Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5079
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5079, 359 aa
1>>>pF1KE5079 359 - 359 aa - 359 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6483+/-0.000392; mu= 15.3102+/- 0.024
mean_var=89.8987+/-19.839, 0's: 0 Z-trim(113.3): 181 B-trim: 1254 in 1/52
Lambda= 0.135269
statistics sampled from 22331 (22573) to 22331 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 7.990
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 894 184.7 2.5e-46
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 881 182.1 1.4e-45
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 849 175.9 1.1e-43
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 849 175.9 1.1e-43
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 849 175.9 1.1e-43
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 842 174.5 2.8e-43
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 842 174.5 2.8e-43
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 842 174.5 2.8e-43
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 830 172.2 1.4e-42
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 813 168.9 1.4e-41
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 809 168.1 2.4e-41
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 795 165.4 1.6e-40
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 777 161.8 1.8e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 752 157.0 5.4e-38
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 740 154.6 2.7e-37
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 738 154.2 3.7e-37
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 736 153.8 4.7e-37
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 733 153.2 6.8e-37
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 732 153.1 7.9e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 685 143.9 4.6e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 515 110.7 4.6e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 473 102.5 1.3e-21
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 188 47.0 8.5e-05
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 188 47.0 8.5e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 171 43.6 0.00076
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 171 43.6 0.00084
NP_001091682 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor ( 487) 171 43.7 0.001
NP_001091683 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor ( 487) 171 43.7 0.001
XP_011531954 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 171 43.7 0.001
NP_000852 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor [Ho ( 487) 171 43.7 0.001
XP_016861772 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 171 43.7 0.001
NP_001091681 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor ( 487) 171 43.7 0.001
XP_011531955 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 171 43.7 0.001
XP_016861773 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 171 43.7 0.001
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 167 42.8 0.0013
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 167 42.8 0.0013
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 164 42.3 0.0021
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 164 42.3 0.0022
NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 164 42.3 0.0022
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 164 42.3 0.0022
NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 164 42.3 0.0023
NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 164 42.3 0.0024
NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 155 40.5 0.0075
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 154 40.3 0.0077
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 904 init1: 758 opt: 894 Z-score: 952.9 bits: 184.7 E(85289): 2.5e-46
Smith-Waterman score: 894; 45.7% identity (76.8% similar) in 302 aa overlap (1-296:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHKPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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pF1KE5 FFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEACLLSG-MA
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYF-FISLATTECILFGLMA
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pF1KE5 YDRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYSY
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NP_003 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
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pF1KE5 EMPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGL---GNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSK
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NP_003 DSPPLFKLSCSD---TILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHR
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pF1KE5 AFSTCSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSGSPI--ELIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKE
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NP_003 AFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 VKGERSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAA
::
NP_003 VKKALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 869 init1: 767 opt: 881 Z-score: 939.2 bits: 182.1 E(85289): 1.4e-45
Smith-Waterman score: 881; 47.3% identity (75.3% similar) in 296 aa overlap (4-296:5-299)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHKPM
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pF1KE5 YEMPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSKAF
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pF1KE5 STCSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSG--SPIELIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKEVK
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NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
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300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GERSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAAPT
NP_001 DALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 849; 45.8% identity (71.2% similar) in 299 aa overlap (1-297:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHKPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEACLLSGMAY
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pF1KE5 DRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYSYE
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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300 310 320 330 340 350
pF1KE5 RSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAAPTAL
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 849; 45.8% identity (71.2% similar) in 299 aa overlap (1-297:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHKPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEACLLSGMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYSYE
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 MPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSKAFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSGSPIE--LIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKEVKGE
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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pF1KE5 RSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAAPTAL
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 870 init1: 723 opt: 849 Z-score: 905.2 bits: 175.9 E(85289): 1.1e-43
Smith-Waterman score: 849; 45.8% identity (71.2% similar) in 299 aa overlap (1-297:11-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIR
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 ADSCLHKPMYFFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGT
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 EACLLSGMAYDRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCE
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 AKIIHHYSYEMPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE5 TSGRSKAFSTCSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSGSPIE--LIFSVQYTVVTPMLNSLIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 SLKNKEVKGERSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACAC
::.:. .::
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 859 init1: 706 opt: 842 Z-score: 898.0 bits: 174.5 E(85289): 2.8e-43
Smith-Waterman score: 842; 43.5% identity (76.3% similar) in 299 aa overlap (1-297:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHKPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEACLLSGMAY
:::..::.::. ... .::..: ..:...:.: ..: ::.:: .. .: : ::. :::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYSYE
::..:.: : :. :: : .:. :: ::... ... .. .. .:. :.: : : :
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 CSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSGSPI--ELIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKEVKGE
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 859 init1: 706 opt: 842 Z-score: 898.0 bits: 174.5 E(85289): 2.8e-43
Smith-Waterman score: 842; 43.5% identity (76.3% similar) in 299 aa overlap (1-297:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHKPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEACLLSGMAY
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pF1KE5 DRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYSYE
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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pF1KE5 RSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAAPTAL
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 859 init1: 706 opt: 842 Z-score: 898.0 bits: 174.5 E(85289): 2.8e-43
Smith-Waterman score: 842; 43.5% identity (76.3% similar) in 299 aa overlap (1-297:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHKPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEACLLSGMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYSYE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 CSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSGSPI--ELIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKEVKGE
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 RSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAAPTAL
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 834 init1: 730 opt: 830 Z-score: 885.4 bits: 172.2 E(85289): 1.4e-42
Smith-Waterman score: 830; 44.6% identity (72.1% similar) in 312 aa overlap (1-308:1-312)
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 MPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSKAFST
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
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pF1KE5 CSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMP--NSGSPIELIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKEVKG-
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
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pF1KE5 -ERSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAAPT
:: : .. :
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 782 init1: 691 opt: 813 Z-score: 867.4 bits: 168.9 E(85289): 1.4e-41
Smith-Waterman score: 813; 43.9% identity (73.2% similar) in 310 aa overlap (5-305:7-314)
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 MYFFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEACLLSGM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 AYDRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYS
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pF1KE5 YEMPSLLPLSCSD--ISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSK
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVE--IICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKK
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NP_006 TFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKD
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]