FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5377, 304 aa
1>>>pF1KE5377 304 - 304 aa - 304 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2675+/-0.000599; mu= 16.7417+/- 0.037
mean_var=128.4588+/-37.425, 0's: 0 Z-trim(107.1): 369 B-trim: 954 in 1/45
Lambda= 0.113160
statistics sampled from 14666 (15182) to 14666 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.49), E-opt: 0.2 (0.178), width: 16
Scan time: 6.430
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 943 166.1 7.8e-41
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 851 151.1 2.6e-36
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 843 149.8 6.5e-36
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 840 149.3 9.1e-36
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 816 145.4 1.4e-34
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XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 799 142.6 9.5e-34
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 783 140.0 5.8e-33
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 776 138.9 1.3e-32
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NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 761 136.4 6.9e-32
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 752 134.9 1.9e-31
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 749 134.4 2.6e-31
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 749 134.5 2.7e-31
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 739 132.8 8.4e-31
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 718 129.4 9e-30
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 705 127.3 4e-29
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 544 101.0 3.2e-21
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 474 89.6 9e-18
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 234 50.4 5.8e-06
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 234 50.4 5.9e-06
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 218 47.8 3.6e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 201 45.0 0.00024
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 202 45.4 0.00027
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NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 199 44.8 0.00034
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 197 44.3 0.00036
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 197 44.4 0.00039
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 197 44.5 0.00044
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 193 43.8 0.0006
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 190 43.4 0.001
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NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 187 42.8 0.0012
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 186 42.7 0.0014
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 186 42.7 0.0015
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 185 42.5 0.0015
XP_011531136 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 183 42.2 0.002
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XP_006712078 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 389) 183 42.2 0.002
XP_011531133 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 183 42.3 0.0023
XP_016859579 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 183 42.3 0.0023
XP_016859578 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 614) 183 42.5 0.0026
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NP_000224 (OMIM: 152790,176410,238320) lutropin-ch ( 699) 183 42.5 0.0029
NP_444508 (OMIM: 606927) trace amine-associated re ( 342) 178 41.3 0.0033
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NP_000729 (OMIM: 118510) muscarinic acetylcholine ( 460) 179 41.6 0.0035
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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pF1KE5 RLCI
::
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300
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
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NP_001 CSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAG
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pF1KE5 IKKRLCI
:.:
NP_001 IRKVFAFLKH
300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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pF1KE5 CDLPLVIKLACKDTYILQLLVIADSGLLSLVCFLLLLVSYGVIIFSV-RYRAASRSSKAF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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:: ..:.: ::.. . .::: : :: .:::.::::::: :.:::.::.::::.::
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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pF1KE5 AAIKKRLCI
: .: :
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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pF1KE5 IKKRLCI
.
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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:. :::.:.:.:::: ..: :: : ..:.. ::..:. . .: . .:.:: .: :
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pF1KE5 KAAIKKRLCI
..:.:.
NP_001 RGAVKRLMGWE
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>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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pF1KE5 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLGFSVVFVGIVLGNLLILVTVTFDSLLHTPM
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::.::::: ::. : ..:::. ..:.:..::.. :: :.:.. .: :: :..:::
NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE5 IDRYVAICKPLHYMTIMSPRVLTGLLLSSYAVGFVHSSSQMAFMLTLPFCGPNVIDSFFC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DLPLVIKLACKDTYILQLLVIADSGLLSLVCFLLLLVSYGVIIFSV-RYRAASRSSKAFS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TLSAHITVVTLFFAPCVFIYVWPFS--RYSVDKILSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNKEVKA
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 AIK---KRLCI
:.: :: :
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLGFSVVFVGIVLGNLLILVTVTFDSLLHTPMY
: :.. ::::::::::.. . .. .:. : :..: :::: ::.. . .:: ::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLSNLSCIDMILASFATPKMIVDFLRERKTISWWGCYSQMFFMHLLGGSEMMLLVAMAI
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICKPLHYMTIMSPRVLTGLLLSSYAVGFVHSSSQMAFMLTLPFCGPNVIDSFFCD
:::::.: :.: .:: . . : ..:.. ::. : : :. . ::.: . :: . :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 LPLVIKLACKDTYILQLLVIADSGLLSLVCFLLLLVSYGVIIFSVRYRAASRSS--KAFS
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSY-IQIISTILKIQSREGRKKAFH
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pF1KE5 TLSAHITVVTLFFAPCVFIYVWPFSRYSV--DKILSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNKEVKA
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
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300
pF1KE5 AIKKRLCI
: .: :
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 799; 43.8% identity (72.5% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLGFSVVFVGIVLGNLLILVTVTFDSLLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLSNLSCIDMILASFATPKMIVDFLRERKTISWWGCYSQMFFMHLLGGSEMMLLVAMAI
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICKPLHYMTIMSPRVLTGLLLSSYAVGFVHSSSQMAFMLTLPFCGPNVIDSFFCD
:::::.: :.: .:: . . : ..:.. ::. : : :. . ::.: . :: . :.
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSY-IQIISTILKIQSREGRKKAFH
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NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
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300
pF1KE5 AIKKRLCI
: .: :
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLGFSVVFVGIVLGNLLILVTVTFDSLLHTPMY
: :.. ::::::::::.. . .. .:. : :..: :::: ::.. . .:: ::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLSNLSCIDMILASFATPKMIVDFLRERKTISWWGCYSQMFFMHLLGGSEMMLLVAMAI
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICKPLHYMTIMSPRVLTGLLLSSYAVGFVHSSSQMAFMLTLPFCGPNVIDSFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 LPLVIKLACKDTYILQLLVIADSGLLSLVCFLLLLVSYGVIIFSVRYRAASRSS--KAFS
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSY-IQIISTILKIQSREGRKKAFH
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TLSAHITVVTLFFAPCVFIYVWPFSRYSV--DKILSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNKEVKA
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
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pF1KE5 AIKKRLCI
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XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 770 init1: 535 opt: 783 Z-score: 712.8 bits: 140.0 E(85289): 5.8e-33
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pF1KE5 MERANHSVVSEFILLGLSK-SQNLQILFFLGFSVVFVGIVLGNLLILVTVTFDSLLHTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 TLSAHITVVTLFFAPCVFIYVWPFSRYSVD--KILSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNKEVKA
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pF1KE5 AIKKRLCI
:...
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
304 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 00:12:03 2016 done: Tue Nov 8 00:12:04 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]