Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5310
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5310, 308 aa
1>>>pF1KE5310 308 - 308 aa - 308 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0070+/-0.00136; mu= 11.4964+/- 0.079
mean_var=158.0587+/-55.782, 0's: 0 Z-trim(101.3): 382 B-trim: 748 in 2/44
Lambda= 0.102015
statistics sampled from 5977 (6471) to 5977 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 1.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 2031 311.9 4.1e-85
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 1936 297.9 6.7e-81
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 1596 247.9 7.9e-66
CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 ( 321) 1566 243.4 1.7e-64
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1141 180.9 1.1e-45
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 1134 179.8 2.3e-45
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 1120 177.8 9.7e-45
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 1110 176.3 2.6e-44
CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 ( 310) 1100 174.8 7.3e-44
CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 ( 313) 1092 173.7 1.7e-43
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1061 169.1 4e-42
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1045 166.7 2e-41
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1041 166.2 3e-41
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1025 163.9 1.6e-40
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1017 162.6 3.5e-40
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1009 161.5 8.1e-40
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1008 161.3 8.9e-40
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1006 161.0 1.1e-39
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 998 159.8 2.4e-39
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 997 159.7 2.7e-39
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 996 159.5 2.9e-39
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 993 159.1 4e-39
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 988 158.4 7.3e-39
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 986 158.1 8.2e-39
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 983 157.7 1.2e-38
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 981 157.3 1.4e-38
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 979 157.0 1.7e-38
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 977 156.8 2.1e-38
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 972 156.0 3.4e-38
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 970 155.7 4.2e-38
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 962 154.6 9.9e-38
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 961 154.4 1e-37
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 960 154.2 1.2e-37
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 954 153.4 2.2e-37
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 953 153.3 2.6e-37
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 952 153.1 2.6e-37
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 952 153.1 2.6e-37
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 952 153.1 2.6e-37
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 948 152.5 3.9e-37
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 938 151.0 1.1e-36
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 936 150.7 1.3e-36
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 933 150.2 1.8e-36
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 933 150.3 1.8e-36
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 931 150.0 2.3e-36
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 928 149.5 3e-36
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 927 149.4 3.4e-36
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 926 149.2 3.7e-36
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 926 149.2 3.8e-36
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 925 149.1 4.1e-36
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 923 148.8 5e-36
>>CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 (308 aa)
initn: 2031 init1: 2031 opt: 2031 Z-score: 1641.6 bits: 311.9 E(32554): 4.1e-85
Smith-Waterman score: 2031; 100.0% identity (100.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHRRLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MAEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHRRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSENKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSENKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGSNHINHFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGSNHINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILPLYRLSCVDPYINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFKMKSKEGRAKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ILPLYRLSCVDPYINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFKMKSKEGRAKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHFLSVSLFYGSLFFMYVRPNLLEEGDKDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNREVISV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CASHFLSVSLFYGSLFFMYVRPNLLEEGDKDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNREVISV
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRKILMKK
::::::::
CCDS43 LRKILMKK
>>CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 (316 aa)
initn: 1951 init1: 1929 opt: 1936 Z-score: 1565.9 bits: 297.9 E(32554): 6.7e-81
Smith-Waterman score: 1936; 94.8% identity (98.4% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHRRLHTPMY
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS33 MVEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHCRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSENKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAMAY
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS33 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSEGKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAVAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGSNHINHFYCD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS33 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGLNHINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILPLYRLSCVDPYINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFKMKSKEGRAKAFST
:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS33 TLPLYRLSCVDPFINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFRMKSKEGRAKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHFLSVSLFYGSLFFMYVRPNLLEEGDKDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNREVISV
::::: ::::::::.::.:.:::::::: .::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS33 CASHFSSVSLFYGSIFFLYIRPNLLEEGGNDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNKEVISV
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRKILMKK
:::::.:
CCDS33 LRKILLKIKSQGSVNK
310
>>CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 (321 aa)
initn: 1596 init1: 1147 opt: 1596 Z-score: 1295.3 bits: 247.9 E(32554): 7.9e-66
Smith-Waterman score: 1596; 74.4% identity (93.5% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHRRLHTPMY
: .:::.. :::::::: ::.:::.::::::::::::.::::.:::::. ..:::::::
CCDS33 MNKENHSLIAEFILTGFTYHPKLKTVLFVVFFAIYLITMVGNIGLVALIYIEQRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSENKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAMAY
::::::.:.::::. :::::::::::::.:::.:::: .:::::: .::.::::::::::
CCDS33 IFLGNLVLMDSCCSSAITPKMLENFFSEDKRITLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGSNHINHFYCD
: ::::::::::: :::: ::::::.::..::::: ::.: ...::.::::..::::.::
CCDS33 DCYVAICNPLQYHTMMSKTLCIQMTAGAYLAGNLHPMIEVEFLLRLTFCGSHQINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILPLYRLSCVDPYINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFKMKSKEGRAKAFST
.::::::::..::::::::::..::.:.::: ::.::.:::.::: :::::::.::.::
CCDS33 VLPLYRLSCINPYINELVLFILAGSIQIFTI--VLVSYFYILFTIFTMKSKEGRGKALST
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHFLSVSLFYGSLFFMYVRPNLLEEGDKDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNREVISV
:::::::::.: ::.:::.::. ..:::::::.::..:.:.::::::::::::.:::..
CCDS33 CASHFLSVSIFCDSLLFMYARPGAVNEGDKDIPVAIFYTLVIPLLNPFIYSLRNKEVINI
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LRKILMKK
..::. :.
CCDS33 MKKIMKKRKFCHILKQMSSPLAT
300 310 320
>>CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 (321 aa)
initn: 1550 init1: 1355 opt: 1566 Z-score: 1271.5 bits: 243.4 E(32554): 1.7e-64
Smith-Waterman score: 1566; 75.4% identity (92.5% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHRRLHTPMY
::.:::.. :::: :::..::::::::::: ::::.:.:::..:::::...::: ::::
CCDS33 MARENHSLAAEFILIGFTNYPELKTLLFVVFSAIYLVTMVGNLGLVALIYVERRLLTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSENKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAMAY
::::::::.::::.::.:::::::::::.. :::::: .:::::: .::.::::::.:::
CCDS33 IFLGNLALMDSCCSCAVTPKMLENFFSEDRIISLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLATMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGSNHINHFYCD
:::::::.::::: :::: :::.:::::: ::::::::::::..::.:: ::.:.::.::
CCDS33 DRYVAICHPLQYHTMMSKTLCIRMTTGAFKAGNLHSMIHVGLLLRLTFCRSNKIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILPLYRLSCVDPYINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFKMKSKEGRAKAFST
:::::::::.:: ::::...::: .:.:::..:::::: ::::.:::::::::.:::::
CCDS33 ILPLYRLSCTDPSINELMIYIFSIPIQIFTIATVLISYLCILLTVFKMKSKEGRGKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHFLSVSLFYGSLFFMYVRPNLLEEGDKDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNREVISV
:::::::::.:: :. ::. :. :::::: :.::...::.::::::::::::.:::.:
CCDS33 CASHFLSVSIFYICLL-MYIGPS--EEGDKDTPVAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVINV
250 260 270 280 290
pF1KE5 LRKILMKK
:.::.
CCDS33 LKKIMRNYNILKQTCSIANLFLIY
300 310 320
>>CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 (314 aa)
initn: 1140 init1: 1121 opt: 1141 Z-score: 933.5 bits: 180.9 E(32554): 1.1e-45
Smith-Waterman score: 1141; 54.1% identity (82.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:6-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MAEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHRRL
: ..: :. .::.:::.: .:: : ::.::..:::::.: :..:.:::.. .:
CCDS33 MSNEDMEQDNTTLLTEFVLTGLTYQPEWKMPLFLVFLVIYLITIVWNLGLIALIWNDPQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 HTPMYIFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSENKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLL
: :::.:::.::.::. . ..::::: ::...:. ::: :: .::. . :..::::
CCDS33 HIPMYFFLGSLAFVDAWISSTVTPKMLVNFLAKNRMISLSECMIQFFSFAFGGTTECFLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AAMAYDRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGSNHIN
:.::::::::::.:: : ..:...:::.. . .:..: ::..:: :.:::.::.:: :.
CCDS33 ATMAYDRYVAICKPLLYPVIMNNSLCIRLLAFSFLGGFLHALIHEVLIFRLTFCNSNIIH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HFYCDILPLYRLSCVDPYINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFKMKSKEGRA
::::::.::. .::.:: :: :..::.:::.::::: .:: :: . :.::.: :: .:
CCDS33 HFYCDIIPLFMISCTDPSINFLMVFILSGSIQVFTIVTVLNSYTFALFTILKKKSVRGVR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAFSTCASHFLSVSLFYGSLFFMYVRPNLLEEGDKDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNR
::::::..:.:::::.:: :.:::.:: . :.:. ....::..:::::.::::::.
CCDS33 KAFSTCGAHLLSVSLYYGPLIFMYLRPASPQADDQDMIDSVFYTIIIPLLNPIIYSLRNK
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 EVISVLRKILMKK
.::. . :.. .
CCDS33 QVIDSFTKMVKRNV
310
>>CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 (309 aa)
initn: 1135 init1: 1116 opt: 1134 Z-score: 928.1 bits: 179.8 E(32554): 2.3e-45
Smith-Waterman score: 1134; 52.1% identity (82.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:3-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MAEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHRRLHTP
..: :.:. .::.:::.::.: :..:.::::...::::.:::..:..::.. .:: :
CCDS33 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYIFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSENKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAM
::.:::.::. :.: . .:::.:: ::.... ::: :: .::::. . :..::::. :
CCDS33 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
70 80 90 100 110 120
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CCDS33 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
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CCDS33 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
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CCDS33 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
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300
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CCDS33 HALRRVIRK
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CCDS33 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
310 320
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CCDS33 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
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CCDS33 CGAHLFSVSLYYGPLLFIYVGPASPQADDQDMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVTVS
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CCDS33 FTKMLKKHVKVSY
310
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CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
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CCDS33 LLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATMAY
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CCDS33 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFYCD
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CCDS33 IIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAFST
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CCDS33 FTKMFKRNDV
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70 80 90 100 110 120
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70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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CCDS33 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYIAGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ILPLYRLSCVDPYINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFKMKSKEGRAKAFST
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CCDS33 TIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILISYTFVLFTVLEKKSDKGVRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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CCDS33 FIKMLKRNVKVSY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]