waterman score: 1208; 58.4% identity (84.8% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVATNNVTEIIFVGFSQNWSEQRVISVMFLLMYTAVVLGNGLIVVTILASKVLTSPMYFF
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CCDS31 MASTSNVTELIFTGLFQDPAVQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSYLSFVEICYCSVMAPKLIFDSFIKRKVISLKGCLTQMFSLHFFGGTEAFLLMVMAYDR
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CCDS31 LSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMAYDC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYMAIMNQRMCGLLVGIAWGGGLLHSVGQTFLIFQLPFCGPNIMDHYFCDVH
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CCDS31 YVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYFCDLQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PVLELACADTFFISLLIITNGGSISVVSFFVLMASYLIILHFLRSHNLEGQHKALSTCAS
:...:::.:::. ......:.: .:: ::..:..::..:: ::.:. ::.:::::::::
CCDS31 PLFKLACTDTFMEGVIVLANSGLFSVFSFLILVSSYIVILVNLRNHSAEGRHKALSTCAS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HVTVVDLFFIPCSLVYIRPCVTLPADKIVAVFYTVVTPLLNPVIYSFRNAEVKNAMRRFI
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CCDS31 HITVVILFFGPAIFLYMRPSSTFTEDKLVAVFYTVITPMLNPIIYTLRNAEVKIAIRRLW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GGKVI
. :
CCDS31 SKKENPGRE
>>CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1220 init1: 1200 opt: 1204 Z-score: 915.2 bits: 177.4 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 1204; 55.1% identity (85.2% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVATNNVTEIIFVGFSQNWSEQRVISVMFLLMYTAVVLGNGLIVVTILASKVLTSPMYFF
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CCDS73 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
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pF1KE5 LSYLSFVEICYCSVMAPKLIFDSFIKRKVISLKGCLTQMFSLHFFGGTEAFLLMVMAYDR
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CCDS73 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
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pF1KE5 YVAICKPLHYMAIMNQRMCGLLVGIAWGGGLLHSVGQTFLIFQLPFCGPNIMDHYFCDVH
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CCDS73 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PVLELACADTFFISLLIITNGGSISVVSFFVLMASYLIILHFLRSHNLEGQHKALSTCAS
:.:.:::.:: .. :.: .:.: : ...: .:..::..:: ::.:.::..:::::::.:
CCDS73 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HVTVVDLFFIPCSLVYIRPCVTLPADKIVAVFYTVVTPLLNPVIYSFRNAEVKNAMRRFI
:.::: :::.:: .::.:: .::: :: ::.:::..::.:::.::...::..:::.:..
CCDS73 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GGKVI
. : :
CCDS73 SRKDISGDK
>>CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1194 init1: 1194 opt: 1196 Z-score: 909.3 bits: 176.4 E(32554): 2.5e-44
Smith-Waterman score: 1196; 55.9% identity (82.9% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVATNNVTEIIFVGFSQNWSEQRVISVMFLLMYTAVVLGNGLIVVTILASKVLTSPMYFF
: :::::.:: :.::. ..: :.: ..: ..::: ::..:. :... ::::::
CCDS31 MEKINNVTEFIFWGLSQSPEIEKVCFVVFSFFYIIILLGNLLIMLTVCLSNLFKSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSYLSFVEICYCSVMAPKLIFDSFIKRKVISLKGCLTQMFSLHFFGGTEAFLLMVMAYDR
::.::::.::: :: :::.: : . : :.:: ::. :.:..:::: :: :.: ::::::
CCDS31 LSFLSFVDICYSSVTAPKMIVDLLAKDKTISYVGCMLQLFGVHFFGCTEIFILTVMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYMAIMNQRMCGLLVGIAWGGGLLHSVGQTFLIFQLPFCGPNIMDHYFCDVH
:::::::::::.:::.. :. .. .: ::.:::. :. :. :::::::: .::::::::
CCDS31 YVAICKPLHYMTIMNRETCNKMLLGTWVGGFLHSIIQVALVVQLPFCGPNEIDHYFCDVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PVLELACADTFFISLLIITNGGSISVVSFFVLMASYLIILHFLRSHNLEGQHKALSTCAS
:::.:::..:....... .:.:.:.. :: .:. :: ::: ::... ::..::::::.:
CCDS31 PVLKLACTETYIVGVVVTANSGTIALGSFVILLISYSIILVSLRKQSAEGRRKALSTCGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HVTVVDLFFIPCSLVYIRPCVTLPADKIVAVFYTVVTPLLNPVIYSFRNAEVKNAMRRFI
:...: .:: ::...:.:: .:. ::.::::::..::.:::.::..:::::::::...
CCDS31 HIAMVVIFFGPCTFMYMRPDTTFSEDKMVAVFYTIITPMLNPLIYTLRNAEVKNAMKKLW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GGKVI
: .:
CCDS31 GRNVFLEAKGK
310
>>CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 (370 aa)
initn: 1102 init1: 1073 opt: 1195 Z-score: 907.8 bits: 176.3 E(32554): 3e-44
Smith-Waterman score: 1195; 56.0% identity (86.0% similar) in 293 aa overlap (7-298:61-353)
10 20 30
pF1KE5 MVATNNVTEIIFVGFSQNWSEQRVISVMFLLMYTAV
:::....:.::: . :... :.::..: :.
CCDS31 QIFLCPNCRLYMIPVGAFIFSLGNMQNQSFVTEFVLLGLSQNPNVQEIVFVVFLFVYIAT
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 VLGNGLIVVTILASK-VLTSPMYFFLSYLSFVEICYCSVMAPKLIFDSFIKRKVISLKGC
: :: :::::::.: .:.:::::::..:::.. :. ::..::.: ::. :.::..::
CCDS31 VGGNMLIVVTILSSPALLVSPMYFFLGFLSFLDACFSSVITPKMIVDSLYVTKTISFEGC
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 LTQMFSLHFFGGTEAFLLMVMAYDRYVAICKPLHYMAIMNQRMCGLLVGIAWGGGLLHSV
. :.:. :::.:.:...: .::::::::::::::: .:::.:.::.:.:.:: ::::::.
CCDS31 MMQLFAEHFFAGVEVIVLTAMAYDRYVAICKPLHYSSIMNRRLCGILMGVAWTGGLLHSM
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 GQTFLIFQLPFCGPNIMDHYFCDVHPVLELACADTFFISLLIITNGGSISVVSFFVLMAS
: .. :::::::::...:..::..:.:::::.:: ...:... :.: : ...: .:..:
CCDS31 IQILFTFQLPFCGPNVINHFMCDLYPLLELACTDTHIFGLMVVINSGFICIINFSLLLVS
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 YLIILHFLRSHNLEGQHKALSTCASHVTVVDLFFIPCSLVYIRPCVTLPADKIVAVFYTV
: .:: ::.:. ::. ::::::.::..:: :::.:: .:: :: .. ::..:.:: .
CCDS31 YAVILLSLRTHSSEGRWKALSTCGSHIAVVILFFVPCIFVYTRPPSAFSLDKMAAIFYII
280 290 300 310 320 330
280 290 300
pF1KE5 VTPLLNPVIYSFRNAEVKNAMRRFIGGKVI
..:::::.::.::: :::.::::
CCDS31 LNPLLNPLIYTFRNKEVKQAMRRIWNRLMVVSDEKENIKL
340 350 360 370
>>CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1200 init1: 1177 opt: 1184 Z-score: 900.5 bits: 174.7 E(32554): 7.8e-44
Smith-Waterman score: 1184; 56.5% identity (83.6% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVATNNVTEIIFVGFSQNWSEQRVISVMFLLMYTAVVLGNGLIVVTILASKVLTSPMYFF
: : :::::... :. .. :.. :.:.:... .:::: :...:: : :.: ::::::
CCDS31 MGAKNNVTEFVLFGLFESREMQHTCFVVFFLFHVLTVLGNLLVIITINARKTLKSPMYFF
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]