Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4569
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4569, 724 aa
1>>>pF1KE4569 724 - 724 aa - 724 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1624+/-0.000482; mu= 6.3421+/- 0.030
mean_var=226.9995+/-46.628, 0's: 0 Z-trim(117.2): 389 B-trim: 44 in 1/53
Lambda= 0.085126
statistics sampled from 28530 (28989) to 28530 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.34), width: 16
Scan time: 7.310
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000086 (OMIM: 132400,177170,600310) cartilage o ( 757) 5311 666.3 1.3e-190
NP_001293142 (OMIM: 600715) thrombospondin-4 isofo ( 870) 3754 475.1 5.1e-133
NP_001293143 (OMIM: 600715) thrombospondin-4 isofo ( 870) 3754 475.1 5.1e-133
NP_001293141 (OMIM: 600715) thrombospondin-4 isofo ( 870) 3754 475.1 5.1e-133
NP_003239 (OMIM: 600715) thrombospondin-4 isoform ( 961) 3754 475.2 5.4e-133
NP_001239537 (OMIM: 188062) thrombospondin-3 isofo ( 836) 3609 457.3 1.1e-127
NP_001239536 (OMIM: 188062) thrombospondin-3 isofo ( 947) 3609 457.4 1.2e-127
NP_009043 (OMIM: 188062) thrombospondin-3 isoform ( 956) 3609 457.4 1.2e-127
XP_006711561 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon (1013) 3609 457.4 1.3e-127
XP_011508236 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 780) 3171 403.5 1.7e-111
XP_011508237 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 780) 3171 403.5 1.7e-111
XP_011508234 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 921) 3171 403.5 1.9e-111
XP_011508235 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 921) 3171 403.5 1.9e-111
XP_011508233 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 921) 3171 403.5 1.9e-111
XP_011508231 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 959) 3171 403.6 1.9e-111
XP_011508230 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 985) 3171 403.6 2e-111
XP_011508229 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon (1007) 3171 403.6 2e-111
XP_011508228 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon (1016) 3171 403.6 2e-111
XP_011508238 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 704) 3122 397.4 1e-109
XP_011508232 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 954) 2839 362.8 3.6e-99
XP_016857695 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 488) 2627 336.5 1.6e-91
NP_003237 (OMIM: 188060) thrombospondin-1 precurso (1170) 2504 321.7 1e-86
XP_011520273 (OMIM: 188060) PREDICTED: thrombospon (1112) 2499 321.1 1.5e-86
NP_003238 (OMIM: 188061,603932) thrombospondin-2 p (1172) 2464 316.8 3.1e-85
XP_016865288 (OMIM: 600715) PREDICTED: thrombospon ( 656) 1918 249.5 3.1e-65
XP_016865289 (OMIM: 600715) PREDICTED: thrombospon ( 637) 1900 247.3 1.4e-64
XP_016865287 (OMIM: 600715) PREDICTED: thrombospon ( 663) 1900 247.3 1.5e-64
NP_000129 (OMIM: 102370,129600,134797,154700,18490 (2871) 317 53.5 1.3e-05
NP_001138581 (OMIM: 602320) protein kinase C-bindi ( 815) 304 51.4 1.7e-05
NP_001138580 (OMIM: 602320) protein kinase C-bindi ( 816) 304 51.4 1.7e-05
XP_011536698 (OMIM: 602320) PREDICTED: protein kin ( 816) 304 51.4 1.7e-05
NP_006150 (OMIM: 602320) protein kinase C-binding ( 816) 304 51.4 1.7e-05
XP_005268962 (OMIM: 602320) PREDICTED: protein kin ( 816) 304 51.4 1.7e-05
XP_016874831 (OMIM: 602320) PREDICTED: protein kin ( 821) 304 51.4 1.7e-05
XP_016874832 (OMIM: 602320) PREDICTED: protein kin ( 821) 304 51.4 1.7e-05
XP_016874833 (OMIM: 602320) PREDICTED: protein kin ( 821) 304 51.4 1.7e-05
NP_001138582 (OMIM: 602320) protein kinase C-bindi ( 839) 304 51.4 1.7e-05
NP_001138579 (OMIM: 602320) protein kinase C-bindi ( 866) 304 51.4 1.8e-05
XP_016874830 (OMIM: 602320) PREDICTED: protein kin ( 871) 304 51.4 1.8e-05
XP_011526256 (OMIM: 125630,606100) PREDICTED: adhe ( 724) 298 50.6 2.6e-05
NP_031387 (OMIM: 605399) nidogen-2 precursor [Homo (1375) 297 50.8 4.4e-05
XP_005267462 (OMIM: 605399) PREDICTED: nidogen-2 i (1402) 297 50.8 4.5e-05
NP_001257981 (OMIM: 125630,606100) adhesion G prot ( 765) 289 49.5 5.8e-05
XP_011526254 (OMIM: 125630,606100) PREDICTED: adhe ( 779) 289 49.5 5.9e-05
XP_016882215 (OMIM: 125630,606100) PREDICTED: adhe ( 798) 289 49.5 6e-05
NP_038475 (OMIM: 125630,606100) adhesion G protein ( 823) 289 49.6 6.1e-05
XP_011526251 (OMIM: 125630,606100) PREDICTED: adhe ( 826) 289 49.6 6.1e-05
XP_011526250 (OMIM: 125630,606100) PREDICTED: adhe ( 837) 289 49.6 6.2e-05
NP_006478 (OMIM: 135820,608180) fibulin-1 isoform ( 566) 283 48.7 7.9e-05
NP_006476 (OMIM: 135820,608180) fibulin-1 isoform ( 601) 283 48.7 8.2e-05
>>NP_000086 (OMIM: 132400,177170,600310) cartilage oligo (757 aa)
initn: 5311 init1: 5311 opt: 5311 Z-score: 3543.3 bits: 666.3 E(85289): 1.3e-190
Smith-Waterman score: 5311; 100.0% identity (100.0% similar) in 724 aa overlap (1-724:34-757)
10 20 30
pF1KE4 MLRELQETNAALQDVRELLRQQVREITFLK
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DTACVLLLTLAALGASGQGQSPLGSDLGPQMLRELQETNAALQDVRELLRQQVREITFLK
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 NTVMECDACGMQQSVRTGLPSVRPLLHCAPGFCFPGVACIQTESGARCGPCPAGFTGNGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NTVMECDACGMQQSVRTGLPSVRPLLHCAPGFCFPGVACIQTESGARCGPCPAGFTGNGS
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 HCTDVNECNAHPCFPRVRCINTSPGFRCEACPPGYSGPTHQGVGLAFAKANKQVCTDINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HCTDVNECNAHPCFPRVRCINTSPGFRCEACPPGYSGPTHQGVGLAFAKANKQVCTDINE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 CETGQHNCVPNSVCINTRGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCPDGSPSECHEHADC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CETGQHNCVPNSVCINTRGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCPDGSPSECHEHADC
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 VLERDGSRSCVCAVGWAGNGILCGRDTDLDGFPDEKLRCPERQCRKDNCVTVPNSGQEDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VLERDGSRSCVCAVGWAGNGILCGRDTDLDGFPDEKLRCPERQCRKDNCVTVPNSGQEDV
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 DRDGIGDACDPDADGDGVPNEKDNCPLVRNPDQRNTDEDKWGDACDNCRSQKNDDQKDTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DRDGIGDACDPDADGDGVPNEKDNCPLVRNPDQRNTDEDKWGDACDNCRSQKNDDQKDTD
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 QDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDGDGIGDACDNCPQKSNPDQADVDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDGDGIGDACDNCPQKSNPDQADVDH
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 DFVGDACDSDQDQDGDGHQDSRDNCPTVPNSAQEDSDHDGQGDACDDDDDNDGVPDSRDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DFVGDACDSDQDQDGDGHQDSRDNCPTVPNSAQEDSDHDGQGDACDDDDDNDGVPDSRDN
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 CRLVPNPGQEDADRDGVGDVCQDDFDADKVVDKIDVCPENAEVTLTDFRAFQTVVLDPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CRLVPNPGQEDADRDGVGDVCQDDFDADKVVDKIDVCPENAEVTLTDFRAFQTVVLDPEG
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 DAQIDPNWVVLNQGREIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFHVNTVTDDDYAGFIFGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DAQIDPNWVVLNQGREIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFHVNTVTDDDYAGFIFGY
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 QDSSSFYVVMWKQMEQTYWQANPFRAVAEPGIQLKAVKSSTGPGEQLRNALWHTGDTESQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QDSSSFYVVMWKQMEQTYWQANPFRAVAEPGIQLKAVKSSTGPGEQLRNALWHTGDTESQ
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 VRLLWKDPRNVGWKDKKSYRWFLQHRPQVGYIRVRFYEGPELVADSNVVLDTTMRGGRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VRLLWKDPRNVGWKDKKSYRWFLQHRPQVGYIRVRFYEGPELVADSNVVLDTTMRGGRLG
670 680 690 700 710 720
700 710 720
pF1KE4 VFCFSQENIIWANLRYRCNDTIPEDYETHQLRQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VFCFSQENIIWANLRYRCNDTIPEDYETHQLRQA
730 740 750
>>NP_001293142 (OMIM: 600715) thrombospondin-4 isoform b (870 aa)
initn: 3653 init1: 2124 opt: 3754 Z-score: 2509.2 bits: 475.1 E(85289): 5.1e-133
Smith-Waterman score: 3866; 70.3% identity (86.2% similar) in 733 aa overlap (2-720:133-861)
10 20 30
pF1KE4 MLRELQETNAALQDVRELLRQQVREITFLKN
: .. . : : .:..::::::.: .::.:
NP_001 LFQVASLQDCFLQQSEPLAATGTGDFNRQFLGQMTQLNQLLGEVKDLLRQQVKETSFLRN
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80
pF1KE4 TVMECDACG---MQQSVRTGL-------PSVRPLLHCAPGFCFPGVACIQTESGARCGPC
:. ::.::: .:. . . . : .:: .: . :: :: : ....: .::::
NP_001 TIAECQACGPLKFQSPTPSTVVPPAPPAPPTRPPRRCDSNPCFRGVQCTDSRDGFQCGPC
170 180 190 200 210 220
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PAGFTGNGSHCTDVNECNAHPCFPRVRCINTSPGFRCEACPPGYSGPTHQGVGLAFAKAN
: :.:::: : ::.::. :::.: :.::: ::::::.::: :..:: ::::..:::.:
NP_001 PEGYTGNGITCIDVDECKYHPCYPGVHCINLSPGFRCDACPVGFTGPMVQGVGISFAKSN
230 240 250 260 270 280
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 KQVCTDINECETGQHNCVPNSVCINTRGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCPDGSP
:::::::.::..: :::::.:.:: ::..::::.::..::: :: .:.: : .
NP_001 KQVCTDIDECRNGA--CVPNSICVNTLGSYRCGPCKPGYTGDQIRGC--KAERNCRNPEL
290 300 310 320 330
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 SECHEHADCVLERDGSRSCVCAVGWAGNGILCGRDTDLDGFPDEKLRCPERQCRKDNCVT
. : .:.:. ::.:. .:::.:::::.: .::.:.:.:..:::.: : :.:.::::
NP_001 NPCSVNAQCIEERQGDVTCVCGVGWAGDGYICGKDVDIDSYPDEELPCSARNCKKDNCKY
340 350 360 370 380 390
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 VPNSGQEDVDRDGIGDACDPDADGDGVPNEKDNCPLVRNPDQRNTDEDKWGDACDNCRSQ
::::::::.:::::::::: ::::::. ::.::: :..: ::::.:.: .::::::: :
NP_001 VPNSGQEDADRDGIGDACDEDADGDGILNEQDNCVLIHNVDQRNSDKDIFGDACDNCLSV
400 410 420 430 440 450
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 KNDDQKDTDQDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDGDGIGDACDNCPQKS
:.:::::: ::::::::::.::: :.: ::::. :: ::.:.::::.:::::.::. :
NP_001 LNNDQKDTDGDGRGDACDDDMDGDGIKNILDNCPKFPNRDQRDKDGDGVGDACDSCPDVS
460 470 480 490 500 510
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 NPDQADVDHDFVGDACDSDQDQDGDGHQDSRDNCPTVPNSAQEDSDHDGQGDACDDDDDN
::.:.:::.:.:::.::..::.:::::::: :::::: :::: :.:.:: :: :::::::
NP_001 NPNQSDVDNDLVGDSCDTNQDSDGDGHQDSTDNCPTVINSAQLDTDKDGIGDECDDDDDN
520 530 540 550 560 570
450 460 470 480 490
pF1KE4 DGVPD----SRDNCRLVPNPGQEDADRDGVGDVCQDDFDADKVVDKIDVCPENAEVTLTD
::.:: . :::::::::.:::.. :::::.:..::: :.:.:.::::::::::::::
NP_001 DGIPDLVPPGPDNCRLVPNPAQEDSNSDGVGDICESDFDQDQVIDRIDVCPENAEVTLTD
580 590 600 610 620 630
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 FRAFQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGREIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFHVNT
:::.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FRAYQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGMEIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFHVNT
640 650 660 670 680 690
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 VTDDDYAGFIFGYQDSSSFYVVMWKQMEQTYWQANPFRAVAEPGIQLKAVKSSTGPGEQL
::::::::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::.:::::.:
NP_001 QTDDDYAGFIFGYQDSSSFYVVMWKQTEQTYWQATPFRAVAEPGIQLKAVKSKTGPGEHL
700 710 720 730 740 750
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 RNALWHTGDTESQVRLLWKDPRNVGWKDKKSYRWFLQHRPQVGYIRVRFYEGPELVADSN
::.::::::: .:::::::: :::::::: :::::::::::::::::::::: ::::::.
NP_001 RNSLWHTGDTSDQVRLLWKDSRNVGWKDKVSYRWFLQHRPQVGYIRVRFYEGSELVADSG
760 770 780 790 800 810
680 690 700 710 720
pF1KE4 VVLDTTMRGGRLGVFCFSQENIIWANLRYRCNDTIPEDYETHQLRQA
:..:::::::::::::::::::::.::.::::::::::.. :
NP_001 VTIDTTMRGGRLGVFCFSQENIIWSNLKYRCNDTIPEDFQEFQTQNFDRFDN
820 830 840 850 860 870
>>NP_001293143 (OMIM: 600715) thrombospondin-4 isoform b (870 aa)
initn: 3653 init1: 2124 opt: 3754 Z-score: 2509.2 bits: 475.1 E(85289): 5.1e-133
Smith-Waterman score: 3866; 70.3% identity (86.2% similar) in 733 aa overlap (2-720:133-861)
10 20 30
pF1KE4 MLRELQETNAALQDVRELLRQQVREITFLKN
: .. . : : .:..::::::.: .::.:
NP_001 LFQVASLQDCFLQQSEPLAATGTGDFNRQFLGQMTQLNQLLGEVKDLLRQQVKETSFLRN
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80
pF1KE4 TVMECDACG---MQQSVRTGL-------PSVRPLLHCAPGFCFPGVACIQTESGARCGPC
:. ::.::: .:. . . . : .:: .: . :: :: : ....: .::::
NP_001 TIAECQACGPLKFQSPTPSTVVPPAPPAPPTRPPRRCDSNPCFRGVQCTDSRDGFQCGPC
170 180 190 200 210 220
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PAGFTGNGSHCTDVNECNAHPCFPRVRCINTSPGFRCEACPPGYSGPTHQGVGLAFAKAN
: :.:::: : ::.::. :::.: :.::: ::::::.::: :..:: ::::..:::.:
NP_001 PEGYTGNGITCIDVDECKYHPCYPGVHCINLSPGFRCDACPVGFTGPMVQGVGISFAKSN
230 240 250 260 270 280
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 KQVCTDINECETGQHNCVPNSVCINTRGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCPDGSP
:::::::.::..: :::::.:.:: ::..::::.::..::: :: .:.: : .
NP_001 KQVCTDIDECRNGA--CVPNSICVNTLGSYRCGPCKPGYTGDQIRGC--KAERNCRNPEL
290 300 310 320 330
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 SECHEHADCVLERDGSRSCVCAVGWAGNGILCGRDTDLDGFPDEKLRCPERQCRKDNCVT
. : .:.:. ::.:. .:::.:::::.: .::.:.:.:..:::.: : :.:.::::
NP_001 NPCSVNAQCIEERQGDVTCVCGVGWAGDGYICGKDVDIDSYPDEELPCSARNCKKDNCKY
340 350 360 370 380 390
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 VPNSGQEDVDRDGIGDACDPDADGDGVPNEKDNCPLVRNPDQRNTDEDKWGDACDNCRSQ
::::::::.:::::::::: ::::::. ::.::: :..: ::::.:.: .::::::: :
NP_001 VPNSGQEDADRDGIGDACDEDADGDGILNEQDNCVLIHNVDQRNSDKDIFGDACDNCLSV
400 410 420 430 440 450
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 KNDDQKDTDQDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDGDGIGDACDNCPQKS
:.:::::: ::::::::::.::: :.: ::::. :: ::.:.::::.:::::.::. :
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::.:.:::.:.:::.::..::.:::::::: :::::: :::: :.:.:: :: :::::::
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::.:: . :::::::::.:::.. :::::.:..::: :.:.:.::::::::::::::
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:::.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
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::.::::::: .:::::::: :::::::: :::::::::::::::::::::: ::::::.
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10 20 30
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::.:: . :::::::::.:::.. :::::.:..::: :.:.:.::::::::::::::
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NP_003 PEGYTGNGITCIDVDECKYHPCYPGVHCINLSPGFRCDACPVGFTGPMVQGVGISFAKSN
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pF1KE4 KQVCTDINECETGQHNCVPNSVCINTRGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCPDGSP
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NP_003 VPNSGQEDADRDGIGDACDEDADGDGILNEQDNCVLIHNVDQRNSDKDIFGDACDNCLSV
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pF1KE4 KNDDQKDTDQDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDGDGIGDACDNCPQKS
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pF1KE4 NPDQADVDHDFVGDACDSDQDQDGDGHQDSRDNCPTVPNSAQEDSDHDGQGDACDDDDDN
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::.:: . :::::::::.:::.. :::::.:..::: :.:.:.::::::::::::::
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:::.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
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::.::::::: .:::::::: :::::::: :::::::::::::::::::::: ::::::.
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pF1KE4 VVLDTTMRGGRLGVFCFSQENIIWANLRYRCNDTIPEDYETHQLRQA
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>>NP_001239537 (OMIM: 188062) thrombospondin-3 isoform 3 (836 aa)
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10 20 30
pF1KE4 MLRELQETNAALQDVRELLRQQVREITFLK
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150 160 170 180 190 200
pF1KE4 INECETGQHN-CVPNSVCINTRGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCPDGSPSECHE
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pF1KE4 HADCVLERDGSRSCVCAVGWAGNGILCGRDTDLDGFPDEKLRCPE--RQCRKDNCVTVPN
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pF1KE4 DQKDTDQDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDGDGIGDACDNCPQKSNPD
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NP_001 DQKDTDGNGEGDACDNDVDGDGIPNGLDNCPKVPNPLQTDRDEDGVGDACDSCPEMSNPT
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pF1KE4 QADVDHDFVGDACDSDQDQDGDGHQDSRDNCPTVPNSAQEDSDHDGQGDACDDDDDNDGV
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pF1KE4 PD----SRDNCRLVPNPGQEDADRDGVGDVCQDDFDADKVVDKIDVCPENAEVTLTDFRA
:: . :::::::::.:.:.: .::::::.:::: : ::: .:::::.::::::::::
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pF1KE4 FQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGREIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFHVNTVTD
.::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGMEIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFHVNTVTD
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pF1KE4 DDYAGFIFGYQDSSSFYVVMWKQMEQTYWQANPFRAVAEPGIQLKAVKSSTGPGEQLRNA
::::::.:.::::. :::::::: :::::::.::::::.::.::::: : .::::.::::
NP_001 DDYAGFLFSYQDSGRFYVVMWKQTEQTYWQATPFRAVAQPGLQLKAVTSVSGPGEHLRNA
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pF1KE4 LWHTGDTESQVRLLWKDPRNVGWKDKKSYRWFLQHRPQVGYIRVRFYEGPELVADSNVVL
::::: : .:::::: :::::::.:: :::: : ::::::::::..::::.:::::.:..
NP_001 LWHTGHTPDQVRLLWTDPRNVGWRDKTSYRWQLLHRPQVGYIRVKLYEGPQLVADSGVII
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pF1KE4 DTTMRGGRLGVFCFSQENIIWANLRYRCNDTIPEDYETHQLRQA
::.::::::::::::::::::.::.::::::.:::.: . ::
NP_001 DTSMRGGRLGVFCFSQENIIWSNLQYRCNDTVPEDFEPFR-RQLLQGRV
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>>NP_001239536 (OMIM: 188062) thrombospondin-3 isoform 2 (947 aa)
initn: 2852 init1: 1679 opt: 3609 Z-score: 2412.5 bits: 457.4 E(85289): 1.2e-127
Smith-Waterman score: 3609; 65.3% identity (83.4% similar) in 733 aa overlap (1-723:222-941)
10 20 30
pF1KE4 MLRELQETNAALQDVRELLRQQVREITFLK
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NP_001 GGSMARVGALSECPFQGDESIHSAGEQTKALVTQLTLFNQILVELRDDIRDQVKEMSLIR
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pF1KE4 NTVMECDACGMQQSVRTGLPSVRPLLHCAPGFCFPGVACIQTES--GARCGPCPAGFTGN
::.:::..::.... :. ::.:. :: :: :... : :::::: :. ::
NP_001 NTIMECQVCGFHEQ-RS---------HCSPNPCFRGVDCMEVYEYPGYRCGPCPPGLQGN
260 270 280 290 300
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pF1KE4 GSHCTDVNEC-NAHPCFPRVRCINTSPGFRCEACPPGYSGPTHQGVGLAFAKANKQVCTD
:.::.:.::: .: :::: :::: :::.::::: ::.: .:::. .:.:.::::.:
NP_001 GTHCSDINECAHADPCFPGSSCINTMPGFHCEACPRGYKGTQVSGVGIDYARASKQVCND
310 320 330 340 350 360
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 INECETGQHN-CVPNSVCINTRGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCPDGSPSECHE
:.::. :... : :::.: :: :::.::::. ::.:.:..:: : : . . : ::
NP_001 IDECNDGNNGGCDPNSICTNTVGSFKCGPCRLGFLGNQSQGCL--PARTCHSPAHSPCHI
370 380 390 400 410
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 HADCVLERDGSRSCVCAVGWAGNGILCGRDTDLDGFPDEKLRCPE--RQCRKDNCVTVPN
:: :..::.:. :: : ::::::: .:: :::.::.::. : : . ..:..:::. .::
NP_001 HAHCLFERNGAVSCQCNVGWAGNGNVCGTDTDIDGYPDQALPCMDNNKHCKQDNCLLTPN
420 430 440 450 460 470
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 SGQEDVDRDGIGDACDPDADGDGVPNEKDNCPLVRNPDQRNTDEDKWGDACDNCRSQKND
:::::.: ::.:: :: ::::::. : .::: : : ::.:.: :..::::::: . :.
NP_001 SGQEDADNDGVGDQCDDDADGDGIKNVEDNCRLFPNKDQQNSDTDSFGDACDNCPNVPNN
480 490 500 510 520 530
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 DQKDTDQDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDGDGIGDACDNCPQKSNPD
:::::: .:.:::::.:.::: : : ::::.::: : : : ::.:::::.::. :::
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10 20 30
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pF1KE4 INECETGQHN-CVPNSVCINTRGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCPDGSPSECHE
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pF1KE4 QADVDHDFVGDACDSDQDQDGDGHQDSRDNCPTVPNSAQEDSDHDGQGDACDDDDDNDGV
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>>XP_011508236 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospondin- (780 aa)
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10 20 30
pF1KE4 MLRELQETNAALQDVRELLRQQVREITFLK
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pF1KE4 INECETGQHN-CVPNSVCINTRGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCPDGSPSECHE
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XP_011 IDECNDGNNGGCDPNSICTNTVGSFKCGPCRLGFLGNQSQGCL--PARTCHSPAHSPCHI
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210 220 230 240 250 260
pF1KE4 HADCVLERDGSRSCVCAVGWAGNGILCGRDTDLDGFPDEKLRCPE--RQCRKDNCVTVPN
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XP_011 HAHCLFERNGAVSCQCNVGWAGNGNVCGTDTDIDGYPDQALPCMDNNKHCKQDNCLLTPN
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270 280 290 300 310 320
pF1KE4 SGQEDVDRDGIGDACDPDADGDGVPNEKDNCPLVRNPDQRNTDEDKWGDACDNCRSQKND
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XP_011 SGQEDADNDGVGDQCDDDADGDGIKNVEDNCRLFPNKDQQNSDTDSFGDACDNCPNVPNN
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pF1KE4 DQKDTDQDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDGDGIGDACDNCPQKSNPD
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XP_011 DQKDTDGNGEGDACDNDVDGDGIPNGLDNCPKVPNPLQTDRDEDGVGDACDSCPEMSNPT
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 QA---DVDHDFVGDACDSDQDQDGDGHQDSRDNCPTVPNSAQEDSDHDGQGDACDDDDDN
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XP_011 QVQGDDADSDLVGDVCDTNEDSDGDGHQDTKDNCPQLPNSSQLDSDNDGLGDECDGDDDN
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450 460 470 480 490
pF1KE4 DGVPD----SRDNCRLVPNPGQEDADRDGVGDVCQDDFDADKVVDKIDVCPENAEVTLTD
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XP_011 DGIPDYVPPGPDNCRLVPNPNQKDSDGNGVGDVCEDDFDNDAVVDPLDVCPESAEVTLTD
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pF1KE4 FRAFQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGREIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFHVNT
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XP_011 VIIDTSMRGGRLGVFCFSQENIIWSNLQYRCNDTVPEDFEPFR-RQLLQGRV
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724 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 18:37:07 2016 done: Mon Nov 7 18:37:08 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]