FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4545, 635 aa
1>>>pF1KE4545 635 - 635 aa - 635 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6185+/-0.000957; mu= 18.9574+/- 0.057
mean_var=89.3037+/-18.321, 0's: 0 Z-trim(106.8): 35 B-trim: 59 in 1/50
Lambda= 0.135719
statistics sampled from 9160 (9194) to 9160 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 3.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 635) 4440 879.8 0
CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 520) 3635 722.1 4.4e-208
CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 632) 2329 466.5 4.9e-131
CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 620) 2309 462.6 7.3e-130
CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 721) 2309 462.6 8.2e-130
CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 602) 2271 455.1 1.2e-127
CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 ( 614) 2252 451.4 1.7e-126
CCDS4305.1 SLC6A7 gene_id:6534|Hs108|chr5 ( 636) 1780 359.0 1.1e-98
CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 617) 1775 358.0 2.2e-98
CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 628) 1775 358.0 2.2e-98
CCDS30695.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 633) 1769 356.8 5e-98
CCDS41316.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 652) 1769 356.8 5.1e-98
CCDS41317.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 706) 1769 356.9 5.4e-98
CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17 ( 630) 1727 348.6 1.5e-95
CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 510) 1722 347.6 2.5e-95
CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5 ( 620) 1720 347.2 3.8e-95
CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3 ( 599) 1598 323.3 5.7e-88
CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 512) 1366 277.9 2.4e-74
CCDS7854.1 SLC6A5 gene_id:9152|Hs108|chr11 ( 797) 1273 259.8 1e-68
CCDS14570.1 SLC6A14 gene_id:11254|Hs108|chrX ( 642) 1105 226.8 6.9e-59
CCDS2730.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 555) 764 160.0 7.8e-39
CCDS82734.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 208) 674 142.1 7.4e-34
CCDS46765.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 200) 666 140.5 2.1e-33
CCDS43077.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 592) 580 124.0 5.7e-28
CCDS3860.1 SLC6A18 gene_id:348932|Hs108|chr5 ( 628) 562 120.5 6.9e-27
CCDS34130.1 SLC6A19 gene_id:340024|Hs108|chr5 ( 634) 544 117.0 8e-26
CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1 ( 727) 535 115.3 3e-25
CCDS53816.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 623) 519 112.1 2.3e-24
CCDS9026.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 730) 519 112.1 2.6e-24
CCDS9027.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 289) 508 109.7 5.8e-24
CCDS42590.1 SLC6A16 gene_id:28968|Hs108|chr19 ( 736) 327 74.5 5.5e-13
>>CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX (635 aa)
initn: 4440 init1: 4440 opt: 4440 Z-score: 4699.8 bits: 879.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4440; 100.0% identity (100.0% similar) in 635 aa overlap (1-635:1-635)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAKKSAENGIYSVSGDEKKGPLIAPGPDGAPAKGDGPVGLGTPGGRLAVPPRETWTRQMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAKKSAENGIYSVSGDEKKGPLIAPGPDGAPAKGDGPVGLGTPGGRLAVPPRETWTRQMD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 FIMSCVGFAVGLGNVWRFPYLCYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FIMSCVGFAVGLGNVWRFPYLCYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 INVWNICPLFKGLGYASMVIVFYCNTYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 INVWNICPLFKGLGYASMVIVFYCNTYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 CVEIFRHEDCANASLANLTCDQLADRRSPVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLCLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CVEIFRHEDCANASLANLTCDQLADRRSPVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLCLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ACWVLVYFCVWKGVKSTGKIVYFTATFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ACWVLVYFCVWKGVKSTGKIVYFTATFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 GSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALTALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALTALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SILGFMAAEQGVHISKVAESGPGLAFIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SILGFMAAEQGVHISKVAESGPGLAFIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 GVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREISVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREISVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSASG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 TTLLWQAFWECVVVAWVYGADRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TTLLWQAFWECVVVAWVYGADRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 YYEPLVYNNTYVYPWWGEAMGWAFALSSMLCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPIWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YYEPLVYNNTYVYPWWGEAMGWAFALSSMLCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPIWG
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE4 LHHLEYRAQDADVRGLTTLTPVSESSKVVVVESVM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LHHLEYRAQDADVRGLTTLTPVSESSKVVVVESVM
610 620 630
>>CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX (520 aa)
initn: 3635 init1: 3635 opt: 3635 Z-score: 3849.2 bits: 722.1 E(32554): 4.4e-208
Smith-Waterman score: 3635; 100.0% identity (100.0% similar) in 520 aa overlap (116-635:1-520)
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 GGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGSINVWNICPLFKGLGYASMVIVFYCN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MKAGSINVWNICPLFKGLGYASMVIVFYCN
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 TYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPDCVEIFRHEDCANASLANLTCDQLAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPDCVEIFRHEDCANASLANLTCDQLAD
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 RRSPVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLCLLACWVLVYFCVWKGVKSTGKIVYFTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RRSPVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLCLLACWVLVYFCVWKGVKSTGKIVYFTA
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 TFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALT
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 ALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVFSILGFMAAEQGVHISKVAESGPGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVFSILGFMAAEQGVHISKVAESGPGLA
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 FIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFVGVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFVGVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREI
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 SVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSASGTTLLWQAFWECVVVAWVYGADRFMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSASGTTLLWQAFWECVVVAWVYGADRFMD
340 350 360 370 380 390
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 DIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVVYYEPLVYNNTYVYPWWGEAMGWAFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVVYYEPLVYNNTYVYPWWGEAMGWAFA
400 410 420 430 440 450
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 LSSMLCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPIWGLHHLEYRAQDADVRGLTTLTPVSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LSSMLCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPIWGLHHLEYRAQDADVRGLTTLTPVSES
460 470 480 490 500 510
630
pF1KE4 SKVVVVESVM
::::::::::
CCDS48 SKVVVVESVM
520
>>CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 (632 aa)
initn: 2308 init1: 1712 opt: 2329 Z-score: 2466.0 bits: 466.5 E(32554): 4.9e-131
Smith-Waterman score: 2329; 56.3% identity (79.3% similar) in 575 aa overlap (24-597:23-590)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAKKSAENGIYSVSGDEKKGPLIAPGPDGAPAKGDGPVGLGTPGGRLAVPPRETWTRQMD
::: : . : .:. :: : :. ...
CCDS26 MTAEKALPLGNGKAAEEARESEAPG-GGCSSGGAAPARHPRVKRDKAVHERGHWNNKVE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 FIMSCVGFAVGLGNVWRFPYLCYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGS
:..: .: .::::::::::::::::::.::::::.. . :::.:::: .:::: . :.
CCDS26 FVLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE4 INVW-NICPLFKGLGYASMVIVFYCNTYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTP
:. : ..::::.:.:::..:: . :.:::..:::...:: . ::: :::::::: :::
CCDS26 ITCWRKVCPLFEGIGYATQVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DCVEIFRHEDCANASLANLTCDQLADRRSPVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLCL
.::: :.. . .: : .. : . :::.::::..:: .: :.: : : ::..:::
CCDS26 NCVE-FQKLNVSNYSHVS-----LQNATSPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LACWVLVYFCVWKGVKSTGKIVYFTATFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSK
:: :.. :::.:::.:::::.:: ::::::..:..::.::: :::: .:: .:: :: :.
CCDS26 LAAWTICYFCIWKGTKSTGKVVYVTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 LGSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALTALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVV
:..::::.:::::::::::: :: :::::::: .:::::.: :.: .:::::: :::..
CCDS26 LSDPQVWVDAGTQIFFSYAICLGCLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 FSILGFMAAEQGVHISKVAESGPGLAFIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQF
::.::::: :::: :..::::::::::::::.:::.::..::::.:::.::..:::::::
CCDS26 FSVLGFMAYEQGVPIAEVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFFMMLIFLGLDSQF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 VGVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREISVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSAS
: ::...:...:. : . ..::. . .. . . : :.:.::::.::::: :.::
CCDS26 VCVESLVTAVVDMYPKVFRRGYRRELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAAS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 GTTLLWQAFWECVVVAWVYGADRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNV
: ::. :..::. ..::::..::.:.: :::::: .:::: ..:: .: ::::: .
CCDS26 GMCLLFVAIFECICIGWVYGSNRFYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 VYYEPLVYNNTYVYPWWGEAMGWAFALSSMLCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPIW
. :.:: ::: :.:: :: ..:: .:::::::.:: . . ...::. :. :.:: :
CCDS26 IKYKPLKYNNIYTYPAWGYGIGWLMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPST
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KE4 GLHHLEYRAQDADVRGLTTLTPVSESSKVVVVESVM
CCDS26 DLKMRGKLGVSPRMVTVNDCDAKLKSDGTIAAITEKETHF
600 610 620 630
>>CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 (620 aa)
initn: 2045 init1: 1710 opt: 2309 Z-score: 2444.9 bits: 462.6 E(32554): 7.3e-130
Smith-Waterman score: 2316; 56.4% identity (79.6% similar) in 578 aa overlap (22-597:17-582)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAKKSAENGIYSVSGDEKKGPLIAPGPDGAPAKGDGPVGLGTPGGRLAVPPRETWTRQMD
.. :.: .:. . : : : :: :. ..:
CCDS33 MATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKP------PQREKWSSKID
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 FIMSCVGFAVGLGNVWRFPYLCYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGS
:..: .: :::::::::::::::::::.::::: .. . .:.:.::::: .::. . :.
CCDS33 FVLSVAGGFVGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEGG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE4 INVWN-ICPLFKGLGYASMVIVFYCNTYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTP
:. :. :::::.:.::::.::: :.:::..:::. ::: .:: :::: :.:.::::
CCDS33 ITCWEKICPLFSGIGYASVVIVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSWNTP
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DCVE-IFRHEDCANASLANLTCDQLADRRSPVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLC
:.: .:.. . .... .. :::::::: .:: :: :.. ::.:.:...::
CCDS33 HCMEDTMRKNKSVWITISS------TNFTSPVIEFWERNVLSLSPGIDHPGSLKWDLALC
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LLACWVLVYFCVWKGVKSTGKIVYFTATFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWS
:: :.. .::.::::.::::.::::::::...:.::::::. :::: :: .:: :: .
CCDS33 LLLVWLVCFFCIWKGVRSTGKVVYFTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDIT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 KLGSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALTALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFV
.: .::::::::::::::::: :::.:.:::::... : :.: ..:. .:::::: .::.
CCDS33 RLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 VFSILGFMAAEQGVHISKVAESGPGLAFIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQ
.:::::::: :::: :. ::::::::::::::.:::.::. .:. :::.::::::::::
CCDS33 IFSILGFMAQEQGVDIADVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQ
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 FVGVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREISVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSA
:: ::: ::.:.:: :. ..::: .:. :.. ... :.:::.::::::::::::.:
CCDS33 FVEVEGQITSLVDLYPSFLRKGYRREIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAA
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 SGTTLLWQAFWECVVVAWVYGADRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFN
::. ::: ::.:: :.::.::.: ..: : :::::: ::::. :. .::..:.: :::.
CCDS33 SGVCLLWVAFFECFVIAWIYGGDNLYDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVGCFIFS
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 VVYYEPLVYNNTYVYPWWGEAMGWAFALSSMLCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPI
.: : ::.::.::::: :. ..::..:::::::::: .. : ...: . : ..: :
CCDS33 LVKYVPLTYNKTYVYPNWAIGLGWSLALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKYLLTPR
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630
pF1KE4 WGLHHLEYRAQDADVRGLTTLTPVSESSKVVVVESVM
CCDS33 EPNRWAVEREGATPYNSRTVMNGALVKPTHIIVETMM
590 600 610 620
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10 20 30 40 50
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.. :.: .:. . : : :
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60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RETWTRQMDFIMSCVGFAVGLGNVWRFPYLCYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEIS
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CCDS77 REKWSSKIDFVLSVAGGFVGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEII
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120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LGQFMKAGSINVWN-ICPLFKGLGYASMVIVFYCNTYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWA
.::. . :.:. :. :::::.:.::::.::: :.:::..:::. ::: .:: ::::
CCDS77 IGQYTSEGGITCWEKICPLFSGIGYASVVIVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWA
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:.:.:::: :.: .:.. . .... .. :::::::: .:: :: :.. ::
CCDS77 HCNHSWNTPHCMEDTMRKNKSVWITISS------TNFTSPVIEFWERNVLSLSPGIDHPG
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230 240 250 260 270 280
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CCDS77 SLKWDLALCLLLVWLVCFFCIWKGVRSTGKVVYFTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGI
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pF1KE4 IYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALTALGSYNRFNNNCYKDAIILALINS
.:: :: ..: .::::::::::::::::: :::.:.:::::... : :.: ..:. .::
CCDS77 KFYLYPDITRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNS
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350 360 370 380 390 400
pF1KE4 GTSFFAGFVVFSILGFMAAEQGVHISKVAESGPGLAFIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFM
:::: .::..:::::::: :::: :. ::::::::::::::.:::.::. .:. :::.:
CCDS77 GTSFVSGFAIFSILGFMAQEQGVDIADVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIM
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410 420 430 440 450 460
pF1KE4 LLLLGLDSQFVGVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREISVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYV
::::::::::: ::: ::.:.:: :. ..::: .:. :.. ... :.:::.:::::
CCDS77 LLLLGLDSQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKGYRREIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYV
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470 480 490 500 510 520
pF1KE4 FQLFDYYSASGTTLLWQAFWECVVVAWVYGADRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPL
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CCDS77 FQLFDYYAASGVCLLWVAFFECFVIAWIYGGDNLYDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPV
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530 540 550 560 570 580
pF1KE4 VCMGIFIFNVVYYEPLVYNNTYVYPWWGEAMGWAFALSSMLCVPLHLLGCLLRAKGTMAE
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CCDS77 LCVGCFIFSLVKYVPLTYNKTYVYPNWAIGLGWSLALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLV
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pF1KE4 RWQHLTQPIWGLHHLEYRAQDADVRGLTTLTPVSESSKVVVVESVM
: ..: :
CCDS77 RVKYLLTPREPNRWAVEREGATPYNSRTVMNGALVKPTHIIVETMM
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: :. .:.:..: .: .:::::::::::
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CCDS85 CYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKICPIFEGIGYASQMI
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CCDS85 VILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCMEFQKTNGSLNGTSENAT-
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CCDS85 -------SPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKV
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:::::::::..:::::.::: :::: .:: .:: :. ..: .::::.:::::::::.::
CCDS85 VYFTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAIC
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:: ::::::::...::::.: : : ..:::::: :::..:::::::. :::: ::.::::
CCDS85 LGCLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAES
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CCDS85 GPGLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKK
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.::. . .. :.. : :.:.::::::::::::.::: ::. :..: . :::::::
CCDS85 NRREVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGA
420 430 440 450 460 470
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pF1KE4 DRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVVYYEPLVYNNTYVYPWWGEAM
::.:.: :::::: : .:.:: :.:: :: . :.:... : ::.::. :.:::::.:.
CCDS85 KRFYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDAL
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:: .:::::.:.: :. :: : :: . :: ..: : : . . . .: . :
CCDS85 GWLLALSSMVCIPAWSLYRLGTL---KGPFRERIRQLMCPAEDLPQRNPAGPSAPATPRT
540 550 560 570 580 590
620 630
pF1KE4 TLTPVSESSKVVVVESVM
.: ..:
CCDS85 SLLRLTELESHC
600
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CCDS85 GKVAVQECGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRF
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pF1KE4 PYLCYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGSINVW-NICPLFKGLGYAS
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CCDS85 PYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGIGLAS
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pF1KE4 MVIVFYCNTYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPDCVEIFRHEDCANAS-LA
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CCDS85 VVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNHSGAGTVTPFE
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:.: :::.:::: .:: ...:.. :.: ::..:::: ::. :::.::::::
CCDS85 NFT--------SPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKS
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pF1KE4 TGKIVYFTATFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFS
:::.:::::::::..::.::.::: :::: .::::::::: .: .::::.:::::::::
CCDS85 TGKVVYFTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFS
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.:: : ::::::::...:::::: : : ..::.::: ::::::::::::. :::: ::.
CCDS85 FAICQGCLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISE
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pF1KE4 VAESGPGLAFIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFVGVEGFITGLLDLLPAS
::::::::::::.:.:::.::.. ::. :::.::..:::::::: :: ..:. .:..: .
CCDS85 VAESGPGLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPRQ
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pF1KE4 YYFRFQREISVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSASGTTLLWQAFWECVVVAW
.::. . ..:..: : .::.::::.:::::::..:: ::. ...: : ..:
CCDS85 LRKSGRRELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCISW
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pF1KE4 VYGADRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVVYYEPLVYNNTYVYPWW
:::::::.:.: :::::: : .: : :.:: .:.. :.:.. : :: :::.:::: :
CCDS85 VYGADRFYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPPW
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: ..:: .:::::.:::: .. ::...: . .: ..: :
CCDS85 GYSIGWFLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAGR
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620 630
pF1KE4 TTLTPVSESSKVVVVESVM
CCDS85 NFGPSPTREGLIAGEKETHL
600 610
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: .:: ..::..::.:. :::::::::::
CCDS43 AHLRKPVTPDLLMTPSDQGDVDLDVDFAAHRGNWTGKLDFLLSCIGYCVGLGNVWRFPYR
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pF1KE4 CYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGSINVWNICPLFKGLGYASMVIV
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CCDS43 AYTNGGGAFLVPYFLMLAICGIPLFFLELSLGQFSSLGPLAVWKISPLFKGAGAAMLLIV
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pF1KE4 FYCNTYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPDCVEIFRHEDCANASLANLTCD
:: :..:. ..:: :.:. ::: ::. ::: :.: .: .: ::::
CCDS43 GLVAIYYNMIIAYVLFYLFASLTSDLPWEHCGNWWNTELCLEHRVSKDGNGALPLNLTC-
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:: :.: ::...: :. :: . :.. :::: ::.:..:. :::::.::
CCDS43 ----TVSPSEEYWSRYVLHIQGSQGIGSPGEIRWNLCLCLLLAWVIVFLCILKGVKSSGK
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.:::::::::..:..:::::: :::: :: .:: :.. .: : .:::.:. :::.: ..
CCDS43 VVYFTATFPYLILLMLLVRGVTLPGAWKGIQFYLTPQFHHLLSSKVWIEAALQIFYSLGV
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:.:.: ...::: :..: :.:..:..: :. ::..:::..::.::.:. : :: ...::.
CCDS43 GFGGLLTFASYNTFHQNIYRDTFIVTLGNAITSILAGFAIFSVLGYMSQELGVPVDQVAK
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.::::::..::.:.:..:..:.:. ::::::: :::::::. .: ..:.. : .: ::.
CCDS43 AGPGLAFVVYPQAMTMLPLSPFWSFLFFFMLLTLGLDSQFAFLETIVTAVTDEFP--YYL
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: .. . .: :. ... : ..:::::: . :.: :::: :. .. :..:. :::
CCDS43 RPKKAVFSGLICVAMYLMGLILTTDGGMYWLVLLDDYSAS-FGLMVVVITTCLAVTRVYG
420 430 440 450 460 470
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pF1KE4 ADRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVVYYEPLVYNNTYVYPWWGEA
.:: :: :.:..: ... :: :..: . ........: :.: :. .: .: :.:
CCDS43 IQRFCRDIHMMLGFKPGLYFRACWLFLSPATLLALMVYSIVKYQPSEYG-SYRFPPWAEL
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pF1KE4 MGWAFALSSMLCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPI--WGLHHLEYRAQDADVRGLT
.: ..: : : .: .: .:: .:.. :: :. ..: ::
CCDS43 LGILMGLLSCLMIPAGMLVAVLREEGSLWERLQQASRPAMDWGPSLEENRTGMYVATLAG
540 550 560 570 580 590
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pF1KE4 TLTPVSESSKVVVVESVM
CCDS43 SQSPKPLMVHMRKYGGITSFENTAIEVDREIAEEEESMM
600 610 620 630
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initn: 1582 init1: 719 opt: 1775 Z-score: 1879.9 bits: 358.0 E(32554): 2.2e-98
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pF1KE4 PLIAPGPDGAPAKGDGPVGLGTPGGRLAVPPRETWTRQMDFIMSCVGFAVGLGNVWRFPY
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CCDS10 LRARKTAELLVVKERNGVQCLLAPRDGDAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPY
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pF1KE4 LCYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGSINVWNICPLFKGLGYASMVI
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CCDS10 LCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPLFYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILI
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CCDS10 ALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTWNSPNCTD----PKLLNGSVLGNHT
150 160 170 180 190 200
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pF1KE4 DQLADRRSPVIEFWENKVLRL--SGGLEVPGALNWEVTLCLLACWVLVYFCVWKGVKSTG
. .:. ::.: ::.: :.:.. : .:.. :::.. ...:: .:::::..:
CCDS10 KYSKYKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSG
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pF1KE4 KIVYFTATFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFSYA
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CCDS10 KVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLG
270 280 290 300 310 320
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pF1KE4 IGLGALTALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVFSILGFMAAEQGVHISKVA
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CCDS10 AGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVA
330 340 350 360 370 380
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