Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4556
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4556, 677 aa
1>>>pF1KE4556 677 - 677 aa - 677 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8198+/-0.000775; mu= 16.6945+/- 0.047
mean_var=68.0322+/-13.497, 0's: 0 Z-trim(108.3): 11 B-trim: 56 in 1/49
Lambda= 0.155495
statistics sampled from 10101 (10108) to 10101 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.31), width: 16
Scan time: 3.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43061.1 GLB1 gene_id:2720|Hs108|chr3 ( 677) 4673 1057.4 0
CCDS43062.1 GLB1 gene_id:2720|Hs108|chr3 ( 647) 4496 1017.7 0
CCDS46785.1 GLB1 gene_id:2720|Hs108|chr3 ( 546) 2989 679.6 3.2e-195
CCDS2437.1 GLB1L gene_id:79411|Hs108|chr2 ( 654) 2029 464.2 2.6e-130
CCDS31724.1 GLB1L2 gene_id:89944|Hs108|chr11 ( 636) 1142 265.3 2e-70
CCDS44780.1 GLB1L3 gene_id:112937|Hs108|chr11 ( 653) 1056 246.0 1.3e-64
CCDS74657.1 GLB1L gene_id:79411|Hs108|chr2 ( 564) 1028 239.7 8.9e-63
>>CCDS43061.1 GLB1 gene_id:2720|Hs108|chr3 (677 aa)
initn: 4673 init1: 4673 opt: 4673 Z-score: 5658.4 bits: 1057.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4673; 99.7% identity (99.7% similar) in 677 aa overlap (1-677:1-677)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPGFLVRILLLLLVLLLLGPTRGLRNATQRMFEIDYSRDSFLKDGQPFRYISGSIHYSRV
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MPGFLVRILPLLLVLLLLGPTRGLRNATQRMFEIDYSRDSFLKDGQPFRYISGSIHYSRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 PRFYWKDRLLKMKMAGLNAIQTYVPWNFHEPWPGQYQFSEDHDVEYFLRLAHELGLLVIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PRFYWKDRLLKMKMAGLNAIQTYVPWNFHEPWPGQYQFSEDHDVEYFLRLAHELGLLVIL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RPGPYICAEWEMGGLPAWLLEKESILLRSSDPDYLAAVDKWLGVLLPKMKPLLYQNGGPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RPGPYICAEWEMGGLPAWLLEKESILLRSSDPDYLAAVDKWLGVLLPKMKPLLYQNGGPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ITVQVENEYGSYFACDFDYLRFLQKRFRHHLGDDVVLFTTDGAHKTFLKCGALQGLYTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ITVQVENEYGSYFACDFDYLRFLQKRFRHHLGDDVVLFTTDGAHKTFLKCGALQGLYTTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 DFGTGSNITDAFLSQRKCEPKGPLINSEFYTGWLDHWGQPHSTIKTEAVASSLYDILARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DFGTGSNITDAFLSQRKCEPKGPLINSEFYTGWLDHWGQPHSTIKTEAVASSLYDILARG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 ASVNLYMFIGGTNFAYWNGANSPYAAQPTSYDYDAPLSEAGDLTEKYFALRNIIQKFEKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ASVNLYMFIGGTNFAYWNGANSPYAAQPTSYDYDAPLSEAGDLTEKYFALRNIIQKFEKV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 PEGPIPPSTPKFAYGKVTLEKLKTVGAALDILCPSGPIKSLYPLTFIQVKQHYGFVLYRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PEGPIPPSTPKFAYGKVTLEKLKTVGAALDILCPSGPIKSLYPLTFIQVKQHYGFVLYRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TLPQDCSNPAPLSSPLNGVHDRAYVAVDGIPQGVLERNNVITLNITGKAGATLDLLVENM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TLPQDCSNPAPLSSPLNGVHDRAYVAVDGIPQGVLERNNVITLNITGKAGATLDLLVENM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 GRVNYGAYINDFKGLVSNLTLSSNILTDWTIFPLDTEDAVRSHLGGWGHRDSGHHDEAWA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS43 GRVNYGAYINDFKGLVSNLTLSSNILTDWTIFPLDTEDAVCSHLGGWGHRDSGHHDEAWA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 HNSSNYTLPAFYMGNFSIPSGIPDLPQDTFIQFPGWTKGQVWINGFNLGRYWPARGPQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HNSSNYTLPAFYMGNFSIPSGIPDLPQDTFIQFPGWTKGQVWINGFNLGRYWPARGPQLT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LFVPQHILMTSAPNTITVLELEWAPCSSDDPELCAVTFVDRPVIGSSVTYDHPSKPVEKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LFVPQHILMTSAPNTITVLELEWAPCSSDDPELCAVTFVDRPVIGSSVTYDHPSKPVEKR
610 620 630 640 650 660
670
pF1KE4 LMPPPPQKNKDSWLDHV
:::::::::::::::::
CCDS43 LMPPPPQKNKDSWLDHV
670
>>CCDS43062.1 GLB1 gene_id:2720|Hs108|chr3 (647 aa)
initn: 4496 init1: 4496 opt: 4496 Z-score: 5444.1 bits: 1017.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4496; 99.8% identity (99.8% similar) in 647 aa overlap (31-677:1-647)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPGFLVRILLLLLVLLLLGPTRGLRNATQRMFEIDYSRDSFLKDGQPFRYISGSIHYSRV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MFEIDYSRDSFLKDGQPFRYISGSIHYSRV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 PRFYWKDRLLKMKMAGLNAIQTYVPWNFHEPWPGQYQFSEDHDVEYFLRLAHELGLLVIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PRFYWKDRLLKMKMAGLNAIQTYVPWNFHEPWPGQYQFSEDHDVEYFLRLAHELGLLVIL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RPGPYICAEWEMGGLPAWLLEKESILLRSSDPDYLAAVDKWLGVLLPKMKPLLYQNGGPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RPGPYICAEWEMGGLPAWLLEKESILLRSSDPDYLAAVDKWLGVLLPKMKPLLYQNGGPV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ITVQVENEYGSYFACDFDYLRFLQKRFRHHLGDDVVLFTTDGAHKTFLKCGALQGLYTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ITVQVENEYGSYFACDFDYLRFLQKRFRHHLGDDVVLFTTDGAHKTFLKCGALQGLYTTV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 DFGTGSNITDAFLSQRKCEPKGPLINSEFYTGWLDHWGQPHSTIKTEAVASSLYDILARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DFGTGSNITDAFLSQRKCEPKGPLINSEFYTGWLDHWGQPHSTIKTEAVASSLYDILARG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 ASVNLYMFIGGTNFAYWNGANSPYAAQPTSYDYDAPLSEAGDLTEKYFALRNIIQKFEKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ASVNLYMFIGGTNFAYWNGANSPYAAQPTSYDYDAPLSEAGDLTEKYFALRNIIQKFEKV
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 PEGPIPPSTPKFAYGKVTLEKLKTVGAALDILCPSGPIKSLYPLTFIQVKQHYGFVLYRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PEGPIPPSTPKFAYGKVTLEKLKTVGAALDILCPSGPIKSLYPLTFIQVKQHYGFVLYRT
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TLPQDCSNPAPLSSPLNGVHDRAYVAVDGIPQGVLERNNVITLNITGKAGATLDLLVENM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TLPQDCSNPAPLSSPLNGVHDRAYVAVDGIPQGVLERNNVITLNITGKAGATLDLLVENM
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 GRVNYGAYINDFKGLVSNLTLSSNILTDWTIFPLDTEDAVRSHLGGWGHRDSGHHDEAWA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS43 GRVNYGAYINDFKGLVSNLTLSSNILTDWTIFPLDTEDAVCSHLGGWGHRDSGHHDEAWA
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 HNSSNYTLPAFYMGNFSIPSGIPDLPQDTFIQFPGWTKGQVWINGFNLGRYWPARGPQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HNSSNYTLPAFYMGNFSIPSGIPDLPQDTFIQFPGWTKGQVWINGFNLGRYWPARGPQLT
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LFVPQHILMTSAPNTITVLELEWAPCSSDDPELCAVTFVDRPVIGSSVTYDHPSKPVEKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LFVPQHILMTSAPNTITVLELEWAPCSSDDPELCAVTFVDRPVIGSSVTYDHPSKPVEKR
580 590 600 610 620 630
670
pF1KE4 LMPPPPQKNKDSWLDHV
:::::::::::::::::
CCDS43 LMPPPPQKNKDSWLDHV
640
>>CCDS46785.1 GLB1 gene_id:2720|Hs108|chr3 (546 aa)
initn: 3509 init1: 2989 opt: 2989 Z-score: 3618.2 bits: 679.6 E(32554): 3.2e-195
Smith-Waterman score: 3279; 77.3% identity (78.9% similar) in 677 aa overlap (1-677:1-546)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPGFLVRILLLLLVLLLLGPTRGLRNATQRMFEIDYSRDSFLKDGQPFRYISGSIHYSRV
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MPGFLVRILPLLLVLLLLGPTRGLRNATQRMFEIDYSRDSFLKDGQPFRYISGSIHYSRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 PRFYWKDRLLKMKMAGLNAIQTYVPWNFHEPWPGQYQFSEDHDVEYFLRLAHELGLLVIL
:::::::::::::::::::::: ::.
CCDS46 PRFYWKDRLLKMKMAGLNAIQTL---------PGS-------------------------
70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RPGPYICAEWEMGGLPAWLLEKESILLRSSDPDYLAAVDKWLGVLLPKMKPLLYQNGGPV
:.. . : : : : . ...:
CCDS46 ------CGQ--VVGSP-------------SAQDEASPLSEW-------------------
90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ITVQVENEYGSYFACDFDYLRFLQKRFRHHLGDDVVLFTTDGAHKTFLKCGALQGLYTTV
. :.:
CCDS46 -----RASYNS-------------------------------------------------
110
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 DFGTGSNITDAFLSQRKCEPKGPLINSEFYTGWLDHWGQPHSTIKTEAVASSLYDILARG
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ---AGSNITDAFLSQRKCEPKGPLINSEFYTGWLDHWGQPHSTIKTEAVASSLYDILARG
120 130 140 150 160
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 ASVNLYMFIGGTNFAYWNGANSPYAAQPTSYDYDAPLSEAGDLTEKYFALRNIIQKFEKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ASVNLYMFIGGTNFAYWNGANSPYAAQPTSYDYDAPLSEAGDLTEKYFALRNIIQKFEKV
170 180 190 200 210 220
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 PEGPIPPSTPKFAYGKVTLEKLKTVGAALDILCPSGPIKSLYPLTFIQVKQHYGFVLYRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PEGPIPPSTPKFAYGKVTLEKLKTVGAALDILCPSGPIKSLYPLTFIQVKQHYGFVLYRT
230 240 250 260 270 280
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TLPQDCSNPAPLSSPLNGVHDRAYVAVDGIPQGVLERNNVITLNITGKAGATLDLLVENM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLPQDCSNPAPLSSPLNGVHDRAYVAVDGIPQGVLERNNVITLNITGKAGATLDLLVENM
290 300 310 320 330 340
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 GRVNYGAYINDFKGLVSNLTLSSNILTDWTIFPLDTEDAVRSHLGGWGHRDSGHHDEAWA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS46 GRVNYGAYINDFKGLVSNLTLSSNILTDWTIFPLDTEDAVCSHLGGWGHRDSGHHDEAWA
350 360 370 380 390 400
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 HNSSNYTLPAFYMGNFSIPSGIPDLPQDTFIQFPGWTKGQVWINGFNLGRYWPARGPQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HNSSNYTLPAFYMGNFSIPSGIPDLPQDTFIQFPGWTKGQVWINGFNLGRYWPARGPQLT
410 420 430 440 450 460
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LFVPQHILMTSAPNTITVLELEWAPCSSDDPELCAVTFVDRPVIGSSVTYDHPSKPVEKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LFVPQHILMTSAPNTITVLELEWAPCSSDDPELCAVTFVDRPVIGSSVTYDHPSKPVEKR
470 480 490 500 510 520
670
pF1KE4 LMPPPPQKNKDSWLDHV
:::::::::::::::::
CCDS46 LMPPPPQKNKDSWLDHV
530 540
>>CCDS2437.1 GLB1L gene_id:79411|Hs108|chr2 (654 aa)
initn: 2107 init1: 1451 opt: 2029 Z-score: 2453.1 bits: 464.2 E(32554): 2.6e-130
Smith-Waterman score: 2305; 55.2% identity (74.3% similar) in 647 aa overlap (6-649:9-629)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MPGFLVRILLLLLVLLLLGPTRGLRNATQRMFEIDYSRDSFLKDGQPFRYISGSIHY
.: ::: : : :: : .: : : .: ..: :: :: ::::.:::.::
CCDS24 MAPKKLSCLRSLLLPLSLTLLLP-----QADTRSFVVDRGHDRFLLDGAPFRYVSGSLHY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 SRVPRFYWKDRLLKMKMAGLNAIQTYVPWNFHEPWPGQYQFSEDHDVEYFLRLAHELGLL
:::: : ::::::. .:::::: :::::.::: :: :.:. ..:. :: : .::
CCDS24 FRVPRVLWADRLLKMRWSGLNAIQFYVPWNYHEPQPGVYNFNGSRDLIAFLNEAALANLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VILRPGPYICAEWEMGGLPAWLLEKESILLRSSDPDYLAAVDKWLGVLLPKMKPLLYQNG
:::::::::::::::::::.:::.: : ::.::::.:::::.:. :::::. : ::.::
CCDS24 VILRPGPYICAEWEMGGLPSWLLRKPEIHLRTSDPDFLAAVDSWFKVLLPKIYPWLYHNG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GPVITVQVENEYGSYFACDFDYLRFLQKRFRHHLGDDVVLFTTDGAHKTFLKCGALQGLY
: .:..::::::::: ::::.:.: : :: ::. ..:::::: . ::::.:.:::
CCDS24 GNIISIQVENEYGSYRACDFSYMRHLAGLFRALLGEKILLFTTDGPEG--LKCGSLRGLY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 TTVDFGTGSNITDAFLSQRKCEPKGPLINSEFYTGWLDHWGQPHSTIKTEAVASSLYDIL
:::::: ..:.: : :: ::.:::.:::.::::::.::: ::: .. ::...: ..:
CCDS24 TTVDFGPADNMTKIFTLLRKYEPHGPLVNSEYYTGWLDYWGQNHSTRSVSAVTKGLENML
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 ARGASVNLYMFIGGTNFAYWNGANSPYAAQP--TSYDYDAPLSEAGDLTEKYFALRNIIQ
:::::.::: :::::.:::::.. : ::::::::.::::: : : ::::..:.
CCDS24 KLGASVNMYMFHGGTNFGYWNGADKKGRFLPITTSYDYDAPISEAGDPTPKLFALRDVIS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 KFEKVPEGPIPPSTPKFAYGKVTLEKLKTVGAALDILCPSGPIKSLYPLTFIQVKQHYGF
::..:: ::.:: .::. : :::. . . : ::.::: :::.:. :.:: ::: .::
CCDS24 KFQEVPLGPLPPPSPKMMLGPVTLHLVGHLLAFLDLLCPRGPIHSILPMTFEAVKQDHGF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 VLYRTTLPQDCSNPAPLSSPLNGVHDRAYVAVDGIPQGVLERNNVITLNITGKAGATLDL
.:::: . . .:.:. : ::::::::: :::. :::.::: : .::: :. ::.
CCDS24 MLYRTYMTHTIFEPTPFWVPNNGVHDRAYVMVDGVFQGVVERNMRDKLFLTGKLGSKLDI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 LVENMGRVNYGAYINDFKGLVSNLTLSSNILTDWTIFPLDTEDAVRSHLGGWGHRDSGHH
:::::::...:. .:::::.. :...:::.: .::: .. :. : .
CCDS24 LVENMGRLSFGSNSSDFKGLLKPPILGQTILTQWMMFPLKIDNLVK-----WWF---PLQ
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 DEAWAHNSSNYTLPAFYMGNFSIPSGIPDLPQDTFIQFPGWTKGQVWINGFNLGRYWPAR
: . .. . :.:: .: : ... : ::. .::::::::::::::::::: .
CCDS24 LPKWPYPQAP-SGPTFYSKTFPILGSVGD----TFLYLPGWTKGQVWINGFNLGRYWTKQ
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 GPQLTLFVPQHILMT-SAPNTITVLELEWAPCSSDDPELCAVTFVDRPVIGSSVTYDHPS
::: ::.::. .:. .: : ::.:::: .: . :. : :.:.:...:. :
CCDS24 GPQQTLYVPRFLLFPRGALNKITLLELEDVPLQ---PQ---VQFLDKPILNSTSTLHRTH
590 600 610 620 630
660 670
pF1KE4 KPVEKRLMPPPPQKNKDSWLDHV
CCDS24 INSLSADTLSASEPMELSGH
640 650
>>CCDS31724.1 GLB1L2 gene_id:89944|Hs108|chr11 (636 aa)
initn: 1013 init1: 598 opt: 1142 Z-score: 1377.9 bits: 265.3 E(32554): 2e-70
Smith-Waterman score: 1343; 38.7% identity (62.8% similar) in 659 aa overlap (3-645:15-630)
10 20 30 40
pF1KE4 MPGFLVRILLLLLVLLLLG-----PTRGLRNATQRMFEIDYSRDSFLK
:.:. ..: .::: : : : ::. :.. .. . .:.
CCDS31 MTTWSLRRRPARTLGLLLLVVLGFLVLRRLDWSTLVPLR-LRH---RQLGLQAKGWNFML
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 DGQPFRYISGSIHYSRVPRFYWKDRLLKMKMAGLNAIQTYVPWNFHEPWPGQYQFSEDHD
. . : ..::::: :::: ::.::::::: :::.. ::::::.::: :...:: . :
CCDS31 EDSTFWIFGGSIHYFRVPREYWRDRLLKMKACGLNTLTTYVPWNLHEPERGKFDFSGNLD
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 VEYFLRLAHELGLLVILRPGPYICAEWEMGGLPAWLLEKESILLRSSDPDYLAAVDKWLG
.: :. .: :.:: ::::::::::.: ..::::.:::. .. ::.. . ::: ..
CCDS31 LEAFVLMAAEIGLWVILRPGPYICSEMDLGGLPSWLLQDPGMRLRTTYKGFTEAVDLYFD
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 VLLPKMKPLLYQNGGPVITVQVENEYGSYFACDFDYLRFLQKRFRHHLGDDVVLFTTDGA
:. .. :: :. :::.:.:::::::::: : :. ...: .. . : .:.:.:
CCDS31 HLMSRVVPLQYKRGGPIIAVQVENEYGSY-NKDPAYMPYVKKALEDR-GIVELLLTSD--
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
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. . : ... :. :.:.::::: :::::.. ::: : .. ::::::: :.:::
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: : ::. ::... .. .: : : ::. : .: .. :: : . ::::
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:... .. : .:..::.:.. . :. :.: ::::. : :. . :
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:. ... . . : : : .:::: :::::: :.: :::..:: :... : .. :.
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:: . . ...: . :. . :::::..:..:: : : :::..
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CCDS31 --ALQFTETPHLGRNQYIK
620 630
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]