FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5331, 309 aa
1>>>pF1KE5331 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0022+/-0.000487; mu= 17.5178+/- 0.030
mean_var=116.8020+/-35.165, 0's: 0 Z-trim(108.2): 406 B-trim: 948 in 1/53
Lambda= 0.118672
statistics sampled from 15753 (16315) to 15753 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.191), width: 16
Scan time: 6.070
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 1383 248.6 1.2e-65
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 1069 194.9 1.8e-49
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 1069 194.9 1.8e-49
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 986 180.7 3.4e-45
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 899 165.8 1e-40
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 892 164.6 2.4e-40
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 879 162.4 1.1e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 876 161.8 1.6e-39
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 860 159.1 1.1e-38
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 852 157.7 2.7e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 850 157.4 3.4e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 847 156.9 4.9e-38
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 845 156.5 6.3e-38
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 835 154.8 2.1e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 835 154.8 2.1e-37
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 835 154.8 2.1e-37
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 823 152.8 8.7e-37
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 816 151.6 1.9e-36
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 766 143.0 7.3e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 529 102.4 1.2e-21
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 522 101.2 2.8e-21
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 229 51.2 3.9e-06
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 229 51.2 4.1e-06
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 216 48.9 1.7e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 216 48.9 1.7e-05
NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 208 47.6 4.8e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 204 46.8 6.9e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 202 46.5 8.9e-05
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 202 46.6 9.8e-05
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 202 46.6 0.0001
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 202 46.7 0.00011
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 201 46.4 0.00011
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 201 46.4 0.00011
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 199 46.0 0.00013
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 199 46.0 0.00013
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 194 45.1 0.00024
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 194 45.2 0.00025
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 194 45.2 0.00025
NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 194 45.2 0.00026
NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 194 45.2 0.00026
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 194 45.2 0.00026
NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 194 45.2 0.00026
NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 194 45.2 0.00026
NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 194 45.2 0.00026
NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 194 45.2 0.00027
NP_005288 (OMIM: 601751) melanin-concentrating hor ( 422) 194 45.2 0.00027
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 194 45.3 0.00027
NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 194 45.3 0.00027
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 192 44.7 0.00028
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 1402 init1: 1383 opt: 1383 Z-score: 1299.8 bits: 248.6 E(85289): 1.2e-65
Smith-Waterman score: 1383; 69.9% identity (89.4% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMAY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLMVLWLSFCTDLEIPHFFCE
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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pF1KE5 LNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKRA
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LKMSFRGKQ
:.
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1069; 53.3% identity (80.5% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLMVLWLSFCTDLEIPHFFCE
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 LNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
.. ...:.:::: ::.. . ..:. :.. :: :: .:. .. . :..:..:::::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKRA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LKMSFRGKQ
::
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1069; 53.3% identity (80.5% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
: :....:::.:::::..:. : .:: .::::::.::::::::::.. :: ::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLMVLWLSFCTDLEIPHFFCE
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 LNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
.. ...:.:::: ::.. . ..:. :.. :: :: .:. .. . :..:..:::::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKRA
:.:::.:: :: : ..::.. ..:... .. :.:.:::.:::::::::::::. .: :
NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LKMSFRGKQ
::
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 1069 init1: 1069 opt: 1069 Z-score: 1009.1 bits: 194.9 E(85289): 1.8e-49
Smith-Waterman score: 1069; 53.3% identity (80.5% similar) in 302 aa overlap (1-302:11-312)
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pF1KE5 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATI
: :....:::.:::::..:. : .:: .::::::.::::::::::..
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 SDSHLHTPMYFFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGL
:: ::::::::::::::.:::: ::.:::: : ....:.. ::.::: : .: .
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 DSLLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLMVLWLSFCT
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 DLEIPHFFCELNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISS
: : ::::... ...:.:::: ::.. . ..:. :.. :: :: .:. .. . :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KE5 AQGKYKAFSTCASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIY
..:..::::::.:::.:: :: : ..::.. ..:... .. :.:.:::.:::::::::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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300
pF1KE5 SLRNKDIKRALKMSFRGKQ
::::. .: :::
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 975 init1: 846 opt: 986 Z-score: 932.4 bits: 180.7 E(85289): 3.4e-45
Smith-Waterman score: 986; 51.5% identity (79.1% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
:. :.. :::.:::.:: :: : .:: .:::::::::.::.::::: :::.::::.:
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMAY
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NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLMVLWLSFCTDLEIPHFFCE
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NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 LNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
. ....:::. .: . .. .. :. .. :: :. .: : :.. :::::::
NP_002 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFST
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pF1KE5 CASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKRA
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NP_002 CASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVKDSV-ATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGA
250 260 270 280 290
pF1KE5 LKMSFRGKQ
:
NP_002 LGRLLDKHFKRLT
300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 899 init1: 899 opt: 899 Z-score: 852.0 bits: 165.8 E(85289): 1e-40
Smith-Waterman score: 899; 48.0% identity (74.5% similar) in 298 aa overlap (5-302:6-303)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPM
: : :. :.:::.:. :.. :: .:: .:.... :: .:. ::::::::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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pF1KE5 YFFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMA
::::::::: :.:.::.:.:::: :. ....::..::: :. .: .: .: :...::
NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLMVLWLSFCTDLEIPHFFC
:::..:::.:: :. ::.: :: .::...: . :: : .: : :: . : ::::
NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ELNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFS
.. :.. :.:.:::. .. . . ... . . :. ::. : :: :.::.:. :::.
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKR
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 ALKMSFRGKQ
:::
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 866 init1: 841 opt: 892 Z-score: 845.5 bits: 164.6 E(85289): 2.4e-40
Smith-Waterman score: 892; 42.3% identity (76.5% similar) in 298 aa overlap (5-302:8-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHT
: .. . :.:.:.:. :.:. .: . : .::.:..:::.::. . ::::::
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MAYDRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLMVLWLSFCTDLEIPHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FCELNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISSAQGKYKA
:::. ...:.: :: .:.. ......... ::. :: ::. :: .: ..:. : :.
NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FSTCASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDI
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 KRALKMSFRGKQ
. :.:
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 918 init1: 824 opt: 879 Z-score: 833.4 bits: 162.4 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 879; 47.4% identity (73.2% similar) in 302 aa overlap (5-305:5-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEPENDTGISEFVLLGLSEEP-ELQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLMVLWLSFCTDLEIPHFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ELNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFS
. :..:.:.:: : .. .. :.. : . :::::..:...: : ::.::.::::
NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKR
::.::: ::::: .. .:. .... ... :. :::.::::::.::::::...:
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 ALKMSFRGKQ
::. .:
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 872 init1: 853 opt: 876 Z-score: 830.6 bits: 161.8 E(85289): 1.6e-39
Smith-Waterman score: 876; 44.7% identity (73.5% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
:. : . ..:.:::.:..:.:. .:: ..: ::.:..:: :::.. : :::::::
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMAY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLMVLWLSFCTDLEIPHFFCE
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
. .:..:: .: . .. : .. .::: :: ::: :: .. : ::.:. :::.:
NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKRA
:.:::.::::: . . .:. .:. .. . ..:...::.:::.::.:::...: :
NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LKMSFRGKQ
: . ::.
NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 846 init1: 846 opt: 860 Z-score: 815.8 bits: 159.1 E(85289): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 860; 42.3% identity (73.8% similar) in 305 aa overlap (5-309:3-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
:... :.:::.::.: :. :: . :. ::.:..:: :::: . : .::.:::
NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
10 20 30 40 50
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pF1KE5 FFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMAY
:::::::: :.:: .. .:.::.:. ...:.. : .:. .:. .: . .::.:::.
NP_009 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLMVLWLSFCTDLEIPHFFCE
::.::.:.::::..:..:::: :. ..:.:. ..:. :. .: : :: : .. : ::
NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
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NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKRA
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
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NP_009 FR-RLLGKEMGLTQS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]