Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5374
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5374, 299 aa
1>>>pF1KE5374 299 - 299 aa - 299 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1766+/-0.00052; mu= 16.3004+/- 0.032
mean_var=69.7161+/-15.374, 0's: 0 Z-trim(106.6): 95 B-trim: 896 in 2/49
Lambda= 0.153606
statistics sampled from 14588 (14670) to 14588 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.494), E-opt: 0.2 (0.172), width: 16
Scan time: 5.790
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 1937 438.9 5.7e-123
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 1373 313.9 2.5e-85
XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1339 306.4 4.4e-83
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 1339 306.4 4.4e-83
XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1339 306.4 4.4e-83
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 1338 306.2 5.3e-83
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 1333 305.1 1.2e-82
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 1328 304.0 2.5e-82
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 1264 289.8 4.6e-78
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 1258 288.4 1.1e-77
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 816 190.5 3.5e-48
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 774 181.2 2.3e-45
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 618 146.6 5.8e-35
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 609 144.6 2.3e-34
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 600 142.6 9.1e-34
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 543 130.0 5.8e-30
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 522 125.4 1.4e-28
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 520 124.9 2e-28
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 457 111.0 3.1e-24
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 412 101.0 3.1e-21
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 373 92.3 1.2e-18
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 342 85.5 1.4e-16
NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 328 82.3 1.2e-15
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 317 79.9 7e-15
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 311 78.6 1.8e-14
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 264 68.2 2.5e-11
NP_001295396 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056
NP_001295398 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056
NP_001295400 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056
NP_001295405 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056
NP_001295394 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056
NP_001295399 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056
NP_001295397 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056
NP_065110 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene rec ( 346) 139 40.5 0.0056
>>NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 1937 init1: 1937 opt: 1937 Z-score: 2328.7 bits: 438.9 E(85289): 5.7e-123
Smith-Waterman score: 1937; 100.0% identity (100.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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NP_795 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
250 260 270 280 290
>>NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1395 init1: 1366 opt: 1373 Z-score: 1653.0 bits: 313.9 E(85289): 2.5e-85
Smith-Waterman score: 1373; 70.5% identity (87.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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NP_795 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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NP_795 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
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NP_795 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
: ...::::.:::::.::::::::::::::::.:::: : :::::::::. ::::::::
NP_795 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
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NP_795 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
250 260 270 280 290 300
NP_795 VKGEKPSSS
>>XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste receptor (299 aa)
initn: 1357 init1: 1328 opt: 1339 Z-score: 1612.5 bits: 306.4 E(85289): 4.4e-83
Smith-Waterman score: 1339; 68.8% identity (87.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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XP_006 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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XP_006 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
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XP_006 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
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XP_006 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
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XP_006 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
>>NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 1357 init1: 1328 opt: 1339 Z-score: 1612.5 bits: 306.4 E(85289): 4.4e-83
Smith-Waterman score: 1339; 68.8% identity (87.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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NP_795 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
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NP_795 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
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NP_795 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
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NP_795 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
>>XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste receptor (299 aa)
initn: 1357 init1: 1328 opt: 1339 Z-score: 1612.5 bits: 306.4 E(85289): 4.4e-83
Smith-Waterman score: 1339; 68.8% identity (87.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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XP_003 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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XP_003 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
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XP_003 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
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XP_003 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
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XP_003 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
>>NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1351 init1: 1327 opt: 1338 Z-score: 1611.1 bits: 306.2 E(85289): 5.3e-83
Smith-Waterman score: 1338; 68.5% identity (87.2% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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NP_795 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
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NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
. ...::::.:.::..::::::::::::::::.:::: :::::::::::.:::::::::
NP_795 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
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NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
250 260 270 280 290 300
NP_795 VKGEKTSSP
>>NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 memb (319 aa)
initn: 1362 init1: 1333 opt: 1333 Z-score: 1604.9 bits: 305.1 E(85289): 1.2e-82
Smith-Waterman score: 1333; 68.8% identity (88.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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NP_001 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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NP_001 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
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NP_001 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
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NP_001 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
.:: .:.:: . ::...:: : .:. : . :::: .::::. :: .: ..:
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250 260 270 280 290 300
NP_001 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
310
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10 20 30 40 50 60
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: ::. :.:: ...::::.:::::::::::: :. :::.::: ::::::::::::.::::
NP_795 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
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pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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NP_795 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
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NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
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:: ...::::.:. ::.::::::::::::::::.:::: :::::::::::.: ::::::.
NP_795 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
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NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
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NP_795 VKGEKPSSP
>>NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 member (309 aa)
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Smith-Waterman score: 1264; 64.2% identity (86.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
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NP_795 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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NP_795 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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:::...::.:::.::.:.::::::.. . ..:.:: :::.: :.::::..::: :::.
NP_795 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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NP_795 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
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NP_795 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
250 260 270 280 290 300
NP_795 AKGQNQSTP
>>NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 member (299 aa)
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10 20 30 40 50 60
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NP_795 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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NP_795 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
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NP_795 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
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NP_795 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
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60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Tue Nov 8 00:11:26 2016 done: Tue Nov 8 00:11:27 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]