Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5010
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5010, 314 aa
1>>>pF1KE5010 314 - 314 aa - 314 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5289+/-0.000497; mu= 20.2774+/- 0.031
mean_var=93.1103+/-25.656, 0's: 0 Z-trim(107.6): 307 B-trim: 1853 in 2/51
Lambda= 0.132915
statistics sampled from 15191 (15640) to 15191 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.518), E-opt: 0.2 (0.183), width: 16
Scan time: 5.680
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1091 220.2 4.4e-57
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1018 206.2 7.1e-53
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 988 200.4 3.8e-51
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 947 192.6 8.9e-49
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 947 192.6 8.9e-49
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 947 192.6 9.1e-49
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 885 180.7 3.4e-45
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 878 179.3 8.5e-45
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 865 176.9 4.8e-44
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 855 174.9 1.8e-43
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 852 174.4 2.7e-43
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 845 173.0 6.9e-43
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 845 173.0 6.9e-43
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 831 170.4 4.6e-42
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 825 169.2 9.8e-42
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 824 169.0 1.1e-41
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 824 169.0 1.1e-41
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 824 169.0 1.1e-41
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 819 168.0 2.2e-41
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 798 164.0 3.5e-40
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 568 119.9 6.8e-27
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 503 107.5 3.9e-23
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 206 50.6 5.7e-06
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 204 50.1 6.8e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 202 49.8 9.5e-06
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 197 48.8 1.8e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 193 48.0 3.1e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 192 47.8 3.5e-05
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 182 45.9 0.00013
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 183 46.2 0.00013
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 182 45.9 0.00013
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 182 46.0 0.00014
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 182 46.0 0.00014
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 182 46.0 0.00015
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 182 46.1 0.00016
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 180 45.5 0.00017
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 180 45.7 0.0002
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 177 45.0 0.00026
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 176 45.0 0.00036
XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349) 174 44.4 0.0004
NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349) 174 44.4 0.0004
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 169 42.8 0.0004
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 169 43.4 0.00077
XP_011527461 (OMIM: 244200,607123) PREDICTED: prok ( 348) 168 43.3 0.00088
XP_016883135 (OMIM: 244200,607123) PREDICTED: prok ( 384) 168 43.3 0.00094
NP_658986 (OMIM: 244200,607123) prokineticin recep ( 384) 168 43.3 0.00094
NP_004113 (OMIM: 601898) growth hormone secretagog ( 289) 166 42.8 0.001
NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamin ( 422) 167 43.2 0.0011
NP_940799 (OMIM: 601898) growth hormone secretagog ( 366) 166 42.9 0.0012
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 166 42.9 0.0012
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 1089 init1: 1089 opt: 1091 Z-score: 1145.9 bits: 220.2 E(85289): 4.4e-57
Smith-Waterman score: 1091; 51.9% identity (82.1% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KE5 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNNEVKNA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LMKLLRRKISLSPG
: ... ::
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 1034 init1: 1005 opt: 1018 Z-score: 1070.2 bits: 206.2 E(85289): 7.1e-53
Smith-Waterman score: 1018; 48.2% identity (77.7% similar) in 309 aa overlap (4-312:6-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTP
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pF1KE5 ACDRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYF
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pF1KE5 CDIVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KE5 STCSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNNEVK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 NALMKLLRRKISLSPG
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 962 init1: 962 opt: 988 Z-score: 1039.2 bits: 200.4 E(85289): 3.8e-51
Smith-Waterman score: 988; 47.9% identity (78.8% similar) in 307 aa overlap (2-308:3-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPM
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pF1KE5 YYFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMA
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pF1KE5 CDRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KE5 DIVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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pF1KE5 TCSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNNEVKN
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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300 310
pF1KE5 ALMKLLRRKISLSPG
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NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 947; 44.7% identity (77.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
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pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
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pF1KE5 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNNEVKNA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LMKLLRRKISLSPG
: :.. : .
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 947; 44.7% identity (77.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
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pF1KE5 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNNEVKNA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LMKLLRRKISLSPG
: :.. : .
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 964 init1: 923 opt: 947 Z-score: 996.5 bits: 192.6 E(85289): 9.1e-49
Smith-Waterman score: 947; 44.7% identity (77.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:11-319)
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pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIR
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LNRQLHTPMYYFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVIS
.. ::::::.:::.:::.:.:.: . .::::.. . . ..::. ::. :..: . :
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ECYMLAAMACDRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SNIIKHYFCDIVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KKGRCKAFSTCSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 SLRNNEVKNALMKLLRRKISLSPG
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 902 init1: 883 opt: 885 Z-score: 932.5 bits: 180.7 E(85289): 3.4e-45
Smith-Waterman score: 885; 44.0% identity (74.5% similar) in 302 aa overlap (5-305:2-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLSSLSFLDF-CYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMA
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NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSII-PKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 CDRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFC
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NP_001 YDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DIVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFS
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NP_001 EIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNNEVKN
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NP_001 TCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQA
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ALMKLLRRKISLSPG
.. :..
NP_001 GIRKVFAFLKH
300
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 884 init1: 736 opt: 878 Z-score: 925.2 bits: 179.3 E(85289): 8.5e-45
Smith-Waterman score: 878; 44.6% identity (72.9% similar) in 303 aa overlap (5-307:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNNEVKNA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQ--QEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LMKLLRRKISLSPG
: :. :
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 880 init1: 851 opt: 865 Z-score: 911.7 bits: 176.9 E(85289): 4.8e-44
Smith-Waterman score: 865; 43.6% identity (75.2% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
::.:::: :: : :::.: .:.::: : . . : ...: . ::.: .. : :.::.
NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
. ..:..::.: .......: .. : :..::. :..:.. . : ::. :::::
NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNNEVKNA
:.::: .: .:::. ...::. : . : . ...::.:. : :::::.::::::..::.:
NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LMKLLRRKISLSPG
: .:: :
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 824 init1: 793 opt: 855 Z-score: 901.3 bits: 174.9 E(85289): 1.8e-43
Smith-Waterman score: 855; 40.8% identity (72.7% similar) in 304 aa overlap (2-305:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHT
: : :. :.: :... .:.. .: . : .: .:..::: .: . :. .:::
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYYFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAA
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MACDRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHY
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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pF1KE5 FCDIVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]