Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4588
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4588, 913 aa
1>>>pF1KE4588 913 - 913 aa - 913 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1397+/-0.00111; mu= 2.9429+/- 0.067
mean_var=164.9147+/-33.820, 0's: 0 Z-trim(108.2): 32 B-trim: 84 in 1/50
Lambda= 0.099872
statistics sampled from 10056 (10076) to 10056 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.31), width: 16
Scan time: 4.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35379.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 913) 5859 857.0 0
CCDS43987.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 895) 5715 836.2 0
CCDS83487.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 900) 5715 836.2 0
CCDS41908.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 759) 4103 604.0 3.5e-172
CCDS9533.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 659) 3755 553.8 3.8e-157
CCDS73604.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 667) 3711 547.5 3.1e-155
CCDS7179.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 745) 979 153.8 1.1e-36
CCDS73086.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 758) 979 153.8 1.1e-36
CCDS55709.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 764) 979 153.8 1.1e-36
CCDS2462.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 ( 768) 977 153.5 1.4e-36
CCDS58751.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 ( 702) 888 140.7 9.2e-33
CCDS34772.1 CUL1 gene_id:8454|Hs108|chr7 ( 776) 872 138.4 5e-32
>>CCDS35379.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (913 aa)
initn: 5859 init1: 5859 opt: 5859 Z-score: 4570.7 bits: 857.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5859; 99.9% identity (100.0% similar) in 913 aa overlap (1-913:1-913)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MMSQSSGSGDGNDDEATTSKDGGFSSPSPSAAAAAQEVRSATDGNTSTTPPTSAKKRKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MMSQSSGSGDGNDDEATTSKDGGFSSPSPSAAAAAQEVRSATDGNTSTTPPTSAKKRKLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SSSSSSSNSSNEREDFDSTSSSSSTPPLQPRDSASPSTSSFCLGVSVAASSHVPIQKKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SSSSSSSNSSNEREDFDSTSSSSSTPPLQPRDSASPSTSSFCLGVSVAASSHVPIQKKLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 FEDTLEFVGFDAKMAEESSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FEDTLEFVGFDAKMAEESSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 YQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 EAIDRSLLRSLLSMLSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EAIDRSLLRSLLSMLSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 SRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 INAMKEAFETFINKRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 INAMKEAFETFINKRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 DVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 QFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LQWQSTIGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRR
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LQWQSTLGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 TLQSLACGKARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TLQSLACGKARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 RVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYME
850 860 870 880 890 900
910
pF1KE4 RDKENPNQYNYIA
:::::::::::::
CCDS35 RDKENPNQYNYIA
910
>>CCDS43987.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (895 aa)
initn: 5715 init1: 5715 opt: 5715 Z-score: 4458.8 bits: 836.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5715; 99.9% identity (100.0% similar) in 891 aa overlap (23-913:5-895)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MMSQSSGSGDGNDDEATTSKDGGFSSPSPSAAAAAQEVRSATDGNTSTTPPTSAKKRKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MFPTGFSSPSPSAAAAAQEVRSATDGNTSTTPPTSAKKRKLN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SSSSSSSNSSNEREDFDSTSSSSSTPPLQPRDSASPSTSSFCLGVSVAASSHVPIQKKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSSSSSSNSSNEREDFDSTSSSSSTPPLQPRDSASPSTSSFCLGVSVAASSHVPIQKKLR
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 FEDTLEFVGFDAKMAEESSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FEDTLEFVGFDAKMAEESSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEEL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 YQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQM
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNG
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 EAIDRSLLRSLLSMLSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EAIDRSLLRSLLSMLSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKR
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLF
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 SRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKF
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 INAMKEAFETFINKRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 INAMKEAFETFINKRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGK
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 DVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMI
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 QFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRK
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LQWQSTIGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRR
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQWQSTLGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRR
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 TLQSLACGKARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TLQSLACGKARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTE
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 RVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYME
830 840 850 860 870 880
910
pF1KE4 RDKENPNQYNYIA
:::::::::::::
CCDS43 RDKENPNQYNYIA
890
>>CCDS83487.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (900 aa)
initn: 5715 init1: 5715 opt: 5715 Z-score: 4458.7 bits: 836.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5715; 99.9% identity (100.0% similar) in 891 aa overlap (23-913:10-900)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MMSQSSGSGDGNDDEATTSKDGGFSSPSPSAAAAAQEVRSATDGNTSTTPPTSAKKRKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MKSVCPVTSGFSSPSPSAAAAAQEVRSATDGNTSTTPPTSAKKRKLN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SSSSSSSNSSNEREDFDSTSSSSSTPPLQPRDSASPSTSSFCLGVSVAASSHVPIQKKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SSSSSSSNSSNEREDFDSTSSSSSTPPLQPRDSASPSTSSFCLGVSVAASSHVPIQKKLR
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 FEDTLEFVGFDAKMAEESSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FEDTLEFVGFDAKMAEESSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEEL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 YQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 YQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQM
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNG
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 EAIDRSLLRSLLSMLSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EAIDRSLLRSLLSMLSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKR
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLF
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 SRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKF
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 INAMKEAFETFINKRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 INAMKEAFETFINKRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGK
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 DVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMI
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 QFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRK
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LQWQSTIGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRR
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LQWQSTLGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRR
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 TLQSLACGKARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TLQSLACGKARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTE
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 RVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYME
830 840 850 860 870 880
910
pF1KE4 RDKENPNQYNYIA
:::::::::::::
CCDS83 RDKENPNQYNYIA
890 900
>>CCDS41908.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 (759 aa)
initn: 4069 init1: 4069 opt: 4103 Z-score: 3204.7 bits: 604.0 E(32554): 3.5e-172
Smith-Waterman score: 4103; 82.6% identity (94.8% similar) in 749 aa overlap (168-913:13-759)
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 SSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSA---
: : ..:::.: .. .. : .:::.:
CCDS41 MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAA--APAKPGGAGGS
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 KKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISA
::::::::.:.:.::.:::..::.::.:::.:.:.::::.:::::::::::::::.:.:
CCDS41 KKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSP
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 NLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
::::::: ::::..::: :::::::::::::::. :::.:::::::::::::::::::
CCDS41 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
110 120 130 140 150 160
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 VLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSM
::::: :::::::::::::.:::::. ::.::::::::::::::.:::.:::::::::.:
CCDS41 VLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGM
170 180 190 200 210 220
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 LSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQ
:::::.:.:::: .:::::: :::::::.:::::::::::.::.::::::.::.:::::.
CCDS41 LSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDH
230 240 250 260 270 280
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 TTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQW
.::: ::: ::::::::::::::::::..::::::. ::. .:::::::::: :.:::.:
CCDS41 STQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHW
290 300 310 320 330 340
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 IEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINK
::::.::..::::::::: :::.::::::::::.:..:: :::.:.: :::.:::::::
CCDS41 SEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINK
350 360 370 380 390 400
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 RPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKR
:::::::::::.::::::::::::::::::. ::::::.::::.::::::::::::::::
CCDS41 RPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKR
410 420 430 440 450 460
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVPGN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.::::. :
CCDS41 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGP
470 480 490 500 510 520
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 IELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTIGHCVLKA
:.::::::::::::::.:::::: :::.::::.::.::::::::::::::.:.:: ::::
CCDS41 IDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKA
530 540 550 560 570 580
740 750 760 770 780 790
pF1KE4 EFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARVLA
::::::::.::::::::::::::::. ::.::::.::::::.:::::::::::::::::
CCDS41 EFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLI
590 600 610 620 630 640
800 810 820 830 840 850
pF1KE4 KNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAI
:.::::..::::::: : .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS41 KSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAI
650 660 670 680 690 700
860 870 880 890 900 910
pF1KE4 VRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYIA
::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:.:
CCDS41 VRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
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230 240 250 260 270 280
pF1KE4 AIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLF
::::::: ::::..::: :::::::::::
CCDS95 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLF
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290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNK
::::. :::.:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::.:::::. ::.:
CCDS95 LKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQSK
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350 360 370 380 390 400
pF1KE4 TIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLM
:::::::::::::.:::.:::::::::.::::::.:.:::: .:::::: :::::::.::
CCDS95 TIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLM
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410 420 430 440 450 460
pF1KE4 QEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLL
:::::::::.::.::::::.::.:::::..::: ::: ::::::::::::::::::..::
CCDS95 QEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLL
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470 480 490 500 510 520
pF1KE4 DENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDK
::::. ::. .:::::::::: :.:::.: ::::.::..::::::::: :::.:::::::
CCDS95 DENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKDK
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530 540 550 560 570 580
pF1KE4 VDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINKRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEK
:::.:..:: :::.:.: :::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.
CCDS95 VDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELER
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pF1KE4 MLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKL
::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 TLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKL
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pF1KE4 EGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQ
::::::::::::::..:::.::::. : :.::::::::::::::.:::::: :::.:::
CCDS95 EGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQ
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pF1KE4 EIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTIGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLE
:.::.::::::::::::::.:.:: ::::::::::::.::::::::::::::::. ::.:
CCDS95 EVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFE
460 470 480 490 500 510
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 EIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQ
:::.::::::.::::::::::::::::: :.::::..::::::: : .::::::::::::
CCDS95 EIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQ
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830 840 850 860 870 880
pF1KE4 IQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPAD
::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::::.:
CCDS95 IQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGD
580 590 600 610 620 630
890 900 910
pF1KE4 LKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYIA
::::::::::::::::::.:::::.:.:
CCDS95 LKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
640 650
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Smith-Waterman score: 3711; 84.4% identity (94.6% similar) in 666 aa overlap (256-913:2-667)
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 AIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLF
::::::: ::::..::: :::::::::::
CCDS73 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLF
10 20 30
290 300 310 320 330
pF1KE4 LKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSI--------WDMGLELFRAHII
::::. :::.:::::::::::::::::::::::: :::: ::::::::.:::
CCDS73 LKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSICPVSYCLYRDMGLELFRTHII
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 SDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLY
::. ::.::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::.:.:::: .:::::: ::
CCDS73 SDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCLY
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pF1KE4 AAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGEHLTAIL
:::::.:::::::::::.::.::::::.::.:::::..::: ::: ::::::::::::::
CCDS73 AAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAIL
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pF1KE4 QKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQ
::::..::::::. ::. .:::::::::: :.:::.: ::::.::..::::::::: :::
CCDS73 QKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQ
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 ELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINKRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKE
.::::::::::.:..:: :::.:.: :::.::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS73 DLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKE
280 290 300 310 320 330
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pF1KE4 ATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHEC
:::::::. ::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHEC
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pF1KE4 GAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHL
::::::::::::::::::::::..:::.::::. : :.::::::::::::::.::::::
CCDS73 GAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHL
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pF1KE4 PPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTIGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFN
:::.::::.::.::::::::::::::.:.:: ::::::::::::.::::::::::::::
CCDS73 TPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFN
460 470 480 490 500 510
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pF1KE4 EGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHK
::. ::.::::.::::::.::::::::::::::::: :.::::..::::::: : .::::
CCDS73 EGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHK
520 530 540 550 560 570
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pF1KE4 LFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQL
::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::
CCDS73 LFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQL
580 590 600 610 620 630
880 890 900 910
pF1KE4 KFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYIA
::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:.:
CCDS73 KFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
640 650 660
>>CCDS7179.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 (745 aa)
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pF1KE4 GLAKSSTTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSI-
::.. . ::::.:: ...:. .
CCDS71 MSLKPRVVD--FDETWNKLLTTIKAVVMLEYVE
10 20 30
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 KYNLEELYQAVENLC-SYK--ISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKID
. . .. .. . :: .: .. :: . . . :.:.. ..:. .: ..:: .
CCDS71 RATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVR-HLHKRVLESEEQVLVM--YH
40 50 60 70 80
300 310 320 330
pF1KE4 RCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSM-----------------LPSIWDMGLELFR
: :... . .. .. .:. .. .:.. : : ...:...:
CCDS71 RYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWR
90 100 110 120 130 140
340 350 360 370 380
pF1KE4 AHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSD---------LQIYQDS
.. . .: : .: :. .:.:: .......... . :..::.
CCDS71 KLMV--EPLQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEI
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 FEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQKSLIATV
::. :: ::.. : :...:.:: . .:...: ::..: : :: .. ..:
CCDS71 FESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHEC
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 EKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFG--
.......:: .:. .:.. ... .:.. .: :. : :. ..:. ..:. :
CCDS71 QQRMVADHLQ-FLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLR
270 280 290 300 310 320
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pF1KE4 STIVINPEKDKTM-VQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINKR-PN---
.: .. :. :. :. .:. . : ..:. . ...:..:. .:. . .: : :.
CCDS71 ATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVC
330 340 350 360 370 380
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 KPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKRLLV
: ::.::: :. :. . : :..:.: : ... .:..: ::::. :: . :::::.
CCDS71 KAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIH
390 400 410 420 430 440
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 GKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQN--VPGNI
: : :.:.:..:..:::. :: :::::. :. :: .: :. .:.....::. . .:
CCDS71 GLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGI
450 460 470 480 490 500
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pF1KE4 ELTVNILTMGYWP-TYVPMEVH-LPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTIGHCVLK
. . .: : :: : .: . .: :. : ..:. :: . ::::: : . .:
CCDS71 SFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVK
510 520 530 540 550 560
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pF1KE4 AEFKEGKKEL-QVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARV
.. :: . .:. .: ::: ::..: : .:....: ... :: .:..:: ...
CCDS71 MNYL-GKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLL--DVKM
570 580 590 600 610 620
800 810 820 830 840 850
pF1KE4 LAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDA
. .. . .::. ..: : .:. : ..::. ..:.: .:. .: : .::.. ..:
CCDS71 INHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQA
630 640 650 660 670 680
860 870 880 890 900 910
pF1KE4 AIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPAD--LKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYN
::::::: ::.: :: :..:: .: . .:. .:: :: :::..:.::.. . ..:.
CCDS71 AIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADEYS
690 700 710 720 730 740
pF1KE4 YIA
:.:
CCDS71 YVA
>>CCDS73086.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 (758 aa)
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Smith-Waterman score: 1076; 28.6% identity (62.8% similar) in 767 aa overlap (191-913:3-758)
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 SILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKL
::. . ... ::.. . ::::.::
CCDS73 MVPGKEFQHYTCTMSLKPRVVD--FDETWNKL
10 20 30
230 240 250 260 270
pF1KE4 KEAVEAIQNSTSI-KYNLEELYQAVENLC-SYK--ISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFR
...:. . . . .. .. . :: .: .. :: . . . :.:.. ..:.
CCDS73 LTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVR-HLHKRV
40 50 60 70 80
280 290 300 310 320
pF1KE4 EDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSM----------------
.: ..:: . . : :... . .. .. .:. .. .:..
CCDS73 LESEEQVLVMYH--RYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNE
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370
pF1KE4 -LPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSD--
: : ...:...: .. . .: : .: :. .:.:: .......... .
CCDS73 PLMEIGELALDMWRKLMV--EPLQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVE
150 160 170 180 190 200
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 -------LQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLIT
:..::. ::. :: ::.. : :...:.:: . .:...: ::..: :
CCDS73 QYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRK
210 220 230 240 250 260
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 YLDQTTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVL
:: .. ..: .......:: .:. .:.. ... .:.. .: :. : :. .
CCDS73 YLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQ-FLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHM
270 280 290 300 310 320
500 510 520 530 540
pF1KE4 LQQWIEYIKAFG--STIVINPEKDKTM-VQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEA
.:. ..:. : .: .. :. :. :. .:. . : ..:. . ...:..:. .:
CCDS73 IQELQNHIHDEGLRATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKA
330 340 350 360 370 380
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.. :: . .:. .: ::: ::..: : .:....: ... :: .:..:: ...
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]