Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5371
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5371, 299 aa
1>>>pF1KE5371 299 - 299 aa - 299 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3478+/-0.00125; mu= 15.5222+/- 0.074
mean_var=70.2938+/-14.750, 0's: 0 Z-trim(100.1): 53 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.152973
statistics sampled from 5950 (5982) to 5950 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.512), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 1.810
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 1882 424.9 3.6e-119
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 496 119.1 4.7e-27
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 473 114.0 1.5e-25
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CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 457 110.4 1.7e-24
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 442 107.1 1.7e-23
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 406 99.2 4.2e-21
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 398 97.4 1.4e-20
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 397 97.2 1.7e-20
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 380 93.4 2.2e-19
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 373 91.9 6.4e-19
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 372 91.7 7.4e-19
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 369 91.0 1.3e-18
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 360 89.0 4.8e-18
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 348 86.4 3e-17
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 343 85.3 6.2e-17
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 341 84.8 8.7e-17
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 340 84.6 1e-16
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 339 84.4 1.2e-16
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 335 83.5 2.2e-16
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 333 83.1 2.9e-16
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 322 80.6 1.6e-15
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 312 78.4 7.5e-15
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 287 72.9 3.2e-13
>>CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 (299 aa)
initn: 1882 init1: 1882 opt: 1882 Z-score: 2253.1 bits: 424.9 E(32554): 3.6e-119
Smith-Waterman score: 1882; 99.0% identity (99.7% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLRLFYSSAIIASVILNFVGIIMNLFITVVNCKTWVKSHRISSSDRILFSLGITRFLMLG
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MLRLFYFSAIIASVILNFVGIIMNLFITVVNCKTWVKSHRISSSDRILFSLGITRFLMLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLVNTIYFVSSNTERSVYLSAFFVLCFMFLDSSSLWFVTLLNILYCVKITNFQHSVFLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LFLVNTIYFVSSNTERSVYLSAFFVLCFMFLDSSSVWFVTLLNILYCVKITNFQHSVFLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRNISPKIPRLLLACVLISAFTTCLYITLSQASPFPELVTTRNNTSFNINEGILSLVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS58 LKRNISPKIPRLLLACVLISAFTTCLYITLSQASPFPELVTTRNNTSFNISEGILSLVVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LVLSSSLQFIINVTSASLLIHSLRRHIQKMQKNATGFWNPQTEAHVGAMKLMVYFLILYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LVLSSSLQFIINVTSASLLIHSLRRHIQKMQKNATGFWNPQTEAHVGAMKLMVYFLILYI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 PYSVATLVQYLPFYAGMDMGTKSICLIFATLYSPGHSVLIIITHPKLKTTAKKILCFKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PYSVATLVQYLPFYAGMDMGTKSICLIFATLYSPGHSVLIIITHPKLKTTAKKILCFKK
250 260 270 280 290
>>CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 (338 aa)
initn: 422 init1: 183 opt: 496 Z-score: 599.1 bits: 119.1 E(32554): 4.7e-27
Smith-Waterman score: 496; 33.9% identity (65.8% similar) in 298 aa overlap (5-294:32-325)
10 20 30
pF1KE5 MLRLFYSSAIIASVILNF-VGIIMNLFITVVNCK
: . :.: .. .. .::: : :: ...
CCDS47 LGRCFPPDTKEKQQLRMTKLCDPAESELSPFLITLILAVLLAEYLIGIIANGFIMAIHAA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 TWVKSHRISSSDRILFSLGITRFLMLGLFLVN-TIYFVSSN--TERSVYLSAFFVLCFMF
::... .:.: ::: :...:. . .:.... :: .: . .: .:: . : . :.:
CCDS47 EWVQNKAVSTSGRILVFLSVSRIALQSLMMLEITISSTSLSFYSEDAVYYA--FKISFIF
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KE5 LDSSSLWFVTLLNILYCVKITNFQHSVFLLLKRNISPKIPRLLLACVLISAFTT---CLY
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CCDS47 LNFCSLWFAAWLSFFYFVKIANFSYPLFLKLRWRITGLIPWLLWLSVFIS-FSHSMFCIN
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 I-TLSQASPFPELVTTRNNTSFNINEGILSLVVSLVLSSSLQFIINVTSASLLIHSLRRH
: :. . :: .. .. .. . ....:. . :. .:. . .:.::: ::.::
CCDS47 ICTVYCNNSFPIHSSNSTKKTYLSEINVVGLAFFFNLGIVTPLIMFILTATLLILSLKRH
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 IQKMQKNATGFWNPQTEAHVGAMKLMVYFLILYIPYSVATLVQYLPFYAGMDMGTKSICL
.: .:::: .:. :::.::.: . ::::::: .:: .. :: . .. ...:
CCDS47 TLHMGSNATGSNDPSMEAHMGAIKAISYFLILYIFNAVALFI-YLSNMFDINSLWNNLCQ
240 250 260 270 280 290
270 280 290
pF1KE5 IFATLYSPGHSVLIIITHPKLKTTAKKILCFKK
:. . : .::.:.: .: :. . :..
CCDS47 IIMAAYPASHSILLIQDNPGLRRAWKRLQLRLHLYPKEWTL
300 310 320 330
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
initn: 467 init1: 208 opt: 473 Z-score: 572.1 bits: 114.0 E(32554): 1.5e-25
Smith-Waterman score: 473; 34.8% identity (61.4% similar) in 290 aa overlap (19-295:19-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLRLFYSSAIIASVILNFVGIIMNLFITVVNCKTWVKSHRISSSDRILFSLGITRFLMLG
:::. : :: .::: :::...:.: : :: ::.:.:. .:
CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LFLVNTIYFV----SSNTERSVYLSAFFVLCFMFLDSSSLWFVTLLNILYCVKITNFQHS
..:.. . .: : . . . :: . . . :.::.: :.: : :: :: :
CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFF---WTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHP
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 VFLLLKRNISPKIPRLLLACVLISAFTTCLYITLSQASPFPELVTTRNNTSFN----INE
.:: .: :. : .::.::..:.: . : : . . : : .. .:... .:.
CCDS86 LFLWMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFIS-LPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 GI-LSLVVSLVLSSSLQFIINVTSASLLIHSLRRHIQKMQKNATGFWNPQTEAHVGAMKL
: . : :.. : : . . : ::: ::::::..:: .::: .:.::::: :.:
CCDS86 TQHASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE5 MVYFLILYIPYSVATLVQYLPFYAGMDMGTKSICLIF----ATLYSPGHSVLIIITHPKL
.. ::.:.: : .. :. .. : . .:: : .: .:: ..:. . ::
CCDS86 VISFLLLFIAYYLSFLIATSSYF----MPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKL
240 250 260 270 280 290
290
pF1KE5 KTTAKKILCFKK
. .. :..
CCDS86 RHASLKVIWKVMSILKGRKFQQHKQI
300 310
>>CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 (323 aa)
initn: 446 init1: 174 opt: 472 Z-score: 570.8 bits: 113.8 E(32554): 1.8e-25
Smith-Waterman score: 472; 31.1% identity (66.6% similar) in 293 aa overlap (10-293:22-309)
10 20 30 40
pF1KE5 MLRLFYSSAIIASVILNFVGIIMNLFITVVNCKTWVKSHRISSSDRIL
...: : ..::. . :::.. :.... . ..:::.
CCDS43 MATVNTDATDKDISKFKVTFTLVVSGIECITGILGSGFITAIYGAEWARGKTLPTGDRIM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 FSLGITRFLMLGLFLVNTIY---FVSSNTERSVYLSAFFVLCFMFLDSSSLWFVTLLNIL
. :...:.:. .....:. : .. :::. .: . .::. :.:::.. :...
CCDS43 LMLSFSRLLLQIWMMLENIFSLLFRIVYNQNSVYI--LFKVITVFLNHSNLWFAAWLKVF
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE5 YCVKITNFQHSVFLLLKRNISPKIPRLLLACVLIS-AFTTCLY-----ITLSQASPFPEL
::..:.::.: .:.:.::.: .: :: ::.: .:. : . .... :.:
CCDS43 YCLRIANFNHPLFFLMKRKIIVLMPWLLRLSVLVSLSFSFPLSRDVFNVYVNSSIPIPSS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 VTTRNNTSFNINEGILSLVVSLVLSSSLQFIINVTSASLLIHSLRRHIQKMQKNATGFWN
.:... . : ...:: .. . .:. . .:.::: ::.:: .: .:::: .
CCDS43 NSTEKKYFSETN--MVNLVFFYNMGIFVPLIMFILAATLLILSLKRHTLHMGSNATGSRD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 PQTEAHVGAMKLMVYFLILYIPYSVATLVQYLPFYAGMDMGTKSICLIFATLYSPGHSVL
:. .::.::.: ::::::: ..: ... .. .. . . .: :. . : ::::
CCDS43 PSMKAHIGAIKATSYFLILYIFNAIALFLSTSNIFDTYS-SWNILCKIIMAAYPAGHSVQ
240 250 260 270 280 290
280 290
pF1KE5 IIITHPKLKTTAKKILCFKK
.:. .: :. . :.
CCDS43 LILGNPGLRRAWKRFQHQVPLYLKGQTL
300 310 320
>>CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 (307 aa)
initn: 459 init1: 194 opt: 457 Z-score: 553.2 bits: 110.4 E(32554): 1.7e-24
Smith-Waterman score: 457; 33.1% identity (63.4% similar) in 290 aa overlap (15-299:15-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLRLFYSSAIIASVILNFVGIIMNLFITVVNCKTWVKSHRISSSDRILFSLGITRFLMLG
.:...:: : ::..: . :.. :. : ::.::: .:: .
CCDS43 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LFLVNTIYFVSSNTERSVYLS-AFFVLCFMFLDSSSLWFVTLLNILYCVKITNFQHSVFL
. :...:. ....: : :. :: : . ::.:...:: . :..:.::::.:. ::.::
CCDS43 VGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHSTFL
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pF1KE5 LLKRNISPKIPRLLLACVLISAFTTCLYITLSQASPFPELVTTR--NNTSFNINEGILSL
:: . .: :::. :::: . : :.. .. . :.. . .: ... : : .
CCDS43 WLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPV-YQEFLIRKFSGNMTYKWNTRIETY
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pF1KE5 VV-SLVLSS-SLQFIINVTSASLLIHSLRRHIQKMQKNATGFWNPQTEAHVGAMKLMVYF
:: : :. : . ..: :::.::::: :.::.:. .. .:.:.::. :.: .. :
CCDS43 YFPSLKLVIWSIPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKSLISF
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pF1KE5 LILYIPYSVATLVQYLPFYAGMDMGTKSICLIFATLYSPGHSVLIIITHPKLKTTAKKIL
:::: : .:. . .:. : . : : ..:... ::... ...:
CCDS43 LILYA-LSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFILIFSNLKLRSVFSQLL
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CFKK
. .
CCDS43 LLARGFWVA
300
>>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 423 init1: 185 opt: 442 Z-score: 535.2 bits: 107.1 E(32554): 1.7e-23
Smith-Waterman score: 442; 32.6% identity (65.2% similar) in 276 aa overlap (19-290:19-294)
10 20 30 40 50 60
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.::..: :: .:: ..: :..:.: :: :. .:.. :...:
CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LFLVNTIYF-VSSNTERSVYLSAFFVLCFMFLDSSSLWFVTLLNILYCVKITNFQHSVFL
..:.... . : ::. : . .. . . : . :.:..: :..:::.::..:.: .::
CCDS58 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
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:: .: . .::. .:.: .: :. .. : : . .::: : : ... :
CCDS58 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 VVSL-VLSSSLQFIINVTSASLLIHSLRRHIQKMQKNATGFWNPQTEAHVGAMKLMVYFL
. : .: .:....: :::: :: :: ..: .:.:. .: :::: :..... :.
CCDS58 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ILYIPYSVATLVQYLPFYAGMDMGTKSICLIFATLYSPGHSVLIIITHPKLKTTAKKILC
.:.. : .: :. . . .: : ... .: ::: ..:. . ::: :
CCDS58 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVMLR
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FKK
CCDS58 CESGHLKPGSKGPIFS
310
>>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 377 init1: 192 opt: 406 Z-score: 492.4 bits: 99.2 E(32554): 4.2e-21
Smith-Waterman score: 406; 29.0% identity (63.3% similar) in 286 aa overlap (19-299:19-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLRLFYSSAIIASVILNFVGIIMNLFITVVNCKTWVKSHRISSSDRILFSLGITRFLMLG
.::. : .:..:: :.:...::. : :: .: :.:. ...
CCDS86 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LFLVNTIYFVSSNTERSVYLSAFFVLCFM-FLDSSSLWFVTLLNILYCVKITNFQHSVFL
...:: : .: . . . . .. : : . ..:..: ::..: .::.. .: .::
CCDS86 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 LLKRNISPKIPRLLLACVLISAFTTCLY-ITLSQASPFPELVTTRNNTS--FNINEGILS
:: .:. . .::.: :: ... . :.:: : .. . : . :....
CCDS86 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 LVVSLV-LSSSLQFIINVTSASLLIHSLRRHIQKMQKNATGFWNPQTEAHVGAMKLMVYF
..: : . . ::... : ::..:: :: .... ::: .:.::.:: :.: :. :
CCDS86 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LILYIPYSVATLVQYLPFYAGMDMGTKSICLIFATLYSPGHSVLIIITHPKLKTTAKKIL
..... : ...... . . . . : : :: :::...:. . ::. : ..:
CCDS86 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CFKK
.:
CCDS86 TCRKIACMI
>>CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 (307 aa)
initn: 333 init1: 195 opt: 398 Z-score: 482.9 bits: 97.4 E(32554): 1.4e-20
Smith-Waterman score: 398; 29.7% identity (64.0% similar) in 300 aa overlap (1-295:1-292)
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