Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5353
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5353, 325 aa
1>>>pF1KE5353 325 - 325 aa - 325 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2408+/-0.00114; mu= -5.0427+/- 0.067
mean_var=365.6924+/-75.794, 0's: 0 Z-trim(113.2): 38 B-trim: 117 in 2/50
Lambda= 0.067068
statistics sampled from 13807 (13836) to 13807 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.762), E-opt: 0.2 (0.425), width: 16
Scan time: 2.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3718.1 TNIP3 gene_id:79931|Hs108|chr4 ( 325) 2190 225.4 4.8e-59
CCDS58925.1 TNIP3 gene_id:79931|Hs108|chr4 ( 369) 1971 204.3 1.2e-52
CCDS58926.1 TNIP3 gene_id:79931|Hs108|chr4 ( 376) 1971 204.3 1.3e-52
CCDS58982.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 ( 583) 572 69.1 9.6e-12
CCDS75359.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 ( 619) 572 69.1 1e-11
CCDS58985.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 ( 635) 572 69.2 1e-11
CCDS34280.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 ( 636) 572 69.2 1e-11
CCDS58984.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 ( 572) 570 68.9 1.1e-11
CCDS58983.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 ( 556) 564 68.3 1.6e-11
>>CCDS3718.1 TNIP3 gene_id:79931|Hs108|chr4 (325 aa)
initn: 2190 init1: 2190 opt: 2190 Z-score: 1173.5 bits: 225.4 E(32554): 4.8e-59
Smith-Waterman score: 2190; 99.7% identity (100.0% similar) in 325 aa overlap (1-325:1-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAHFVQGTSRMIAAESSTEHKECAEPSTRKNLMNSLEQKIRCLEKQRKELLEVNQQWDQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MAHFVQGTSRMIAAESSTEHKECAEPSTRKNLMNSLEQKIRCLEKQRKELLEVNQQWDQQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FRSMKELYERKVAELKTKLDAAERFLSTREKDPHQRQRKDDRQREDDRHRDLTRDRLQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS37 FRSMKELYERKVAELKTKLDAAERFLSTREKDPHQRQRKDDRQREDDRQRDLTRDRLQRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EKEKERLNEELHELKEENKLLKGKNTLANKEKEHYECEIKRLNKALQDALNIKCSFSEDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EKEKERLNEELHELKEENKLLKGKNTLANKEKEHYECEIKRLNKALQDALNIKCSFSEDC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LRKSRVEFCHEEMRTEMEVLKQQVQIYEEDFKKERSDRERLNQEKEELQQINETSQSQLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LRKSRVEFCHEEMRTEMEVLKQQVQIYEEDFKKERSDRERLNQEKEELQQINETSQSQLN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RLNSQIKACQMEKEKLEKQLKQMYCPPCNCGLVFHLQDPWVPTGPGAVQKQREHPPDYQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RLNSQIKACQMEKEKLEKQLKQMYCPPCNCGLVFHLQDPWVPTGPGAVQKQREHPPDYQW
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE5 YALDQLPPDVQHKANGLSSVKKVHP
:::::::::::::::::::::::::
CCDS37 YALDQLPPDVQHKANGLSSVKKVHP
310 320
>>CCDS58925.1 TNIP3 gene_id:79931|Hs108|chr4 (369 aa)
initn: 1971 init1: 1971 opt: 1971 Z-score: 1058.3 bits: 204.3 E(32554): 1.2e-52
Smith-Waterman score: 1971; 99.7% identity (100.0% similar) in 295 aa overlap (1-295:71-365)
10 20 30
pF1KE5 MAHFVQGTSRMIAAESSTEHKECAEPSTRK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ASPHPKRFTPEAMPTHRNLCSLKTPGKTASMAHFVQGTSRMIAAESSTEHKECAEPSTRK
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 NLMNSLEQKIRCLEKQRKELLEVNQQWDQQFRSMKELYERKVAELKTKLDAAERFLSTRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NLMNSLEQKIRCLEKQRKELLEVNQQWDQQFRSMKELYERKVAELKTKLDAAERFLSTRE
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 KDPHQRQRKDDRQREDDRHRDLTRDRLQREEKEKERLNEELHELKEENKLLKGKNTLANK
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KDPHQRQRKDDRQREDDRQRDLTRDRLQREEKEKERLNEELHELKEENKLLKGKNTLANK
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 EKEHYECEIKRLNKALQDALNIKCSFSEDCLRKSRVEFCHEEMRTEMEVLKQQVQIYEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EKEHYECEIKRLNKALQDALNIKCSFSEDCLRKSRVEFCHEEMRTEMEVLKQQVQIYEED
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 FKKERSDRERLNQEKEELQQINETSQSQLNRLNSQIKACQMEKEKLEKQLKQMYCPPCNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FKKERSDRERLNQEKEELQQINETSQSQLNRLNSQIKACQMEKEKLEKQLKQMYCPPCNC
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320
pF1KE5 GLVFHLQDPWVPTGPGAVQKQREHPPDYQWYALDQLPPDVQHKANGLSSVKKVHP
:::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GLVFHLQDPWVPTGPGAVQKQREHPVYPQ
350 360
>>CCDS58926.1 TNIP3 gene_id:79931|Hs108|chr4 (376 aa)
initn: 1971 init1: 1971 opt: 1971 Z-score: 1058.2 bits: 204.3 E(32554): 1.3e-52
Smith-Waterman score: 1971; 99.7% identity (100.0% similar) in 295 aa overlap (1-295:78-372)
10 20 30
pF1KE5 MAHFVQGTSRMIAAESSTEHKECAEPSTRK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ASPHPKRFTPEAMPTHRNLCSLKTPGKTASMAHFVQGTSRMIAAESSTEHKECAEPSTRK
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 NLMNSLEQKIRCLEKQRKELLEVNQQWDQQFRSMKELYERKVAELKTKLDAAERFLSTRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NLMNSLEQKIRCLEKQRKELLEVNQQWDQQFRSMKELYERKVAELKTKLDAAERFLSTRE
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 KDPHQRQRKDDRQREDDRHRDLTRDRLQREEKEKERLNEELHELKEENKLLKGKNTLANK
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KDPHQRQRKDDRQREDDRQRDLTRDRLQREEKEKERLNEELHELKEENKLLKGKNTLANK
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 EKEHYECEIKRLNKALQDALNIKCSFSEDCLRKSRVEFCHEEMRTEMEVLKQQVQIYEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EKEHYECEIKRLNKALQDALNIKCSFSEDCLRKSRVEFCHEEMRTEMEVLKQQVQIYEED
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 FKKERSDRERLNQEKEELQQINETSQSQLNRLNSQIKACQMEKEKLEKQLKQMYCPPCNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FKKERSDRERLNQEKEELQQINETSQSQLNRLNSQIKACQMEKEKLEKQLKQMYCPPCNC
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320
pF1KE5 GLVFHLQDPWVPTGPGAVQKQREHPPDYQWYALDQLPPDVQHKANGLSSVKKVHP
:::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GLVFHLQDPWVPTGPGAVQKQREHPVYPQ
350 360 370
>>CCDS58982.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 (583 aa)
initn: 493 init1: 237 opt: 572 Z-score: 324.3 bits: 69.1 E(32554): 9.6e-12
Smith-Waterman score: 572; 36.9% identity (66.9% similar) in 287 aa overlap (33-308:243-522)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 HFVQGTSRMIAAESSTEHKECAEPSTRKNLMNSLEQKIRCLEKQRKELLEVNQQWDQQFR
... :.:.. ::.::.::::::.::::.::
CCDS58 SPKMEGTGKKAVAGQQQASVTAGKVPEVVALGAAEKKVKMLEQQRSELLEVNKQWDQHFR
220 230 240 250 260 270
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SMKELYERKVAELKTKLDAAERFLSTREKDPHQRQRKDDRQREDDRHRDLTRDRLQREEK
:::. ::.:..::. :: .. .. : . ....::. ::. :...... ::
CCDS58 SMKQQYEQKITELRQKLADLQKQVTDLEAE------REQKQRDFDRKLLLAKSKIEMEET
280 290 300 310 320
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EKERLNEELHELKEENKLLKGKNTLANKEKEHYECEIKRLNKALQDALNIKCSFSEDCLR
.::.:. : .::... : :. . . ....:. : ::.::::::..::.:. :
CCDS58 DKEQLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTRQREYQEKEIQRLNKALEEALSIQTPPSSPPTA
330 340 350 360 370 380
190 200 210 220 230
pF1KE5 KSRVE-----FCHEEMRTEMEVLKQQVQIYEEDFKKERSDRERLNQEKEELQQINETSQS
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CCDS58 FGSPEGAGALLRKQELVTQNELLKQQVKIFEEDFQRERSDRERMNEEKEELKKQVEKLQA
390 400 410 420 430 440
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 QLNRLNSQIKACQMEKEKLEKQLKQMYCPPCNCGLVFHLQD-PWVPTG--PGAVQKQREH
:.. :.:.:: . ..:: .. :.:. : .:.. : : : : .
CCDS58 QVTLSNAQLKAFK-DEEKAREALRQQKRKAKASGERYHVEPHPEHLCGAYPYAYPPMPAM
450 460 470 480 490 500
300 310 320
pF1KE5 PPDY---QWYALDQLPPDVQHKANGLSSVKKVHP
: . .: . ::
CCDS58 VPHHGFEDWSQIRYPPPPMAMEHPPPLPNSRLFHLPEYTWRLPCGGVRNPNQSSQVMDPP
510 520 530 540 550 560
>>CCDS75359.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 (619 aa)
initn: 455 init1: 237 opt: 572 Z-score: 324.0 bits: 69.1 E(32554): 1e-11
Smith-Waterman score: 572; 36.9% identity (66.9% similar) in 287 aa overlap (33-308:296-575)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 HFVQGTSRMIAAESSTEHKECAEPSTRKNLMNSLEQKIRCLEKQRKELLEVNQQWDQQFR
... :.:.. ::.::.::::::.::::.::
CCDS75 SPKMEGTGKKAVAGQQQASVTAGKVPEVVALGAAEKKVKMLEQQRSELLEVNKQWDQHFR
270 280 290 300 310 320
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SMKELYERKVAELKTKLDAAERFLSTREKDPHQRQRKDDRQREDDRHRDLTRDRLQREEK
:::. ::.:..::. :: .. .. : . ....::. ::. :...... ::
CCDS75 SMKQQYEQKITELRQKLADLQKQVTDLEAE------REQKQRDFDRKLLLAKSKIEMEET
330 340 350 360 370
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EKERLNEELHELKEENKLLKGKNTLANKEKEHYECEIKRLNKALQDALNIKCSFSEDCLR
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CCDS75 DKEQLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTRQREYQEKEIQRLNKALEEALSIQTPPSSPPTA
380 390 400 410 420 430
190 200 210 220 230
pF1KE5 KSRVE-----FCHEEMRTEMEVLKQQVQIYEEDFKKERSDRERLNQEKEELQQINETSQS
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CCDS75 FGSPEGAGALLRKQELVTQNELLKQQVKIFEEDFQRERSDRERMNEEKEELKKQVEKLQA
440 450 460 470 480 490
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 QLNRLNSQIKACQMEKEKLEKQLKQMYCPPCNCGLVFHLQD-PWVPTG--PGAVQKQREH
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CCDS75 QVTLSNAQLKAFK-DEEKAREALRQQKRKAKASGERYHVEPHPEHLCGAYPYAYPPMPAM
500 510 520 530 540 550
300 310 320
pF1KE5 PPDY---QWYALDQLPPDVQHKANGLSSVKKVHP
: . .: . ::
CCDS75 VPHHGFEDWSQIRYPPPPMAMEHPPPLPNSRLFHLHQFCRSRNTPGVYPVEGFEIQIRAP
560 570 580 590 600 610
>>CCDS58985.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 (635 aa)
initn: 460 init1: 237 opt: 572 Z-score: 323.9 bits: 69.2 E(32554): 1e-11
Smith-Waterman score: 572; 36.9% identity (66.9% similar) in 287 aa overlap (33-308:296-575)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 HFVQGTSRMIAAESSTEHKECAEPSTRKNLMNSLEQKIRCLEKQRKELLEVNQQWDQQFR
... :.:.. ::.::.::::::.::::.::
CCDS58 SPKMEGTGKKAVAGQQQASVTAGKVPEVVALGAAEKKVKMLEQQRSELLEVNKQWDQHFR
270 280 290 300 310 320
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SMKELYERKVAELKTKLDAAERFLSTREKDPHQRQRKDDRQREDDRHRDLTRDRLQREEK
:::. ::.:..::. :: .. .. : . ....::. ::. :...... ::
CCDS58 SMKQQYEQKITELRQKLADLQKQVTDLEAE------REQKQRDFDRKLLLAKSKIEMEET
330 340 350 360 370
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EKERLNEELHELKEENKLLKGKNTLANKEKEHYECEIKRLNKALQDALNIKCSFSEDCLR
.::.:. : .::... : :. . . ....:. : ::.::::::..::.:. :
CCDS58 DKEQLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTRQREYQEKEIQRLNKALEEALSIQTPPSSPPTA
380 390 400 410 420 430
190 200 210 220 230
pF1KE5 KSRVE-----FCHEEMRTEMEVLKQQVQIYEEDFKKERSDRERLNQEKEELQQINETSQS
. : . ..:. :. :.:::::.:.::::..:::::::.:.:::::.. : :.
CCDS58 FGSPEGAGALLRKQELVTQNELLKQQVKIFEEDFQRERSDRERMNEEKEELKKQVEKLQA
440 450 460 470 480 490
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 QLNRLNSQIKACQMEKEKLEKQLKQMYCPPCNCGLVFHLQD-PWVPTG--PGAVQKQREH
:.. :.:.:: . ..:: .. :.:. : .:.. : : : : .
CCDS58 QVTLSNAQLKAFK-DEEKAREALRQQKRKAKASGERYHVEPHPEHLCGAYPYAYPPMPAM
500 510 520 530 540 550
300 310 320
pF1KE5 PPDY---QWYALDQLPPDVQHKANGLSSVKKVHP
: . .: . ::
CCDS58 VPHHGFEDWSQIRYPPPPMAMEHPPPLPNSRLFHLPEYTWRLPCGGVRNPNQSSQVMDPP
560 570 580 590 600 610
>>CCDS34280.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 (636 aa)
initn: 460 init1: 237 opt: 572 Z-score: 323.9 bits: 69.2 E(32554): 1e-11
Smith-Waterman score: 572; 36.9% identity (66.9% similar) in 287 aa overlap (33-308:296-575)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 HFVQGTSRMIAAESSTEHKECAEPSTRKNLMNSLEQKIRCLEKQRKELLEVNQQWDQQFR
... :.:.. ::.::.::::::.::::.::
CCDS34 SPKMEGTGKKAVAGQQQASVTAGKVPEVVALGAAEKKVKMLEQQRSELLEVNKQWDQHFR
270 280 290 300 310 320
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SMKELYERKVAELKTKLDAAERFLSTREKDPHQRQRKDDRQREDDRHRDLTRDRLQREEK
:::. ::.:..::. :: .. .. : . ....::. ::. :...... ::
CCDS34 SMKQQYEQKITELRQKLADLQKQVTDLEAE------REQKQRDFDRKLLLAKSKIEMEET
330 340 350 360 370
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EKERLNEELHELKEENKLLKGKNTLANKEKEHYECEIKRLNKALQDALNIKCSFSEDCLR
.::.:. : .::... : :. . . ....:. : ::.::::::..::.:. :
CCDS34 DKEQLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTRQREYQEKEIQRLNKALEEALSIQTPPSSPPTA
380 390 400 410 420 430
190 200 210 220 230
pF1KE5 KSRVE-----FCHEEMRTEMEVLKQQVQIYEEDFKKERSDRERLNQEKEELQQINETSQS
. : . ..:. :. :.:::::.:.::::..:::::::.:.:::::.. : :.
CCDS34 FGSPEGAGALLRKQELVTQNELLKQQVKIFEEDFQRERSDRERMNEEKEELKKQVEKLQA
440 450 460 470 480 490
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 QLNRLNSQIKACQMEKEKLEKQLKQMYCPPCNCGLVFHLQD-PWVPTG--PGAVQKQREH
:.. :.:.:: . ..:: .. :.:. : .:.. : : : : .
CCDS34 QVTLSNAQLKAFK-DEEKAREALRQQKRKAKASGERYHVEPHPEHLCGAYPYAYPPMPAM
500 510 520 530 540 550
300 310 320
pF1KE5 PPDY---QWYALDQLPPDVQHKANGLSSVKKVHP
: . .: . ::
CCDS34 VPHHGFEDWSQIRYPPPPMAMEHPPPLPNSRLFHLPEYTWRLPCGGVRNPNQSSQVMDPP
560 570 580 590 600 610
>>CCDS58984.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 (572 aa)
initn: 631 init1: 237 opt: 570 Z-score: 323.4 bits: 68.9 E(32554): 1.1e-11
Smith-Waterman score: 579; 38.3% identity (68.8% similar) in 282 aa overlap (33-295:296-571)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 HFVQGTSRMIAAESSTEHKECAEPSTRKNLMNSLEQKIRCLEKQRKELLEVNQQWDQQFR
... :.:.. ::.::.::::::.::::.::
CCDS58 SPKMEGTGKKAVAGQQQASVTAGKVPEVVALGAAEKKVKMLEQQRSELLEVNKQWDQHFR
270 280 290 300 310 320
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SMKELYERKVAELKTKLDAAERFLSTREKDPHQRQRKDDRQREDDRHRDLTRDRLQREEK
:::. ::.:..::. :: .. .. : . ....::. ::. :...... ::
CCDS58 SMKQQYEQKITELRQKLADLQKQVTDLEAE------REQKQRDFDRKLLLAKSKIEMEET
330 340 350 360 370
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EKERLNEELHELKEENKLLKGKNTLANKEKEHYECEIKRLNKALQDALNIKCSFSEDCLR
.::.:. : .::... : :. . . ....:. : ::.::::::..::.:. :
CCDS58 DKEQLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTRQREYQEKEIQRLNKALEEALSIQTPPSSPPTA
380 390 400 410 420 430
190 200 210 220 230
pF1KE5 KSRVE-----FCHEEMRTEMEVLKQQVQIYEEDFKKERSDRERLNQEKEELQQINETSQS
. : . ..:. :. :.:::::.:.::::..:::::::.:.:::::.. : :.
CCDS58 FGSPEGAGALLRKQELVTQNELLKQQVKIFEEDFQRERSDRERMNEEKEELKKQVEKLQA
440 450 460 470 480 490
240 250 260 270 280
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