FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5079, 359 aa
1>>>pF1KE5079 359 - 359 aa - 359 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7274+/-0.000916; mu= 14.7976+/- 0.055
mean_var=111.5941+/-30.323, 0's: 0 Z-trim(106.8): 363 B-trim: 1003 in 2/50
Lambda= 0.121410
statistics sampled from 8737 (9166) to 8737 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 2.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31789.1 OR8S1 gene_id:341568|Hs108|chr12 ( 359) 2356 423.8 1.1e-118
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CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 887 166.5 2.9e-41
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 881 165.4 5.9e-41
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CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 864 162.4 4.8e-40
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CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 855 160.8 1.4e-39
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CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 845 159.1 4.8e-39
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 842 158.6 6.7e-39
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CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 840 158.2 8.7e-39
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 839 158.0 9.9e-39
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CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 836 157.5 1.4e-38
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CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 833 157.0 2.1e-38
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CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 826 155.8 4.7e-38
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CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 818 154.4 1.2e-37
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 818 154.4 1.3e-37
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CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 817 154.2 1.4e-37
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CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 812 153.3 2.7e-37
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 809 152.8 3.7e-37
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 808 152.6 4.2e-37
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 808 152.6 4.2e-37
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 808 152.6 4.2e-37
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 808 152.6 4.2e-37
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 807 152.4 4.7e-37
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 807 152.5 5.1e-37
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 804 151.9 6.8e-37
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 804 151.9 7e-37
>>CCDS31789.1 OR8S1 gene_id:341568|Hs108|chr12 (359 aa)
initn: 2356 init1: 2356 opt: 2356 Z-score: 2244.2 bits: 423.8 E(32554): 1.1e-118
Smith-Waterman score: 2356; 99.7% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (1-359:1-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHKPMY
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CCDS31 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLMIRADSCLHKPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEACLLSGMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEACLLSGMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYSYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYSYE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSGSPIELIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKEVKGERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSGSPIELIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKEVKGERS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE5 LRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAAPTALP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAAPTALP
310 320 330 340 350
>>CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 904 init1: 758 opt: 894 Z-score: 861.0 bits: 167.7 E(32554): 1.2e-41
Smith-Waterman score: 894; 45.7% identity (76.8% similar) in 302 aa overlap (1-296:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHKPMY
:. :....:::.::::. ... .::..:: :: ::.. :: ..:.:: :: :: :::
CCDS31 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEACLLSG-MA
:::..:::::.: :..:.:::: .:::..:::: ::. :..: :.. .: :.: : ::
CCDS31 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYF-FISLATTECILFGLMA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYSY
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CCDS31 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EMPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGL---GNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSK
. : :. ::::: ... :..: :. :..:... ::. .. .:.:. : :: .
CCDS31 DSPPLFKLSCSD---TILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFSTCSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSGSPI--ELIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKE
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CCDS31 AFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 VKGERSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAA
::
CCDS31 VKKALANVISRKRTSSFL
300 310
>>CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 (324 aa)
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Smith-Waterman score: 887; 45.0% identity (76.7% similar) in 300 aa overlap (1-296:1-299)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MALG-NHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHKPM
::.: :.. .:.:.::::: :... .::.::::.::::. :: :. .:. :: :: ::
CCDS31 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHMPM
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pF1KE5 YFFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEAC-LLSGM
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CCDS31 YFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQ-YFVFCGMGLTECFLLAAM
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pF1KE5 AYDRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYS
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CCDS31 AYDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINHFF
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pF1KE5 YEMPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSKAF
..: .: ::::: : .. . ... :. . :.:..:: :......:::..::.:::
CCDS31 CDLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTKAF
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pF1KE5 STCSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSGSPI--ELIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKEVK
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CCDS31 STCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIK
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pF1KE5 GERSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAAPT
CCDS31 NAMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
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>>CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 (311 aa)
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Smith-Waterman score: 881; 47.3% identity (75.3% similar) in 296 aa overlap (4-296:5-299)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHKPM
:: . :: :.:::.: : : .::..:: ::. .. :: :...:: :: :: ::
CCDS31 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAG-TEACLLSGM
:::::.:::.:.:. : ::::: :::....::. ::. : .:.: : : .:.::...:
CCDS31 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQ-YFIFSTMGLSESCLMTAM
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pF1KE5 AYDRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYS
::::.:::: ::::..::. : . .: :.. :. .:... ... :: ...:.:.
CCDS31 AYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFF
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pF1KE5 YEMPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSKAF
.::.:: :::.: . :.. :... :....:: : .:..:.:..::::::
CCDS31 CDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSG--SPIELIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKEVK
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CCDS31 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GERSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAAPT
CCDS31 DALKRLQKRKCC
300 310
>>CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 (322 aa)
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Smith-Waterman score: 864; 45.8% identity (75.9% similar) in 299 aa overlap (1-297:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHKPMY
:. :.:...::::::: :. .:..:.::::.:: :.. ::...:.:. :: :: :::
CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEACLLSGMAY
::::::...:. :::: ::::: :. .:. .. .::..:..: . : .. :...:::
CCDS35 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMNMQTQHLAVFYKGCISQTYFFIFFADLDSFLITSMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYSYE
::..:::.:: :. :: .. . :: ::: .. ::...:: ... :: .:: :: .
CCDS35 DRYVAICHPLHYATIMTQSQCVMLVAGSWVIACACALLHTLLLAQLSFCADHIIPHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSKAFST
. .:: ::::: : . .:.. ..: . :: ...:: .: :::.: ::.: ::.::
CCDS35 LGALLKLSCSDTSLNQLAIFTAALTAIMLPFLCILVSYGHIGVTILQIPSTKGICKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 CSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSGSPIE--LIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKEVKGE
:..::..::.:: . . ...: :.. . .: :: ::.:::::: .::::.::..::
CCDS35 CGSHLSVVTIYYRTIIGLYFLPPSSNTNDKNIIASVIYTAVTPMLNPFIYSLRNKDIKGA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 RSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAAPTAL
CCDS35 LRKLLSRSGAVAHACNLNTLGG
310 320
>>CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 (326 aa)
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Smith-Waterman score: 864; 47.1% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (1-302:18-322)
10 20 30 40
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENL
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CCDS31 MGFLSPMHPCRPPTQRRMAAGNHSTVTEFILKGLTKRADLQLPLFLLFLGIYLVTIVGNL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 MLLLVIRADSCLHKPMYFFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFF
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CCDS31 GMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPKMLVNFVSEKNIISYAGCMSQLYF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 VFVTAGTEACLLSGMAYDRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLA
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CCDS31 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 VNMVFCEAKIIHHYSYEMPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIIS
... .:: : :.. .: :. ::::. .... :. .. . . : :..::: :.:
CCDS31 LKLPYCEHLISHYFCDILP-LMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILS
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 TILSISSTSGRSKAFSTCSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSGSPI--ELIFSVQYTVVTP
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CCDS31 SILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIP
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
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::: :::::.:::::. ...::
CCDS31 MLNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
300 310 320
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHKPMY
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CCDS32 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEACLLSGMAY
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CCDS32 FFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENKAISYMDCLTQVYFSMFFPILDTLLLTVMAY
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pF1KE5 DRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHHYSYE
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CCDS32 DRFVAVCHPLHYMIIMNPHLCGLLVFVTWLIGVMTSLLHISLMMHLIFCKDFEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 MPSLLPLSCSD--ISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSKAF
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CCDS32 LTYILQLACSDTFLNSTLIYFMTGVL--GVFPLLGIIFSYSRIASSIRKMSSSGGKQKAL
190 200 210 220 230
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pF1KE5 STCSAHLTAVTLYYGSGLLRHL---MPNSGSPIELIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKEV
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CCDS32 STCGSHLSVVSLFYGTGIGVHFTSAVTHSSQKIS-VASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 KGERSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAAP
::
CCDS32 KGALGSLLSRAASCL
300 310
>>CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 (315 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MALGNHSTITEFLLLGLSADPNIRALLFVLFLGIYLLTIMENLMLLLVIRADSCLHK
: :..: :.:::.. :...::::: :::::: :. :: :...::.:. ::
CCDS31 MSITKAWNSSSVTMFILLGFTDHPELQALLFVTFLGIYLTTLAWNLALIFLIRGDTHLHT
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pF1KE5 PMYFFLSHLSFVDLCFSSVIVPKMLENLLSQRKTISVEGCLAQVFFVFVTAGTEACLL-S
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CCDS31 PMYFFLSNLSFIDICYSSAVAPNMLTDFFWEQKTISFVGCAAQ-FFFFVGMGLSECLLLT
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 GMAYDRHAAICRPLLYGQIMGKQLYMHLVWGSWGLGFLDALINVLLAVNMVFCEAKIIHH
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CCDS31 AMAYDRYAAISSPLLYPTIMTQGLCTRMVVGAYVGGFLSSLIQASSIFRLHFCGPNIINH
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 YSYEMPSLLPLSCSDISRSLIALLCSTLLHGLGNFLLVFLSYTRIISTILSISSTSGRSK
. ..: .: ::::: : .. . .. : .:: ...:: :.:..:.: :. :: :
CCDS31 FFCDLPPVLALSCSDTFLSQVVNFLVVVTVGGTSFLQLLISYGYIVSAVLKIPSAEGRWK
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pF1KE5 AFSTCSAHLTAVTLYYGSGLLRHLMPNSGSPI--ELIFSVQYTVVTPMLNSLIYSLKNKE
: .::..:: .::: .:..:. .: :.:. . . . :: :..: :::: :::::.:::
CCDS31 ACNTCASHLMVVTLLFGTALFVYLRPSSSYLLGRDKVVSVFYSLVIPMLNPLIYSLRNKE
240 250 260 270 280 290
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pF1KE5 VKGERSLRDSSHLPQLHKGQARWKRPAFTEGRREPGHPELSIPVTPQPQGACACSALRAA
.:
CCDS31 IKDALWKVLERKKVFS
300 310
>>CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 (312 aa)
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CCDS31 MMGRRNDTNVADFILTGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTS-NYISFTGCFAQMFCFVFL--GTAECYLLSS
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CCDS31 MAYDRYAAICSPLHYTVIMPKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHF
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CCDS31 FCDTSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTL--MVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQ
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CCDS31 KAFSTCVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNR
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:::
CCDS31 EVKNALIRVMQRRQDSR
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CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS10 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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