Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4511
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4511, 539 aa
1>>>pF1KE4511 539 - 539 aa - 539 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0128+/- 0.001; mu= 14.8513+/- 0.060
mean_var=86.0846+/-16.869, 0's: 0 Z-trim(106.1): 46 B-trim: 253 in 1/50
Lambda= 0.138233
statistics sampled from 8779 (8817) to 8779 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16
Scan time: 3.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5111.1 KPNA5 gene_id:3841|Hs108|chr6 ( 539) 3569 722.1 3.9e-208
CCDS352.1 KPNA6 gene_id:23633|Hs108|chr1 ( 536) 3012 611.0 1.1e-174
CCDS3013.1 KPNA1 gene_id:3836|Hs108|chr3 ( 538) 2883 585.3 6e-167
CCDS32713.1 KPNA2 gene_id:3838|Hs108|chr17 ( 529) 1546 318.7 1.1e-86
CCDS3191.1 KPNA4 gene_id:3840|Hs108|chr3 ( 521) 1480 305.5 9.9e-83
CCDS9421.1 KPNA3 gene_id:3839|Hs108|chr13 ( 521) 1446 298.7 1.1e-80
CCDS47651.1 KPNA7 gene_id:402569|Hs108|chr7 ( 516) 1232 256.0 7.6e-68
CCDS58071.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 ( 484) 291 68.4 2.2e-11
CCDS7140.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 ( 458) 289 68.0 2.8e-11
CCDS73072.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 ( 484) 289 68.0 2.9e-11
CCDS7139.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 ( 509) 289 68.0 3.1e-11
>>CCDS5111.1 KPNA5 gene_id:3841|Hs108|chr6 (539 aa)
initn: 3569 init1: 3569 opt: 3569 Z-score: 3850.1 bits: 722.1 E(32554): 3.9e-208
Smith-Waterman score: 3569; 100.0% identity (100.0% similar) in 539 aa overlap (1-539:1-539)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDE
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CCDS51 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPID
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 QVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 QVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 CRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 CRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 RLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 WTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 WTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 VALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGLD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE4 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGFQL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGFQL
490 500 510 520 530
>>CCDS352.1 KPNA6 gene_id:23633|Hs108|chr1 (536 aa)
initn: 3016 init1: 2668 opt: 3012 Z-score: 3249.8 bits: 611.0 E(32554): 1.1e-174
Smith-Waterman score: 3012; 84.0% identity (94.6% similar) in 539 aa overlap (1-539:1-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDE
:..::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::.:::::::: : ..
CCDS35 METMASPGKDNYRMKSYKNNALNPEEMRRRREEEGIQLRKQKREQQLFKRRNVELINEEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPID
.:..: ..: .:::. : :.: .::.:.::...: ::..::::::::::::.::::
CCDS35 AMFDSLLMDSYVSSTTG---ESVITREMVEMLFSDDSDLQLATTQKFRKLLSKEPSPPID
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 QVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLN
.::. : ::.:::.::.:::::::::::::::::::::: .::.:::.:::::::.:::
CCDS35 EVINTPRVVDRFVEFLKRNENCTLQFEAAWALTNIASGTSQQTKIVIEAGAVPIFIELLN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNL
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CCDS35 SDFEDVQEQAVWALGNIAGDSSVCRDYVLNCSILNPLLTLLTKSTRLTMTRNAVWALSNL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 CRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCR
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CCDS35 CRGKNPPPEFAKVSPCLPVLSRLLFSSDSDLLADACWALSYLSDGPNEKIQAVIDSGVCR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RLVELLMHNDYKVASPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 WTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WTISNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGLD
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..: :.::::.:::::::::
CCDS35 VSLGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEGKRSGSGVNPYCGLIEEAYGLD
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KE4 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGFQL
::::::::::::::::::::::::::::.:: :..:::::.:::::::: ::::.::::
CCDS35 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEDDDSSLAPQVDETQQQFIFQQPEAPMEGFQL
480 490 500 510 520 530
>>CCDS3013.1 KPNA1 gene_id:3836|Hs108|chr3 (538 aa)
initn: 2882 init1: 2601 opt: 2883 Z-score: 3110.7 bits: 585.3 E(32554): 6e-167
Smith-Waterman score: 2883; 80.1% identity (93.1% similar) in 539 aa overlap (4-539:1-538)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRND-
:..:::.:.:.::::::.:::.::::::::::.::::::::::::::::: ...
CCDS30 MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEET
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 --ESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNP
: : .. ... .::. : :.:.::..::::.. .:::.:::::::::::::::
CCDS30 EEEVMSDGGFHEAQISNMEMAPGG-VITSDMIEMIFSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 PIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIK
:::.::. :::: :::.::.:.::::::::.::.:::::::. :.:..::..:::::::.
CCDS30 PIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LLNSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWAL
::.:: :::::::::::::::::.. :::.::.:.::::::.:....:::: ::::::::
CCDS30 LLSSEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWAL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSG
:::::::.:::.:.:::::::::: ::: :: :::::.::::::::::::::::::::.:
CCDS30 SNLCRGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 VCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::.:
CCDS30 VCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 EACWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQI
:::::.::::::::::::.::::::::.:: ::: ::::::::::::::::::::. :::
CCDS30 EACWTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 RYLVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAY
.::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :::::::::::::
CCDS30 KYLVELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAY
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 GLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGF
:::::::::::::::::::::::::::::.:..: ::.:::: ::::.:::: ::::.::
CCDS30 GLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQVDLNQQQYIFQQCEAPMEGF
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 QL
::
CCDS30 QL
>>CCDS32713.1 KPNA2 gene_id:3838|Hs108|chr17 (529 aa)
initn: 1539 init1: 810 opt: 1546 Z-score: 1669.8 bits: 318.7 E(32554): 1.1e-86
Smith-Waterman score: 1546; 48.3% identity (75.0% similar) in 528 aa overlap (13-533:13-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDE
:.. .:::. . :::::: : ...::: :...:..::::: .:
CCDS32 MSTNENANTPAARLHRFKNKGKDSTEMRRRRIEVNVELRKAKKDDQMLKRRNVSSFPDDA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 SMLESPIQDP-DISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPI
. ::.:. . ..:: . . :.:. : :.:...:: ::: :::::.: .:::
CCDS32 T---SPLQENRNNQGTV-----NWSVDDIVKGINSSNVENQLQATQAARKLLSREKQPPI
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 DQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLL
:..: . :.. .::.:: :.. .:::.::::::::::: .::.:.. ::.: ::.::
CCDS32 DNII-RAGLIPKFVSFLGRTDCSPIQFESAWALTNIASGTSEQTKAVVDGGAIPAFISLL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 NSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTT----RNAVW
: : ..:::::::::::::.. ::.:.. . ::: ::. . . . :: .:
CCDS32 ASPHAHISEQAVWALGNIAGDGSVFRDLVIKYGAVDPLLALLAVPDMSSLACGYLRNLTW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ALSNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVID
.::::::.::: : .. : : .: ::: .::.::::.:::.:::.::::..: :.
CCDS32 TLSNLCRNKNPAPPIDAVEQILPTLVRLLHHDDPEVLADTCWAISYLTDGPNERIGMVVK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 SGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESI
.:: .::.:: .. .:.:::::.:::::: : ::::... .:: . ::..:: .:
CCDS32 TGVVPQLVKLLGASELPIVTPALRAIGNIVTGTDEQTQVVIDAGALAVFPSLLTNPKTNI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 RKEACWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPE
.::: ::.:::::: . ::: :.. .. : :. .:.::.:.:.:::.::.:: ::::: :
CCDS32 QKEATWTMSNITAGRQDQIQQVVNHGLVPFLVSVLSKADFKTQKEAVWAVTNYTSGGTVE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 QIRYLVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEE
:: ::: : :.:: .:::. :.::. : :... ::.. .:. .. . ..: .:::
CCDS32 QIVYLVHCGIIEPLMNLLTAKDTKIILVILDAISNIFQAAEKLGETEKLSI-----MIEE
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 AYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEED-DPSIVPQVDENQQQFIFQQQE-AP
:::::: ::.:::. .:. ...:::.::.:::. : ..::.. ... . :: :. ::
CCDS32 CGGLDKIEALQNHENESVYKASLSLIEKYFSVEEEEDQNVVPET--TSEGYTFQVQDGAP
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 MDGFQL
CCDS32 GTFNF
>>CCDS3191.1 KPNA4 gene_id:3840|Hs108|chr3 (521 aa)
initn: 1557 init1: 1186 opt: 1480 Z-score: 1598.8 bits: 305.5 E(32554): 9.9e-83
Smith-Waterman score: 1598; 48.1% identity (75.9% similar) in 540 aa overlap (4-539:1-521)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDAMASPGK-DNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRND
::. : :: :.:..:::. . . :::.:.: ..:::.::.:.:.::::: :..:
CCDS31 MADNEKLDNQRLKNFKNKGRDLETMRRQRNEVVVELRKNKRDEHLLKRRNV--PHED
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPI
.: ::.. . ... .:: :.: ::.:.: :::::.. ::::
CCDS31 IC------EDSDIDGDYRV--QNTSLEAIVQNASSDNQGIQLSAVQAARKLLSSDRNPPI
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 DQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLL
:..: : :.. .:. :::..: .:::::::::::::::: .:..:....:::.:..::
CCDS31 DDLI-KSGILPILVHCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSEQTQAVVQSNAVPLFLRLL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 NSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSN
.: :..: :::::::::: ::. .:::.:.. .. ::: ... : .: ::..:.. :
CCDS31 HSPHQNVCEQAVWALGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVMVN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVC
::: :.::: . .. : .: :. .: ..:.:. ::::::.:. :..:: :::::.
CCDS31 LCRHKDPPPPMETIQEILPALCVLIHHTDVNILVDTVWALSYLTDAGNEQIQMVIDSGIV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 RRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEA
.:: :: :.. :: . ::::::::::: : ::::.:::.:: . ::. :::.: :::
CCDS31 PHLVPLLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDALSHFPALLTHPKEKINKEA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 CWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRY
: .:::::::. :.:::::::. :..:..:.:..: :.:::::::.: : .: .:. :
CCDS31 VWFLSNITAGNQQQVQAVIDANLVPMIIHLLDKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVAY
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGL
:. . : :.:.:::: :...:::.:.:: :::...:.:.. : :::: ::
CCDS31 LIQQNVIPPFCNLLTVKDAQVVQVVLDGLSNILKMAEDEAETIG-------NLIEECGGL
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 DKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEE--DDPSIVPQVDENQQQFIFQQQ-EAPMDG
.::: ::.:::..::. :...:...:. .. .:::.::.. .. : :... ..: .:
CCDS31 EKIEQLQNHENEDIYKLAYEIIDQFFSSDDIDEDPSLVPEAIQGGT-FGFNSSANVPTEG
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 FQL
::.
CCDS31 FQF
520
>>CCDS9421.1 KPNA3 gene_id:3839|Hs108|chr13 (521 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDE
.:. .:.:.::.:::. . . :::.:.: ..:::.::.:.:.:.::: :. .:
CCDS94 MAENPSLENHRIKSFKNKGRDVETMRRHRNEVTVELRKNKRDEHLLKKRNV--PQ-EE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPID
:. .: . : :... ..:. ..: :.: ::.:.: :::::.. :::::
CCDS94 SLEDSDV-DADFKA------QNVTLEAILQNATSDNPVVQLSAVQAARKLLSSDRNPPID
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 QVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLN
..: : :.. .:: :::..: .:::::::::::::::: .:..:....:::.:..::
CCDS94 DLI-KSGILPILVKCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSAQTQAVVQSNAVPLFLRLLR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNL
: :..: :::::::::: ::. .:::.:.. .. ::: ... : .: ::..:.. ::
CCDS94 SPHQNVCEQAVWALGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVIVNL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 CRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCR
::.:.::: . :. : .: :.. .: ..:.:. ::::::.:: :..:: ::::::
CCDS94 CRNKDPPPPMETVQEILPALCVLIYHTDINILVDTVWALSYLTDGGNEQIQMVIDSGVVP
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
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CCDS94 FLVPLLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNLLSHPKEKINKEAV
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 WTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
: .:::::::. :.::::::...:..:. : :..: :.:::::::.: : .: .:..::
CCDS94 WFLSNITAGNQQQVQAVIDAGLIPMIIHQLAKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVEYL
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGLD
: . : :.:.::.: ::..:::.:.::.::: .. .:. . .::: ::.
CCDS94 VQQNVIPPFCNLLSVKDSQVVQVVLDGLKNILIMAGDEA-------STIAEIIEECGGLE
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530
pF1KE4 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEE--DDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGFQ
::: ::.:::..::. ::..:..::. .. .:: ..:.. .
CCDS94 KIEVLQQHENEDIYKLAFEIIDQYFSGDDIDEDPCLIPEATQGGTYNFDPTANLQTKEFN
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 L
CCDS94 F
>>CCDS47651.1 KPNA7 gene_id:402569|Hs108|chr7 (516 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNV--YLPRN
: ...: .. . . :..: ...::: :..:: .::::. . :
CCDS47 MPTLDAPEERRRKFKYRGKDVSLRRQQRMAVSLELRKAKKDEQTLKRRNITSFCP--
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 DESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPP
..: . . .: . :.. . . :.. . ::: ::.::.: :::
CCDS47 -----DTPSEKTAKGVAVSLTLGEII-----KGVNSSDPVLCFQATQTARKMLSQEKNPP
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKL
. ::. :.. :.:.::. . :::::::::::::::: .:..:.: ::. .:.:
CCDS47 LKLVIEA-GLIPRMVEFLKSSLYPCLQFEAAWALTNIASGTSEQTRAVVEGGAIQPLIEL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LNSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALS
:.: . : :::::::::::::. : :: :.. . .: :: :.. . .: :: .:.::
CCDS47 LSSSNVAVCEQAVWALGNIAGDGPEFRDNVITSNAIPHLLALISPTLPITFLRNITWTLS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 NLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGV
::::.::: : . :. : .: .:: .: .::.:.:::::::.:: : .: :...::
CCDS47 NLCRNKNPYPCDTAVKQILPALLHLLQHQDSEVLSDACWALSYLTDGSNKRIGQVVNTGV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 CRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKE
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CCDS47 LPRLVVLMTSSELNVLTPSLRTVGNIVTGTDEQTQMAIDAGMLNVLPQLLQHNKPSIQKE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 ACWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIR
: :..::..:: .:: .. ...: :. .:...::...:::.: ..: ..:.: .:.
CCDS47 AAWALSNVAAGPCHHIQQLLAYDVLPPLVALLKNGEFKVQKEAVWMVANFATGATMDQLI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 YLVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYG
:: : ..:: .:::. : ::: . :. . ::. .:..:..... : :::: :
CCDS47 QLVHSGVLEPLVNLLTAPDVKIVLIILDVISCILQAAEKRSEKENL-----CLLIEELGG
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 LDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDP-SIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGF
.:.:: :: :::..: :.:...::..:: :::. ... :: ... .::
CCDS47 IDRIEALQLHENRQIGQSALNIIEKHFGEEEDESQTLLSQVIDQDYEFIDYECLAKK
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 QL
>>CCDS58071.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 (484 aa)
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pF1KE4 RNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLNSEHEDVQEQAVWALGNI
..:.. .. :: . .:. :. ::: .
CCDS58 MHSLTMDLWIPNGQAGVMSLLRTLLLDVVPTIQQTAALALGRL
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 AGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNLCRGKNPPPNFSKVSPC-
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CCDS58 ANYNDDLAEAVVKCDILPQLVYSLAEQNRFYK-KAAAFVLRAV--GKHSPQLAQAIVDCG
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 -LNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCRRLVELLMHNDYKVVS
:..: : . :: : . ::: :.. . :::.:.:. :: ... . .
CCDS58 ALDTLVICLEDFDPGVKEAAAWALRYIARHNAELSQAVVDAGAVPLLVLCIQEPEIALKR
110 120 130 140 150 160
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 PALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEACWTVSNITAGNRAQIQ
: :...:. . .:.... .:. : ... .: ..... ..:... . .
CCDS58 IAASALSDIAKHSPELAQTVVDAGAVAHLAQMILNPDAKLKHQILSALSQVSKHSVDLAE
170 180 190 200 210 220
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 AVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYLVALGCIKPLCDLLTV
:..:.::::.. :. . ..:.:. : . .. ::: . .: : . . :
CCDS58 MVVEAEIFPVVLTCLKDKDEYVKKNASTLIREIAKH-TPELSQLVVNAGGVAAVIDCIGS
230 240 250 260 270
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 MDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQ
CCDS58 CKGNTRLPGIMMLGYVAAHSENLAMAVIISKGVPQLSVCLSEEPEDHIKAAAAWALGQIG
280 290 300 310 320 330
>>CCDS7140.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 (458 aa)
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140 150 160 170 180 190
pF1KE4 ENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLNSEHEDVQEQAVWALGNIAG
:.. .. :: . .:. :. ::: .:.
CCDS71 EQYQKARTQFVQMVAELATRPQNIETLQNAGVMSLLRTLLLDVVPTIQQTAALALGRLAN
20 30 40 50 60 70
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 DNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNLCRGKNPPPNFSKVSPC--L
: . . :..:.::: :. :...::. . :...: . ::. : . . : :
CCDS71 YNDDLAEAVVKCDILPQLVYSLAEQNRFYK-KAAAFVLRAV--GKHSPQLAQAIVDCGAL
80 90 100 110 120
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 NVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCRRLVELLMHNDYKVVSPA
..: : . :: : . ::: :.. . :::.:.:. :: ... . . :
CCDS71 DTLVICLEDFDPGVKEAAAWALRYIARHNAELSQAVVDAGAVPLLVLCIQEPEIALKRIA
130 140 150 160 170 180
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:...:. . .:.... .:. : ... .: ..... ..:... . . :
CCDS71 ASALSDIAKHSPELAQTVVDAGAVAHLAQMILNPDAKLKHQILSALSQVSKHSVDLAEMV
190 200 210 220 230 240
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pF1KE4 IDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYLVALGCIKPLCDLLTVMD
..:.::::.. :. . ..:.:. : . .. ::: . .: : . . :
CCDS71 VEAEIFPVVLTCLKDKDEYVKKNASTLIREIAKH-TPELSQLVVNAGGVAAVIDCIGSCK
250 260 270 280 290 300
440 450 460 470 480 490
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CCDS71 GNTRLPGIMMLGYVAAHSENLAMAVIISKGVPQLSVCLSEEPEDHIKAAAAWALGQIGRH
310 320 330 340 350 360
>>CCDS73072.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 (484 aa)
initn: 262 init1: 169 opt: 289 Z-score: 315.6 bits: 68.0 E(32554): 2.9e-11
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CCDS73 MVAELATRPQNIETLQNAGVMSLLRTLLLDVVPTIQQTAALALGRLAN
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
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: . . :..:.::: :. :...::. . :...: . ::. : . . : :
CCDS73 YNDDLAEAVVKCDILPQLVYSLAEQNRFYK-KAAAFVLRAV--GKHSPQLAQAIVDCGAL
50 60 70 80 90 100
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..: : . :: : . ::: :.. . :::.:.:. :: ... . . :
CCDS73 DTLVICLEDFDPGVKEAAAWALRYIARHNAELSQAVVDAGAVPLLVLCIQEPEIALKRIA
110 120 130 140 150 160
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:...:. . .:.... .:. : ... .: ..... ..:... . . :
CCDS73 ASALSDIAKHSPELAQTVVDAGAVAHLAQMILNPDAKLKHQILSALSQVSKHSVDLAEMV
170 180 190 200 210 220
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pF1KE4 IDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYLVALGCIKPLCDLLTVMD
..:.::::.. :. . ..:.:. : . .. ::: . .: : . . :
CCDS73 VEAEIFPVVLTCLKDKDEYVKKNASTLIREIAKH-TPELSQLVVNAGGVAAVIDCIGSCK
230 240 250 260 270 280
440 450 460 470 480 490
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CCDS73 GNTRLPGIMMLGYVAAHSENLAMAVIISKGVPQLSVCLSEEPEDHIKAAAAWALGQIGRH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]