Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4555
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4555, 675 aa
1>>>pF1KE4555 675 - 675 aa - 675 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1530+/-0.00127; mu= 20.7626+/- 0.077
mean_var=82.4373+/-16.844, 0's: 0 Z-trim(101.8): 86 B-trim: 15 in 1/49
Lambda= 0.141258
statistics sampled from 6594 (6685) to 6594 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 3.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5645.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 ( 675) 4419 911.4 0
CCDS55130.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 ( 676) 4407 909.0 0
CCDS33327.1 SLC25A12 gene_id:8604|Hs108|chr2 ( 678) 3518 727.8 1.2e-209
CCDS55913.1 SLC25A21 gene_id:89874|Hs108|chr14 ( 298) 434 99.0 1.1e-20
CCDS9663.1 SLC25A21 gene_id:89874|Hs108|chr14 ( 299) 434 99.0 1.1e-20
CCDS13744.1 SLC25A18 gene_id:83733|Hs108|chr22 ( 315) 391 90.2 4.8e-18
CCDS7715.1 SLC25A22 gene_id:79751|Hs108|chr11 ( 323) 390 90.0 5.6e-18
CCDS76021.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 290) 354 82.7 8.4e-16
CCDS14624.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 322) 354 82.7 9e-16
CCDS14623.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 325) 354 82.7 9.1e-16
CCDS31967.1 SLC25A30 gene_id:253512|Hs108|chr13 ( 291) 346 81.0 2.6e-15
CCDS3753.1 UCP1 gene_id:7350|Hs108|chr4 ( 307) 332 78.2 2e-14
CCDS82138.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 ( 336) 332 78.2 2.1e-14
CCDS11482.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 ( 351) 332 78.2 2.2e-14
CCDS45700.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 ( 359) 332 78.3 2.2e-14
CCDS32882.1 SLC25A23 gene_id:79085|Hs108|chr19 ( 468) 332 78.4 2.7e-14
CCDS41670.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 288) 316 74.9 1.8e-13
CCDS45937.1 SLC25A41 gene_id:284427|Hs108|chr19 ( 370) 316 75.0 2.1e-13
CCDS6890.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 469) 314 74.7 3.4e-13
CCDS35151.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 503) 314 74.7 3.6e-13
CCDS83420.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 515) 314 74.7 3.6e-13
CCDS786.1 SLC25A24 gene_id:29957|Hs108|chr1 ( 458) 306 73.0 1e-12
CCDS41361.1 SLC25A24 gene_id:29957|Hs108|chr1 ( 477) 306 73.1 1.1e-12
CCDS2905.2 SLC25A26 gene_id:115286|Hs108|chr3 ( 274) 303 72.2 1.1e-12
CCDS32156.1 SLC25A29 gene_id:123096|Hs108|chr14 ( 303) 294 70.4 4.2e-12
CCDS76431.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 226) 291 69.7 5.1e-12
CCDS41671.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 246) 291 69.7 5.5e-12
CCDS60850.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 264) 291 69.8 5.7e-12
CCDS5610.1 SLC25A40 gene_id:55972|Hs108|chr7 ( 338) 292 70.1 6e-12
CCDS14577.1 SLC25A43 gene_id:203427|Hs108|chrX ( 341) 287 69.1 1.2e-11
CCDS2779.1 SLC25A20 gene_id:788|Hs108|chr3 ( 301) 285 68.6 1.5e-11
CCDS7280.1 SLC25A16 gene_id:8034|Hs108|chr10 ( 332) 279 67.4 3.7e-11
CCDS9959.1 SLC25A47 gene_id:283600|Hs108|chr14 ( 308) 276 66.8 5.3e-11
CCDS66539.1 SLC25A30 gene_id:253512|Hs108|chr13 ( 240) 272 65.9 7.8e-11
>>CCDS5645.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 (675 aa)
initn: 4419 init1: 4419 opt: 4419 Z-score: 4869.5 bits: 911.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4419; 100.0% identity (100.0% similar) in 675 aa overlap (1-675:1-675)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAAKVALTKRADPAELRTIFLKYASIEKNGEFFMSPNDFVTRYLNIFGESQPNPKTVEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MAAAKVALTKRADPAELRTIFLKYASIEKNGEFFMSPNDFVTRYLNIFGESQPNPKTVEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LSGVVDQTKDGLISFQEFVAFESVLCAPDALFMVAFQLFDKAGKGEVTFEDVKQVFGQTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LSGVVDQTKDGLISFQEFVAFESVLCAPDALFMVAFQLFDKAGKGEVTFEDVKQVFGQTT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 IHQHIPFNWDSEFVQLHFGKERKRHLTYAEFTQFLLEIQLEHAKQAFVQRDNARTGRVTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IHQHIPFNWDSEFVQLHFGKERKRHLTYAEFTQFLLEIQLEHAKQAFVQRDNARTGRVTA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 IDFRDIMVTIRPHVLTPFVEECLVAAAGGTTSHQVSFSYFNGFNSLLNNMELIRKIYSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IDFRDIMVTIRPHVLTPFVEECLVAAAGGTTSHQVSFSYFNGFNSLLNNMELIRKIYSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 AGTRKDVEVTKEEFVLAAQKFGQVTPMEVDILFQLADLYEPRGRMTLADIERIAPLEEGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AGTRKDVEVTKEEFVLAAQKFGQVTPMEVDILFQLADLYEPRGRMTLADIERIAPLEEGT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LPFNLAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LPFNLAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 STGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 STGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 HKDGSVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRVSALSVVRDLGFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HKDGSVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRVSALSVVRDLGFF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 GIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANEDGQVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANEDGQVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVTP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 ADVIKTRLQVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ADVIKTRLQVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 ELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFGLYLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFGLYLPL
610 620 630 640 650 660
670
pF1KE4 FKPSVSTSKAIGGGP
:::::::::::::::
CCDS56 FKPSVSTSKAIGGGP
670
>>CCDS55130.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 (676 aa)
initn: 2411 init1: 2411 opt: 4407 Z-score: 4856.3 bits: 909.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4407; 99.9% identity (99.9% similar) in 676 aa overlap (1-675:1-676)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAAKVALTKRADPAELRTIFLKYASIEKNGEFFMSPNDFVTRYLNIFGESQPNPKTVEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MAAAKVALTKRADPAELRTIFLKYASIEKNGEFFMSPNDFVTRYLNIFGESQPNPKTVEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LSGVVDQTKDGLISFQEFVAFESVLCAPDALFMVAFQLFDKAGKGEVTFEDVKQVFGQTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LSGVVDQTKDGLISFQEFVAFESVLCAPDALFMVAFQLFDKAGKGEVTFEDVKQVFGQTT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 IHQHIPFNWDSEFVQLHFGKERKRHLTYAEFTQFLLEIQLEHAKQAFVQRDNARTGRVTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IHQHIPFNWDSEFVQLHFGKERKRHLTYAEFTQFLLEIQLEHAKQAFVQRDNARTGRVTA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 IDFRDIMVTIRPHVLTPFVEECLVAAAGGTTSHQVSFSYFNGFNSLLNNMELIRKIYSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IDFRDIMVTIRPHVLTPFVEECLVAAAGGTTSHQVSFSYFNGFNSLLNNMELIRKIYSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 AGTRKDVEVTKEEFVLAAQKFGQVTPMEVDILFQLADLYEPRGRMTLADIERIAPLEEGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AGTRKDVEVTKEEFVLAAQKFGQVTPMEVDILFQLADLYEPRGRMTLADIERIAPLEEGT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE4 LPFNLAEAQRQ-KASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQ
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LPFNLAEAQRQQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 RSTGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RSTGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 MHKDGSVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRVSALSVVRDLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MHKDGSVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRVSALSVVRDLGF
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 FGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANEDGQVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANEDGQVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVT
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 PADVIKTRLQVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PADVIKTRLQVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLT
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 YELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFGLYLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFGLYLP
610 620 630 640 650 660
660 670
pF1KE4 LFKPSVSTSKAIGGGP
::::::::::::::::
CCDS55 LFKPSVSTSKAIGGGP
670
>>CCDS33327.1 SLC25A12 gene_id:8604|Hs108|chr2 (678 aa)
initn: 3321 init1: 1794 opt: 3518 Z-score: 3877.1 bits: 727.8 E(32554): 1.2e-209
Smith-Waterman score: 3518; 78.2% identity (93.1% similar) in 666 aa overlap (3-666:2-666)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAAKVALTKRADPAELRTIFLKYASIEKNGEFFMSPNDFVTRYLNIFGESQPNPKTVEL
:.:: :::.:: :::.:::.::: : .:: .:.:.::: :::..... . ::: :.:
CCDS33 MAVKVQTTKRGDPHELRNIFLQYASTEVDGERYMTPEDFVQRYLGLYNDPNSNPKIVQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LSGVVDQTKDGLISFQEFVAFESVLCAPDALFMVAFQLFDKAGKGEVTFEDVKQVFGQTT
:.::.:::::::::.:::.::::::::::..:.::::::::.:.::::::.::..::::
CCDS33 LAGVADQTKDGLISYQEFLAFESVLCAPDSMFIVAFQLFDKSGNGEVTFENVKEIFGQTI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 IHQHIPFNWDSEFVQLHFGKERKRHLTYAEFTQFLLEIQLEHAKQAFVQRDNARTGRVTA
::.::::::: ::..::::..::.::.:.:::::: :.:::::.:::. .:....: ...
CCDS33 IHHHIPFNWDCEFIRLHFGHNRKKHLNYTEFTQFLQELQLEHARQAFALKDKSKSGMISG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 IDFRDIMVTIRPHVLTPFVEECLVAAAGGTTSHQVSFSYFNGFNSLLNNMELIRKIYSTL
.:: ::::::: :.::::::: ::.::::. ::::::::::.::::::::::.:::::::
CCDS33 LDFSDIMVTIRSHMLTPFVEENLVSAAGGSISHQVSFSYFNAFNSLLNNMELVRKIYSTL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 AGTRKDVEVTKEEFVLAAQKFGQVTPMEVDILFQLADLYEPRGRMTLADIERIAPLEEGT
::::::::::::::. .: ..:::::.:.:::.::::::. ::.::::::::::: ::.
CCDS33 AGTRKDVEVTKEEFAQSAIRYGQVTPLEIDILYQLADLYNASGRLTLADIERIAPLAEGA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LPFNLAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQR
::.:::: :::.. : .::. ::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LPYNLAELQRQQSPG-LGRPIWLQIAESAYRFTLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQR
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 STGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFM
..:: :::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::
CCDS33 GSGSVVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLIPQLIGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFT
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 HKDGSVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRVSALSVVRDLGFF
..:::::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::.:
CCDS33 RRDGSVPLPAEVLAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRVSALNVLRDLGIF
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 GIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANEDGQVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVTP
:.:::::::::::::::::::: ::: : .:.:.:.:. .:: :::.::.::::::::
CCDS33 GLYKGAKACFLRDIPFSAIYFPVYAHCKLLLADENGHVGGLNLLAAGAMAGVPAASLVTP
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 ADVIKTRLQVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::..::::::::::::::.::
CCDS33 ADVIKTRLQVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPSAFWKGTAARVFRSSPQFGVTLVTY
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650
pF1KE4 ELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRI-NLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFGLYLP
:::::::::::::.:: ::::.::::: .:: ::::.:::.::.:::::::::::::::
CCDS33 ELLQRWFYIDFGGLKPAGSEPTPKSRIADLPPANPDHIGGYRLATATFAGIENKFGLYLP
600 610 620 630 640 650
660 670
pF1KE4 LFK-PSVSTSKAIGGGP
:: :::.
CCDS33 KFKSPSVAVVQPKAAVAATQ
660 670
>>CCDS55913.1 SLC25A21 gene_id:89874|Hs108|chr14 (298 aa)
initn: 386 init1: 134 opt: 434 Z-score: 485.1 bits: 99.0 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 434; 30.8% identity (59.9% similar) in 302 aa overlap (317-607:2-295)
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LADIERIAPLEEGTLPFNLAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAV
::.: . : :.. .. :. :: : .
CCDS55 MSAKPEVSLVREASRQIVAGGSAGLVEICLM
10 20 30
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 YPIDLVKTRMQNQRSTGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKA
.:.:.::::.: :: . . ::. : :. ....::.::.:.:.:: .:. .:..:
CCDS55 HPLDVVKTRFQIQRCA---TDPNSYKSLVDSFRMIFQMEGLFGFYKGILPPILAETPKRA
40 50 60 70 80
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 IKLTVNDFVRDKFMHKDGSVPLAAEI---LAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEIT
.:. :. ... . : : :. . .:: .: ...: .::.:.::. :: :.. :
CCDS55 VKF----FTFEQYKKLLGYVSLSPALTFAIAGLGSGLTEAIVVNPFEVVKVGLQ-ANRNT
90 100 110 120 130 140
470 480 490 500 510
pF1KE4 TGPRVSALSVVRDL------GFFGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASF-ANEDG
. . :... .:.. :. :. :: : . : :. .:: : .:: . .:.:
CCDS55 FAEQPSTVGYARQIIKKEGWGLQGLNKGLTATLGRHGVFNMVYFGFYYNVKNMIPVNKDP
150 160 170 180 190 200
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 QVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARA-GQTTYSGVIDCFRKILREEGP
. . : ..: :. . : :: :.:.: . :. : . . . .:::
CCDS55 ILEFWRKFGIGLLSGTIASVINIPFDVAKSRIQGPQPVPGEIKYRTCFKTMATVYQEEGI
210 220 230 240 250 260
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 KALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPD
::.:: ...: .: .: ::.:: :.
CCDS55 LALYKGLLPKIMRLGPGGAVMLLVYEYTYSWLQEN
270 280 290
640 650 660 670
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::.: . : :.. .. :. :: : .
CCDS96 MSAKPEVSLVREASRQIVAGGSAGLVEICLM
10 20 30
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 YPIDLVKTRMQNQRSTGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKA
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CCDS96 HPLDVVKTRFQIQRCA---TDPNSYKSLVDSFRMIFQMEGLFGFYKGILPPILAETPKRA
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pF1KE4 IKLTVNDFVRDKFMHKDGSVPLAAEI---LAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEIT
.:. :. ... . : : :. . .:: .: ...: .::.:.::. :: :.. :
CCDS96 VKF----FTFEQYKKLLGYVSLSPALTFAIAGLGSGLTEAIVVNPFEVVKVGLQ-ANRNT
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. . :... .:.. :. :. :: : . : :. .:: : .:: . .:.:
CCDS96 FAEQPSTVGYARQIIKKEGWGLQGLNKGLTATLGRHGVFNMVYFGFYYNVKNMIPVNKDP
150 160 170 180 190 200
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 QVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARA-GQTTYSGVIDCFRKILREEGP
. . : ..: :. . : :: :.:.: . :. : . . . .:::
CCDS96 ILEFWRKFGIGLLSGTIASVINIPFDVAKSRIQGPQPVPGEIKYRTCFKTMATVYQEEGI
210 220 230 240 250 260
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 KALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPD
::.:: ...: .: .: ::.:: :.
CCDS96 LALYKGLLPKIMRLGPGGAVMLLVYEYTYSWLQENW
270 280 290
640 650 660 670
pF1KE4 HVGGYKLAVATFAGIENKFGLYLPLFKPSVSTSKAIGGGP
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:.::: ::.: :.::::.:::.:::.
CCDS13 MTHQDLSITAKLINGGVAGLVGVTCVFPIDLAKTRLQNQH----
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:. :::. .::. :. : :::::.::: .: :.:::::::..::: : ... .::
CCDS13 --GKAMYKGMIDCLMKTARAEGFFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFR-RLLMEDG
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pF1KE4 -SVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEI-----------------TTG-
. : :.::: :: ::. : :.:..::.:: ::.. :::
CCDS13 MQRNLKMEMLAGCGAGMCQVVVTCPMEMLKIQLQDAGRLAVHHQGSASAPSTSRSYTTGS
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pF1KE4 ------PRVS--ALSVVRDLGFFGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKA-SFANEDG
: .. : ..: :. :.:.: : .::::::: :::: .:... .: . :
CCDS13 ASTHRRPSATLIAWELLRTQGLAGLYRGLGATLLRDIPFSIIYFPLFANLNNLGFNELAG
160 170 180 190 200 210
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pF1KE4 QVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARA-GQTTYSGVIDCFRKILREEGP
..: . ...: .:: :: ::: ::.:::.:. .. :. :::. :: ::. .:::
CCDS13 KASFAHSFVSGCVAGSIAAVAVTPLDVLKTRIQTLKKGLGEDMYSGITDCARKLWIQEGP
220 230 240 250 260 270
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 KALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPD
.:. :::: :.. .: ::.. .:
CCDS13 SAFMKGAGCRALVIAPLFGIAQGVYFIGIGERILKCFD
280 290 300 310
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pF1KE4 LAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRSTGS
:..:: .:.: :.::::.:::.:::..
CCDS77 MADKQISLPAKLINGGIAGLIGVTCVFPIDLAKTRLQNQQN---
10 20 30 40
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 FVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFMHKDG
:. .: . ::. :..: ::.::.::: .: :.:::::::..::: : . . :::
CCDS77 --GQRVYTSMSDCLIKTVRSEGYFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRHQ-LSKDG
50 60 70 80 90
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pF1KE4 S-VPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITT-------------------
. . : :.::: :: ::: :.:.:..::.:: ::.:..
CCDS77 QKLTLLKEMLAGCGAGTCQVIVTTPMEMLKIQLQDAGRIAAQRKILAAQGQLSAQGGAQP
100 110 120 130 140 150
470 480 490 500 510
pF1KE4 ------GPRVSALSVVRDL----GFFGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANE
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CCDS77 SVEAPAAPRPTATQLTRDLLRSRGIAGLYKGLGATLLRDVPFSVVYFPLFANLNQLGRPA
160 170 180 190 200 210
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 DGQVSPGSL-LLAGAIAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARA-GQTTYSGVIDCFRKILRE
. . :: . .::: .:: :: :.: ::.::::: :. .. ::::..:: :::::.
CCDS77 SEEKSPFYVSFLAGCVAGSAAAVAVNPCDVVKTRLQSLQRGVNEDTYSGILDCARKILRH
220 230 240 250 260 270
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pF1KE4 EGPKALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAP
:::.:. ::: :.. .: ::.. ..: :
CCDS77 EGPSAFLKGAYCRALVIAPLFGIAQVVYFLGIAESLLGLLQDPQA
280 290 300 310 320
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pF1KE4 PFNLAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQ-R
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pF1KE4 STGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFM
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40 50 60 70 80 90
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pF1KE4 HKDGSVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRV-SALSVVRDLGF
.. . : ... : .: . ..:: ...:::.:. : . : . : ... .. :
CCDS76 ERLEDETLLINMICGVVSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQGSLFQGSMIGSFIDIYQQEGT
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pF1KE4 FGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANEDGQVSPGSL--LLAGAIAGMPAASL
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CCDS76 RGLWRGVVPTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLI-LSGMMGDTILTHFVSSFTCGLAGALA
160 170 180 190 200 210
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pF1KE4 VTPADVIKTRL--QVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGV
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CCDS76 SNPVDVVRTRMMNQRAIVGHVDLYKGTVDGILKMWKHEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNII
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pF1KE4 TLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFG
..::: :.:
CCDS76 FFITYEQLKRLQI
280 290
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: :..:. :. ...:.::.:::.: : .
CCDS14 FLRVKFATAAVIHQKSTTVSHEMSGLNWKPFVYGGLASIVAEFGTFPVDLTKTRLQVQGQ
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: . :. :.. : . .. . :: ..:: :. : :: : .::. . . .. :.
CCDS14 SIDARFKEIKYRGMFHALFRICKEEGVLALYSGIAPALLRQASYGTIKIGIYQSLKRLFV
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.. . : ... : .: . ..:: ...:::.:. : . : . : ... .. :
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:...:. : .. .: : .: . .:... : .... :. .:
CCDS14 RGLWRGVVPTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLI-LSGMMGDTILTHFVSSFTCGLAGALA
200 210 220 230 240
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pF1KE4 VTPADVIKTRL--QVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGV
.:.::..::. : : . :.:..: . :. ..:: ::.:: .: .: .
CCDS14 SNPVDVVRTRMMNQRAIVGHVDLYKGTVDGILKMWKHEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNII
250 260 270 280 290 300
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 TLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFG
..::: :.:
CCDS14 FFITYEQLKRLQI
310 320
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310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PFNLAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQ-R
: :..:. :. ...:.::.:::.: : .
CCDS14 VKFATAAVIVSGHQKSTTVSHEMSGLNWKPFVYGGLASIVAEFGTFPVDLTKTRLQVQGQ
20 30 40 50 60 70
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 STGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFM
: . :. :.. : . .. . :: ..:: :. : :: : .::. . . .. :.
CCDS14 SIDARFKEIKYRGMFHALFRICKEEGVLALYSGIAPALLRQASYGTIKIGIYQSLKRLFV
80 90 100 110 120 130
430 440 450 460 470
pF1KE4 HKDGSVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRV-SALSVVRDLGF
.. . : ... : .: . ..:: ...:::.:. : . : . : ... .. :
CCDS14 ERLEDETLLINMICGVVSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQGSLFQGSMIGSFIDIYQQEGT
140 150 160 170 180 190
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 FGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANEDGQVSPGSL--LLAGAIAGMPAASL
:...:. : .. .: : .: . .:... : .... :. .:
CCDS14 RGLWRGVVPTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLI-LSGMMGDTILTHFVSSFTCGLAGALA
200 210 220 230 240 250
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 VTPADVIKTRL--QVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGV
.:.::..::. : : . :.:..: . :. ..:: ::.:: .: .: .
CCDS14 SNPVDVVRTRMMNQRAIVGHVDLYKGTVDGILKMWKHEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNII
260 270 280 290 300 310
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 TLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFG
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CCDS14 FFITYEQLKRLQI
320
675 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]