Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4532
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4532, 594 aa
1>>>pF1KE4532 594 - 594 aa - 594 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0120+/-0.00106; mu= 15.2884+/- 0.064
mean_var=76.8576+/-15.458, 0's: 0 Z-trim(103.6): 19 B-trim: 7 in 1/47
Lambda= 0.146295
statistics sampled from 7458 (7472) to 7458 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 3.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35146.1 STXBP1 gene_id:6812|Hs108|chr9 ( 594) 3862 825.2 0
CCDS6874.1 STXBP1 gene_id:6812|Hs108|chr9 ( 603) 3765 804.7 0
CCDS12181.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 ( 593) 2558 549.9 3.2e-156
CCDS45948.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 ( 590) 2531 544.2 1.7e-154
CCDS62522.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 ( 604) 2130 459.6 5.1e-129
CCDS790.1 STXBP3 gene_id:6814|Hs108|chr1 ( 592) 2015 435.3 1e-121
CCDS72904.1 VPS45 gene_id:11311|Hs108|chr1 ( 447) 293 71.8 2e-12
CCDS944.1 VPS45 gene_id:11311|Hs108|chr1 ( 570) 293 71.9 2.5e-12
>>CCDS35146.1 STXBP1 gene_id:6812|Hs108|chr9 (594 aa)
initn: 3862 init1: 3862 opt: 3862 Z-score: 4405.5 bits: 825.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3862; 100.0% identity (100.0% similar) in 594 aa overlap (1-594:1-594)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE4 ILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
550 560 570 580 590
>>CCDS6874.1 STXBP1 gene_id:6812|Hs108|chr9 (603 aa)
initn: 3762 init1: 3762 opt: 3765 Z-score: 4294.7 bits: 804.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3765; 99.1% identity (99.5% similar) in 583 aa overlap (1-583:1-583)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE4 ILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.: :.
CCDS68 ILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPTKFLMDLRHPDFRESSRVSFEDQAP
550 560 570 580 590 600
CCDS68 TME
>>CCDS12181.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 (593 aa)
initn: 2502 init1: 1416 opt: 2558 Z-score: 2918.1 bits: 549.9 E(32554): 3.2e-156
Smith-Waterman score: 2558; 63.5% identity (86.0% similar) in 594 aa overlap (1-593:1-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
::: ::::::::::. ::..::: ::::::..:. :::.:::::::.::..::::::::
CCDS12 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
:::::::.:::::.::..:.::::..::.::. :: :.:::.::::.::. ::.:: .
CCDS12 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
:: :::.::: ::..::::::.::.:::. : ..: : .:. .. :: ::.::::::
CCDS12 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
:::.::::.::: .:.: ::. . ::.:.::: :..::::.:.::::::.::. ::
CCDS12 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
::.:::::::::.:::: ::.:.:.:::.:..::: : ::::::::::. ::: :::.::
CCDS12 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
..::. :. : :::..: .:....::::.:::::::::::.:::::::::.:::::..:
CCDS12 KKVTELLRTFCESKRLTT-DKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKG
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
.:.::: ::::::::.::::::::: :. :::.:::: : .:::::..::::.:.::..:
CCDS12 SVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
::: ::::::.. ..: .: :. .:: ... . :. : .::. : :::::::::
CCDS12 ENLAKLIQHANVQAHSS-LIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERM-EPTYQLSRWTP
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
.:::.:::..::.:: . .:..: . .. : .:::::.:::::::: : :.:::::..
CCDS12 VIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGIEARAGPRLIVY
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KE4 ILGGVSLNEMRCAYEVTQAN-GKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
..:::...::: :::::.:. :::::::::.::::: ..:: :: :.: :.:.
CCDS12 VMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
540 550 560 570 580 590
>>CCDS45948.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 (590 aa)
initn: 2478 init1: 974 opt: 2531 Z-score: 2887.3 bits: 544.2 E(32554): 1.7e-154
Smith-Waterman score: 2531; 63.1% identity (85.5% similar) in 594 aa overlap (1-593:1-588)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
::: ::::::::::. ::..::: ::::::..:. :::.:::::::.::..::::::::
CCDS45 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
:::::::.:::::.::..:.::. ::.::. :: :.:::.::::.::. ::.:: .
CCDS45 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKA---LIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
:: :::.::: ::..::::::.::.:::. : ..: : .:. .. :: ::.::::::
CCDS45 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
:::.::::.::: .:.: ::. . ::.:.::: :..::::.:.::::::.::. ::
CCDS45 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
::.:::::::::.:::: ::.:.:.:::.:..::: : ::::::::::. ::: :::.::
CCDS45 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
..::. :. : :::..: .:....::::.:::::::::::.:::::::::.:::::..:
CCDS45 KKVTELLRTFCESKRLTT-DKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKG
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
.:.::: ::::::::.::::::::: :. :::.:::: : .:::::..::::.:.::..:
CCDS45 SVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
::: ::::::.. ..: .: :. .:: ... . :. : .::. : :::::::::
CCDS45 ENLAKLIQHANVQAHSS-LIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERM-EPTYQLSRWTP
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
.:::.:::..::.:: . .:..: . .. : .:::::.:::::::: : :.:::::..
CCDS45 VIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGIEARAGPRLIVY
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KE4 ILGGVSLNEMRCAYEVTQAN-GKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
..:::...::: :::::.:. :::::::::.::::: ..:: :: :.: :.:.
CCDS45 VMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
540 550 560 570 580 590
>>CCDS62522.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 (604 aa)
initn: 2489 init1: 986 opt: 2130 Z-score: 2429.7 bits: 459.6 E(32554): 5.1e-129
Smith-Waterman score: 2526; 62.3% identity (84.5% similar) in 605 aa overlap (1-593:1-602)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
::: ::::::::::. ::..::: ::::::..:. :::.:::::::.::..::::::::
CCDS62 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE4 INKRREPLPSLEAVYLITPSEK-----------SVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDS
:::::::.:::::.::..:.:: ::..::.::. :: :.:::.::::.
CCDS62 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKAQAQRVIHLPQSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 CPDALFNELVKSRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPIL
::. ::.:: .:: :::.::: ::..::::::.::.:::. : ..: : .:. .. :
CCDS62 CPEPLFSELGRSRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 ERLAEQIATLCATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQ
: ::.:::::::::.::::.::: .:.: ::. . ::.:.::: :..::::.:.:::
CCDS62 EVLAQQIATLCATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 LLILDRGFDPSSPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWI
:::.::. :: ::.:::::::::.:::: ::.:.:.:::.:..::: : ::::::::::.
CCDS62 LLIMDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWV
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 ALRHKHIAEVSQEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLH
::: :::.::..::. :. : :::..: .:....::::.:::::::::::.:::::::
CCDS62 ELRHMHIADVSKKVTELLRTFCESKRLTT-DKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLH
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 LAEDCMKHYQGTVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIIL
::.:::::..:.:.::: ::::::::.::::::::: :. :::.:::: : .:::::..:
CCDS62 LADDCMKHFKGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 LYIFLKNGITEENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERIS
:::.:.::..:::: ::::::.. ..: .: :. .:: ... . :. : .::.
CCDS62 LYILLRNGVSEENLAKLIQHANVQAHSS-LIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERM-
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 EQTYQLSRWTPIIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPG
: :::::::::.:::.:::..::.:: . .:..: . .. : .:::::.::::::::
CCDS62 EPTYQLSRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGI
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530 540 550 560 570 580
pF1KE4 EYRSGPRLIIFILGGVSLNEMRCAYEVTQAN-GKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKT
: :.:::::....:::...::: :::::.:. :::::::::.::::: ..:: :: :.:
CCDS62 EARAGPRLIVYVMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKK
540 550 560 570 580 590
590
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:.:.
CCDS62 LEDIALP
600
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CCDS79 VVENIYKNREPVRQMKALYFITPTSKSVDCFLHDFASKSENKYKAAYIYFTDFCPDNLFN
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CCDS79 QIVTVCATLDENPGVRYKSKPLDNASKLAQLVEKKLEDYYKIDEKSLIKG--KTHSQLLI
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CCDS79 IDRGFDPVSTVLHELTFQAMAYDLLPIENDTYKYKTDG----KEKEAILEEEDDLWVRIR
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CCDS79 DCMNKFKLNIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNCDKIRAILLYI
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CCDS79 FSINGTTEENLDRLIQNVKIENE-SDMIRNWSYLGVPIVPQS---QQGKPLRKDRSAEET
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CCDS79 FQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSKEWPYCSQCPAVWNGSGAVSAR----QKPRANYLED
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CCDS79 RKNGSKLIVFVIGGITYSEVRCAYEVSQAHKSCEVIIGSTHVLTPKKLLDDIKMLNKPKD
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pF1KE4 EISS
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CCDS79 KVSLIKDE
590
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. .. :. .: . :::.. :. :. :. .:.:..
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CCDS72 SRR
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CCDS94 RIDSQNREIMKHLKAICFLRPTKENVDYIIQELRRP---KYTIYFIYFSNVISKSDVKSL
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CCDS94 AEADEQEVVAEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNILGCCQGRNWDP--AQ-----LSRTTQGLT
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CCDS94 ALLLSLKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVP----PLLLILDRC
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CCDS94 NFAEIGSNIKNLMEDFQKKKPKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGEL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]