Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4509
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4509, 532 aa
1>>>pF1KE4509 532 - 532 aa - 532 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4671+/-0.000738; mu= 18.1523+/- 0.045
mean_var=71.0192+/-14.576, 0's: 0 Z-trim(109.2): 21 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.152190
statistics sampled from 10675 (10693) to 10675 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.328), width: 16
Scan time: 3.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1879.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 532) 3366 748.1 5.9e-216
CCDS12692.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 541) 1893 424.7 1.4e-118
CCDS46125.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 339) 1381 312.1 6.4e-85
CCDS46126.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 313) 1323 299.4 4.1e-81
CCDS54362.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 234) 1178 267.5 1.2e-71
CCDS78004.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 496) 1041 237.6 2.6e-62
CCDS3919.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 542) 1041 237.6 2.8e-62
CCDS12321.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 564) 1006 229.9 6e-60
CCDS6452.1 SLC1A1 gene_id:6505|Hs108|chr9 ( 524) 984 225.1 1.6e-58
CCDS55756.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 565) 983 224.9 2e-58
CCDS31459.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 574) 983 224.9 2e-58
CCDS574.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 560) 942 215.9 1e-55
CCDS72796.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 472) 938 215.0 1.6e-55
CCDS78003.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 430) 863 198.5 1.3e-50
CCDS54844.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 497) 747 173.0 7.1e-43
CCDS72797.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 619) 578 136.0 1.3e-31
CCDS62578.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 312) 456 109.0 8.2e-24
CCDS72798.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 158) 346 84.7 8.7e-17
>>CCDS1879.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 (532 aa)
initn: 3366 init1: 3366 opt: 3366 Z-score: 3990.6 bits: 748.1 E(32554): 5.9e-216
Smith-Waterman score: 3366; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MEKSNETNGYLDSAQAGPAAGPGAPGTAAGRARRCAGFLRRQALVLLTVSGVLAGAGLGA
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CCDS18 MEKSNETNGYLDSAQAGPAAGPGAPGTAAGRARRCAGFLRRQALVLLTVSGVLAGAGLGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ALRGLSLSRTQVTYLAFPGEMLLRMLRMIILPLVVCSLVSGAASLDASCLGRLGGIAVAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ALRGLSLSRTQVTYLAFPGEMLLRMLRMIILPLVVCSLVSGAASLDASCLGRLGGIAVAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 FGLTTLSASALAVALAFIIKPGSGAQTLQSSDLGLEDSGPPPVPKETVDSFLDLARNLFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 FGLTTLSASALAVALAFIIKPGSGAQTLQSSDLGLEDSGPPPVPKETVDSFLDLARNLFP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SNLVVAAFRTYATDYKVVTQNSSSGNVTHEKIPIGTEIEGMNILGLVLFALVLGVALKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SNLVVAAFRTYATDYKVVTQNSSSGNVTHEKIPIGTEIEGMNILGLVLFALVLGVALKKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 GSEGEDLIRFFNSLNEATMVLVSWIMWYVPVGIMFLVGSKIVEMKDIIVLVTSLGKYIFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GSEGEDLIRFFNSLNEATMVLVSWIMWYVPVGIMFLVGSKIVEMKDIIVLVTSLGKYIFA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 SILGHVIHGGIVLPLIYFVFTRKNPFRFLLGLLAPFATAFATCSSSATLPSMMKCIEENN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SILGHVIHGGIVLPLIYFVFTRKNPFRFLLGLLAPFATAFATCSSSATLPSMMKCIEENN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 GVDKRISRFILPIGATVNMDGAAIFQCVAAVFIAQLNNVELNAGQIFTILVTATASSVGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GVDKRISRFILPIGATVNMDGAAIFQCVAAVFIAQLNNVELNAGQIFTILVTATASSVGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 AGVPAGGVLTIAIILEAIGLPTHDLPLILAVDWIVDRTTTVVNVEGDALGAGILHHLNQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 AGVPAGGVLTIAIILEAIGLPTHDLPLILAVDWIVDRTTTVVNVEGDALGAGILHHLNQK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE4 ATKKGEQELAEVKVEAIPNCKSEEETSPLVTHQNPAGPVASAPELESKESVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ATKKGEQELAEVKVEAIPNCKSEEETSPLVTHQNPAGPVASAPELESKESVL
490 500 510 520 530
>>CCDS12692.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 (541 aa)
initn: 1800 init1: 1271 opt: 1893 Z-score: 2242.6 bits: 424.7 E(32554): 1.4e-118
Smith-Waterman score: 1893; 60.9% identity (81.9% similar) in 524 aa overlap (17-532:32-541)
10 20 30 40
pF1KE4 MEKSNETNGYLDSAQAGPAAGPGAPGTAAGRARRCAGFLRRQALVL
: ::: : :. ..::: :: . :::
CCDS12 VADPPRDSKGLAAAEPTANGGLALASIEDQGAAAG-GYCGSR-DQVRRC---LRANLLVL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LTVSGVLAGAGLGAALRG----LSLSRTQVTYLAFPGEMLLRMLRMIILPLVVCSLVSGA
::: .:.::..:: .. : :.:. ... ..::::.:::.:::::::::::::..::
CCDS12 LTVVAVVAGVALGLGVSGAGGALALGPERLSAFVFPGELLLRLLRMIILPLVVCSLIGGA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 ASLDASCLGRLGGIAVAYFGLTTLSASALAVALAFIIKPGSGAQTLQSSDLGLEDSGPPP
:::: . :::::. :. .: .::: ::::.:.::. ..::... ....: .: :.
CCDS12 ASLDPGALGRLGAWALLFFLVTTLLASALGVGLALALQPGAASAAINAS-VGAAGSAENA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 VPKETVDSFLDLARNLFPSNLVVAAFRTYATDYKVVTQNSSSGNVTHEKIPIGTEIEGMN
::..:::::::::.:::::: ::::.:.: :. . . .: :. :.:.: :.::::
CCDS12 PSKEVLDSFLDLARNIFPSNLVSAAFRSYSTTYE---ERNITG--TRVKVPVGQEVEGMN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 ILGLVLFALVLGVALKKLGSEGEDLIRFFNSLNEATMVLVSWIMWYVPVGIMFLVGSKIV
:::::.::.:.::::.::: ::: :::::::.::::::::::::::.::::::::..:::
CCDS12 ILGLVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIRFFNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGIMFLVAGKIV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 EMKDIIVLVTSLGKYIFASILGHVIHGGIVLPLIYFVFTRKNPFRFLLGLLAPFATAFAT
::.:. .: . :::::. .:::.::: .:::::::.::::::.::: :...:.::::.:
CCDS12 EMEDVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHGLLVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIVTPLATAFGT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 CSSSATLPSMMKCIEENNGVDKRISRFILPIGATVNMDGAAIFQCVAAVFIAQLNNVELN
::::::: ::::.:::::: :.::::::::::::::::::.::::::::::::.. :.
CCDS12 SSSSATLPLMMKCVEENNGVAKHISRFILPIGATVNMDGAALFQCVAAVFIAQLSQQSLD
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 AGQIFTILVTATASSVGAAGVPAGGVLTIAIILEAIGLPTHDLPLILAVDWIVDRTTTVV
.:.:::::::::::::::.:::::::.::::::..::. . :::::::.:::. ::.
CCDS12 FVKIITILVTATASSVGAAGIPAGGVLTLAIILEAVNLPVDHISLILAVDWLVDRSCTVL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE4 NVEGDALGAGILH-HLNQKATKKGEQELAEVKVEAI--PNCKSEEETSPLVTH-QNPAGP
::::::::::.:. .... ... : :: .:: : : :: .::. : ..:::
CCDS12 NVEGDALGAGLLQNYVDRTESRSTEPELIQVKSELPLDPLPVPTEEGNPLLKHYRGPAGD
480 490 500 510 520 530
520 530
pF1KE4 VASAPELESKESVL
.. : : ::::.
CCDS12 ATVASE---KESVM
540
>>CCDS46125.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 (339 aa)
initn: 1353 init1: 1271 opt: 1381 Z-score: 1638.1 bits: 312.1 E(32554): 6.4e-85
Smith-Waterman score: 1381; 65.0% identity (84.1% similar) in 346 aa overlap (191-532:2-339)
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 PPVPKETVDSFLDLARNLFPSNLVVAAFRTYATDYKVVTQNSSSGNVTHEKIPIGTEIEG
:.: :. . . .: :. :.:.: :.::
CCDS46 MYSTTYE---ERNITG--TRVKVPVGQEVEG
10 20
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 MNILGLVLFALVLGVALKKLGSEGEDLIRFFNSLNEATMVLVSWIMWYVPVGIMFLVGSK
:::::::.::.:.::::.::: ::: :::::::.::::::::::::::.::::::::..:
CCDS46 MNILGLVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIRFFNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGIMFLVAGK
30 40 50 60 70 80
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 IVEMKDIIVLVTSLGKYIFASILGHVIHGGIVLPLIYFVFTRKNPFRFLLGLLAPFATAF
::::.:. .: . :::::. .:::.::: .:::::::.::::::.::: :...:.::::
CCDS46 IVEMEDVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHGLLVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIVTPLATAF
90 100 110 120 130 140
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 ATCSSSATLPSMMKCIEENNGVDKRISRFILPIGATVNMDGAAIFQCVAAVFIAQLNNVE
.: ::::::: ::::.:::::: :.::::::::::::::::::.::::::::::::..
CCDS46 GTSSSSATLPLMMKCVEENNGVAKHISRFILPIGATVNMDGAALFQCVAAVFIAQLSQQS
150 160 170 180 190 200
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 LNAGQIFTILVTATASSVGAAGVPAGGVLTIAIILEAIGLPTHDLPLILAVDWIVDRTTT
:. .:.:::::::::::::::.:::::::.::::::..::. . :::::::.:::. :
CCDS46 LDFVKIITILVTATASSVGAAGIPAGGVLTLAIILEAVNLPVDHISLILAVDWLVDRSCT
210 220 230 240 250 260
470 480 490 500 510
pF1KE4 VVNVEGDALGAGILH-HLNQKATKKGEQELAEVKVEAI--PNCKSEEETSPLVTH-QNPA
:.::::::::::.:. .... ... : :: .:: : : :: .::. : ..::
CCDS46 VLNVEGDALGAGLLQNYVDRTESRSTEPELIQVKSELPLDPLPVPTEEGNPLLKHYRGPA
270 280 290 300 310 320
520 530
pF1KE4 GPVASAPELESKESVL
: .. : : ::::.
CCDS46 GDATVASE---KESVM
330
>>CCDS46126.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 (313 aa)
initn: 1339 init1: 1257 opt: 1323 Z-score: 1569.8 bits: 299.4 E(32554): 4.1e-81
Smith-Waterman score: 1323; 67.7% identity (85.8% similar) in 316 aa overlap (221-532:1-313)
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 YATDYKVVTQNSSSGNVTHEKIPIGTEIEGMNILGLVLFALVLGVALKKLGSEGEDLIRF
:::::::.::.:.::::.::: ::: ::::
CCDS46 MNILGLVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIRF
10 20 30
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 FNSLNEATMVLVSWIMWYVPVGIMFLVGSKIVEMKDIIVLVTSLGKYIFASILGHVIHGG
:::.::::::::::::::.::::::::..:::::.:. .: . :::::. .:::.:::
CCDS46 FNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGIMFLVAGKIVEMEDVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHGL
40 50 60 70 80 90
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 IVLPLIYFVFTRKNPFRFLLGLLAPFATAFATCSSSATLPSMMKCIEENNGVDKRISRFI
.:::::::.::::::.::: :...:.::::.: ::::::: ::::.:::::: :.:::::
CCDS46 LVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIVTPLATAFGTSSSSATLPLMMKCVEENNGVAKHISRFI
100 110 120 130 140 150
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 LPIGATVNMDGAAIFQCVAAVFIAQLNNVELNAGQIFTILVTATASSVGAAGVPAGGVLT
:::::::::::::.::::::::::::.. :. .:.:::::::::::::::.:::::::
CCDS46 LPIGATVNMDGAALFQCVAAVFIAQLSQQSLDFVKIITILVTATASSVGAAGIPAGGVLT
160 170 180 190 200 210
440 450 460 470 480
pF1KE4 IAIILEAIGLPTHDLPLILAVDWIVDRTTTVVNVEGDALGAGILH-HLNQKATKKGEQEL
.::::::..::. . :::::::.:::. ::.::::::::::.:. .... ... : ::
CCDS46 LAIILEAVNLPVDHISLILAVDWLVDRSCTVLNVEGDALGAGLLQNYVDRTESRSTEPEL
220 230 240 250 260 270
490 500 510 520 530
pF1KE4 AEVKVEAI--PNCKSEEETSPLVTH-QNPAGPVASAPELESKESVL
.:: : : :: .::. : ..::: .. : : ::::.
CCDS46 IQVKSELPLDPLPVPTEEGNPLLKHYRGPAGDATVASE---KESVM
280 290 300 310
>>CCDS54362.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 (234 aa)
initn: 1447 init1: 1178 opt: 1178 Z-score: 1399.6 bits: 267.5 E(32554): 1.2e-71
Smith-Waterman score: 1298; 75.0% identity (75.0% similar) in 312 aa overlap (221-532:1-234)
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 YATDYKVVTQNSSSGNVTHEKIPIGTEIEGMNILGLVLFALVLGVALKKLGSEGEDLIRF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MNILGLVLFALVLGVALKKLGSEGEDLIRF
10 20 30
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 FNSLNEATMVLVSWIMWYVPVGIMFLVGSKIVEMKDIIVLVTSLGKYIFASILGHVIHGG
::::::::::::::::
CCDS54 FNSLNEATMVLVSWIM--------------------------------------------
40
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 IVLPLIYFVFTRKNPFRFLLGLLAPFATAFATCSSSATLPSMMKCIEENNGVDKRISRFI
:: ::::::::::::::::::::::::
CCDS54 --------------------------------CS--ATLPSMMKCIEENNGVDKRISRFI
50 60 70
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 LPIGATVNMDGAAIFQCVAAVFIAQLNNVELNAGQIFTILVTATASSVGAAGVPAGGVLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPIGATVNMDGAAIFQCVAAVFIAQLNNVELNAGQIFTILVTATASSVGAAGVPAGGVLT
80 90 100 110 120 130
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 IAIILEAIGLPTHDLPLILAVDWIVDRTTTVVNVEGDALGAGILHHLNQKATKKGEQELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IAIILEAIGLPTHDLPLILAVDWIVDRTTTVVNVEGDALGAGILHHLNQKATKKGEQELA
140 150 160 170 180 190
500 510 520 530
pF1KE4 EVKVEAIPNCKSEEETSPLVTHQNPAGPVASAPELESKESVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EVKVEAIPNCKSEEETSPLVTHQNPAGPVASAPELESKESVL
200 210 220 230
>>CCDS78004.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (496 aa)
initn: 1170 init1: 992 opt: 1041 Z-score: 1232.1 bits: 237.6 E(32554): 2.6e-62
Smith-Waterman score: 1204; 45.4% identity (74.1% similar) in 432 aa overlap (85-495:45-469)
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GAGLGAALRGLSLSRTQVTYLAFPGEMLLRMLRMIILPLVVCSLVSGAASLDASCLGRLG
..: .. :.: ... : :.::.. :..:
CCDS78 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGMAALDSKASGKMG
20 30 40 50 60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 GIAVAYFGLTTLSASALAVALAFIIKPGSGAQTLQSSDLGLEDSGPPPVPKETVDSFLDL
::.:. ::. : .... ...::.::.:.. ... : : ..:.::::
CCDS78 MRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKE------NMHREGKI-VRVTAADAFLDL
80 90 100 110 120
180 190 200 210
pF1KE4 ARNLFPSNLVVAAFRTYATDY-----KVVTQNSSS--GNV--------------THEKIP
::.:: ::: : :. . :.: :: : . . : : :.: .:
CCDS78 IRNMFPPNLVEACFKQFKTNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVP
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 IGTEIEGMNILGLVLFALVLGVALKKLGSEGEDLIRFFNSLNEATMVLVSWIMWYVPVGI
. ..:.: ::::.:.. .: .. .. .:. : .::.::::: : ::. ::::.::::
CCDS78 VPGSVNGVNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGI
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 MFLVGSKIVEMKDIIVLVTSLGKYIFASILGHVIHGGIVLPLIYFVFTRKNPFRFLLGLL
.::...:::::.:. :. .:. : . :.: .::. :::::.::. :::::. :. :::
CCDS78 LFLIAGKIVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLL
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 APFATAFATCSSSATLPSMMKCIEENNGVDKRISRFILPIGATVNMDGAAIFQCVAAVFI
. ::..: ::::::: .::.:::::::::..::.::.:::.::::.:... .::.::
CCDS78 QALITALGTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFI
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 AQLNNVELNAGQIFTILVTATASSVGAAGVPAGGVLTIAIILEAIGLPTHDLPLILAVDW
::.:: ::: :::.:: .::::.:.::::.: .:..:..:.: ..:::: :. ::.::::
CCDS78 AQVNNFELNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDW
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 IVDRTTTVVNVEGDALGAGILHHLNQKATKKGEQELAEVKVEAIPNCKSEEETSPLVTHQ
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CCDS78 FLDRLRTTTNVLGDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETE
430 440 450 460 470 480
520 530
pF1KE4 NPAGPVASAPELESKESVL
CCDS78 KPIDSETKM
490
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10 20 30 40 50 60
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CCDS39 RMERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGFTLRPYRM
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SRTQVTYLAFPGEMLLRMLRMIILPLVVCSLVSGAASLDASCLGRLGGIAVAYFGLTTLS
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CCDS39 SYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTII
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130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ASALAVALAFIIKPGSGAQTLQSSDLGLEDSGPPPVPKETVDSFLDLARNLFPSNLVVAA
: .... ...::.::.:.. ... : : ..:.:::: ::.:: ::: :
CCDS39 AVVIGIIIVIIIHPGKGTKE------NMHREGKI-VRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEAC
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CCDS39 FKQFKTNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNGVNALGL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 VLFALVLGVALKKLGSEGEDLIRFFNSLNEATMVLVSWIMWYVPVGIMFLVGSKIVEMKD
:.:.. .: .. .. .:. : .::.::::: : ::. ::::.::::.::...:::::.:
CCDS39 VVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEMED
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290 300 310 320 330 340
pF1KE4 IIVLVTSLGKYIFASILGHVIHGGIVLPLIYFVFTRKNPFRFLLGLLAPFATAFATCSSS
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CCDS39 MGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSS
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350 360 370 380 390 400
pF1KE4 ATLPSMMKCIEENNGVDKRISRFILPIGATVNMDGAAIFQCVAAVFIAQLNNVELNAGQI
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CCDS39 ATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQI
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410 420 430 440 450 460
pF1KE4 FTILVTATASSVGAAGVPAGGVLTIAIILEAIGLPTHDLPLILAVDWIVDRTTTVVNVEG
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CCDS39 ITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVLG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 DALGAGILHHLNQKATKKGEQELAEVKVEAIPNCKSEEETSPLVTHQNPAGPVASAPELE
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CCDS39 DSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
490 500 510 520 530 540
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10 20 30 40 50 60
pF1KE4 NGYLDSAQAGPAAGPGAPGTAAGRARRCAGFLRRQALVLLTVSGVLAGAGLGAALRGLSL
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CCDS12 WLQRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFALRPYQL
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70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SRTQVTYLAFPGEMLLRMLRMIILPLVVCSLVSGAASLDASCLGRLGGIAVAYFGLTTLS
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CCDS12 TYRQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAAVYYMVTTII
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130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ASALAVALAFIIKPGSGAQTLQSSDLGLEDSGP-PPVPKETVDSFLDLARNLFPSNLVVA
: ... .. ::.::.:.. ::. : .: :.:.:.:: ::.:: ::: :
CCDS12 AVFIGILMVTIIHPGKGSKE------GLHREGRIETIP--TADAFMDLIRNMFPPNLVEA
150 160 170 180 190
190 200
pF1KE4 AFRTYATDY--KVVT------QNSS-------------SG-----NVTH-----------
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CCDS12 CFKQFKTQYSTRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENVTRALGTLQEMLSF
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 -EKIPIGTEIEGMNILGLVLFALVLGVALKKLGSEGEDLIRFFNSLNEATMVLVSWIMWY
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CCDS12 EETVPVPGSANGINALGLVVFSVAFGLVIGGMKHKGRVLRDFFDSLNEAIMRLVGIIIWY
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 VPVGIMFLVGSKIVEMKDIIVLVTSLGKYIFASILGHVIHGGIVLPLIYFVFTRKNPFRF
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CCDS12 APVGILFLIAGKILEMEDMAVLGGQLGMYTLTVIVGLFLHAGIVLPLIYFLVTHRNPFPF
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 LLGLLAPFATAFATCSSSATLPSMMKCIEENNGVDKRISRFILPIGATVNMDGAAIFQCV
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CCDS12 IGGMLQALITAMGTSSSSATLPITFRCLEEGLGVDRRITRFVLPVGATVNMDGTALYEAL
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 AAVFIAQLNNVELNAGQIFTILVTATASSVGAAGVPAGGVLTIAIILEAIGLPTHDLPLI
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CCDS12 AAIFIAQVNNYELNLGQITTISITATAASVGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTEDITLI
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450 460 470 480 490 500
pF1KE4 LAVDWIVDRTTTVVNVEGDALGAGILHHLNQKATKKGEQELAEVKVEAIPNCKSEEETSP
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CCDS12 IAVDWFLDRLRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQRELELQEAELTLPSLGKPYKSLMAQEKGA
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510 520 530
pF1KE4 LVTHQNPAGPVASAPELESKESVL
CCDS12 SRGRGGNESAM
560
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10 20 30 40 50 60
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CCDS64 LVREHSNLSTLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVV
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pF1KE4 YFGLTTLSASALAVALAFIIKPGSGAQTLQSSDLGLEDSGPPPVPKETVDSFLDLARNLF
:. ::: : :...:. :::: .. . . : . : : :::..::: ::.:
CCDS64 YYFCTTLIAVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTG----STPEVS--TVDAMLDLIRNMF
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pF1KE4 PSNLVVAAFRTYAT------------------DYKVVTQNSSSGNVTHEKIPIGTEIEGM
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CCDS64 PENLVQACFQQYKTKREEVKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNKTKEYKIVGMYSDGI
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pF1KE4 NILGLVLFALVLGVALKKLGSEGEDLIRFFNSLNEATMVLVSWIMWYVPVGIMFLVGSKI
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CCDS64 NVLGLIVFCLVFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKI
220 230 240 250 260 270
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pF1KE4 VEMKDIIVLVTSLGKYIFASILGHVIHGGIVLPLIYFVFTRKNPFRFLLGLLAPFATAFA
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CCDS64 IEVEDWEIF-RKLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALM
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::::::: ..: :::: :::::.::.::.:::.::::.:... ::::::::::...:
CCDS64 ISSSSATLPVTFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDL
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. :::.:: .:::..:.:::::: .:..:..:.: :.:::..:. ::.::::..:: :.
CCDS64 GIGQIITISITATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTM
390 400 410 420 430 440
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pF1KE4 VNVEGDALGAGILHHLNQKATKKGEQELAEVKVEAIPNCKSEEETSPLVTHQNPAGPVAS
::: :::.:.::...:..: ..
CCDS64 VNVLGDAFGTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFA
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10 20 30 40 50 60
pF1KE4 KSNETNGYLDSAQAGPAAGPGAPGTAAGRARRCAGFLRRQALVLLTVSGVLAGAGLGAAL
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CCDS55 MPKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDK-LGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLL
10 20 30 40 50
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pF1KE4 RGLSLSRTQVTYL-AFPGEMLLRMLRMIILPLVVCSLVSGAASLDASCLGRLGGIAVAYF
: : . .:..: ::::..:.:::.:.::::.. ::..: ..:::. :::: :..:.
CCDS55 RLASPIHPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYY
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CCDS55 MSTTIIAAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQ---LG---PGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPE
120 130 140 150 160
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pF1KE4 NLVVAAFRTYATDYKVVT--------QNSSSG-----NVTHEKIPIGTEI---------E
::: : :. : : : :..:. : : ..: :.. .
CCDS55 NLVQACFQQIQTVTKKVLVAPPPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPEETKMVIKKGLEFKD
170 180 190 200 210 220
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:::.:::. : ...:.:. :.:.... .. ::: ::: .: :: :::: :.:: :. .
CCDS55 GMNVLGLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICG
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pF1KE4 KIVEMKDIIVLVTSLGKYIFASILGHVIHGGIVLPLIYFVFTRKNPFRFLLGLLAPFATA
::. .::. :.. .:: :. . :.: .::::: ::::::: :::::: :. :.. . ::
CCDS55 KIIAIKDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITA
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CCDS55 VLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMR
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532 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]