Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5374
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5374, 299 aa
1>>>pF1KE5374 299 - 299 aa - 299 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5301+/-0.00121; mu= 14.3274+/- 0.072
mean_var=71.3010+/-16.061, 0's: 0 Z-trim(100.9): 57 B-trim: 352 in 1/46
Lambda= 0.151889
statistics sampled from 6239 (6283) to 6239 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16
Scan time: 1.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 1937 434.1 6.3e-122
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 1373 310.5 1e-84
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 1338 302.8 2.1e-82
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 1333 301.7 4.6e-82
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 1328 300.6 9.6e-82
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 1264 286.6 1.6e-77
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 1258 285.3 3.9e-77
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 816 188.4 5.6e-48
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 774 179.2 3.4e-45
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 618 145.0 6.7e-35
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 609 143.1 2.6e-34
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 600 141.1 1e-33
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 543 128.6 5.9e-30
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 522 124.0 1.4e-28
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 520 123.6 2e-28
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 457 109.8 2.7e-24
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 412 99.9 2.5e-21
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 373 91.3 9.3e-19
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 354 87.2 1.8e-17
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 342 84.5 1e-16
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 328 81.5 8.4e-16
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 317 79.1 4.8e-15
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 311 77.8 1.2e-14
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 269 68.6 7.4e-12
>>CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 1937 init1: 1937 opt: 1937 Z-score: 2302.5 bits: 434.1 E(32554): 6.3e-122
Smith-Waterman score: 1937; 100.0% identity (100.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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CCDS86 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
250 260 270 280 290
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1395 init1: 1366 opt: 1373 Z-score: 1634.3 bits: 310.5 E(32554): 1e-84
Smith-Waterman score: 1373; 70.5% identity (87.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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CCDS53 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
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CCDS53 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
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CCDS53 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
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CCDS53 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
250 260 270 280 290 300
CCDS53 VKGEKPSSS
>>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1351 init1: 1327 opt: 1338 Z-score: 1592.9 bits: 302.8 E(32554): 2.1e-82
Smith-Waterman score: 1338; 68.5% identity (87.2% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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CCDS53 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
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CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
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CCDS53 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
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CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
250 260 270 280 290 300
CCDS53 VKGEKTSSP
>>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 (319 aa)
initn: 1362 init1: 1333 opt: 1333 Z-score: 1586.7 bits: 301.7 E(32554): 4.6e-82
Smith-Waterman score: 1333; 68.8% identity (88.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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CCDS53 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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CCDS53 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
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CCDS53 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
: .:.:.::.:::::.::::::::::::::::.:::: :::::::::::. ::::::::
CCDS53 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
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CCDS53 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
250 260 270 280 290 300
CCDS53 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
310
>>CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1345 init1: 1322 opt: 1328 Z-score: 1581.0 bits: 300.6 E(32554): 9.6e-82
Smith-Waterman score: 1328; 69.1% identity (87.2% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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CCDS53 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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CCDS53 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
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CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
:: ...::::.:. ::.::::::::::::::::.:::: :::::::::::.: ::::::.
CCDS53 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
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CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
250 260 270 280 290 300
CCDS53 VKGEKPSSP
>>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1283 init1: 1235 opt: 1264 Z-score: 1505.2 bits: 286.6 E(32554): 1.6e-77
Smith-Waterman score: 1264; 64.2% identity (86.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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CCDS86 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
..::.:: :::::. .... : :::.::::::.:::..:::::::::.::: :.: :
CCDS86 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
:::...::.:::.::.:.::::::.. . ..:.:: :::.: :.::::..::: :::.
CCDS86 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
: ..:::::.:::::.:: :::::::::::::.:::: :::.:::::::. :::.: ::
CCDS86 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
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CCDS86 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
250 260 270 280 290 300
CCDS86 AKGQNQSTP
>>CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 1266 init1: 1246 opt: 1258 Z-score: 1498.3 bits: 285.3 E(32554): 3.9e-77
Smith-Waterman score: 1258; 65.3% identity (86.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
:. :: :. :::.. ::::: ::::::::: ::::. .:::::.::::::.::::::::
CCDS86 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
..:. :: ::.: :.:..:.::.. :::.:::::::::::.:::: ::::::::::. ::
CCDS86 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
::.:..::.:::::: :.::.:.: : .::: .:..:::::.: :.::::..::: ::::
CCDS86 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
:: ..:::::::: ::.::::::::::::.::..:::: :::::::::::. :::.: ::
CCDS86 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
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CCDS86 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
250 260 270 280 290
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
initn: 789 init1: 285 opt: 816 Z-score: 974.8 bits: 188.4 E(32554): 5.6e-48
Smith-Waterman score: 816; 44.2% identity (75.4% similar) in 301 aa overlap (1-297:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
: . : .:...:.. :..::..::::.:.: ::::.....::.:..: ::.:::::.:
CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
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70 80 90 100 110
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]