FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5080, 321 aa
1>>>pF1KE5080 321 - 321 aa - 321 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3013+/-0.000485; mu= 21.5869+/- 0.030
mean_var=117.7765+/-35.065, 0's: 0 Z-trim(108.1): 421 B-trim: 839 in 1/51
Lambda= 0.118180
statistics sampled from 15504 (16134) to 15504 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 6.350
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 869 160.1 5.4e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 830 153.5 5.4e-37
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 826 152.8 8.7e-37
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 820 151.8 1.8e-36
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 798 148.0 2.3e-35
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 772 143.6 5.1e-34
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 772 143.6 5.1e-34
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 772 143.6 5.2e-34
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 763 142.0 1.5e-33
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 757 141.0 3e-33
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 755 140.7 3.8e-33
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 752 140.2 5.5e-33
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 748 139.5 8.7e-33
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 742 138.5 1.8e-32
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XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 742 138.5 1.8e-32
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 740 138.1 2.2e-32
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 733 136.9 5.1e-32
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 689 129.5 9.6e-30
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 688 129.2 1e-29
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 501 97.4 4.2e-20
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 480 93.8 5e-19
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 239 52.9 1.3e-06
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 236 52.5 2e-06
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 235 52.3 2.3e-06
NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 227 50.9 5.9e-06
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 221 49.7 9.9e-06
NP_795345 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 1 ( 342) 220 49.5 1.2e-05
NP_073625 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 1 ( 342) 220 49.5 1.2e-05
XP_016862558 (OMIM: 600515,609821) PREDICTED: P2Y ( 342) 220 49.5 1.2e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 215 48.7 2.1e-05
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 216 49.0 2.1e-05
XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 216 49.1 2.3e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 204 46.8 7.4e-05
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 203 46.9 0.0001
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 200 46.0 0.00012
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 200 46.1 0.00012
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 201 46.4 0.00012
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 200 46.1 0.00012
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 200 46.1 0.00012
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NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 200 46.2 0.00013
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 200 46.2 0.00013
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 200 46.2 0.00013
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NP_001043 (OMIM: 182454) somatostatin receptor typ ( 388) 200 46.2 0.00013
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 200 46.2 0.00013
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 199 45.9 0.00013
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>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 890 init1: 869 opt: 869 Z-score: 821.1 bits: 160.1 E(85289): 5.4e-39
Smith-Waterman score: 869; 40.3% identity (74.4% similar) in 305 aa overlap (2-306:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHS
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:::.::..::.::::. . ..:: ..: . :: . :..:..: .::...: ..:.:
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120 130 140 150 160 170
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240 250 260 270 280 290
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300 310 320
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..:...... :
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 830; 40.9% identity (72.8% similar) in 313 aa overlap (3-314:6-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSD-ERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSP
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pF1KE5 SYDRYAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFF
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NP_001 AYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFF
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pF1KE5 CDVPQMLKLACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKVF
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NP_001 CDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAF
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pF1KE5 STCLPHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSMK
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NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
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300 310 320
pF1KE5 AALRKMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
::.. : .:: :
NP_001 DALKR------LQKRKCC
300 310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 826; 41.5% identity (71.6% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMYYF
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pF1KE5 LKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSYDR
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pF1KE5 YAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCDVP
:.:.:::::: ::. :: : . . ..:. : . ..... .. .:.: : . .: :.::
NP_009 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVP
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pF1KE5 QMLKLACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKVFSTCL
...:.: ::: .:. .. . : :..:: : .:::: ::.:: :.:.::
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pF1KE5 PHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSMKAALR
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NP_009 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAFR
250 260 270 280 290 300
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pF1KE5 KMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
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NP_009 RLLGKEMGLTQS
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSP
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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: .:.:
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
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Smith-Waterman score: 798; 41.6% identity (71.3% similar) in 296 aa overlap (1-296:1-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMYYF
::: .: ::::.:::.. :. .: :..:::.:.:: ::: . ..: .::::::.:
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XP_011 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVP
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...:.: ::: .:. .. . : :..:: : .:::: ::.:: :.:.::
XP_011 ALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCS
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pF1KE5 PHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSMKAALR
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XP_011 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRRGS
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pF1KE5 KMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 772; 38.9% identity (70.6% similar) in 306 aa overlap (3-305:5-307)
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pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMY
: .:.: :::.:.: . . : : . :: :: .. :::::: ...: ::.:::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VPQMLKLACSYEFINEIAL---AAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKV
: .:::.:: .::. . .:.. . :.:... ::..: :::..::..:: :.
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILA---SYMHITCTVLKVPSTKGRWKA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FSTCLPHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSM
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NP_036 FSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYL
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE5 KAALRKMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
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NP_036 KGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 772 init1: 751 opt: 772 Z-score: 731.7 bits: 143.6 E(85289): 5.1e-34
Smith-Waterman score: 772; 38.9% identity (70.6% similar) in 306 aa overlap (3-305:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 VPQMLKLACSYEFINEIAL---AAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKV
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILA---SYMHITCTVLKVPSTKGRWKA
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pF1KE5 FSTCLPHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSM
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XP_011 FSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYL
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE5 KAALRKMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
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XP_011 KGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 772 init1: 751 opt: 772 Z-score: 731.6 bits: 143.6 E(85289): 5.2e-34
Smith-Waterman score: 772; 38.9% identity (70.6% similar) in 306 aa overlap (3-305:15-317)
10 20 30 40
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIIT
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 VDRRLHSPMYYFLKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASS
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 EVAILTVMSYDRYAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 KRVIHQFFCDVPQMLKLACSYEFINEIAL---AAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLR
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILA---SYMHITCTVLK
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pF1KE5 IPSAEGRTKVFSTCLPHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNP
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XP_011 VPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNP
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pF1KE5 VIYSLRNDSMKAALRKMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
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XP_011 FIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 717 init1: 629 opt: 763 Z-score: 723.4 bits: 142.0 E(85289): 1.5e-33
Smith-Waterman score: 763; 39.9% identity (69.3% similar) in 306 aa overlap (3-305:5-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMY
: . : :::.:.:. . : . .:: ::....::.::: :. : :::.:.:
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSY
.:: .::. :: :.. :.:. ..: : :: . :. :..:...:.. . ::.::.:
NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCD
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NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 VPQMLKLACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLIS---IVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKV
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NP_002 MYVLLRMACSNIQINHTVLIA---TGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKA
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NP_002 FSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLK-PLHTYSVKDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDM
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pF1KE5 KAALRKMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
..:: ..:.:
NP_002 HGALGRLLDKHFKRLT
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 754 init1: 723 opt: 757 Z-score: 717.8 bits: 141.0 E(85289): 3e-33
Smith-Waterman score: 757; 38.6% identity (71.8% similar) in 308 aa overlap (3-308:5-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMY
: .... :.:.::::. .:. . .:.:..:::.:.:: :: . .: .::.:::
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMG-NGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMS
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYN-LNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMA
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pF1KE5 YDRYAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFC
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NP_001 YDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLR
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 DVPQMLKLACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKVFS
..: ....:: : .. ........ :. :.::: : .::.: :: :: :.:.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]