Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4591
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4591, 1107 aa
1>>>pF1KE4591 1107 - 1107 aa - 1107 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1223+/-0.00089; mu= 14.2545+/- 0.054
mean_var=120.9119+/-24.270, 0's: 0 Z-trim(110.0): 26 B-trim: 112 in 1/50
Lambda= 0.116638
statistics sampled from 11259 (11273) to 11259 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.346), width: 16
Scan time: 4.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12795.1 POLD1 gene_id:5424|Hs108|chr19 (1107) 7467 1268.3 0
CCDS82381.1 POLD1 gene_id:5424|Hs108|chr19 (1133) 4043 692.1 1.8e-198
CCDS69177.1 REV3L gene_id:5980|Hs108|chr6 (3052) 779 143.1 9.1e-33
CCDS5091.2 REV3L gene_id:5980|Hs108|chr6 (3130) 779 143.1 9.3e-33
CCDS14214.1 POLA1 gene_id:5422|Hs108|chrX (1462) 448 87.2 2.9e-16
CCDS83462.1 POLA1 gene_id:5422|Hs108|chrX (1468) 448 87.2 2.9e-16
>>CCDS12795.1 POLD1 gene_id:5424|Hs108|chr19 (1107 aa)
initn: 7467 init1: 7467 opt: 7467 Z-score: 6790.6 bits: 1268.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7467; 99.9% identity (100.0% similar) in 1107 aa overlap (1-1107:1-1107)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDGKRRPGPGPGVPPKRARGGLWDDDDAPRPSQFEEDLALMEEMEAEHRLQEQEEEELQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MDGKRRPGPGPGVPPKRARGGLWDDDDAPRPSQFEEDLALMEEMEAEHRLQEQEEEELQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VLEGVADGQVPPSAIDPRWLRPTPPALDPQTEPLIFQQLEIDHYVGPAQPVPGGPPPSHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS12 VLEGVADGQVPPSAIDPRWLRPTPPALDPQTEPLIFQQLEIDHYVGPAQPVPGGPPPSRG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVPVLRAFGVTDEGFSVCCHIHGFAPYFYTPAPPGFGPEHMGDLQRELNLAISRDSRGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SVPVLRAFGVTDEGFSVCCHIHGFAPYFYTPAPPGFGPEHMGDLQRELNLAISRDSRGGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ELTGPAVLAVELCSRESMFGYHGHGPSPFLRITVALPRLVAPARRLLEQGIRVAGLGTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELTGPAVLAVELCSRESMFGYHGHGPSPFLRITVALPRLVAPARRLLEQGIRVAGLGTPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FAPYEANVDFEIRFMVDTDIVGCNWLELPAGKYALRLKEKATQCQLEADVLWSDVVSHPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FAPYEANVDFEIRFMVDTDIVGCNWLELPAGKYALRLKEKATQCQLEADVLWSDVVSHPP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 EGPWQRIAPLRVLSFDIECAGRKGIFPEPERDPVIQICSLGLRWGEPEPFLRLALTLRPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EGPWQRIAPLRVLSFDIECAGRKGIFPEPERDPVIQICSLGLRWGEPEPFLRLALTLRPC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 APILGAKVQSYEKEEDLLQAWSTFIRIMDPDVITGYNIQNFDLPYLISRAQTLKVQTFPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 APILGAKVQSYEKEEDLLQAWSTFIRIMDPDVITGYNIQNFDLPYLISRAQTLKVQTFPF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LGRVAGLCSNIRDSSFQSKQTGRRDTKVVSMVGRVQMDMLQVLLREYKLRSYTLNAVSFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGRVAGLCSNIRDSSFQSKQTGRRDTKVVSMVGRVQMDMLQVLLREYKLRSYTLNAVSFH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 FLGEQKEDVQHSIITDLQNGNDQTRRRLAVYCLKDAYLPLRLLERLMVLVNAVEMARVTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FLGEQKEDVQHSIITDLQNGNDQTRRRLAVYCLKDAYLPLRLLERLMVLVNAVEMARVTG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 VPLSYLLSRGQQVKVVSQLLRQAMHEGLLMPVVKSEGGEDYTGATVIEPLKGYYDVPIAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VPLSYLLSRGQQVKVVSQLLRQAMHEGLLMPVVKSEGGEDYTGATVIEPLKGYYDVPIAT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LDFSSLYPSIMMAHNLCYTTLLRPGTAQKLGLTEDQFIRTPTGDEFVKTSVRKGLLPQIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDFSSLYPSIMMAHNLCYTTLLRPGTAQKLGLTEDQFIRTPTGDEFVKTSVRKGLLPQIL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 ENLLSARKRAKAELAKETDPLRRQVLDGRQLALKVSANSVYGFTGAQVGKLPCLEISQSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ENLLSARKRAKAELAKETDPLRRQVLDGRQLALKVSANSVYGFTGAQVGKLPCLEISQSV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 TGFGRQMIEKTKQLVESKYTVENGYSTSAKVVYGDTDSVMCRFGVSSVAEAMALGREAAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGFGRQMIEKTKQLVESKYTVENGYSTSAKVVYGDTDSVMCRFGVSSVAEAMALGREAAD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 WVSGHFPSPIRLEFEKVYFPYLLISKKRYAGLLFSSRPDAHDRMDCKGLEAVRRDNCPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WVSGHFPSPIRLEFEKVYFPYLLISKKRYAGLLFSSRPDAHDRMDCKGLEAVRRDNCPLV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 ANLVTASLRRLLIDRDPEGAVAHAQDVISDLLCNRIDISQLVITKELTRAASDYAGKQAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ANLVTASLRRLLIDRDPEGAVAHAQDVISDLLCNRIDISQLVITKELTRAASDYAGKQAH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 VELAERMRKRDPGSAPSLGDRVPYVIISAAKGVAAYMKSEDPLFVLEHSLPIDTQYYLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VELAERMRKRDPGSAPSLGDRVPYVIISAAKGVAAYMKSEDPLFVLEHSLPIDTQYYLEQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 QLAKPLLRIFEPILGEGRAEAVLLRGDHTRCKTVLTGKVGGLLAFAKRRNCCIGCRTVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QLAKPLLRIFEPILGEGRAEAVLLRGDHTRCKTVLTGKVGGLLAFAKRRNCCIGCRTVLS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 HQGAVCEFCQPRESELYQKEVSHLNALEERFSRLWTQCQRCQGSLHEDVICTSRDCPIFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HQGAVCEFCQPRESELYQKEVSHLNALEERFSRLWTQCQRCQGSLHEDVICTSRDCPIFY
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KE4 MRKKVRKDLEDQEQLLRRFGPPGPEAW
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MRKKVRKDLEDQEQLLRRFGPPGPEAW
1090 1100
>>CCDS82381.1 POLD1 gene_id:5424|Hs108|chr19 (1133 aa)
initn: 7453 init1: 4042 opt: 4043 Z-score: 3676.5 bits: 692.1 E(32554): 1.8e-198
Smith-Waterman score: 7405; 97.6% identity (97.7% similar) in 1133 aa overlap (1-1107:1-1133)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDGKRRPGPGPGVPPKRARGGLWDDDDAPRPSQFEEDLALMEEMEAEHRLQEQEEEELQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MDGKRRPGPGPGVPPKRARGGLWDDDDAPRPSQFEEDLALMEEMEAEHRLQEQEEEELQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VLEGVADGQVPPSAIDPRWLRPTPPALDPQTEPLIFQQLEIDHYVGPAQPVPGGPPPSHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS82 VLEGVADGQVPPSAIDPRWLRPTPPALDPQTEPLIFQQLEIDHYVGPAQPVPGGPPPSRG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVPVLRAFGVTDEGFSVCCHIHGFAPYFYTPAPPGFGPEHMGDLQRELNLAISRDSRGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SVPVLRAFGVTDEGFSVCCHIHGFAPYFYTPAPPGFGPEHMGDLQRELNLAISRDSRGGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ELTGPAVLAVELCSRESMFGYHGHGPSPFLRITVALPRLVAPARRLLEQGIRVAGLGTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ELTGPAVLAVELCSRESMFGYHGHGPSPFLRITVALPRLVAPARRLLEQGIRVAGLGTPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FAPYEANVDFEIRFMVDTDIVGCNWLELPAGKYALRLKEKATQCQLEADVLWSDVVSHPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FAPYEANVDFEIRFMVDTDIVGCNWLELPAGKYALRLKEKATQCQLEADVLWSDVVSHPP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 EGPWQRIAPLRVLSFDIECAGRKGIFPEPERDPVIQICSLGLRWGEPEPFLRLALTLRPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EGPWQRIAPLRVLSFDIECAGRKGIFPEPERDPVIQICSLGLRWGEPEPFLRLALTLRPC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 APILGAKVQSYEKEEDLLQAWSTFIRIMDPDVITGYNIQNFDLPYLISRAQTLKVQTFPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 APILGAKVQSYEKEEDLLQAWSTFIRIMDPDVITGYNIQNFDLPYLISRAQTLKVQTFPF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LGRVAGLCSNIRDSSFQSKQTGRRDTKVVSMVGRVQMDMLQVLLREYKLRSYTLNAVSFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LGRVAGLCSNIRDSSFQSKQTGRRDTKVVSMVGRVQMDMLQVLLREYKLRSYTLNAVSFH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 FLGEQKEDVQHSIITDLQNGNDQTRRRLAVYCLKDAYLPLRLLERLMVLVNAVEMARVTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FLGEQKEDVQHSIITDLQNGNDQTRRRLAVYCLKDAYLPLRLLERLMVLVNAVEMARVTG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE4 VPLSYLLSRGQQVKVVSQLLRQAMHEGLLMPVVKSEGGEDYTGATVIEPLKG--------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VPLSYLLSRGQQVKVVSQLLRQAMHEGLLMPVVKSEGGEDYTGATVIEPLKGVRPQDRAG
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630
pF1KE4 ------------------YYDVPIATLDFSSLYPSIMMAHNLCYTTLLRPGTAQKLGLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AAWELLALTPGRGCSPPRYYDVPIATLDFSSLYPSIMMAHNLCYTTLLRPGTAQKLGLTE
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 DQFIRTPTGDEFVKTSVRKGLLPQILENLLSARKRAKAELAKETDPLRRQVLDGRQLALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DQFIRTPTGDEFVKTSVRKGLLPQILENLLSARKRAKAELAKETDPLRRQVLDGRQLALK
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 VSANSVYGFTGAQVGKLPCLEISQSVTGFGRQMIEKTKQLVESKYTVENGYSTSAKVVYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VSANSVYGFTGAQVGKLPCLEISQSVTGFGRQMIEKTKQLVESKYTVENGYSTSAKVVYG
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KE4 DTDSVMCRFGVSSVAEAMALGREAADWVSGHFPSPIRLEFEKVYFPYLLISKKRYAGLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DTDSVMCRFGVSSVAEAMALGREAADWVSGHFPSPIRLEFEKVYFPYLLISKKRYAGLLF
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KE4 SSRPDAHDRMDCKGLEAVRRDNCPLVANLVTASLRRLLIDRDPEGAVAHAQDVISDLLCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SSRPDAHDRMDCKGLEAVRRDNCPLVANLVTASLRRLLIDRDPEGAVAHAQDVISDLLCN
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KE4 RIDISQLVITKELTRAASDYAGKQAHVELAERMRKRDPGSAPSLGDRVPYVIISAAKGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RIDISQLVITKELTRAASDYAGKQAHVELAERMRKRDPGSAPSLGDRVPYVIISAAKGVA
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980 990
pF1KE4 AYMKSEDPLFVLEHSLPIDTQYYLEQQLAKPLLRIFEPILGEGRAEAVLLRGDHTRCKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AYMKSEDPLFVLEHSLPIDTQYYLEQQLAKPLLRIFEPILGEGRAEAVLLRGDHTRCKTV
970 980 990 1000 1010 1020
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE4 LTGKVGGLLAFAKRRNCCIGCRTVLSHQGAVCEFCQPRESELYQKEVSHLNALEERFSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LTGKVGGLLAFAKRRNCCIGCRTVLSHQGAVCEFCQPRESELYQKEVSHLNALEERFSRL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE4 WTQCQRCQGSLHEDVICTSRDCPIFYMRKKVRKDLEDQEQLLRRFGPPGPEAW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 WTQCQRCQGSLHEDVICTSRDCPIFYMRKKVRKDLEDQEQLLRRFGPPGPEAW
1090 1100 1110 1120 1130
>>CCDS69177.1 REV3L gene_id:5980|Hs108|chr6 (3052 aa)
initn: 889 init1: 312 opt: 779 Z-score: 701.8 bits: 143.1 E(32554): 9.1e-33
Smith-Waterman score: 1161; 26.5% identity (56.6% similar) in 1121 aa overlap (52-1099:1989-3052)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 LWDDDDAPRPSQFEEDLALMEEMEAEHRLQEQEEEELQSVLEGVADGQVPPSAIDPRWLR
... .. : .:.. . : .: . . :
CCDS69 FSSSVNPDDKPVVPPKMDVSPCILPTTAHTKEDVDNSQIALQAPTTG-CSQTASESQMLP
1960 1970 1980 1990 2000 2010
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PTPPALDPQTEPLIFQQLEIDHYVGPAQP-VPGGPPPSHGSVPVLRAFGVTDEGFSVCCH
:. : ::. . .. . ..:.. ..: : :: .. : .:.. :. : .
CCDS69 PVASASDPEKD----EDDDDNYYISYSSPDSPVIPPWQQPISPDSKALNGDDRPSSPVEE
2020 2030 2040 2050 2060 2070
150 160 170 180 190
pF1KE4 IHGFA-PYFYTPAPPGFGPEHMGDLQRELNLA-ISRDSRGGRELTGPAVLAVELCSRESM
. ..: : : :. .. :. : .. :. .: :. : ::.
CCDS69 LPSLAFENFLKPIKDGIQKSPCSEPQEPLVISPINTRARTGK------------C--ESL
2080 2090 2100 2110
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 FGYHGHGPSPFLRITVALPRLVAPARRLLEQGIRVAGLGTPSFAPYEANVDFEIRFMVDT
.:. .:... :.:::. .. ::. : : ... . .:
CCDS69 C-FHS---TPIIQ------------RKLLERLPEAPGLSPLSTEPKTQKLS--NKKGSNT
2120 2130 2140 2150 2160
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 DIVGCNWLELPAGKYALRLKEKATQCQLEADVLWSDV-----VSHPPEGP-WQRIAPLRV
: . : ...: . :... : . ... :. ..: : .
CCDS69 DTLRRVLLTQAKNQFAAVNTPQKETSQIDGPSLNNTYGFKVSIQNLQEAKALHEIQNLTL
2170 2180 2190 2200 2210 2220
320 330 340 350
pF1KE4 LSFDIECAGRKGIFPEPERDPVIQICSL--GLRWGEPEP-FLRLALT-------------
.: ... :. . :.:: :: ::.: . : : . ::
CCDS69 ISVELHARTRRDLEPDPEFDP---ICALFYCISSDTPLPDTEKTELTGVIVIDKDKTVFS
2230 2240 2250 2260 2270
360 370 380 390 400
pF1KE4 --LRPCAPIL------GAKVQSYEKEEDLLQAWSTFIRIMDPDVITGYNIQNFDLPYLIS
.: .:.: : .: :. :.. ...:. .:::.. ::.:: . ::..
CCDS69 QDIRYQTPLLIRSGITGLEVTYAADEKALFHEIANIIKRYDPDILLGYEIQMHSWGYLLQ
2280 2290 2300 2310 2320 2330
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 RAQTLKVQTFPFLGRVAGLCSNIRDSSFQSKQTGRRDTKVVSMVGRVQMDMLQVLLREYK
:: .:... ...:: . : .. . . : . ...:::. ... ... :
CCDS69 RAAALSIDLCRMISRVPDDKIENRFAA-ERDEYGSYTMSEINIVGRITLNLWRIMRNEVA
2340 2350 2360 2370 2380 2390
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 LRSYTLNAVSFHFLGEQKEDVQHSIITD-LQNGNDQTRRRLAVYCLKDAYLPLRLLERLM
: .::.. :::: : .. ...: ..: .: : ... . .. . :..::.:
CCDS69 LTNYTFENVSFHVLHQRFPLFTFRVLSDWFDNKTDLYRWKMVDHYVSRVRGNLQMLEQLD
2400 2410 2420 2430 2440 2450
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 VLVNAVEMARVTGVPLSYLLSRGQQVKVVSQLLRQA--MHEGLLMPVV--KSEGGEDYTG
.. .. ::::. :. . ..:.::.: .: :..:: : :. . : : .:.
CCDS69 LIGKTSEMARLFGIQFLHVLTRGSQYRVESMMLRIAKPMNYIPVTPSVQQRSQMRAPQCV
2460 2470 2480 2490 2500 2510
590 600 610 620 630
pF1KE4 ATVIEPLKGYYDVPIATLDFSSLYPSIMMAHNLCYTTLLRPGTAQKLGLTEDQF------
..:: . .:. . .:::.::::::..:.: :..: : : ...:: :.:
CCDS69 PLIMEPESRFYSNSVLVLDFQSLYPSIVIAYNYCFSTCL--GHVENLG-KYDEFKFGCTS
2520 2530 2540 2550 2560 2570
640 650 660 670 680
pF1KE4 ----------IR-----TPTGDEFVKTSVRKGLLPQILENLLSARKRAKAEL-AKETDPL
.: .:.: ::: :::::.::..::..:..: .: . : . :
CCDS69 LRVPPDLLYQVRHDITVSPNGVAFVKPSVRKGVLPRMLEEILKTRFMVKQSMKAYKQDRA
2580 2590 2600 2610 2620 2630
690 700 710 720 730 740
pF1KE4 RRQVLDGRQLALKVSANSVYGFTGAQV-GKLPCLEISQSVTGFGRQMIEKTKQLVESKYT
..::.:::.::. :: ..:.:.:. :..::.:...:.. .:. .:.. .::.. :
CCDS69 LSRMLDARQLGLKLIANVTFGYTSANFSGRMPCIEVGDSIVHKARETLERAIKLVND--T
2640 2650 2660 2670 2680 2690
750 760 770 780 790 800
pF1KE4 VENGYSTSAKVVYGDTDSVMCRFGVSSVAEAMALGREAADWVSGHFPSPIRLEFEKVYFP
. : :.::::::::.. . .. ... .:.: :. :.. :.:..:.:::::.:
CCDS69 KKWG----ARVVYGDTDSMFVLLKGATKEQSFKIGQEIAEAVTATNPKPVKLKFEKVYLP
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pF1KE4 YLLISKKRYAGLLFSSRPDAHDRMDCKGLEAVRRDNCPLVANLVTASLRRLLIDRDPEGA
.: .::::.: .. . . .: ::.:.::::.:: :.... ::. :. ::
CCDS69 CVLQTKKRYVGYMYETLDQKDPVFDAKGIETVRRDSCPAVSKILERSLKLLFETRDISLI
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pF1KE4 VAHAQDVISDLLCNRIDISQLVITKELTRAASDYAGKQAH-VELAERMRKRDPGSAPSLG
..: :: .. .:......:: . : : . .::...: : : :..:
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pF1KE4 DRVPYVIISAAKGVAAYMKSEDPLFVLEH-SLPIDTQYYLEQQLAKPLLRIFEPILG---
.::::::: .. :: . . :. ::. .: ... ::. .:. :: ::: ..:
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pF1KE4 -EGRAEAVLLRGDHTRCKTVLTGKVGGLLAFAKRRNCCIGCRTVLSHQGAVCEFC--QPR
: .. . .. :. : . . .: . : . .: ..: : ::.
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pF1KE4 E-SELYQKEVSHLNALEERFSRLWTQCQRCQGSLHEDVICTSRDCPIFYMRKKVRKDLED
. . . ..:. .:. .:.. .. :. : : . . . :.: .::... ..: ..:
CCDS69 HVAVILNQEIRELERQQEQLVKI---CKNCTGCFDRHIPCVSLNCPVLFKLSRVNRELSK
2990 3000 3010 3020 3030 3040
1100
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CCDS69 APYLRQLLDQF
3050
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: . : ...: . :... : . ... :. ..: : .
CCDS50 DTLRRVLLTQAKNQFAAVNTPQKETSQIDGPSLNNTYGFKVSIQNLQEAKALHEIQNLTL
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.: ... :. . :.:: :: ::.: . : : . ::
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.: .:.: : .: :. :.. ...:. .:::.. ::.:: . ::..
CCDS50 QDIRYQTPLLIRSGITGLEVTYAADEKALFHEIANIIKRYDPDILLGYEIQMHSWGYLLQ
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:: .:... ...:: . : .. . . : . ...:::. ... ... :
CCDS50 RAAALSIDLCRMISRVPDDKIENRFAA-ERDEYGSYTMSEINIVGRITLNLWRIMRNEVA
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pF1KE4 LRSYTLNAVSFHFLGEQKEDVQHSIITD-LQNGNDQTRRRLAVYCLKDAYLPLRLLERLM
: .::.. :::: : .. ...: ..: .: : ... . .. . :..::.:
CCDS50 LTNYTFENVSFHVLHQRFPLFTFRVLSDWFDNKTDLYRWKMVDHYVSRVRGNLQMLEQLD
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.. .. ::::. :. . ..:.::.: .: :..:: : :. . : : .:.
CCDS50 LIGKTSEMARLFGIQFLHVLTRGSQYRVESMMLRIAKPMNYIPVTPSVQQRSQMRAPQCV
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..:: . .:. . .:::.::::::..:.: :..: : : ...:: :.:
CCDS50 PLIMEPESRFYSNSVLVLDFQSLYPSIVIAYNYCFSTCL--GHVENLG-KYDEFKFGCTS
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.: .:.: ::: :::::.::..::..:..: .: . : . :
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..::.:::.::. :: ..:.:.:. :..::.:...:.. .:. .:.. .::.. :
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. : :.::::::::.. . .. ... .:.: :. :.. :.:..:.:::::.:
CCDS50 KKWG----ARVVYGDTDSMFVLLKGATKEQSFKIGQEIAEAVTATNPKPVKLKFEKVYLP
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.: .::::.: .. . . .: ::.:.::::.:: :.... ::. :. ::
CCDS50 CVLQTKKRYVGYMYETLDQKDPVFDAKGIETVRRDSCPAVSKILERSLKLLFETRDISLI
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..: :: .. .:......:: . : : . .::...: : : :..:
CCDS50 KQYVQRQCMKLLEGKASIQDFIFAKEYRGSFSYKPGACVPALELTRKMLTYDRRSEPQVG
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.::::::: .. :: . . :. ::. .: ... ::. .:. :: ::: ..:
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pF1KE4 -EGRAEAVLLRGDHTRCKTVLTGKVGGLLAFAKRRNCCIGCRTVLSHQGAVCEFC--QPR
: .. . .. :. : . . .: . : . .: ..: : ::.
CCDS50 FSWYHELPRIHKATSSSRSEPEGRKGTISQYFTTLHCPV-CDDLTQH--GICSKCRSQPQ
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pF1KE4 E-SELYQKEVSHLNALEERFSRLWTQCQRCQGSLHEDVICTSRDCPIFYMRKKVRKDLED
. . . ..:. .:. .:.. .. :. : : . . . :.: .::... ..: ..:
CCDS50 HVAVILNQEIRELERQQEQLVKI---CKNCTGCFDRHIPCVSLNCPVLFKLSRVNRELSK
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1100
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CCDS50 APYLRQLLDQF
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... ..: . .. : :: :.:. :..: :.:: :
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...:. ::..: .: :. : .: : :: :::..:::.:: : . ... .
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. :: ::... .::..:. :...: :.::::::.: . ... :.. ::
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.. . :. . . ...... :. ::..::.::.:. :.. ... :::. :::
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.:: :.. ::..: . .. : . :: : ::: . .....: ... : . ..
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pF1KE4 -SLPIDTQYYLEQQLAKPLLRIFEPILGEGRAEAVLLRGDHTRCKTVLTGKVGGLLAFAK
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CCDS14 DNLTIDTQYYLAQQIHPVVARICEPIDG---IDAVLIATWLGLDPTQFRVHHYHKDEEND
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CCDS83 CKVEAMALKPDLVNVIKDVSP----PPLVVMAFSMKTMQN----AKNHQNEIIAMAALVH
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CCDS83 HSFALDKAAPKPPFQSHFCVVSKPKDCIFPYAFKEVIEKKNVKVEVAATERTLLGFFLAK
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CCDS83 VHKIDPDIIVGHNIYGFELEVLLQRINVCKAPHWSKIGRLKR--SNMPKLGGRSG-FGER
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.. :. :... ... . .:: :. . ..: .. . : .. . ..:
CCDS83 NATCGRMICDVEISAKELI----RCKSYHLSELVQQILKTERVVIPMENIQNMYSESSQL
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CCDS83 LYLLE-HTWKDAKFILQIMCELNVLPLALQITNIAGNIMSRTLMGGRSERNEFLLLHAFY
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pF1KE4 HEGLLMP---VVKSE----GGED------------------YTGATVIEPLKGYYDVPIA
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CCDS83 ENNYIVPDKQIFRKPQQKLGDEDEEIDGDTNKYKKGRKKAAYAGGLVLDPKVGFYDKFIL
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CCDS83 LLDFNSLYPSIIQEFNICFTTVQRVASEAQK--VTEDG--EQEQIPELPDPSLEMGILPR
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CCDS83 EIRKLVERRKQVK-QLMKQQDLNPDLILQYDIRQKALKLTANSMYGCLGFSYSRFYAKPL
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. :: ::... .::..:. :...: :.::::::.: . ... :.. ::
CCDS83 AALVTYKGREILMHTKEMVQ-KMNLE--------VIYGDTDSIMINTNSTNLEEVFKLGN
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.. . :. . . ...... :. ::..::.::.:. :.. ... :::. :::
CCDS83 KVKSEVNKLY-KLLEIDIDGVFKSLLLLKKKKYAALVVEPTSDGNYVTKQELKGLDIVRR
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CCDS83 DWCDLAKDTGNFVIGQILSDQSRDTIVENIQKRLIEIGENVLNGSVPVSQFEINKALTKD
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