Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4532
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4532, 594 aa
1>>>pF1KE4532 594 - 594 aa - 594 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6450+/-0.000445; mu= 17.8736+/- 0.028
mean_var=81.5770+/-16.323, 0's: 0 Z-trim(110.3): 23 B-trim: 36 in 1/52
Lambda= 0.142001
statistics sampled from 18617 (18635) to 18617 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 10.490
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001027392 (OMIM: 602926,612164) syntaxin-bindin ( 594) 3862 801.6 0
NP_003156 (OMIM: 602926,612164) syntaxin-binding p ( 603) 3765 781.7 0
NP_008880 (OMIM: 601717,613101) syntaxin-binding p ( 593) 2558 534.4 3.9e-151
NP_001120868 (OMIM: 601717,613101) syntaxin-bindin ( 590) 2531 528.9 1.8e-149
NP_001258963 (OMIM: 601717,613101) syntaxin-bindin ( 604) 2130 446.8 9.9e-125
NP_009200 (OMIM: 608339) syntaxin-binding protein ( 592) 2015 423.2 1.2e-117
XP_011526512 (OMIM: 601717,613101) PREDICTED: synt ( 597) 2015 423.2 1.2e-117
XP_011526514 (OMIM: 601717,613101) PREDICTED: synt ( 439) 1916 402.8 1.2e-111
NP_001266284 (OMIM: 610035,615285) vacuolar protei ( 447) 293 70.4 1.5e-11
NP_001266283 (OMIM: 610035,615285) vacuolar protei ( 534) 293 70.4 1.7e-11
NP_009190 (OMIM: 610035,615285) vacuolar protein s ( 570) 293 70.4 1.8e-11
XP_016855653 (OMIM: 610035,615285) PREDICTED: vacu ( 503) 277 67.1 1.6e-10
NP_001266282 (OMIM: 610035,615285) vacuolar protei ( 538) 256 62.8 3.3e-09
>>NP_001027392 (OMIM: 602926,612164) syntaxin-binding pr (594 aa)
initn: 3862 init1: 3862 opt: 3862 Z-score: 4278.1 bits: 801.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3862; 100.0% identity (100.0% similar) in 594 aa overlap (1-594:1-594)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE4 ILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
550 560 570 580 590
>>NP_003156 (OMIM: 602926,612164) syntaxin-binding prote (603 aa)
initn: 3762 init1: 3762 opt: 3765 Z-score: 4170.6 bits: 781.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3765; 99.1% identity (99.5% similar) in 583 aa overlap (1-583:1-583)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE4 ILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.: :.
NP_003 ILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPTKFLMDLRHPDFRESSRVSFEDQAP
550 560 570 580 590 600
NP_003 TME
>>NP_008880 (OMIM: 601717,613101) syntaxin-binding prote (593 aa)
initn: 2502 init1: 1416 opt: 2558 Z-score: 2834.3 bits: 534.4 E(85289): 3.9e-151
Smith-Waterman score: 2558; 63.5% identity (86.0% similar) in 594 aa overlap (1-593:1-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
::: ::::::::::. ::..::: ::::::..:. :::.:::::::.::..::::::::
NP_008 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
:::::::.:::::.::..:.::::..::.::. :: :.:::.::::.::. ::.:: .
NP_008 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
:: :::.::: ::..::::::.::.:::. : ..: : .:. .. :: ::.::::::
NP_008 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
:::.::::.::: .:.: ::. . ::.:.::: :..::::.:.::::::.::. ::
NP_008 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
::.:::::::::.:::: ::.:.:.:::.:..::: : ::::::::::. ::: :::.::
NP_008 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
..::. :. : :::..: .:....::::.:::::::::::.:::::::::.:::::..:
NP_008 KKVTELLRTFCESKRLTT-DKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKG
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
.:.::: ::::::::.::::::::: :. :::.:::: : .:::::..::::.:.::..:
NP_008 SVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
::: ::::::.. ..: .: :. .:: ... . :. : .::. : :::::::::
NP_008 ENLAKLIQHANVQAHSS-LIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERM-EPTYQLSRWTP
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
.:::.:::..::.:: . .:..: . .. : .:::::.:::::::: : :.:::::..
NP_008 VIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGIEARAGPRLIVY
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KE4 ILGGVSLNEMRCAYEVTQAN-GKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
..:::...::: :::::.:. :::::::::.::::: ..:: :: :.: :.:.
NP_008 VMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
540 550 560 570 580 590
>>NP_001120868 (OMIM: 601717,613101) syntaxin-binding pr (590 aa)
initn: 2478 init1: 974 opt: 2531 Z-score: 2804.5 bits: 528.9 E(85289): 1.8e-149
Smith-Waterman score: 2531; 63.1% identity (85.5% similar) in 594 aa overlap (1-593:1-588)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
::: ::::::::::. ::..::: ::::::..:. :::.:::::::.::..::::::::
NP_001 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
:::::::.:::::.::..:.::. ::.::. :: :.:::.::::.::. ::.:: .
NP_001 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKA---LIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
:: :::.::: ::..::::::.::.:::. : ..: : .:. .. :: ::.::::::
NP_001 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
:::.::::.::: .:.: ::. . ::.:.::: :..::::.:.::::::.::. ::
NP_001 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
::.:::::::::.:::: ::.:.:.:::.:..::: : ::::::::::. ::: :::.::
NP_001 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
..::. :. : :::..: .:....::::.:::::::::::.:::::::::.:::::..:
NP_001 KKVTELLRTFCESKRLTT-DKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKG
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
.:.::: ::::::::.::::::::: :. :::.:::: : .:::::..::::.:.::..:
NP_001 SVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
::: ::::::.. ..: .: :. .:: ... . :. : .::. : :::::::::
NP_001 ENLAKLIQHANVQAHSS-LIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERM-EPTYQLSRWTP
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
.:::.:::..::.:: . .:..: . .. : .:::::.:::::::: : :.:::::..
NP_001 VIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGIEARAGPRLIVY
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KE4 ILGGVSLNEMRCAYEVTQAN-GKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
..:::...::: :::::.:. :::::::::.::::: ..:: :: :.: :.:.
NP_001 VMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
540 550 560 570 580 590
>>NP_001258963 (OMIM: 601717,613101) syntaxin-binding pr (604 aa)
initn: 2489 init1: 986 opt: 2130 Z-score: 2360.3 bits: 446.8 E(85289): 9.9e-125
Smith-Waterman score: 2526; 62.3% identity (84.5% similar) in 605 aa overlap (1-593:1-602)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
::: ::::::::::. ::..::: ::::::..:. :::.:::::::.::..::::::::
NP_001 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE4 INKRREPLPSLEAVYLITPSEK-----------SVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDS
:::::::.:::::.::..:.:: ::..::.::. :: :.:::.::::.
NP_001 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKAQAQRVIHLPQSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 CPDALFNELVKSRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPIL
::. ::.:: .:: :::.::: ::..::::::.::.:::. : ..: : .:. .. :
NP_001 CPEPLFSELGRSRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 ERLAEQIATLCATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQ
: ::.:::::::::.::::.::: .:.: ::. . ::.:.::: :..::::.:.:::
NP_001 EVLAQQIATLCATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 LLILDRGFDPSSPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWI
:::.::. :: ::.:::::::::.:::: ::.:.:.:::.:..::: : ::::::::::.
NP_001 LLIMDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWV
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290 300 310 320 330 340
pF1KE4 ALRHKHIAEVSQEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLH
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NP_001 ELRHMHIADVSKKVTELLRTFCESKRLTT-DKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLH
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 LAEDCMKHYQGTVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIIL
::.:::::..:.:.::: ::::::::.::::::::: :. :::.:::: : .:::::..:
NP_001 LADDCMKHFKGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLL
360 370 380 390 400 410
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pF1KE4 LYIFLKNGITEENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERIS
:::.:.::..:::: ::::::.. ..: .: :. .:: ... . :. : .::.
NP_001 LYILLRNGVSEENLAKLIQHANVQAHSS-LIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERM-
420 430 440 450 460 470
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pF1KE4 EQTYQLSRWTPIIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPG
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NP_001 EPTYQLSRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGI
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pF1KE4 EYRSGPRLIIFILGGVSLNEMRCAYEVTQAN-GKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKT
: :.:::::....:::...::: :::::.:. :::::::::.::::: ..:: :: :.:
NP_001 EARAGPRLIVYVMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKK
540 550 560 570 580 590
590
pF1KE4 DEEISS
:.:.
NP_001 LEDIALP
600
>>NP_009200 (OMIM: 608339) syntaxin-binding protein 3 [H (592 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE4 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGIT
.: :::.:: .:: :. ::.::::....:... ..:.:::::::.. ::::
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pF1KE4 IVEDINKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFN
.::.: : :::. ...:.:.:::. ::: .. :: . ::.::...::: ::: :::
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pF1KE4 ELVKSRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPH--KAQMKNPILERLAE
. .:. .: :. ::::.:.:.:::::.:: :.: ::: .:. :. :.: .:.
NP_009 K-IKASCSKSIRRCKEINISFIPHESQVYTLDVPDAFYYCYSPDPGNAKGKDAIMETMAD
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pF1KE4 QIATLCATLKEYPAVRYRGEYKDNAL-LAQLIQDKL-DAYKADDPTMGEGPDKARSQLLI
::.:.:::: : :.:::... ::: ::::.. :: : :: :. .. .: :..:::::
NP_009 QIVTVCATLDENPGVRYKSKPLDNASKLAQLVEKKLEDYYKIDEKSLIKG--KTHSQLLI
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pF1KE4 LDRGFDPSSPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALR
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NP_009 IDRGFDPVSTVLHELTFQAMAYDLLPIENDTYKYKTDG----KEKEAILEEEDDLWVRIR
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pF1KE4 HKHIAEVSQEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAE
:.::: : .:. . .:..::.:. . : ::.. :.:..::::...:...: .::.:::
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pF1KE4 DCMKHYQGTVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYI
:::.... ...:::..:::::.::::::.:.:: ::...:.::. : .. :::: :::::
NP_009 DCMNKFKLNIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNCDKIRAILLYI
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pF1KE4 FLKNGITEENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQT
: :: :::::..:::...: : :..: : ..:::::: .: ...:: ::.: .:.:
NP_009 FSINGTTEENLDRLIQNVKIENE-SDMIRNWSYLGVPIVPQS---QQGKPLRKDRSAEET
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pF1KE4 YQLSRWTPIIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPG--E
.:::::::.:::::::.:...::.:..:: : .. .. ::::: .: .: .
NP_009 FQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSKEWPYCSQCPAVWNGSGAVSAR----QKPRANYLED
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pF1KE4 YRSGPRLIIFILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDE
..: .::.:..::.. .:.::::::.::. . ::.:::::.:::.:::: .: ::: .
NP_009 RKNGSKLIVFVIGGITYSEVRCAYEVSQAHKSCEVIIGSTHVLTPKKLLDDIKMLNKPKD
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pF1KE4 EISS
..:
NP_009 KVSLIKDE
590
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Smith-Waterman score: 2015; 66.2% identity (87.9% similar) in 447 aa overlap (1-447:1-445)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
::: ::::::::::. ::..::: ::::::..:. :::.:::::::.::..::::::::
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XP_011 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
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:: :::.::: ::..::::::.::.:::. : ..: : .:. .. :: ::.::::::
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pF1KE4 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
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::: ::::::.. ..: .: :. .::
XP_011 ENLAKLIQHANVQAHSS-LIRNLEQLGGTVTNPGGALTPSPSLPHPSSISLCTVSPYLSL
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>>XP_011526514 (OMIM: 601717,613101) PREDICTED: syntaxin (439 aa)
initn: 1901 init1: 1416 opt: 1916 Z-score: 2125.4 bits: 402.8 E(85289): 1.2e-111
Smith-Waterman score: 1916; 67.3% identity (88.5% similar) in 416 aa overlap (1-416:1-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
::: ::::::::::. ::..::: ::::::..:. :::.:::::::.::..::::::::
XP_011 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
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pF1KE4 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
:::::::.:::::.::..:.::::..::.::. :: :.:::.::::.::. ::.:: .
XP_011 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
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:: :::.::: ::..::::::.::.:::. : ..: : .:. .. :: ::.::::::
XP_011 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
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pF1KE4 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
:::.::::.::: .:.: ::. . ::.:.::: :..::::.:.::::::.::. ::
XP_011 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
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pF1KE4 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
::.:::::::::.:::: ::.:.:.:::.:..::: : ::::::::::. ::: :::.::
XP_011 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
250 260 270 280 290 300
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pF1KE4 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
..::. :. : :::..: .:....::::.:::::::::::.:::::::::.:::::..:
XP_011 KKVTELLRTFCESKRLTT-DKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKG
310 320 330 340 350
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pF1KE4 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
.:.::: ::::::::.::::::::: :. :::.:::: : .:::::..::::.:.:
XP_011 SVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNATPL
360 370 380 390 400 410
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pF1KE4 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
XP_011 DPGTLLHWLGDSSTEVRAPC
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>>NP_001266284 (OMIM: 610035,615285) vacuolar protein so (447 aa)
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: : .. ...: .::. : .::. .
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pF1KE4 ALLAQLIQDKLDA-YKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPSSPVLHELTFQAMSYDLL
::. ... . :. . : : :::::: : .:.:.. :.::: ..::
NP_001 KRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPP----LLLILDRCDDAITPLLNQWTYQAMVHELL
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pF1KE4 PIEND-VYKYETSGIGEARVKEVLLD-EDDDLWIALRHKHIAEVSQEVTRSLKDFSSSKR
:.:. . .. ::.. ..::.:. :.:... . ..::..... ..::...:
NP_001 GINNNRIDLSRVPGISKD-LREVVLSAENDEFYANNMYLNFAEIGSNIKNLMEDFQKKKP
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pF1KE4 MNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHY-QGTVDKLCRVEQDLAM
. . .. :.. .....::..: . : :. .. . . . .. .. .:::.::
NP_001 KEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQELAC
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pF1KE4 GTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITEENLNKLI---QHAQ
.: .. .. : .: . .:. .: :...:: . . . ..: :. ..
NP_001 QNDH-----SSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYALHYERHSSNSLPGLMMDLRNKG
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pF1KE4 IPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQ--------LSRWTPIIK
. . .... ... : : : : .:. :..: . .. :...
NP_001 VSEKYRKLVSAVVEYGGKRVRGSDLF---SPKDAVAITKQFLKGLKGVENVYTQHQPFLH
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pF1KE4 DIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPR-LIIFIL
. .. :. .: . :::.. :. :. :. .:.:..
NP_001 ETLDHLIKGRLKENLYPYLG------------------------PSTLRDRPQDIIVFVI
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pF1KE4 GGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
::.. .: .:...... ....:.: . . ...:.
NP_001 GGATYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVHNTKSFLEEVLASGLHSRSKESSQVTSRSA
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NP_001 SRR
>>NP_001266283 (OMIM: 610035,615285) vacuolar protein so (534 aa)
initn: 221 init1: 102 opt: 293 Z-score: 327.2 bits: 70.4 E(85289): 1.7e-11
Smith-Waterman score: 384; 20.1% identity (56.4% similar) in 551 aa overlap (48-580:6-509)
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pF1KE4 VIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVEDINKR-REPLPSLEAVYL
..:. . . . : :... :: . :.:. .
NP_001 MVYTQSEILQKEVYLFERIDSQNREIMKHLKAICF
10 20 30
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pF1KE4 ITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVKSRAAKVIKTLTEINIA
. :....: .:.... : :: ..:.. . . :... .:. . :.
NP_001 LRPTKENVDYIIQELRRP---KYTIYFIYFSNVISKSDVKSLAEADEQEVVAEVQEFYGD
40 50 60 70 80 90
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pF1KE4 FLPYESQVYSLDSADSFQSF-YSPHKAQMKNPILERLAEQIATLCATLKEYPAVRYRGEY
.. . ...::. :. ..: :: : : .. ...: .::. : .::.
NP_001 YIAVNPHLFSLNILGCCQGRNWDP--AQ-----LSRTTQGLTALLLSLKKCPMIRYQLSS
100 110 120 130 140
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pF1KE4 KDNALLAQLIQDKLDA-YKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPSSPVLHELTFQAMSY
. ::. ... . :. . : : :::::: : .:.:.. :.::: .
NP_001 EAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPP----LLLILDRCDDAITPLLNQWTYQAMVH
150 160 170 180 190 200
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pF1KE4 DLLPIEND-VYKYETSGIGEARVKEVLLD-EDDDLWIALRHKHIAEVSQEVTRSLKDFSS
.:: :.:. . .. ::.. ..::.:. :.:... . ..::..... ..::..
NP_001 ELLGINNNRIDLSRVPGISKD-LREVVLSAENDEFYANNMYLNFAEIGSNIKNLMEDFQK
210 220 230 240 250 260
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pF1KE4 SKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHY-QGTVDKLCRVEQD
.: . . .. :.. .....::..: . : :. .. . . . .. .. .:::.
NP_001 KKPKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQE
270 280 290 300 310 320
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pF1KE4 LAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITEENLNKLI---Q
:: .: .. .. : .: . .:. .: :...:: . . . ..: :. .
NP_001 LACQNDH-----SSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYALHYERHSSNSLPGLMMDLR
330 340 350 360 370
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pF1KE4 HAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQ--------LSRWTP
. . . .... ... : : : : .:. :..: . .. :
NP_001 NKGVSEKYRKLVSAVVEYGGKRVRGSDLF---SPKDAVAITKQFLKGLKGVENVYTQHQP
380 390 400 410 420 430
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pF1KE4 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPR-LII
.... .. :. .: . :::.. :. :. :. .:.
NP_001 FLHETLDHLIKGRLKENLYPYLG------------------------PSTLRDRPQDIIV
440 450 460
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 FILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
:..::.. .: .:...... ....:.: . . ...:.
NP_001 FVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVHNTKSFLEEVLASGLHSRSKESSQVTS
470 480 490 500 510 520
NP_001 RSASRR
530
594 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:11:41 2016 done: Sun Nov 6 00:11:42 2016
Total Scan time: 10.490 Total Display time: 0.150
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]