Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5063
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5063, 517 aa
1>>>pF1KE5063 517 - 517 aa - 517 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2234+/-0.00222; mu= 15.8721+/- 0.132
mean_var=246.0975+/-51.591, 0's: 0 Z-trim(99.4): 972 B-trim: 10 in 1/50
Lambda= 0.081756
statistics sampled from 4704 (5734) to 4704 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.432), E-opt: 0.2 (0.176), width: 16
Scan time: 2.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47596.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 517) 3644 444.7 1.2e-124
CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 586) 3644 444.8 1.2e-124
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 3603 439.9 3.5e-123
CCDS75609.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 510) 3598 439.3 5e-123
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 2620 324.1 2.9e-88
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 2576 318.8 1e-86
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 2532 313.7 4.1e-85
CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 586) 2525 312.8 6.7e-85
CCDS74323.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 618) 2525 312.9 6.9e-85
CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 2525 312.9 7.1e-85
CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 574) 2499 309.7 5.6e-84
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 2499 309.8 5.8e-84
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 2488 308.4 1.4e-83
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 2481 307.6 2.5e-83
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2461 305.5 1.5e-82
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2461 305.5 1.5e-82
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2461 305.5 1.5e-82
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 ( 576) 2446 303.5 4.2e-82
CCDS5527.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 783) 2430 301.8 1.8e-81
CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 852) 2430 301.9 1.9e-81
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2431 302.2 2.1e-81
CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 2414 299.8 6.1e-81
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2416 300.4 7e-81
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 2411 299.6 9.1e-81
CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 820) 2405 298.9 1.4e-80
CCDS46030.1 ZNF257 gene_id:113835|Hs108|chr19 ( 563) 2401 298.2 1.7e-80
CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 2381 295.8 8.3e-80
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 2371 294.6 1.9e-79
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 2361 293.4 4.3e-79
CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19 ( 555) 2347 291.8 1.4e-78
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 2342 291.2 2.1e-78
CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 ( 570) 2335 290.4 3.7e-78
CCDS5528.2 ZNF273 gene_id:10793|Hs108|chr7 ( 569) 2310 287.4 2.8e-77
CCDS46028.1 ZNF90 gene_id:7643|Hs108|chr19 ( 601) 2282 284.2 2.9e-76
CCDS34644.1 ZNF680 gene_id:340252|Hs108|chr7 ( 530) 2257 281.1 2.1e-75
CCDS43593.1 ZNF117 gene_id:51351|Hs108|chr7 ( 483) 2222 276.9 3.5e-74
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 2193 273.6 4e-73
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2151 269.3 1.9e-71
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 2129 266.4 9.7e-71
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 2124 265.4 1.1e-70
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 2124 265.4 1.1e-70
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 2113 264.8 4.2e-70
CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 646) 2063 258.4 1.8e-68
CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 774) 2063 258.5 2e-68
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 1969 247.1 3.4e-65
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1942 243.9 3e-64
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1942 244.1 3.4e-64
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1942 244.1 3.5e-64
CCDS59370.1 ZNF728 gene_id:388523|Hs108|chr19 ( 622) 1912 240.6 4e-63
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1910 240.4 5e-63
>>CCDS47596.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 (517 aa)
initn: 3644 init1: 3644 opt: 3644 Z-score: 2351.5 bits: 444.7 E(32554): 1.2e-124
Smith-Waterman score: 3644; 100.0% identity (100.0% similar) in 517 aa overlap (1-517:1-517)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 QHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHME
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 KCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 CGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 FNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKF
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE5 STLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQT
490 500 510
>>CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 (586 aa)
initn: 3644 init1: 3644 opt: 3644 Z-score: 2351.0 bits: 444.8 E(32554): 1.2e-124
Smith-Waterman score: 3644; 100.0% identity (100.0% similar) in 517 aa overlap (1-517:70-586)
10 20 30
pF1KE5 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVFLGIAVSKPDLITWLEQGKEPWNLKRHEMVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVI
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 LRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPN
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 VNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKH
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 KIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIH
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEK
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 PYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKC
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 EECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECG
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 KAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFN
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 QSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNY
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 TKEKLQT
:::::::
CCDS34 TKEKLQT
580
>>CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 (554 aa)
initn: 3603 init1: 3603 opt: 3603 Z-score: 2325.1 bits: 439.9 E(32554): 3.5e-123
Smith-Waterman score: 3603; 100.0% identity (100.0% similar) in 511 aa overlap (7-517:44-554)
10 20 30
pF1KE5 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SLEEWQCLDTAQRNLYRDVMLENYRNLVFLVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGK
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 YGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKI
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 RHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTG
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPY
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 KCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEE
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 CGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKA
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 FKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVF
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 STLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 STLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLT
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 ARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQ
500 510 520 530 540 550
pF1KE5 T
:
CCDS75 T
>>CCDS75609.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 (510 aa)
initn: 3598 init1: 3598 opt: 3598 Z-score: 2322.2 bits: 439.3 E(32554): 5e-123
Smith-Waterman score: 3598; 100.0% identity (100.0% similar) in 510 aa overlap (8-517:1-510)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 QHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHME
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPY
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 KCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 CGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKA
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 FNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKF
420 430 440 450 460 470
490 500 510
pF1KE5 STLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 STLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQT
480 490 500 510
>>CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 6268 init1: 2557 opt: 2620 Z-score: 1698.1 bits: 324.1 E(32554): 2.9e-88
Smith-Waterman score: 2620; 72.3% identity (86.2% similar) in 516 aa overlap (1-515:70-585)
10 20 30
pF1KE5 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVI
:::. : .: :::::.:::....:::::::
CCDS59 LAFLGIAVSKPDLIICLEKEKEPWNMKRDEMVDEPPGICPHFAQDIWPEQGVEDSFQKVI
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 LRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPN
:: . : ::::::::: :::: :::.: ::::::::.:::..: :: ::.:::.:: :
CCDS59 LRRFEKCGHENLQLRKGCKSVDECKVHKEGYNGLNQCFTTTQGKASQCGKYLKVFYKFIN
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 VNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKH
.:: ::::: :::::::: :::::.:. ::::.:.: : ::::.::::.::::::::.:
CCDS59 LNRYKIRHTRKKPFKCKNCVKSFCMFSHKTQHKSIYTTEKSYKCKECGKTFNWSSTLTNH
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 KIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIH
: :: :::::::: :::::.::: : ::. ::::::::::::::::..::::: :::::
CCDS59 KKTHTEEKPYKCEEYGKAFNQSSNYTTHKVTHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTIHKRIH
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEK
: ::: :::::::::.: : :. :::.:. .:::::::::::: : : .:: .:.:::
CCDS59 TGEKPCKCEECGKAFSQPSALTIHKRMHIGEKPYKCEECGKAFVWSSTLTRHKRLHSGEK
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 PYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKC
:::::::.:::.::..:: :.:::::::::::.:::::: ::::::::::::::::::
CCDS59 PYKCEECAKAFSQFGHLTTHRIIHTGEKPYKCEECGKAFIWPSTLTKHKRIHTGEKPYKC
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 EECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECG
:::::::..::.::.::::::::::::::.::::: ::: .:.::. : ..::::::::.
CCDS59 EECGKAFHRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSNLTEHKKIHTREKPYKCEECS
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 KAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFN
:::: :.:: :: .:: :::::::::::::.::: .: :::::: : ::::.::.::
CCDS59 KAFSRSSALTTHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFI
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500
pF1KE5 QSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCK-HECGRAFNKSSN
::.:. .: :.::::::: ::: :.::. :.: ::.::.::::: : .:::.:::.:::
CCDS59 LSSTLSKHKRIHTGEKPYKCEECGKTFNQSSNLSTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSN
520 530 540 550 560 570
510
pF1KE5 YTKEKLQT
. .:.
CCDS59 LSTHKIIHTGEKPYKCDECGKSFIWSSTLFKHKRIHT
580 590 600 610
>>CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 (595 aa)
initn: 4338 init1: 2535 opt: 2576 Z-score: 1670.1 bits: 318.8 E(32554): 1e-86
Smith-Waterman score: 2576; 71.7% identity (84.9% similar) in 516 aa overlap (1-515:71-586)
10 20 30
pF1KE5 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVI
:: : :::::::::.:::..::::::::
CCDS32 VFLGITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVT
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 LRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPN
:. ::: :::: ::: .:.: ::..::: ::::::::.:.:::::::::::: ::: :
CCDS32 LKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSN
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 VNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKH
::..:::: :::::: . :::: :.: ::.:..:::: :::::::::::::::::::
CCDS32 SNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKH
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 KIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIH
: ::::::::::::::::::.:::: ::: :::::::::::::::.::: :::: :: ::
CCDS32 KRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIH
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEK
: ::::::.:::::::. : :. :..:: .::::::::::::. : : :::::::::
CCDS32 TGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEK
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 PYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKC
::::..::::::: ..:: :..::::::::::..::::::. : :: :: ::::::::::
CCDS32 PYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKC
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 EECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECG
.:::::::.:::::.:::::::::::::..: :::. :: .:.::. : .:::.::.::
CCDS32 KECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCG
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 KAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFN
:::. :.::.:: ::.:::::::::::.:. : .: :::::: : ::::.::.:::
CCDS32 KAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFN
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500
pF1KE5 QSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCK-HECGRAFNKSSN
:::.:: .: :.:::::: ::: ::::. :.: :. :.::::: : .:: .::. ::
CCDS32 QSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSV
530 540 550 560 570 580
510
pF1KE5 YTKEKLQT
::.:.
CCDS32 LTKHKIIHTGEKLQI
590
>>CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 (674 aa)
initn: 9668 init1: 2488 opt: 2532 Z-score: 1641.6 bits: 313.7 E(32554): 4.1e-85
Smith-Waterman score: 2532; 69.6% identity (85.5% similar) in 516 aa overlap (1-514:70-584)
10 20 30
pF1KE5 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVI
:::. ::.:::::.: :::..::::::::
CCDS42 LVFLGIAVSKPDLITCLEKEKEPCKMKRHEMVDEPPVVCSHFAEDFWPEQDIKDSFQKVT
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 LRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPN
:: : : ::::::::: .:.: ::.::::::::::::: :.::...:: :::::. : :
CCDS42 LRRYDKRGHENLQLRKGYKTVGDCKLYKGGYNGLNQCLTLTQSKMYHCDIYVKVFYAFSN
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 VNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKH
..: : ::::::::.::. ::::::::::::::::: :: .:.:.: :.::: ::.::.:
CCDS42 ADRYKTRHTGKKPFQCKKCGKSFCMLSQLTQHKKIHIRENTYRCKEFGNAFNQSSALTNH
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 KIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIH
: :..::: :.:::::::::. :.::.:: ::::::::::.::::::.: :::: :::::
CCDS42 KRIYVGEKHYRCEECGKAFNHYSTLTNHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSRYSTLTTHKRIH
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEK
. ::::::.::::.:. : ..::: :: :.:::::.:::::: : : .:: ::::::
CCDS42 SGEKPYKCDECGKTFSISSTFTKHKIIHTEEKPYKCKECGKAFNRSSTLTSHKRIHTGEK
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 PYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKC
:::::::::::: :.:::::.::::::::::.:::::::::: ::.::.:::::.:::
CCDS42 PYKCEECGKAFNWSSTLTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSRLTRHKKIHTGEEPYKF
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 EECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECG
:.::..: :::::. : ::::::::.::.:::.:..::..:.::: : :.:::::.:::
CCDS42 EKCGRVFTCSSTLTQDKKIHTGEKPYNCEECGKVFTYSSTLTRHKRIHTEEKPYKCNECG
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 KAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFN
:::. : ::.:. ::: :::::::::::::.::: ...:: ::. : ::::.::.::
CCDS42 KAFNRSSHLTSHRRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLNSHKKIHSGEKPYKCEECGKAFI
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500
pF1KE5 QSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKP--CKHECGRAFNKSS
:: :: .: :.::::::: ::: ::::. : : :. :.::::: :: .: .::..::
CCDS42 LSSRLTQHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSRLTQHKKIHTGEKPYKCK-QCDKAFTHSS
520 530 540 550 560 570
510
pF1KE5 NYTKEKLQT
: ...:
CCDS42 NLSSHKKIHSGEKPYKCEECGKAFNRSSRLTQHKKIHTREKPYKCEECAKAFTRSSRLTQ
580 590 600 610 620 630
>>CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 (586 aa)
initn: 8020 init1: 2459 opt: 2525 Z-score: 1637.7 bits: 312.8 E(32554): 6.7e-85
Smith-Waterman score: 2571; 70.3% identity (81.6% similar) in 543 aa overlap (1-514:6-548)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACK
:::. : :: :::::.:::....:::::.::: ::::::::::::: :::: :
CCDS74 MKRHEMVDEPPGMCPHFAQDLWPEQGMEDSFQKAILRRYGKYGHENLQLRKGCKSVDEYK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 VYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCM
: : ::::::::.::..::.::::::.:::.:: : :: ::::: :: ::::.: : :::
CCDS74 VNKEGYNGLNQCFTTAQSKVFQCDKYLKVFYKFLNSNRPKIRHTEKKSFKCKKRVKLFCM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150
pF1KE5 LSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHK------------------------
::. ::::.:. :: ::::.::::.::::::::.:.
CCDS74 LSHKTQHKSIYHREKSYKCKECGKTFNWSSTLTNHRKIYTEEKPYKCEEYNKSPKQLSTL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KE5 ----IIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHK
:::.::: :::::::.::::::::: :::::::::::::::::::: :::::.::
CCDS74 TTHEIIHAGEKLYKCEECGEAFNRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTEHK
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 RIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHT
.:::..:::::::::::: : :..:::.: .:::::::::::: : : ::::::
CCDS74 KIHTRKKPYKCEECGKAFIWSSTLTRHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHT
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 GEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKP
::: ::: ::::::.:.:.:: :::::.::: :::.::::.::.::.:: :: :::::::
CCDS74 GEKRYKCLECGKAFKQLSTLTTHKIIHVGEKLYKCEECGKGFNRSSNLTTHKIIHTGEKP
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 YKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCE
:::::::::: :::::.:: ::: :::::::.::::: :::..:.::: : .::::::
CCDS74 YKCEECGKAFIWSSTLTKHKRIHTREKPYKCEECGKAFIWSSTLTRHKRMHTGEKPYKCE
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 ECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGN
::::.:: :::: :::::: :::::::::::::: :: .::::::::: : :::::::.
CCDS74 ECGKSFSQSSTLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGK
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 AFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCK-HECGRAFNK
::.::: :: .: :.::::::: ::: :.::. ::. :..:.:: :: : .:::.::
CCDS74 AFKQSSILTNHKRIHTGEKPYKCEECGKSFNRSSTFTKHKVIHTGVKPYKCEECGKAFFW
490 500 510 520 530 540
510
pF1KE5 SSNYTKEKLQT
::. ::.:
CCDS74 SSTLTKHKRIHTGEQPYKWEKFGKAFNRSSHLTTDKITHWREILQV
550 560 570 580
>>CCDS74323.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 (618 aa)
initn: 8020 init1: 2459 opt: 2525 Z-score: 1637.5 bits: 312.9 E(32554): 6.9e-85
Smith-Waterman score: 2571; 70.3% identity (81.6% similar) in 543 aa overlap (1-514:38-580)
10 20 30
pF1KE5 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVI
:::. : :: :::::.:::....:::::.:
CCDS74 LAFLGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHEMVDEPPGMCPHFAQDLWPEQGMEDSFQKAI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 LRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPN
:: ::::::::::::: :::: :: : ::::::::.::..::.::::::.:::.:: :
CCDS74 LRRYGKYGHENLQLRKGCKSVDEYKVNKEGYNGLNQCFTTAQSKVFQCDKYLKVFYKFLN
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 VNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKH
:: ::::: :: ::::.: : :::::. ::::.:. :: ::::.::::.::::::::.:
CCDS74 SNRPKIRHTEKKSFKCKKRVKLFCMLSHKTQHKSIYHREKSYKCKECGKTFNWSSTLTNH
130 140 150 160 170 180
160 170 180
pF1KE5 K----------------------------IIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIH
. :::.::: :::::::.::::::::: :::::
CCDS74 RKIYTEEKPYKCEEYNKSPKQLSTLTTHEIIHAGEKLYKCEECGEAFNRSSNLTTHKIIH
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDK
::::::::::::::: :::::.::.:::..:::::::::::: : :..:::.: .:
CCDS74 TGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTEHKKIHTRKKPYKCEECGKAFIWSSTLTRHKRMHTGEK
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 PYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKC
::::::::::: : : ::::::::: ::: ::::::.:.:.:: :::::.::: :::
CCDS74 PYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKRYKCLECGKAFKQLSTLTTHKIIHVGEKLYKC
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 DECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCG
.::::.::.::.:: :: ::::::::::::::::: :::::.:: ::: :::::::.::
CCDS74 EECGKGFNRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTKHKRIHTREKPYKCEECG
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 KAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFN
::: :::..:.::: : .::::::::::.:: :::: :::::: ::::::::::::::
CCDS74 KAFIWSSTLTRHKRMHTGEKPYKCEECGKSFSQSSTLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFN
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 QSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFST
:: .::::::::: : :::::::.::.::: :: .: :.::::::: ::: :.::. ::
CCDS74 WSSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGKAFKQSSILTNHKRIHTGEKPYKCEECGKSFNRSST
490 500 510 520 530 540
490 500 510
pF1KE5 LITHQIIYTGEKPCK-HECGRAFNKSSNYTKEKLQT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]