FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5357, 309 aa
1>>>pF1KE5357 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2636+/-0.00126; mu= 16.1233+/- 0.075
mean_var=69.9918+/-15.330, 0's: 0 Z-trim(101.0): 64 B-trim: 808 in 2/46
Lambda= 0.153303
statistics sampled from 6273 (6328) to 6273 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.529), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 1.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 2021 456.5 1.2e-128
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 1421 323.8 1.1e-88
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 1385 315.8 2.6e-86
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 1354 309.0 3.1e-84
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 1351 308.3 4.7e-84
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 1311 299.5 2.2e-81
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 1264 289.0 2.9e-78
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 882 204.6 8e-53
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 750 175.4 5.1e-44
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 690 162.1 5.1e-40
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 678 159.5 3.1e-39
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 618 146.2 3.1e-35
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 602 142.6 3.6e-34
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 581 138.0 9.1e-33
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 573 136.2 3.1e-32
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 462 111.7 7.3e-25
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 432 105.0 7.4e-23
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 418 101.9 6.2e-22
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 398 97.5 1.4e-20
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 377 92.9 3.7e-19
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 374 92.2 5.3e-19
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 341 84.9 8.7e-17
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 338 84.3 1.4e-16
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 329 82.2 5.1e-16
>>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 2021 init1: 2021 opt: 2021 Z-score: 2423.1 bits: 456.5 E(32554): 1.2e-128
Smith-Waterman score: 2021; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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CCDS86 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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CCDS86 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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CCDS86 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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CCDS86 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AKGQNQSTP
:::::::::
CCDS86 AKGQNQSTP
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1449 init1: 1410 opt: 1421 Z-score: 1705.9 bits: 323.8 E(32554): 1.1e-88
Smith-Waterman score: 1421; 69.5% identity (87.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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CCDS53 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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CCDS53 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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CCDS53 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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CCDS53 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AKGQNQSTP
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CCDS53 VKGEKPSSS
>>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1400 init1: 1374 opt: 1385 Z-score: 1662.9 bits: 315.8 E(32554): 2.6e-86
Smith-Waterman score: 1385; 67.0% identity (86.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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CCDS53 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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CCDS53 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AKGQNQSTP
.::.. :.:
CCDS53 VKGEKTSSP
>>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 (319 aa)
initn: 1363 init1: 1343 opt: 1354 Z-score: 1625.7 bits: 309.0 E(32554): 3.1e-84
Smith-Waterman score: 1354; 69.2% identity (85.6% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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CCDS53 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
:.:::::.: :::. ...: : :.:::::::: :::::::.::::.:.::: ::: .
CCDS53 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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CCDS53 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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CCDS53 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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CCDS53 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AKGQNQSTP
.: ..
CCDS53 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
310
>>CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 1351 init1: 1351 opt: 1351 Z-score: 1622.5 bits: 308.3 E(32554): 4.7e-84
Smith-Waterman score: 1351; 69.8% identity (86.9% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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CCDS86 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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CCDS86 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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CCDS86 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
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pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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CCDS86 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
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pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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CCDS86 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
250 260 270 280 290
pF1KE5 AKGQNQSTP
>>CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1310 init1: 1286 opt: 1311 Z-score: 1574.5 bits: 299.5 E(32554): 2.2e-81
Smith-Waterman score: 1311; 65.7% identity (84.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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CCDS53 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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CCDS53 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
:.::.::::::. ::::: ::::::::::::::::::::::.:::::::: ::.: :.
CCDS53 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AKGQNQSTP
.::.. :.:
CCDS53 VKGEKPSSP
>>CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 1283 init1: 1235 opt: 1264 Z-score: 1518.5 bits: 289.0 E(32554): 2.9e-78
Smith-Waterman score: 1264; 64.2% identity (86.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
:..::.: ::::..: :.:::::::::::.::: ::::.::::::::..::::::.::::
CCDS86 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
..::.:: :::::. .... : :::.::::::.:::..:::::::::.::: :.: :
CCDS86 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
:::...::.:::.::.:.::::::.. . ..:.:: :::.: :.::::..::: :::.
CCDS86 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
: ..:::::.:::::.:: :::::::::::::.:::: :::.:::::::. :::.: ::
CCDS86 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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CCDS86 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
250 260 270 280 290
pF1KE5 AKGQNQSTP
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]