Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5375
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5375, 303 aa
1>>>pF1KE5375 303 - 303 aa - 303 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7368+/-0.000507; mu= 19.2895+/- 0.031
mean_var=95.5283+/-24.155, 0's: 0 Z-trim(108.0): 225 B-trim: 968 in 1/52
Lambda= 0.131222
statistics sampled from 15796 (16095) to 15796 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.527), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 5.650
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1163 231.1 2.1e-60
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 863 174.3 2.7e-43
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 863 174.3 2.7e-43
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 863 174.4 2.7e-43
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 827 167.5 3e-41
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 804 163.2 6.1e-40
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 773 157.3 3.6e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 771 156.9 4.6e-38
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 766 156.0 8.9e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 761 155.0 1.7e-37
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 761 155.0 1.7e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 761 155.0 1.7e-37
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 758 154.5 2.5e-37
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 755 153.9 3.8e-37
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 746 152.2 1.2e-36
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 744 151.8 1.6e-36
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 742 151.5 2.1e-36
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 705 144.4 2.7e-34
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 688 141.2 2.5e-33
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 668 137.4 3.4e-32
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 504 106.4 7.7e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 493 104.3 3.3e-22
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 184 46.0 0.00016
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 180 45.2 0.00025
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 180 45.2 0.00025
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 178 44.7 0.0003
NP_000789 (OMIM: 126453,143465,606798) D(1B) dopam ( 477) 178 44.9 0.00038
XP_016855650 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_016855647 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_011542345 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_016855641 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_016855643 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_016855642 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_011542346 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_011542349 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_016855648 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
NP_000731 (OMIM: 100100,118494) muscarinic acetylc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_011542343 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_011542347 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_011542348 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_016855652 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_016855646 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_016855644 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
XP_016855649 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 179 45.2 0.00038
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 177 44.6 0.00038
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 175 44.1 0.00044
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 175 44.3 0.00056
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1183 init1: 1163 opt: 1163 Z-score: 1205.4 bits: 231.1 E(85289): 2.1e-60
Smith-Waterman score: 1163; 57.7% identity (84.0% similar) in 293 aa overlap (1-293:7-299)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTEFIFLVLSPNQEVQRVCFVIFLFLYTAIVLGNFLIVLTVMTSRSLGSPMYFF
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LSYLSFMEICYSSATAPKLISDLLAERKVISWWGCMAQLFFLHFFGGTEIFLLTVMAYDH
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
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pF1KE5 YVAICKPLSYTTIMNWQVCTVLVGIAWVGGFMHSFAQILLIFHLLFCGPNVINHYFCDLV
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PLLKLACSDTFLIGLLIVANGGTLSVISFGVLLASYMVILLHLRTWSSEGWCKALSTCGS
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NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 HFAVVILFFGPCVFNSLRPSTTLPIDKMVAVFYTVITAILNPVIYSLRNAEMRKAMKRLW
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NP_001 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 IRTLRLNEK
NP_001 SRKDISGDK
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MTEFIFLVLSPNQEVQRVCFVIFLFLYTAIVLGNFLIVLTVMTSRSLGSPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 DHYVAICKPLSYTTIMNWQVCTVLVGIAWVGGFMHSFAQILLIFHLLFCGPNVINHYFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 LVPLLKLACSDTFLIGLLIVANGGTLSVISFGVLLASYMVILLH-LRTWSSEGWCKALST
..:::::.:::: : ..:...:. . . : .::::: : :.. :..: ::.::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280
pF1KE5 CGSHFAVVILFFGPCV---FNSLRPSTTLPIDKMVAVFYTVITAILNPVIYSLRNAEMRK
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLS-SHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
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290 300
pF1KE5 AMKRLWIRTLRLNEK
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NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 863; 45.4% identity (75.2% similar) in 302 aa overlap (1-298:9-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTEFIFLVLSPNQEVQRVCFVIFLFLYTAIVLGNFLIVLTVMTSRSLGSPMY
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pF1KE5 FFLSYLSFMEICYSSATAPKLISDLLAERKVISWWGCMAQLFFLHFFGGTEIFLLTVMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DHYVAICKPLSYTTIMNWQVCTVLVGIAWVGGFMHSFAQILLIFHLLFCGPNVINHYFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 LVPLLKLACSDTFLIGLLIVANGGTLSVISFGVLLASYMVILLH-LRTWSSEGWCKALST
..:::::.:::: : ..:...:. . . : .::::: : :.. :..: ::.::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CGSHFAVVILFFGPCV---FNSLRPSTTLPIDKMVAVFYTVITAILNPVIYSLRNAEMRK
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLS-SHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
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290 300
pF1KE5 AMKRLWIRTLRLNEK
:.:.. :..
XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 846 init1: 657 opt: 863 Z-score: 898.2 bits: 174.4 E(85289): 2.7e-43
Smith-Waterman score: 863; 45.4% identity (75.2% similar) in 302 aa overlap (1-298:19-319)
10 20 30 40
pF1KE5 MTEFIFLVLSPNQEVQRVCFVIFLFLYTAIVLGNFLIVLTVM
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 TSRSLGSPMYFFLSYLSFMEICYSSATAPKLISDLLAERKVISWWGCMAQLFFLHFFGGT
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 PNVINHYFCDLVPLLKLACSDTFLIGLLIVANGGTLSVISFGVLLASYMVILLH-LRTWS
:.:.:.:::..:::::.:::: : ..:...:. . . : .::::: : :.. :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KE5 SEGWCKALSTCGSHFAVVILFFGPCV---FNSLRPSTTLPIDKMVAVFYTVITAILNPVI
..: ::.::::::.:::.::.. . :: : : . : :..:.:::.: .::: :
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLS-SHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFI
250 260 270 280 290
280 290 300
pF1KE5 YSLRNAEMRKAMKRLWIRTLRLNEK
::::: .. :.:.. :..
XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 824 init1: 648 opt: 827 Z-score: 861.5 bits: 167.5 E(85289): 3e-41
Smith-Waterman score: 827; 43.2% identity (72.0% similar) in 296 aa overlap (1-293:11-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTEFIFLVLSPNQEVQRVCFVIFLFLYTAIVLGNFLIVLTVMTSRSLGSP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 MYFFLSYLSFMEICYSSATAPKLISDLLAERKVISWWGCMAQLFFLHFFGGTEIFLLTVM
:::::: :::...:: : .::.. ..:.: : ::..:: :..:. :. :: :.:..:
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pF1KE5 AYDHYVAICKPLSYTTIMNWQVCTVLVGIAWVGGFMHSFAQILLIFHLLFCGPNVINHYF
:::.:::::.:: ::..:. .: :. ....:: : :... . : : .: :::::.:
NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDLVPLLKLACSDTFLIGLLIVANGGTLSVISFGVLLASYMVILLH-LRTWSSEGWCKAL
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KE5 STCGSHFAVVILFFGPCVFNSLRPSTTL-P-IDKMVAVFYTVITAILNPVIYSLRNAEMR
:::.::.. : .. : .: ::: : ::...::::.. .:::.:::::: ...
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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290 300
pF1KE5 KAMKRLWIRTLRLNEK
: ...
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 826 init1: 567 opt: 804 Z-score: 838.0 bits: 163.2 E(85289): 6.1e-40
Smith-Waterman score: 804; 41.6% identity (75.8% similar) in 293 aa overlap (1-290:9-301)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTEFIFLVLSPNQEVQRVCFVIFLFLYTAIVLGNFLIVLTVMTSRSLGSPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSYLSFMEICYSSATAPKLISDLLAERKVISWWGCMAQLFFLHFFGGTEIFLLTVMAY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DHYVAICKPLSYTTIMNWQVCTVLVGIAWVGGFMHSFAQILLIFHLLFCGPNVINHYFCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LVPLLKLACSDTFLIGLLIVANGGTLSVISFGVLLASYMVILLHLRTW-SSEGWCKALST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE5 CGSHFAVVILFFGPCVFNSLRPSTTLPI--DKMVAVFYTVITAILNPVIYSLRNAEMRKA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
290 300
pF1KE5 MKRLWIRTLRLNEK
.
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 774 init1: 605 opt: 773 Z-score: 806.3 bits: 157.3 E(85289): 3.6e-38
Smith-Waterman score: 773; 43.1% identity (72.2% similar) in 299 aa overlap (1-296:9-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTEFIFLVLSPNQEVQRVCFVIFLFLYTAIVLGNFLIVLTVMTSRSLGSPMY
...:..: :: . :.: : : .:: .: . ::::.::.:.: .. : .:::
NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSYLSFMEICYSSATAPKLISDLLAERKVISWWGCMAQLFFLHFFGGTEIFLLTVMAY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DHYVAICKPLSYTTIMNWQVCTVLVGIAWVGGFMHSFAQILLIFHLLFCGPNVINHYFCD
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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pF1KE5 LVPLLKLACSDTFLIGLLIVANGGTLSVISFGVLLASYMVILLHLRTWSS-EGWCKALST
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
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240 250 260 270 280
pF1KE5 CGSHFAVVILFFGPC--VFNSLRPSTTLPIDKMVAVFYTVITAILNPVIYSLRNAEMRKA
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
290 300
pF1KE5 MKRLWIRTLRLNEK
..:: :
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 772 init1: 553 opt: 771 Z-score: 804.3 bits: 156.9 E(85289): 4.6e-38
Smith-Waterman score: 771; 39.1% identity (76.1% similar) in 297 aa overlap (1-294:6-302)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTEFIFLVLSPNQEVQRVCFVIFLFLYTAIVLGNFLIVLTVMTSRSLGSPMYFFL
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVFL
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 SYLSFMEICYSSATAPKLISDLLAERKVISWWGCMAQLFFLHFFGGTEIFLLTVMAYDHY
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NP_001 LTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDRY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 VAICKPLSYTTIMNWQVCTVLVGIAWVGGFMHSFAQILLIFHLLFCGPNVINHYFCDLVP
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NP_001 VAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEIPP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LLKLACSDTFLIGLLIVANGGTLSVISFGVLLASY-MVILLHLRTWSSEGWCKALSTCGS
:: :.:: . . ... . ::.. .: . :: ..:. :: . :: ::.:::.:
NP_001 LLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTCSS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 HFAVVILFFGPCVFNSLRPST--TLPIDKMVAVFYTVITAILNPVIYSLRNAEMRKAMKR
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NP_001 HLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGIRK
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 LWIRTLRLNEK
..
NP_001 VFAFLKH
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 766; 42.0% identity (71.7% similar) in 300 aa overlap (1-296:10-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTEFIFLVLSPNQEVQRVCFVIFLFLYTAIVLGNF-LIVLTVMTSRSLGSP
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSH-LHTP
10 20 30 40 50
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pF1KE5 MYFFLSYLSFMEICYSSATAPKLISDLLAERKVISWWGCMAQLFFLHFFGGTEIFLLTVM
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NP_001 MYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAM
60 70 80 90 100 110
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pF1KE5 AYDHYVAICKPLSYTTIMNWQVCTVLVGIAWVGGFMHSFAQILLIFHLLFCGPNVINHYF
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NP_001 AYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 CDLVPLLKLACSDTFLIGLLIVANGGTLSVISFGVLLASYMVILLH-LRTWSSEGWCKAL
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NP_001 CDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAF
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 STCGSHFAVVILFFGPCVFNSLRPST--TLPIDKMVAVFYTVITAILNPVIYSLRNAEMR
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NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE5 KAMKRLWIRTLRLNEK
:.::: :
NP_001 DALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 760 init1: 551 opt: 761 Z-score: 794.0 bits: 155.0 E(85289): 1.7e-37
Smith-Waterman score: 761; 40.6% identity (71.8% similar) in 298 aa overlap (1-294:9-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTEFIFLVLSPNQEVQRVCFVIFLFLYTAIVLGNFLIVLTVMTSRSLGSPMY
..:::.: :: . ... ::.:: .:.. :::: :::: . . : .:::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSYLSFMEICYSSATAPKLISDLLAERKVISWWGCMAQLFFLHFFGGTEIFLLTVMAY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DHYVAICKPLSYTTIMNWQVCTVLVGIAWVGGFMHSFAQILLIFHLLFCGPNVINHYFCD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 LVPLLKLACSDTFLIGLLIVANGGTLSVISFGVLLASYM-VILLHLRTWSSEGWCKALST
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]