FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5010, 314 aa
1>>>pF1KE5010 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0763+/-0.00119; mu= 16.9280+/- 0.070
mean_var=158.1215+/-55.551, 0's: 0 Z-trim(101.8): 382 B-trim: 761 in 2/47
Lambda= 0.101995
statistics sampled from 6182 (6661) to 6182 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 1.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 2026 311.0 7.4e-85
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1334 209.2 3.4e-54
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1330 208.6 5e-54
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1286 202.2 4.5e-52
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1254 197.4 1.2e-50
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1247 196.4 2.4e-50
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1246 196.3 2.8e-50
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1228 193.6 1.7e-49
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1186 187.4 1.2e-47
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1175 185.8 3.7e-47
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1144 181.4 9.4e-46
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1120 177.7 1e-44
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1104 175.4 5.2e-44
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1092 173.6 1.7e-43
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1091 173.5 1.9e-43
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1087 172.9 2.9e-43
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1086 172.7 3.2e-43
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1085 172.6 3.6e-43
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1082 172.1 4.9e-43
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1081 172.0 5.3e-43
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1080 171.8 5.9e-43
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 1071 170.5 1.5e-42
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1066 169.8 2.5e-42
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1064 169.5 3.1e-42
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1059 168.8 5.2e-42
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1054 168.0 8.4e-42
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CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1041 166.1 3.2e-41
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 1040 166.0 3.6e-41
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1039 165.8 3.9e-41
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1037 165.5 4.7e-41
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1037 165.5 4.8e-41
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1029 164.3 1.1e-40
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1028 164.2 1.2e-40
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 1024 163.6 1.8e-40
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1022 163.3 2.2e-40
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1022 163.3 2.3e-40
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1020 163.0 2.7e-40
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1020 163.0 2.7e-40
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1018 162.7 3.3e-40
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 1017 162.6 3.7e-40
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1015 162.3 4.5e-40
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1013 162.0 5.5e-40
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1010 161.5 7.6e-40
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1003 160.5 1.5e-39
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 988 158.3 7.1e-39
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 983 157.7 1.3e-38
>>CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 2026 init1: 2026 opt: 2026 Z-score: 1636.9 bits: 311.0 E(32554): 7.4e-85
Smith-Waterman score: 2026; 99.0% identity (99.7% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAICSPLLYRVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNNEVKNA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::
CCDS31 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVILMLNPLIYSLRNNEVRNA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LMKLLRRKISLSPG
::::::::::::::
CCDS31 LMKLLRRKISLSPG
310
>>CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 (326 aa)
initn: 1333 init1: 735 opt: 1334 Z-score: 1086.4 bits: 209.2 E(32554): 3.4e-54
Smith-Waterman score: 1334; 65.7% identity (86.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:18-325)
10 20 30 40
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNL
:.. ::::::::.:.:::..:.:::::: :::::: ::.::::
CCDS31 MGFLSPMHPCRPPTQRRMAAGNHSTVTEFILKGLTKRADLQLPLFLLFLGIYLVTIVGNL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 SMISIIRLNRQLHTPMYYFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFF
.::..: :: :::::::::::.::..:.::::::::::: .:. . :::.::: ::.:
CCDS31 GMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPKMLVNFVSEKNIISYAGCMSQLYF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 FCVCVISECYMLAAMACDRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCI
: : ::.:::::..:: ::::::: ::::..::: ..: ::::.:...:. ..:. : .
CCDS31 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 LRLSFCGSNIIKHYFCDIVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILT
:.: .: ..:.::::::.::.:::::::: :. .: .:::...::::...::.:::.
CCDS31 LKLPYC-EHLISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILS
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 SILRIHSKKGRCKAFSTCSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIP
::: : . .:: ::::::::::.:: ::::: :::::.. ::::::.:.:::::::::
CCDS31 SILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIP
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE5 MLNPLIYSLRNNEVKNALMKLLRRKISLSPG
:::::::::::.::: :..: :: :.
CCDS31 MLNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
300 310 320
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 1314 init1: 1294 opt: 1330 Z-score: 1083.5 bits: 208.6 E(32554): 5e-54
Smith-Waterman score: 1330; 65.9% identity (87.9% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
: ..:.: ...:.:.:::.::::::::: ::::::.:::::::.:: .: .. ::::::
CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
::::::::.::::::::::::: .:: . .: :: ::.::::: : :..: :.:.:::
CCDS31 YFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAY
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
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CCDS31 DRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
..::..::::.:...:::.:.:.::: .. .:.. .:::::: :::.:.:..:: :::.:
CCDS31 VLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNNEVKNA
::::: ::..:.::. ::.:: ::.:: :::::::::::::::::::::::::..::.:
CCDS31 CSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LMKLLRRKISLSPG
: :.:
CCDS31 LRKVLVGK
>>CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1309 init1: 1267 opt: 1286 Z-score: 1048.4 bits: 202.2 E(32554): 4.5e-52
Smith-Waterman score: 1286; 60.8% identity (85.2% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
:. .:.:.::::.:.::.:: ::::::: ::::::.:::::::.: ..: :. .::::::
CCDS73 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
::::::::.:::.:.::::::: .:. . ::: :: ::.:: : .:.::.::::::
CCDS73 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
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CCDS73 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
..::.:::::: :...:::. .:.::... ::::. :: ::..:::.:.: .:: :::::
CCDS73 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNNEVKNA
::::. ::..:.:: :::.:.: ::. : :::::::: ..::::::::::::..:. .
CCDS73 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LMKLLRRKISLSPG
: :.:.:. :
CCDS73 LKKMLQRRTLL
310
>>CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1256 init1: 1237 opt: 1254 Z-score: 1023.0 bits: 197.4 E(32554): 1.2e-50
Smith-Waterman score: 1254; 59.3% identity (85.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
:...: : ::.:.:.:::.: .:.::: ::::.:.:::::::..:..:::: .::::::
CCDS84 MAAENSSFVTQFILAGLTDQPGVQIPLFFLFLGFYVVTVVGNLGLITLIRLNSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
.:: .:::.::::::::::::: .:. . ::::.::: ::::: :.:: ..:.:::
CCDS84 FFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKNSISYAGCMTQLFFFLFFVVSESFILSAMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
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CCDS84 DRYVAICNPLLYMVTMSPQVCFLLLLGVYGMGFAGAMAHTACMMGVTFCANNLVNHYMCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
:.::.. .:.:::..::..::. :... . ..::.::::.::.::..: : .:: :::::
CCDS84 ILPLLECACTSTYVNELVVFVVVGIDIGVPTVTIFISYALILSSIFHIDSTEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNNEVKNA
::::. :: .:.:: ::::: : ...: ::::.:::::.::::::::::::..:: :
CCDS84 CSSHIIAVSLFFGSGAFMYLKPFSLLAMNQGKVSSLFYTTVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LMKLLRRKISLSPG
: :.: .
CCDS84 LKKILNKNAFS
310
>>CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1260 init1: 1061 opt: 1247 Z-score: 1017.4 bits: 196.4 E(32554): 2.4e-50
Smith-Waterman score: 1247; 60.1% identity (84.7% similar) in 313 aa overlap (1-309:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNLSMISIIRLNRQLHTPMY
: ..:.: ::::.:.:::.. :.: ::: ::: .: ::.::::..: .. :: .::::::
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70 80 90 100 110 120
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CCDS31 ILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGINIMVPSCTILISYVFIVTSILHIKSTQGRSKAFST
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250 260 270 280 290
300 310
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CCDS31 LRKALIKIQRRNIF
300 310
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40 50 60 70 80 90
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>>CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 (313 aa)
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CCDS31 YFLFNLSFIDLCYSSVFTPKMLMNFVSKKNIISNVGCMTRLFFFLFFVISECYMLTSMAY
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pF1KE5 DRYVAICSPLLYKVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
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CCDS31 DRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGLAGATAHTGCMLRLTFCSANIINHYLCD
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pF1KE5 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
:.::..:::.:::..:...... : :... : ::.:::.::.::::.:.: .:: :::::
CCDS31 ILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGTNITVPSCTILISYVFIVTSILHIKSTQGRSKAFST
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pF1KE5 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNNEVK--
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CCDS31 CSSHVIALSLFFGSAAFMYIK-YSSGSMEQGKVSSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 --NALMKLLRRKISLSPG
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CCDS31 LRKALIKIQRRNIF
300 310
>>CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 (310 aa)
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CCDS31 MAAKN-SSVTEFILEGLTHQPGLRIPLFFLFLGFYTVTVVGNLGLITLIGLNSHLHTPMY
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pF1KE5 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
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CCDS31 FFLFNLSLIDFCFSTTITPKMLMSFVSRKNIISFTGCMTQLFFFCFFVVSESFILSAMAY
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CCDS31 DRYVAICNPLLYTVTMSCQVCLLLLLGAYGMGFAGAMAHTGSIMNLTFCADNLVNHFMCD
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CCDS31 ILPLLELSCNSSYMNELVVFIVVAVDVGMPIVTVFISYALILSSILHNSSTEGRSKAFST
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CCDS31 LRRTLGRKIFS
300 310
>>CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 (309 aa)
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CCDS31 MTLRNSSSVTEFILVGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVFTVVGNLGLITLIGINPSLHTPMY
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CCDS31 FFLFNLSFIDLCYSCVFTPKMLNDFVS-ESIISYVGCMTQLFFFCFFVNSECYVLVSMAY
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CCDS31 DRYVAICNPLLYMVTMSPRVCFLLMFGSYVVGFAGAMAHTGSMLRLTFCDSNVIDHYLCD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]