Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5004
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5004, 914 aa
1>>>pF1KE5004 914 - 914 aa - 914 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3210+/-0.000363; mu= 16.3181+/- 0.023
mean_var=79.8459+/-15.489, 0's: 0 Z-trim(114.0): 13 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.143532
statistics sampled from 23627 (23635) to 23627 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16
Scan time: 12.560
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001276 (OMIM: 603906) calcium-activated chlorid ( 914) 6038 1260.4 0
NP_036260 (OMIM: 616857) calcium-activated chlorid ( 919) 3726 781.6 0
XP_011539317 (OMIM: 616857) PREDICTED: calcium-act ( 868) 3536 742.3 2.5e-213
NP_006527 (OMIM: 604003) calcium-activated chlorid ( 943) 2539 535.8 3.7e-151
XP_011540750 (OMIM: 604003) PREDICTED: calcium-act ( 616) 1743 370.9 1e-101
>>NP_001276 (OMIM: 603906) calcium-activated chloride ch (914 aa)
initn: 6038 init1: 6038 opt: 6038 Z-score: 6750.7 bits: 1260.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6038; 100.0% identity (100.0% similar) in 914 aa overlap (1-914:1-914)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPFKSSVFILILHLLEGALSNSLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQIKDMVTQA
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NP_001 MGPFKSSVFILILHLLEGALSNSLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQIKDMVTQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SLYLFEATGKRFYFKNVAILIPETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPPGNDEPYTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLYLFEATGKRFYFKNVAILIPETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPPGNDEPYTE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 QMGNCGEKGERIHLTPDFIAGKKLAEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNNDEKFYLSNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QMGNCGEKGERIHLTPDFIAGKKLAEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNNDEKFYLSNG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 RIQAVRCSAGITGTNVVKKCQGGSCYTKRCTFNKVTGLYEKGCEFVLQSRQTEKASIMFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RIQAVRCSAGITGTNVVKKCQGGSCYTKRCTFNKVTGLYEKGCEFVLQSRQTEKASIMFA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QHVDSIVEFCTEQNHNKEAPNKQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPMTTQPPNPTFSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QHVDSIVEFCTEQNHNKEAPNKQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPMTTQPPNPTFSLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 QIGQRIVCLVLDKSGSMATGNRLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMVTFDSAAHVQNELI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIGQRIVCLVLDKSGSMATGNRLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMVTFDSAAHVQNELI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 QINSGSDRDTLAKRLPAAASGGTSICSGLRSAFTVIRKKYPTDGSEIVLLTDGEDNTISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QINSGSDRDTLAKRLPAAASGGTSICSGLRSAFTVIRKKYPTDGSEIVLLTDGEDNTISG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 CFNEVKQSGAIIHTVALGPSAAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQNNGLIDAFGALSSGNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CFNEVKQSGAIIHTVALGPSAAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQNNGLIDAFGALSSGNG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 AVSQRSIQLESKGLTLQNSQWMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTMQPPQILLWDPSGQKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVSQRSIQLESKGLTLQNSQWMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTMQPPQILLWDPSGQKQG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 GFVVDKNTKMAYLQIPGIAKVGTWKYSLQASSQTLTLTVTSRASNATLPPITVTSKTNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFVVDKNTKMAYLQIPGIAKVGTWKYSLQASSQTLTLTVTSRASNATLPPITVTSKTNKD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 TSKFPSPLVVYANIRQGASPILRASVTALIESVNGKTVTLELLDNGAGADATKDDGVYSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSKFPSPLVVYANIRQGASPILRASVTALIESVNGKTVTLELLDNGAGADATKDDGVYSR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 YFTTYDTNGRYSVKVRALGGVNAARRRVIPQQSGALYIPGWIENDEIQWNPPRPEINKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YFTTYDTNGRYSVKVRALGGVNAARRRVIPQQSGALYIPGWIENDEIQWNPPRPEINKDD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 VQHKQVCFSRTSSGGSFVASDVPNAPIPDLFPPGQITDLKAEIHGGSLINLTWTAPGDDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQHKQVCFSRTSSGGSFVASDVPNAPIPDLFPPGQITDLKAEIHGGSLINLTWTAPGDDY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 DHGTAHKYIIRISTSILDLRDKFNESLQVNTTALIPKEANSEEVFLFKPENITFENGTDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DHGTAHKYIIRISTSILDLRDKFNESLQVNTTALIPKEANSEEVFLFKPENITFENGTDL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE5 FIAIQAVDKVDLKSEISNIARVSLFIPPQTPPETPSPDETSAPCPNIHINSTIPGIHILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FIAIQAVDKVDLKSEISNIARVSLFIPPQTPPETPSPDETSAPCPNIHINSTIPGIHILK
850 860 870 880 890 900
910
pF1KE5 IMWKWIGELQLSIA
::::::::::::::
NP_001 IMWKWIGELQLSIA
910
>>NP_036260 (OMIM: 616857) calcium-activated chloride ch (919 aa)
initn: 2799 init1: 1048 opt: 3726 Z-score: 4163.3 bits: 781.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3726; 61.8% identity (83.2% similar) in 912 aa overlap (1-907:1-906)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPFKSSVFILILHLLEGALSNSLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQIKDMVTQA
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NP_036 MGLFRGFVFLLVLCLLHQS-NTSFIKLNNNGFEDIVIVIDPSVPEDEKIIEQIEDMVTTA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SLYLFEATGKRFYFKNVAILIPETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPPGNDEPYTE
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NP_036 STYLFEATEKRFFFKNVSILIPENWKENPQYKRPKHENHKHADVIVAPPTLPGRDEPYTK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 QMGNCGEKGERIHLTPDFIAGKKLAEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNNDEKFYLSNG
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NP_036 QFTECGEKGEYIHFTPDLLLGKKQNEYGPPGKLFVHEWAHLRWGVFDEYNEDQPFYRAKS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 R-IQAVRCSAGITGTNVVKKCQGGSCYTKRCTFNKVTGLYEKGCEFVLQSRQTEKASIMF
. :.:.::::::.: : : ::::::: .. : ....: :: : :.: .. :::::::::
NP_036 KKIEATRCSAGISGRNRVYKCQGGSCLSRACRIDSTTKLYGKDCQFFPDKVQTEKASIMF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AQHVDSIVEFCTEQNHNKEAPNKQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPMTTQPPNPTFSL
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NP_036 MQSIDSVVEFCNEKTHNQEAPSLQNIKCNFRSTWEVISNSEDFKNTIPMVTPPPPPVFSL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 LQIGQRIVCLVLDKSGSMATGNRLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMVTFDSAAHVQNEL
:.:.::::::::::::::. .::::.:::.. ::::::: ::::::: :::.: . :.:
NP_036 LKISQRIVCLVLDKSGSMGGKDRLNRMNQAAKHFLLQTVENGSWVGMVHFDSTATIVNKL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 IQINSGSDRDTLAKRLPAAASGGTSICSGLRSAFTVIRKKYPT-DGSEIVLLTDGEDNTI
:::.:...:.:: ::. ::::::::.. :: :: . . ::::..:::::::::
NP_036 IQIKSSDERNTLMAGLPTYPLGGTSICSGIKYAFQVIGELHSQLDGSEVLLLTDGEDNTA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 SGCFNEVKQSGAIIHTVALGPSAAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQNNGLIDAFGALSSG
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NP_036 SSCIDEVKQSGAIVHFIALGRAADEAVIEMSKITGGSHFYVSDEAQNNGLIDAFGALTSG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 NGAVSQRSIQLESKGLTLQNSQWMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTMQPPQILLWDPSGQK
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NP_036 NTDLSQKSLQLESKGLTLNSNAWMNDTVIIDSTVGKDTFFLITWNSLPPSISLWDPSGTI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 QGGFVVDKNTKMAYLQIPGIAKVGTWKYSLQASS--QTLTLTVTSRASNATLPPITVTSK
. .:.:: ..:::::.::: :::::: :.:::.. .:::.::::::.:...:::::..:
NP_036 MENFTVDATSKMAYLSIPGTAKVGTWAYNLQAKANPETLTITVTSRAANSSVPPITVNAK
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 TNKDTSKFPSPLVVYANIRQGASPILRASVTALIESVNGKTVTLELLDNGAGADATKDDG
:::...::::..:::.: :: :.: :.:::.::: ::.: .:::::::::::. :.::
NP_036 MNKDVNSFPSPMIVYAEILQGYVPVLGANVTAFIESQNGHTEVLELLDNGAGADSFKNDG
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE5 VYSRYFTTYDTNGRYSVKVRALGGVNAARRRVIPQQSGALYIPGWIENDEIQWNPPRPEI
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NP_036 VYSRYFTAYTENGRYSLKVRAHGGANTARLKLRPPLNRAAYIPGWVVNGEIEANPPRPEI
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE5 NKDDVQHKQVCFSRTSSGGSFVASDVPNAPIPDLFPPGQITDLKAEIHGGSLINLTWTAP
. .:.: ::::.:::.::.:.::. :.:: .::.::::: : .: ..: ::::::
NP_036 D-EDTQTTLEDFSRTASGGAFVVSQVPSLPLPDQYPPSQITDLDATVHEDKII-LTWTAP
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE5 GDDYDHGTAHKYIIRISTSILDLRDKFNESLQVNTTALIPKEANSEEVFLFKPENITFEN
::..: : ...::::::.:::::::.:...:::::: : ::::::.: : ::::::. ::
NP_036 GDNFDVGKVQRYIIRISASILDLRDSFDDALQVNTTDLSPKEANSKESFAFKPENISEEN
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE5 GTDLFIAIQAVDKVDLKSEISNIARVSLFIPPQTPPET-PSPDETSAPCPNIHINSTIPG
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NP_036 ATHIFIAIKSIDKSNLTSKVSNIAQVTLFIPQANPDDIDPTPTPTPTPTPDKSHNS---G
840 850 860 870 880 890
900 910
pF1KE5 IHILKIMWKWIGELQLSIA
..: .. . ::
NP_036 VNISTLVLSVIGSVVIVNFILSTTI
900 910
>>XP_011539317 (OMIM: 616857) PREDICTED: calcium-activat (868 aa)
initn: 2756 init1: 1048 opt: 3536 Z-score: 3951.1 bits: 742.3 E(85289): 2.5e-213
Smith-Waterman score: 3536; 62.1% identity (83.0% similar) in 860 aa overlap (53-907:1-855)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 SLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQIKDMVTQASLYLFEATGKRFYFKNVAILIP
..:::: :: :::::: :::.::::.::::
XP_011 MEDMVTTASTYLFEATEKRFFFKNVSILIP
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 ETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPPGNDEPYTEQMGNCGEKGERIHLTPDFIAGK
:.:: . .: ::: :..:.:::.:: : :: :::::.:. .:::::: ::.:::.. ::
XP_011 ENWKENPQYKRPKHENHKHADVIVAPPTLPGRDEPYTKQFTECGEKGEYIHFTPDLLLGK
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 KLAEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNNDEKFYLSNGR-IQAVRCSAGITGTNVVKKCQ
: :::: :. :::::::::::::::::.:. :: .... :.:.::::::.: : : :::
XP_011 KQNEYGPPGKLFVHEWAHLRWGVFDEYNEDQPFYRAKSKKIEATRCSAGISGRNRVYKCQ
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 GGSCYTKRCTFNKVTGLYEKGCEFVLQSRQTEKASIMFAQHVDSIVEFCTEQNHNKEAPN
:::: .. : ....: :: : :.: .. ::::::::: : .::.::::.:..::.:::.
XP_011 GGSCLSRACRIDSTTKLYGKDCQFFPDKVQTEKASIMFMQSIDSVVEFCNEKTHNQEAPS
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 KQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPMTTQPPNPTFSLLQIGQRIVCLVLDKSGSMATGN
:: :::.::::::: .:::::.: ::.: :: :.::::.:.::::::::::::::. .
XP_011 LQNIKCNFRSTWEVISNSEDFKNTIPMVTPPPPPVFSLLKISQRIVCLVLDKSGSMGGKD
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 RLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMVTFDSAAHVQNELIQINSGSDRDTLAKRLPAAASG
::::.:::.. ::::::: ::::::: :::.: . :.::::.:...:.:: ::. :
XP_011 RLNRMNQAAKHFLLQTVENGSWVGMVHFDSTATIVNKLIQIKSSDERNTLMAGLPTYPLG
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 GTSICSGLRSAFTVIRKKYPT-DGSEIVLLTDGEDNTISGCFNEVKQSGAIIHTVALGPS
:::::::.. :: :: . . ::::..::::::::: :.:..::::::::.: .::: .
XP_011 GTSICSGIKYAFQVIGELHSQLDGSEVLLLTDGEDNTASSCIDEVKQSGAIVHFIALGRA
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 AAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQNNGLIDAFGALSSGNGAVSQRSIQLESKGLTLQNSQ
: . . :.::.::: . :.::..::::::::::::.::: .::.:.:::::::::...
XP_011 ADEAVIEMSKITGGSHFYVSDEAQNNGLIDAFGALTSGNTDLSQKSLQLESKGLTLNSNA
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 WMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTMQPPQILLWDPSGQKQGGFVVDKNTKMAYLQIPGIAK
::: :::.::::::::.:::::. ::.: :::::: . .:.:: ..:::::.::: ::
XP_011 WMNDTVIIDSTVGKDTFFLITWNSLPPSISLWDPSGTIMENFTVDATSKMAYLSIPGTAK
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610
pF1KE5 VGTWKYSLQASS--QTLTLTVTSRASNATLPPITVTSKTNKDTSKFPSPLVVYANIRQGA
:::: :.:::.. .:::.::::::.:...:::::..: :::...::::..:::.: ::
XP_011 VGTWAYNLQAKANPETLTITVTSRAANSSVPPITVNAKMNKDVNSFPSPMIVYAEILQGY
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KE5 SPILRASVTALIESVNGKTVTLELLDNGAGADATKDDGVYSRYFTTYDTNGRYSVKVRAL
:.: :.:::.::: ::.: .:::::::::::. :.:::::::::.: :::::.::::
XP_011 VPVLGANVTAFIESQNGHTEVLELLDNGAGADSFKNDGVYSRYFTAYTENGRYSLKVRAH
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KE5 GGVNAARRRVIPQQSGALYIPGWIENDEIQWNPPRPEINKDDVQHKQVCFSRTSSGGSFV
::.:.:: .. : . : :::::. : ::. :::::::. .:.: ::::.:::.::
XP_011 GGANTARLKLRPPLNRAAYIPGWVVNGEIEANPPRPEID-EDTQTTLEDFSRTASGGAFV
640 650 660 670 680
740 750 760 770 780 790
pF1KE5 ASDVPNAPIPDLFPPGQITDLKAEIHGGSLINLTWTAPGDDYDHGTAHKYIIRISTSILD
.:.::. :.:: .::.::::: : .: ..: ::::::::..: : ...::::::.::::
XP_011 VSQVPSLPLPDQYPPSQITDLDATVHEDKII-LTWTAPGDNFDVGKVQRYIIRISASILD
690 700 710 720 730 740
800 810 820 830 840 850
pF1KE5 LRDKFNESLQVNTTALIPKEANSEEVFLFKPENITFENGTDLFIAIQAVDKVDLKSEISN
:::.:...:::::: : ::::::.: : ::::::. ::.: .::::...:: .: :..::
XP_011 LRDSFDDALQVNTTDLSPKEANSKESFAFKPENISEENATHIFIAIKSIDKSNLTSKVSN
750 760 770 780 790 800
860 870 880 890 900 910
pF1KE5 IARVSLFIPPQTPPET-PSPDETSAPCPNIHINSTIPGIHILKIMWKWIGELQLSIA
::.:.:::: .: . :.: : .: :. :: :..: .. . ::
XP_011 IAQVTLFIPQANPDDIDPTPTPTPTPTPDKSHNS---GVNISTLVLSVIGSVVIVNFILS
810 820 830 840 850 860
XP_011 TTI
>>NP_006527 (OMIM: 604003) calcium-activated chloride ch (943 aa)
initn: 2091 init1: 588 opt: 2539 Z-score: 2834.7 bits: 535.8 E(85289): 3.7e-151
Smith-Waterman score: 2630; 45.6% identity (75.9% similar) in 906 aa overlap (2-878:8-899)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGPFKSSVFILILHLLEGALS--NSLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQ
::. . :. .: : . : .. .::..:::.:...::.:.:::...::..
NP_006 MTQRSIAGPICNLKFVTLLVALSSELPFLGAGVQLQDNGYNGLLIAINPQVPENQNLISN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 IKDMVTQASLYLFEATGKRFYFKNVAILIPETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPP
::.:.:.::.:::.:: .: .:.:. :::: :::.. . . : :.:..:.:.:..
NP_006 IKEMITEASFYLFNATKRRVFFRNIKILIPATWKANNNS-KIKQESYEKANVIVTDWYGA
70 80 90 100 110
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