Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4578
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4578, 774 aa
1>>>pF1KE4578 774 - 774 aa - 774 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3716+/-0.000411; mu= 20.5027+/- 0.026
mean_var=84.0534+/-17.651, 0's: 0 Z-trim(112.1): 86 B-trim: 291 in 1/51
Lambda= 0.139893
statistics sampled from 20877 (20963) to 20877 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 7.560
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002309 (OMIM: 606663) lysyl oxidase homolog 2 p ( 774) 5505 1121.7 0
XP_011531436 (OMIM: 607163) PREDICTED: lysyl oxida ( 753) 3125 641.4 4.2e-183
NP_115992 (OMIM: 607163) lysyl oxidase homolog 3 i ( 753) 3125 641.4 4.2e-183
NP_115587 (OMIM: 607318) lysyl oxidase homolog 4 p ( 756) 2299 474.7 6.4e-133
XP_005270273 (OMIM: 607318) PREDICTED: lysyl oxida ( 757) 2292 473.3 1.7e-132
XP_006718083 (OMIM: 607318) PREDICTED: lysyl oxida ( 757) 2292 473.3 1.7e-132
NP_001276093 (OMIM: 607163) lysyl oxidase homolog ( 608) 2177 450.0 1.4e-125
XP_016860601 (OMIM: 607163) PREDICTED: lysyl oxida ( 392) 1882 390.3 8.4e-108
NP_001276094 (OMIM: 607163) lysyl oxidase homolog ( 392) 1882 390.3 8.4e-108
NP_002308 (OMIM: 153455,617168) protein-lysine 6-o ( 417) 759 163.7 1.5e-39
XP_016877668 (OMIM: 153456,177650) PREDICTED: lysy ( 225) 735 158.6 2.7e-38
NP_005567 (OMIM: 153456,177650) lysyl oxidase homo ( 574) 737 159.3 4.1e-38
NP_001171573 (OMIM: 153455,617168) protein-lysine ( 187) 704 152.3 1.8e-36
XP_011537709 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2411) 554 122.9 1.6e-26
XP_011537711 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2411) 552 122.5 2.1e-26
XP_011537715 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2282) 549 121.9 3.1e-26
XP_016871287 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (1990) 546 121.2 4.2e-26
XP_011537710 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2411) 546 121.3 4.9e-26
XP_011537712 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2411) 546 121.3 4.9e-26
NP_001307573 (OMIM: 601969) deleted in malignant b (2412) 546 121.3 4.9e-26
XP_011537705 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2413) 546 121.3 4.9e-26
XP_011537707 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2413) 546 121.3 4.9e-26
XP_011537704 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2413) 546 121.3 4.9e-26
XP_011537703 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2413) 546 121.3 4.9e-26
NP_015568 (OMIM: 601969) deleted in malignant brai (2413) 546 121.3 4.9e-26
XP_011537702 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2434) 546 121.3 4.9e-26
XP_006717728 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2510) 546 121.3 5e-26
XP_011537701 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2510) 546 121.3 5e-26
XP_011537700 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2521) 546 121.3 5e-26
XP_006717723 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2526) 546 121.3 5e-26
XP_011537698 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2526) 546 121.3 5e-26
XP_011537691 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2541) 546 121.3 5e-26
XP_011537690 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2542) 546 121.3 5e-26
XP_011537692 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2532) 514 114.9 4.4e-24
XP_011537697 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2532) 511 114.3 6.7e-24
XP_011537713 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2403) 510 114.0 7.4e-24
XP_011537694 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2532) 481 108.2 4.5e-22
XP_011537695 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2532) 480 108.0 5.1e-22
XP_011537696 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2532) 480 108.0 5.1e-22
NP_001304002 (OMIM: 153455,617168) protein-lysine ( 120) 462 103.3 6.5e-22
NP_005885 (OMIM: 602592) CD5 antigen-like precurso ( 347) 430 97.2 1.3e-19
XP_005245659 (OMIM: 602592) PREDICTED: CD5 antigen ( 347) 430 97.2 1.3e-19
XP_016858295 (OMIM: 602592) PREDICTED: CD5 antigen ( 353) 430 97.2 1.3e-19
NP_981961 (OMIM: 605545) scavenger receptor cystei (1121) 419 95.4 1.4e-18
XP_005253586 (OMIM: 605545) PREDICTED: scavenger r (1124) 419 95.4 1.4e-18
NP_004235 (OMIM: 605545) scavenger receptor cystei (1156) 419 95.4 1.5e-18
XP_016875720 (OMIM: 605545) PREDICTED: scavenger r (1161) 419 95.4 1.5e-18
XP_011518923 (OMIM: 606079) PREDICTED: scavenger r ( 766) 406 92.6 6.6e-18
XP_011518922 (OMIM: 606079) PREDICTED: scavenger r (1182) 406 92.8 9.1e-18
XP_011518921 (OMIM: 606079) PREDICTED: scavenger r (1182) 406 92.8 9.1e-18
>>NP_002309 (OMIM: 606663) lysyl oxidase homolog 2 precu (774 aa)
initn: 5505 init1: 5505 opt: 5505 Z-score: 6004.1 bits: 1121.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5505; 99.9% identity (100.0% similar) in 774 aa overlap (1-774:1-774)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 IWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 IQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGLPAVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGLPAVVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 CVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVSA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAESQGCNHEEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAESQGCNHEEDA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 GVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCRQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 GLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYGAG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 VACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYRRLLRFS
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFMLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYRRLLRFS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 SQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKASFCLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKASFCLED
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 TECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNFEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNFEV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KE4 AESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ
730 740 750 760 770
>>XP_011531436 (OMIM: 607163) PREDICTED: lysyl oxidase h (753 aa)
initn: 2887 init1: 1665 opt: 3125 Z-score: 3408.3 bits: 641.4 E(85289): 4.2e-183
Smith-Waterman score: 3125; 55.1% identity (79.6% similar) in 760 aa overlap (19-771:1-752)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHY-----PEYFQQPAPEYHQPQAPANVAK
. :.:. :.. : . .:.: :. :.
XP_011 MRPVSVWQWSPWGLLLCLLCSSCLGSPSPSTG-PEKKAGSQG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 IQLRLAGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYG
...:::: :: :::::. :.:::.:::::...:::..:::::..:: .:: :..::
XP_011 LRFRLAGFPRKPYEGRVEIQRAGEWGTICDDDFTLQAAHILCRELGFTEATGWTHSAKYG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 KGEGPIWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQ
: : :::::: :.:.: ... :.: ::: .:: : ::.::.:.:.:.:::. :...: .
XP_011 PGTGRIWLDNLSCSGTEQSVTECASRGWGNSDCTHDEDAGVICKDQRLPGFS-DSNVI-E
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 IENLNIQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFG
.:. ..:::..::: .. :. :: :: :::. :.:.::: :.:.::.:::::.:
XP_011 VEH-HLQVEEVRIRPAVGWGRRPLPVTEGLVEVRLPDGWSQVCDKGWSAHNSHVVCGMLG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 FPGERTYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGL
::.:. :. :...:.:... . .. :.:::::.: :.: . : . : .:
XP_011 FPSEKRVNAAFYRLLAQRQQHSFGLHGVACVGTEAHLSLCSLEFYRANDTAR---CPGGG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 PAVVSCVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPE-QPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDK
::::::::: :.. .. .. .. ::. . :::.:::. ::::::::: . :::::: :
XP_011 PAVVSCVPGPVYAASSGQKKQQQSKPQGEARVRLKGGAHPGEGRVEVLKASTWGTVCDRK
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 WDLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKF-NAESQG
::: .:::::::::::::.::..:.:.:::.: :::.:..:.:.: :. : : ..
XP_011 WDLHAASVVCRELGFGSAREALSGARMGQGMGAIHLSEVRCSGQELSLWKCPHKNITAED
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 CNHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEA
:.: .::::::: : : . ..::.:::. .:::::: . : : ::..::..:: .::
XP_011 CSHSQDAGVRCNLPYTGAETRIRLSGGRSQHEGRVEVQIGGPGPLRWGLICGDDWGTLEA
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 MVVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQG
::.:::::::.:....:::::: . : ..::::::.:.:::::: .: : : ..: .
XP_011 MVACRQLGLGYANHGLQETWYWDSG-NITEVVMSGVRCTGTELSLDQCAHHGTHITCKRT
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 GVQYGAGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGY
:... ::: ::::: ::.:.. .::.:.:.::::. .: :: :::::..:: ... :.
XP_011 GTRFTAGVICSETASDLLLHSALVQETAYIEDRPLHMLYCAAEENCLASSARSANWPYGH
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 RRLLRFSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHK
:::::::::::: :..::::: :::.:.::.:: :::::..:::::.:. ::::::::::
XP_011 RRLLRFSSQIHNLGRADFRPKAGRHSWVWHECHGHYHSMDIFTHYDILTPNGTKVAEGHK
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 ASFCLEDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVV
::::::::::. :..: :::::::.::::.::::.:::::::::.::::: ::.:..:::
XP_011 ASFCLEDTECQEDVSKRYECANFGEQGITVGCWDLYRHDIDCQWIDITDVKPGNYILQVV
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 INPNFEVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSP
:::::::::::..:: ::: .:::::::..::::: .::::....::.. : .::.
XP_011 INPNFEVAESDFTNNAMKCNCKYDGHRIWVHNCHIGDAFSEEANRRFERYPGQTSNQII
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 Q
>>NP_115992 (OMIM: 607163) lysyl oxidase homolog 3 isofo (753 aa)
initn: 2887 init1: 1665 opt: 3125 Z-score: 3408.3 bits: 641.4 E(85289): 4.2e-183
Smith-Waterman score: 3125; 55.1% identity (79.6% similar) in 760 aa overlap (19-771:1-752)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHY-----PEYFQQPAPEYHQPQAPANVAK
. :.:. :.. : . .:.: :. :.
NP_115 MRPVSVWQWSPWGLLLCLLCSSCLGSPSPSTG-PEKKAGSQG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 IQLRLAGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYG
...:::: :: :::::. :.:::.:::::...:::..:::::..:: .:: :..::
NP_115 LRFRLAGFPRKPYEGRVEIQRAGEWGTICDDDFTLQAAHILCRELGFTEATGWTHSAKYG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 KGEGPIWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQ
: : :::::: :.:.: ... :.: ::: .:: : ::.::.:.:.:.:::. :...: .
NP_115 PGTGRIWLDNLSCSGTEQSVTECASRGWGNSDCTHDEDAGVICKDQRLPGFS-DSNVI-E
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 IENLNIQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFG
.:. ..:::..::: .. :. :: :: :::. :.:.::: :.:.::.:::::.:
NP_115 VEH-HLQVEEVRIRPAVGWGRRPLPVTEGLVEVRLPDGWSQVCDKGWSAHNSHVVCGMLG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 FPGERTYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGL
::.:. :. :...:.:... . .. :.:::::.: :.: . : . : .:
NP_115 FPSEKRVNAAFYRLLAQRQQHSFGLHGVACVGTEAHLSLCSLEFYRANDTAR---CPGGG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 PAVVSCVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPE-QPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDK
::::::::: :.. .. .. .. ::. . :::.:::. ::::::::: . :::::: :
NP_115 PAVVSCVPGPVYAASSGQKKQQQSKPQGEARVRLKGGAHPGEGRVEVLKASTWGTVCDRK
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 WDLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKF-NAESQG
::: .:::::::::::::.::..:.:.:::.: :::.:..:.:.: :. : : ..
NP_115 WDLHAASVVCRELGFGSAREALSGARMGQGMGAIHLSEVRCSGQELSLWKCPHKNITAED
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 CNHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEA
:.: .::::::: : : . ..::.:::. .:::::: . : : ::..::..:: .::
NP_115 CSHSQDAGVRCNLPYTGAETRIRLSGGRSQHEGRVEVQIGGPGPLRWGLICGDDWGTLEA
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 MVVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQG
::.:::::::.:....:::::: . : ..::::::.:.:::::: .: : : ..: .
NP_115 MVACRQLGLGYANHGLQETWYWDSG-NITEVVMSGVRCTGTELSLDQCAHHGTHITCKRT
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 GVQYGAGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGY
:... ::: ::::: ::.:.. .::.:.:.::::. .: :: :::::..:: ... :.
NP_115 GTRFTAGVICSETASDLLLHSALVQETAYIEDRPLHMLYCAAEENCLASSARSANWPYGH
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 RRLLRFSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHK
:::::::::::: :..::::: :::.:.::.:: :::::..:::::.:. ::::::::::
NP_115 RRLLRFSSQIHNLGRADFRPKAGRHSWVWHECHGHYHSMDIFTHYDILTPNGTKVAEGHK
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 ASFCLEDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVV
::::::::::. :..: :::::::.::::.::::.:::::::::.::::: ::.:..:::
NP_115 ASFCLEDTECQEDVSKRYECANFGEQGITVGCWDLYRHDIDCQWIDITDVKPGNYILQVV
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 INPNFEVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSP
:::::::::::..:: ::: .:::::::..::::: .::::....::.. : .::.
NP_115 INPNFEVAESDFTNNAMKCNCKYDGHRIWVHNCHIGDAFSEEANRRFERYPGQTSNQII
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 Q
>>NP_115587 (OMIM: 607318) lysyl oxidase homolog 4 precu (756 aa)
initn: 2334 init1: 1594 opt: 2299 Z-score: 2507.4 bits: 474.7 E(85289): 6.4e-133
Smith-Waterman score: 3014; 55.3% identity (78.8% similar) in 740 aa overlap (47-769:21-754)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 ALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRLAGQKRKHSEGRVEVYY
:. : ... .:::.: . : :::.:: .
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pF1KE4 DGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGPIWLDNLHCTGNEATLA
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NP_115 QGQWGTVCDDNFAIQEATVACRQLGFEAALTWAHSAKYGQGEGPIWLDNVRCVGTESSLD
60 70 80 90 100 110
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pF1KE4 ACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLNIQVEDIRIRAILSTYR
: ::::::.::.:.:::::.: .: :. ..... : . . ..:..:.. ::.. .
NP_115 QCGSNGWGVSDCSHSEDVGVICHPRRHRGY-LSETVSNALGPQGRRLEEVRLKPILASAK
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 KRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGERTYNTKVYKMF------
...:: :: :::: :.:.::. :: .::::::::.:::.: ... :.
NP_115 QHSPVTEGAVEVKYEGHWRQVCDQGWTMNNSRVVCGMLGFPSEVPVDSHYYRKVWDLKMR
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300
pF1KE4 --ASR-----RKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNV---TCENGLPAVVS
:: :. .: .. : ::: :...: ::.. : .. .: .:. ::::
NP_115 DPKSRLKSLTNKNSFWIHQVTCLGTEPHMANC----QVQVAPARGKLRPACPGGMHAVVS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 CVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVSA
:: : : : . ::. :.: ::::.:: .:::::::: : .:::::: .:.:.::
NP_115 CVAGPHFRPPKTKPQRKGSWAEEPRVRLRSGAQVGEGRVEVLMNRQWGTVCDHRWNLISA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KE4 SVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAESQ-GCNHEED
:::::.::::::.::. :.:::::.:::::.:..: : :... :: :: ::.::.:
NP_115 SVVCRQLGFGSAREALFGARLGQGLGPIHLSEVRCRGYERTLSDCPALEGSQNGCQHEND
350 360 370 380 390 400
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pF1KE4 AGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCRQ
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NP_115 AAVRCNVPNMGFQNQVRLAGGRIPEEGLLEVQVEVNGVPRWGSVCSENWGLTEAMVACRQ
410 420 430 440 450 460
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pF1KE4 LGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYGA
:::::: .:..:::.: : ...::::::.::::::.: .:.. : : : .:: .. :
NP_115 LGLGFAIHAYKETWFWSGTPRAQEVVMSGVRCSGTELALQQCQRHGP-VHCSHGGGRFLA
470 480 490 500 510 520
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pF1KE4 GVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYRRLLRF
::.: ..:::::.::..::.:.::::::. : :: :::::: :: . : ::::::::
NP_115 GVSCMDSAPDLVMNAQLVQETAYLEDRPLSQLYCAHEENCLSKSADHMDWPYGYRRLLRF
530 540 550 560 570 580
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pF1KE4 SSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKASFCLE
:.::.: :..:::::.:: .:.::.:::::::.:::::::::.:::.:::::::::::::
NP_115 STQIYNLGRTDFRPKTGRDSWVWHQCHRHYHSIEVFTHYDLLTLNGSKVAEGHKASFCLE
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 DTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNFE
::.: .:. : :::::.::.:.:::: ::::::::::::::: ::.:.:::..::..:
NP_115 DTNCPTGLQRRYACANFGEQGVTVGCWDTYRHDIDCQWVDITDVGPGNYIFQVIVNPHYE
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 VAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ
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NP_115 VAESDFSNNMLQCRCKYDGHRVWLHNCHTGNSYPANAELSLEQEQRLRNNLI
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>>XP_005270273 (OMIM: 607318) PREDICTED: lysyl oxidase h (757 aa)
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Smith-Waterman score: 3007; 55.3% identity (78.7% similar) in 741 aa overlap (47-769:21-755)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 ALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRLAGQKRKHSEGRVEVYY
:. : ... .:::.: . : :::.:: .
XP_005 MAWSPPATLFLFLLLLGQPPPSRPQSLGTTKLRLVGPESKPEEGRLEVLH
10 20 30 40 50
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pF1KE4 DGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGPIWLDNLHCTGNEATLA
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XP_005 QGQWGTVCDDNFAIQEATVACRQLGFEAALTWAHSAKYGQGEGPIWLDNVRCVGTESSLD
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 ACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLNIQVEDIRIRAILSTYR
: ::::::.::.:.:::::.: .: :. ..... : . . ..:..:.. ::.. .
XP_005 QCGSNGWGVSDCSHSEDVGVICHPRRHRGY-LSETVSNALGPQGRRLEEVRLKPILASAK
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 KRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGERTYNTKVYKMF------
...:: :: :::: :.:.::. :: .::::::::.:::.: ... :.
XP_005 QHSPVTEGAVEVKYEGHWRQVCDQGWTMNNSRVVCGMLGFPSEVPVDSHYYRKVWDLKMR
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300
pF1KE4 --ASR-----RKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNV---TCENGLPAVVS
:: :. .: .. : ::: :...: ::.. : .. .: .:. ::::
XP_005 DPKSRLKSLTNKNSFWIHQVTCLGTEPHMANC----QVQVAPARGKLRPACPGGMHAVVS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE4 CVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQ-PLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVS
:: : : : . ::. :: : ::::.:: .:::::::: : .:::::: .:.:.:
XP_005 CVAGPHFRPPKTKPQRKGSWAEQEPRVRLRSGAQVGEGRVEVLMNRQWGTVCDHRWNLIS
290 300 310 320 330 340
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pF1KE4 ASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAESQ-GCNHEE
::::::.::::::.::. :.:::::.:::::.:..: : :... :: :: ::.::.
XP_005 ASVVCRQLGFGSAREALFGARLGQGLGPIHLSEVRCRGYERTLSDCPALEGSQNGCQHEN
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pF1KE4 DAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCR
::.::::.: ::.:...:: ::: : :: .:: :: :: :: ::..:::..::::.::
XP_005 DAAVRCNVPNMGFQNQVRLAGGRIPEEGLLEVQVEVNGVPRWGSVCSENWGLTEAMVACR
410 420 430 440 450 460
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pF1KE4 QLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYG
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XP_005 QLGLGFAIHAYKETWFWSGTPRAQEVVMSGVRCSGTELALQQCQRHGP-VHCSHGGGRFL
470 480 490 500 510 520
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pF1KE4 AGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYRRLLR
:::.: ..:::::.::..::.:.::::::. : :: :::::: :: . : :::::::
XP_005 AGVSCMDSAPDLVMNAQLVQETAYLEDRPLSQLYCAHEENCLSKSADHMDWPYGYRRLLR
530 540 550 560 570 580
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pF1KE4 FSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKASFCL
::.::.: :..:::::.:: .:.::.:::::::.:::::::::.:::.::::::::::::
XP_005 FSTQIYNLGRTDFRPKTGRDSWVWHQCHRHYHSIEVFTHYDLLTLNGSKVAEGHKASFCL
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 EDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNF
:::.: .:. : :::::.::.:.:::: ::::::::::::::: ::.:.:::..::..
XP_005 EDTNCPTGLQRRYACANFGEQGVTVGCWDTYRHDIDCQWVDITDVGPGNYIFQVIVNPHY
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 EVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ
::::::.:::...:: .:::::.:..::: :.:. ..: ..:. . : ::
XP_005 EVAESDFSNNMLQCRCKYDGHRVWLHNCHTGNSYPANAELSLEQEQRLRNNLI
710 720 730 740 750
>>XP_006718083 (OMIM: 607318) PREDICTED: lysyl oxidase h (757 aa)
initn: 2258 init1: 1518 opt: 2292 Z-score: 2499.7 bits: 473.3 E(85289): 1.7e-132
Smith-Waterman score: 3007; 55.3% identity (78.7% similar) in 741 aa overlap (47-769:21-755)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 ALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRLAGQKRKHSEGRVEVYY
:. : ... .:::.: . : :::.:: .
XP_006 MAWSPPATLFLFLLLLGQPPPSRPQSLGTTKLRLVGPESKPEEGRLEVLH
10 20 30 40 50
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pF1KE4 DGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGPIWLDNLHCTGNEATLA
.:::::::::.:.:. : :.::.::. : .:. :..::.:::::::::..:.:.:..:
XP_006 QGQWGTVCDDNFAIQEATVACRQLGFEAALTWAHSAKYGQGEGPIWLDNVRCVGTESSLD
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 ACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLNIQVEDIRIRAILSTYR
: ::::::.::.:.:::::.: .: :. ..... : . . ..:..:.. ::.. .
XP_006 QCGSNGWGVSDCSHSEDVGVICHPRRHRGY-LSETVSNALGPQGRRLEEVRLKPILASAK
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 KRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGERTYNTKVYKMF------
...:: :: :::: :.:.::. :: .::::::::.:::.: ... :.
XP_006 QHSPVTEGAVEVKYEGHWRQVCDQGWTMNNSRVVCGMLGFPSEVPVDSHYYRKVWDLKMR
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300
pF1KE4 --ASR-----RKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNV---TCENGLPAVVS
:: :. .: .. : ::: :...: ::.. : .. .: .:. ::::
XP_006 DPKSRLKSLTNKNSFWIHQVTCLGTEPHMANC----QVQVAPARGKLRPACPGGMHAVVS
230 240 250 260 270 280
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pF1KE4 CVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQ-PLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVS
:: : : : . ::. :: : ::::.:: .:::::::: : .:::::: .:.:.:
XP_006 CVAGPHFRPPKTKPQRKGSWAEQEPRVRLRSGAQVGEGRVEVLMNRQWGTVCDHRWNLIS
290 300 310 320 330 340
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pF1KE4 ASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAESQ-GCNHEE
::::::.::::::.::. :.:::::.:::::.:..: : :... :: :: ::.::.
XP_006 ASVVCRQLGFGSAREALFGARLGQGLGPIHLSEVRCRGYERTLSDCPALEGSQNGCQHEN
350 360 370 380 390 400
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pF1KE4 DAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCR
::.::::.: ::.:...:: ::: : :: .:: :: :: :: ::..:::..::::.::
XP_006 DAAVRCNVPNMGFQNQVRLAGGRIPEEGLLEVQVEVNGVPRWGSVCSENWGLTEAMVACR
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 QLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYG
::::::: .:..:::.: : ...::::::.::::::.: .:.. : : : .:: ..
XP_006 QLGLGFAIHAYKETWFWSGTPRAQEVVMSGVRCSGTELALQQCQRHGP-VHCSHGGGRFL
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 AGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYRRLLR
:::.: ..:::::.::..::.:.::::::. : :: :::::: :: . : :::::::
XP_006 AGVSCMDSAPDLVMNAQLVQETAYLEDRPLSQLYCAHEENCLSKSADHMDWPYGYRRLLR
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 FSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKASFCL
::.::.: :..:::::.:: .:.::.:::::::.:::::::::.:::.::::::::::::
XP_006 FSTQIYNLGRTDFRPKTGRDSWVWHQCHRHYHSIEVFTHYDLLTLNGSKVAEGHKASFCL
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 EDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNF
:::.: .:. : :::::.::.:.:::: ::::::::::::::: ::.:.:::..::..
XP_006 EDTNCPTGLQRRYACANFGEQGVTVGCWDTYRHDIDCQWVDITDVGPGNYIFQVIVNPHY
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 EVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ
::::::.:::...:: .:::::.:..::: :.:. ..: ..:. . : ::
XP_006 EVAESDFSNNMLQCRCKYDGHRVWLHNCHTGNSYPANAELSLEQEQRLRNNLI
710 720 730 740 750
>>NP_001276093 (OMIM: 607163) lysyl oxidase homolog 3 is (608 aa)
initn: 2673 init1: 1665 opt: 2177 Z-score: 2375.6 bits: 450.0 E(85289): 1.4e-125
Smith-Waterman score: 2420; 47.4% identity (66.0% similar) in 759 aa overlap (19-771:1-607)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHY-----PEYFQQPAPEYHQPQAPANVAK
. :.:. :.. : . .:.: :. :.
NP_001 MRPVSVWQWSPWGLLLCLLCSSCLGSPSPSTG-PEKKAGSQG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 IQLRLAGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYG
...:::: :: :::::. :.:::.:::::...:::..:::::..:: .:: :..::
NP_001 LRFRLAGFPRKPYEGRVEIQRAGEWGTICDDDFTLQAAHILCRELGFTEATGWTHSAKYG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 KGEGPIWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQ
: : :::::: :.:.: ... :.: ::: .:: : ::.::.:.:.:.:::. :...:
NP_001 PGTGRIWLDNLSCSGTEQSVTECASRGWGNSDCTHDEDAGVICKDQRLPGFS-DSNVI--
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 IENLNIQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFG
NP_001 ------------------------------------------------------------
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 FPGERTYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGL
::.
NP_001 ---------------------------------EAR------------------------
160
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 PAVVSCVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKW
:::.:::. ::::::::: . :::::: ::
NP_001 ------------------------------VRLKGGAHPGEGRVEVLKASTWGTVCDRKW
170 180 190
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 DLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKF-NAESQGC
:: .:::::::::::::.::..:.:.:::.: :::.:..:.:.: :. : : .. :
NP_001 DLHAASVVCRELGFGSAREALSGARMGQGMGAIHLSEVRCSGQELSLWKCPHKNITAEDC
200 210 220 230 240 250
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 NHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAM
.: .::::::: : : . ..::.:::. .:::::: . : : ::..::..:: .:::
NP_001 SHSQDAGVRCNLPYTGAETRIRLSGGRSQHEGRVEVQIGGPGPLRWGLICGDDWGTLEAM
260 270 280 290 300 310
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 VVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGG
:.:::::::.:....:::::: . : ..::::::.:.:::::: .: : : ..: . :
NP_001 VACRQLGLGYANHGLQETWYWDSG-NITEVVMSGVRCTGTELSLDQCAHHGTHITCKRTG
320 330 340 350 360 370
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 VQYGAGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYR
... ::: ::::: ::.:.. .::.:.:.::::. .: :: :::::..:: ... :.:
NP_001 TRFTAGVICSETASDLLLHSALVQETAYIEDRPLHMLYCAAEENCLASSARSANWPYGHR
380 390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 RLLRFSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKA
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NP_001 RLLRFSSQIHNLGRADFRPKAGRHSWVWHECHGHYHSMDIFTHYDILTPNGTKVAEGHKA
440 450 460 470 480 490
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 SFCLEDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVI
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NP_001 SFCLEDTECQEDVSKRYECANFGEQGITVGCWDLYRHDIDCQWIDITDVKPGNYILQVVI
500 510 520 530 540 550
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 NPNFEVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ
::::::::::..:: ::: .:::::::..::::: .::::....::.. : .::.
NP_001 NPNFEVAESDFTNNAMKCNCKYDGHRIWVHNCHIGDAFSEEANRRFERYPGQTSNQII
560 570 580 590 600
>>XP_016860601 (OMIM: 607163) PREDICTED: lysyl oxidase h (392 aa)
initn: 1874 init1: 1395 opt: 1882 Z-score: 2056.4 bits: 390.3 E(85289): 8.4e-108
Smith-Waterman score: 1882; 61.7% identity (84.7% similar) in 392 aa overlap (381-771:1-391)
360 370 380 390 400
pF1KE4 CDDKWDLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKF-NA
.:::.: :::.:..:.:.: :. : :
XP_016 MGQGMGAIHLSEVRCSGQELSLWKCPHKNI
10 20 30
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 ESQGCNHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWG
.. :.: .::::::: : : . ..::.:::. .:::::: . : : ::..::..::
XP_016 TAEDCSHSQDAGVRCNLPYTGAETRIRLSGGRSQHEGRVEVQIGGPGPLRWGLICGDDWG
40 50 60 70 80 90
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 IVEAMVVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVA
.::::.:::::::.:....:::::: . : ..::::::.:.:::::: .: : : ..
XP_016 TLEAMVACRQLGLGYANHGLQETWYWDSG-NITEVVMSGVRCTGTELSLDQCAHHGTHIT
100 110 120 130 140
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 CPQGGVQYGAGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDP
: . :... ::: ::::: ::.:.. .::.:.:.::::. .: :: :::::..:: ...
XP_016 CKRTGTRFTAGVICSETASDLLLHSALVQETAYIEDRPLHMLYCAAEENCLASSARSANW
150 160 170 180 190 200
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 TTGYRRLLRFSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVA
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XP_016 PYGHRRLLRFSSQIHNLGRADFRPKAGRHSWVWHECHGHYHSMDIFTHYDILTPNGTKVA
210 220 230 240 250 260
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 EGHKASFCLEDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYL
::::::::::::::. :..: :::::::.::::.::::.:::::::::.::::: ::.:.
XP_016 EGHKASFCLEDTECQEDVSKRYECANFGEQGITVGCWDLYRHDIDCQWIDITDVKPGNYI
270 280 290 300 310 320
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 FQVVINPNFEVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNN
.::::::::::::::..:: ::: .:::::::..::::: .::::....::.. : .:
XP_016 LQVVINPNFEVAESDFTNNAMKCNCKYDGHRIWVHNCHIGDAFSEEANRRFERYPGQTSN
330 340 350 360 370 380
770
pF1KE4 QLSPQ
:.
XP_016 QII
390
>>NP_001276094 (OMIM: 607163) lysyl oxidase homolog 3 is (392 aa)
initn: 1874 init1: 1395 opt: 1882 Z-score: 2056.4 bits: 390.3 E(85289): 8.4e-108
Smith-Waterman score: 1882; 61.7% identity (84.7% similar) in 392 aa overlap (381-771:1-391)
360 370 380 390 400
pF1KE4 CDDKWDLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKF-NA
.:::.: :::.:..:.:.: :. : :
NP_001 MGQGMGAIHLSEVRCSGQELSLWKCPHKNI
10 20 30
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 ESQGCNHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWG
.. :.: .::::::: : : . ..::.:::. .:::::: . : : ::..::..::
NP_001 TAEDCSHSQDAGVRCNLPYTGAETRIRLSGGRSQHEGRVEVQIGGPGPLRWGLICGDDWG
40 50 60 70 80 90
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 IVEAMVVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVA
.::::.:::::::.:....:::::: . : ..::::::.:.:::::: .: : : ..
NP_001 TLEAMVACRQLGLGYANHGLQETWYWDSG-NITEVVMSGVRCTGTELSLDQCAHHGTHIT
100 110 120 130 140
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 CPQGGVQYGAGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDP
: . :... ::: ::::: ::.:.. .::.:.:.::::. .: :: :::::..:: ...
NP_001 CKRTGTRFTAGVICSETASDLLLHSALVQETAYIEDRPLHMLYCAAEENCLASSARSANW
150 160 170 180 190 200
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 TTGYRRLLRFSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVA
:.:::::::::::: :..::::: :::.:.::.:: :::::..:::::.:. ::::::
NP_001 PYGHRRLLRFSSQIHNLGRADFRPKAGRHSWVWHECHGHYHSMDIFTHYDILTPNGTKVA
210 220 230 240 250 260
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 EGHKASFCLEDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYL
::::::::::::::. :..: :::::::.::::.::::.:::::::::.::::: ::.:.
NP_001 EGHKASFCLEDTECQEDVSKRYECANFGEQGITVGCWDLYRHDIDCQWIDITDVKPGNYI
270 280 290 300 310 320
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 FQVVINPNFEVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNN
.::::::::::::::..:: ::: .:::::::..::::: .::::....::.. : .:
NP_001 LQVVINPNFEVAESDFTNNAMKCNCKYDGHRIWVHNCHIGDAFSEEANRRFERYPGQTSN
330 340 350 360 370 380
770
pF1KE4 QLSPQ
:.
NP_001 QII
390
>>NP_002308 (OMIM: 153455,617168) protein-lysine 6-oxida (417 aa)
initn: 705 init1: 492 opt: 759 Z-score: 831.1 bits: 163.7 E(85289): 1.5e-39
Smith-Waterman score: 759; 47.1% identity (72.4% similar) in 221 aa overlap (531-748:195-414)
510 520 530 540 550
pF1KE4 SNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYGAGVACSETA-PDLVLNAEMVQQ
: : . : :.. . . :::: . ..:
NP_002 GMVGDDPYNPYKYSDDNPYYNYYDTYERPRPGGRYRPGYGTGYFQYGLPDLVADPYYIQA
170 180 190 200 210 220
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pF1KE4 TTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTT-GYRRLLRFSSQIHNNGQSDFRPKNGRH
.::.. :. :.:: :::::...: ..: .: :::: ....:.: ::: :. :.
NP_002 STYVQKMSMYNLRCAAEENCLASTAYRADVRDYDHRVLLRFPQRVKNQGTSDFLPSRPRY
230 240 250 260 270 280
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 AWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTK-VAEGHKASFCLEDTECEGDIQKNYECANFG
.: ::.::.:::::. :.:::::. : . :::::::::::::: :. .. . :.
NP_002 SWEWHSCHQHYHSMDEFSHYDLLDANTQRRVAEGHKASFCLEDTSCDYGYHRRFACTAH-
290 300 310 320 330 340
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pF1KE4 DQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNFEVAESDYSNNIMKCRSRYD
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NP_002 TQGLSPGCYDTYGADIDCQWIDITDVKPGNYILKVSVNPSYLVPESDYTNNVVRCDIRYT
350 360 370 380 390 400
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NP_002 GHHAYASGCTISPY
410
774 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 18:37:48 2016 done: Mon Nov 7 18:37:49 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]