Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4533
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4533, 598 aa
1>>>pF1KE4533 598 - 598 aa - 598 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2487+/-0.000948; mu= 16.8149+/- 0.058
mean_var=125.2596+/-25.587, 0's: 0 Z-trim(109.4): 63 B-trim: 678 in 1/51
Lambda= 0.114596
statistics sampled from 10816 (10874) to 10816 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 3.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3273.2 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 599) 3889 654.4 1.2e-187
CCDS77870.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 605) 3867 650.8 1.4e-186
CCDS77869.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 536) 3376 569.6 3.6e-162
CCDS33903.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 556) 2287 389.6 5.9e-108
CCDS11543.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 ( 577) 1705 293.3 5.6e-79
CCDS5382.1 IGF2BP3 gene_id:10643|Hs108|chr7 ( 579) 1676 288.6 1.5e-77
CCDS54138.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 ( 438) 917 163.0 7.5e-40
>>CCDS3273.2 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 (599 aa)
initn: 3889 init1: 3889 opt: 3889 Z-score: 3482.6 bits: 654.4 E(32554): 1.2e-187
Smith-Waterman score: 3889; 100.0% identity (100.0% similar) in 598 aa overlap (1-598:2-599)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MMNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTET
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 AVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDHSSREQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDHSSREQG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 HAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENSGAAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENSGAAEK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGRNLKKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGRNLKKI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 EHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLAVNQQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLAVNQQA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLYPHHQFGPFPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLYPHHQFGPFPH
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 HHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERMVIITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERMVIITG
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 PPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNELQNLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNELQNLTS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 AEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYPQGVASQRSK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYPQGVASQRSK
550 560 570 580 590
>>CCDS77870.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 (605 aa)
initn: 3154 init1: 3154 opt: 3867 Z-score: 3462.9 bits: 650.8 E(32554): 1.4e-186
Smith-Waterman score: 3867; 99.0% identity (99.0% similar) in 604 aa overlap (1-598:2-605)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MMNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQV------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVFAFSLV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 NTDTETAVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NTDTETAVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SSREQGHAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SSREQGHAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKEN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SGAAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SGAAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 RNLKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RNLKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDML
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 AVNQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLYPHHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AVNQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLYPHHQ
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 FGPFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FGPFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSER
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 MVIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MVIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNE
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 LQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYPQGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYPQGVA
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 SQRSK
:::::
CCDS77 SQRSK
>>CCDS77869.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 (536 aa)
initn: 3376 init1: 3376 opt: 3376 Z-score: 3024.9 bits: 569.6 E(32554): 3.6e-162
Smith-Waterman score: 3376; 100.0% identity (100.0% similar) in 519 aa overlap (80-598:18-536)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 AIRAIETLSGKVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVEN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MFSCPGHYHVDGFLNPGSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVEN
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 VEQVNTDTETAVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VEQVNTDTETAVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQ
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 RGDHSSREQGHAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RGDHSSREQGHAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIH
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 RKENSGAAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RKENSGAAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLI
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 GKEGRNLKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GKEGRNLKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFE
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 NDMLAVNQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NDMLAVNQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLY
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 PHHQFGPFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PHHQFGPFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPD
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 VSERMVIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VSERMVIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGK
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 TVNELQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TVNELQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYP
470 480 490 500 510 520
590
pF1KE4 QGVASQRSK
:::::::::
CCDS77 QGVASQRSK
530
>>CCDS33903.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 (556 aa)
initn: 2373 init1: 2287 opt: 2287 Z-score: 2051.7 bits: 389.6 E(32554): 5.9e-108
Smith-Waterman score: 3499; 92.8% identity (92.8% similar) in 598 aa overlap (1-598:2-556)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MMNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTET
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 AVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDHSSREQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDHSSREQG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 HAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENSGAAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENSGAAEK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGRNLKKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGRNLKKI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 EHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLAVNQQA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLAVN---
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLYPHHQFGPFPH
::::::::::::::::::::
CCDS33 ----------------------------------------THSGYFSSLYPHHQFGPFPH
360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 HHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERMVIITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERMVIITG
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 PPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNELQNLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNELQNLTS
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 AEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYPQGVASQRSK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYPQGVASQRSK
500 510 520 530 540 550
>>CCDS11543.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 (577 aa)
initn: 2546 init1: 948 opt: 1705 Z-score: 1531.4 bits: 293.3 E(32554): 5.6e-79
Smith-Waterman score: 2557; 65.8% identity (85.6% similar) in 603 aa overlap (1-598:1-577)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSGK
:::::::::. .:: ::...:...:. .:: :.:::::::: ::..::..::::.:::
CCDS11 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTETA
:::.:: .:...:: :: ::::::::::::.:.:::::.:::::::::: :::::..:::
CCDS11 VELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESETA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 VVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDHSSR---E
::::::..::... :. ::.:::.::...:.::::::.... :. ..:: .:: .
CCDS11 VVNVTYSNREQTRQAIMKLNGHQLENHALKVSYIPDEQIAQG--PENGRRGGFGSRGQPR
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 QGH--APGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENSG
:: : :. .. .:.:.:::.:::::.::::::::: ::.::::::::..:.:::::.:
CCDS11 QGSPVAAGAPAKQQQVDIPLRLLVPTQYVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 AAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGRN
:::: ...:.:::: : ::.::::::.::: .:: :.:.::::::::..:::::::::::
CCDS11 AAEKAISVHSTPEGCSSACKMILEIMHKEAKDTKTADEVPLKILAHNNFVGRLIGKEGRN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 LKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLAV
:::.:..: :::::::::::..:::::::::::..: : :: :::::.:::.:::. :.
CCDS11 LKKVEQDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAYENDVAAM
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLYPHHQFG
. :..:::::::.:.:.: .. :.. :: : .. :::: :
CCDS11 SLQSHLIPGLNLAAVGLFPASSSAVPPP--PSSVTGAAPYSSFM----------------
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 PFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERMV
. ::::.:..:::.::::::::::: :::::.:::.::::::: : :: . :::
CCDS11 ------QAPEQEMVQVFIPAQAVGAIIGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETPDSKVRMV
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 IITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNELQ
::::::::::::::::.:::::::::.::::::::.:::::.:.::::::::::::::::
CCDS11 IITGPPEAQFKAQGRIYGKLKEENFFGPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGGKTVNELQ
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 NLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYPQGVASQ
:::.:::.::::::::::..:::.:::::.::: ::::::.:. :::::.:: .. :.
CCDS11 NLTAAEVVVPRDQTPDENDQVIVKIIGHFYASQMAQRKIRDILAQVKQQHQKGQSNQAQA
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 RSK
: :
CCDS11 RRK
>>CCDS5382.1 IGF2BP3 gene_id:10643|Hs108|chr7 (579 aa)
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Smith-Waterman score: 2496; 65.1% identity (85.8% similar) in 604 aa overlap (1-598:1-579)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSGK
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CCDS53 MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTETA
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CCDS53 IELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSETA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 VVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQ--RAQRG--DHSSR
::::::.....:. :..::.: :.::...:..::::: ... .: : :..:: ...:
CCDS53 VVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRGLGQRGSS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EQGHAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENSGA
.:: .::..:. . :.:::.::::::::::::::: ::.::::::::..:.:::::.::
CCDS53 RQG-SPGSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAGA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 AEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGRNL
::: .:: .:::::: ::. :::::.:::.. :..:::::::::::..::::::::::::
CCDS53 AEKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 KKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLAVN
::::..: :::::: ::.:..:::::::::::.::.::.:: :::::.::..:::. ..:
CCDS53 KKIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIASMN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 QQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLYPHHQFGP
::.:::::::.:::.: ::.. : :: . :: :.. : :
CCDS53 LQAHLIPGLNLNALGLF--------PPTS--GMPPPT--------SGPPSAMTP-----P
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420 430 440 450 460 470
pF1KE4 FPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERMVI
.:. .. : : :.::::. .:::::::.: :::::.:::::::::::::.::.. ::::
CCDS53 YPQFEQ-SETETVHLFIPALSVGAIIGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPDAKVRMVI
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480 490 500 510 520 530
pF1KE4 ITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNELQN
:::::::::::::::.::.::::: .::::::::::::::: .:::::::::::::::::
CCDS53 ITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEENFVSPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQN
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 LTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQ-QEQKYPQ-GVAS
:.::::.::::::::::..:.:.: :::.: :.:::::.::. :::: :.:: : : .
CCDS53 LSSAEVVVPRDQTPDENDQVVVKITGHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPPQ
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 QRSK
.: :
CCDS53 SRRK
>>CCDS54138.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 (438 aa)
initn: 1525 init1: 900 opt: 917 Z-score: 828.9 bits: 163.0 E(32554): 7.5e-40
Smith-Waterman score: 1730; 53.0% identity (66.4% similar) in 598 aa overlap (1-598:1-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSGK
:::::::::. .:: ::...:...:. .:: :.:::::::: ::..::..::::.:::
CCDS54 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTETA
:::.:: .:...:: :: ::::::::::::.:.:::::.:::::::::: :::::..:::
CCDS54 VELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESETA
70 80 90 100 110 120
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pF1KE4 VVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQRAQRGDHSSREQGH
::::::..::
CCDS54 VVNVTYSNRE--------------------------------------------------
130
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 APGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENSGAAEKP
:.:: :
CCDS54 ------QTRQAD------------------------------------------------
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 VTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGRNLKKIE
:.::::::::..::::::::::::::.:
CCDS54 --------------------------------EVPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLKKVE
140 150 160
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLAVNQQAN
..: :::::::::::..:::::::::::..: : :: :::::.:::.:::. :.. :..
CCDS54 QDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAYENDVAAMSLQSH
170 180 190 200 210 220
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pF1KE4 LIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLYPHHQFGPFPHH
:::::::.:.:.: .. :.. :: : .. :::: :
CCDS54 LIPGLNLAAVGLFPASSSAVPPP--PSSVTGAAPYSSFM---------------------
230 240 250 260
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 HSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERMVIITGP
. ::::.:..:::.::::::::::: :::::.:::.::::::: : :: . ::::::::
CCDS54 -QAPEQEMVQVFIPAQAVGAIIGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETPDSKVRMVIITGP
270 280 290 300 310 320
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pF1KE4 PEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNELQNLTSA
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CCDS54 PEAQFKAQGRIYGKLKEENFFGPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGGKTVNELQNLTAA
330 340 350 360 370 380
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pF1KE4 EVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQQEQKYPQGVASQRSK
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CCDS54 EVVVPRDQTPDENDQVIVKIIGHFYASQMAQRKIRDILAQVKQQHQKGQSNQAQARRK
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598 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:10:57 2016 done: Sun Nov 6 00:10:57 2016
Total Scan time: 3.690 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]