Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4508
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4508, 532 aa
1>>>pF1KE4508 532 - 532 aa - 532 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5231+/-0.00113; mu= 14.1318+/- 0.069
mean_var=121.4370+/-24.921, 0's: 0 Z-trim(105.8): 50 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.116385
statistics sampled from 8611 (8645) to 8611 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.266), width: 16
Scan time: 2.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS72830.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1 ( 532) 3402 582.8 3.3e-166
CCDS754.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1 ( 531) 3383 579.6 3e-165
CCDS72828.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1 ( 537) 3382 579.5 3.4e-165
CCDS72829.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1 ( 536) 3363 576.3 3.1e-164
CCDS32859.1 PTBP1 gene_id:5725|Hs108|chr19 ( 531) 2615 450.7 2e-126
CCDS45892.1 PTBP1 gene_id:5725|Hs108|chr19 ( 550) 1248 221.2 2.5e-57
CCDS42456.1 PTBP1 gene_id:5725|Hs108|chr19 ( 557) 1248 221.2 2.5e-57
CCDS59140.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9 ( 457) 1142 203.3 5e-52
CCDS55332.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9 ( 524) 1142 203.4 5.5e-52
CCDS6784.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9 ( 552) 1142 203.4 5.7e-52
CCDS55333.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9 ( 555) 1142 203.4 5.8e-52
CCDS59141.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9 ( 558) 1142 203.4 5.8e-52
>>CCDS72830.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1 (532 aa)
initn: 3402 init1: 3402 opt: 3402 Z-score: 3097.5 bits: 582.8 E(32554): 3.3e-166
Smith-Waterman score: 3402; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
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CCDS72 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
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CCDS72 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQRAQAVLQAVTAVQTANTPLSGTTVSESAVTPAQSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQRAQAVLQAVTAVQTANTPLSGTTVSESAVTPAQSPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLALDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLALDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAKETSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAKETSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVLLVSNLNEEMVTPQSLFTLFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVLLVSNLNEEMVTPQSLFTLFG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTVQLPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTVQLPRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 GLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLRTLFANTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLRTLFANTGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE4 TVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI
490 500 510 520 530
>>CCDS754.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1 (531 aa)
initn: 3129 init1: 3129 opt: 3383 Z-score: 3080.3 bits: 579.6 E(32554): 3e-165
Smith-Waterman score: 3383; 99.8% identity (99.8% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQRAQAVLQAVTAVQTANTPLSGTTVSESAVTPAQSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQRAQAVLQAVTAVQTANTPLSGTTVSESAVTPAQSPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLALDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLALDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAKETSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAKETSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVLLVSNLNEEMVTPQSLFTLFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVLLVSNLNEEMVTPQSLFTLFG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTVQLPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTVQLPRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 GLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLRTLFANTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLRTLFANTGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE4 TVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TVKAFKFFQ-DHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI
490 500 510 520 530
>>CCDS72828.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1 (537 aa)
initn: 1956 init1: 1956 opt: 3382 Z-score: 3079.3 bits: 579.5 E(32554): 3.4e-165
Smith-Waterman score: 3382; 99.1% identity (99.1% similar) in 537 aa overlap (1-532:1-537)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQRAQAVLQAVTAVQTANTPLSGTTVSESAVTPAQSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQRAQAVLQAVTAVQTANTPLSGTTVSESAVTPAQSPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLALDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLALDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAKETSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAKETSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE4 L-----AVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVLLVSNLNEEMVTPQSL
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LGLPVAAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVLLVSNLNEEMVTPQSL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 FTLFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FTLFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 QLPREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLRTLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QLPREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLRTLF
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 ANTGGTVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ANTGGTVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI
490 500 510 520 530
>>CCDS72829.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1 (536 aa)
initn: 2213 init1: 1956 opt: 3363 Z-score: 3062.1 bits: 576.3 E(32554): 3.1e-164
Smith-Waterman score: 3363; 98.9% identity (98.9% similar) in 537 aa overlap (1-532:1-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQRAQAVLQAVTAVQTANTPLSGTTVSESAVTPAQSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQRAQAVLQAVTAVQTANTPLSGTTVSESAVTPAQSPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLALDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLALDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAKETSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAKETSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE4 L-----AVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVLLVSNLNEEMVTPQSL
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LGLPVAAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVLLVSNLNEEMVTPQSL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 FTLFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FTLFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 QLPREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLRTLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QLPREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLRTLF
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 ANTGGTVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI
:::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ANTGGTVKAFKFFQ-DHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI
490 500 510 520 530
>>CCDS32859.1 PTBP1 gene_id:5725|Hs108|chr19 (531 aa)
initn: 1888 init1: 1190 opt: 2615 Z-score: 2383.4 bits: 450.7 E(32554): 2e-126
Smith-Waterman score: 2615; 75.0% identity (92.3% similar) in 535 aa overlap (1-532:1-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
::::: ..:::.:::::::.: : ..: :. . .:::::::::::... :.::::
CCDS32 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
.:::::: .::: :::.::::::::::.::::::::::.:. ::::: ::::::..:::
CCDS32 IHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQ-RAQAVLQAVTAVQTANTPL--SGTTVSESAVTPAQ
::.::::::.:::::::::.. :: ::::.::::..::..: : :...:. . . .:
CCDS32 LRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SPVLRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLA
:::::::..:..::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:::.::.:::.
CCDS32 SPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAKE
::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.:: ..::::.
CCDS32 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFG--
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 TSLLAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVLLVSNLNEEMVTPQSLFT
:. : :::.:::::.::::::: :::...::....::.:::::::: : :::::::
CCDS32 LSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAA--AGRIAIPGLAGAGNSVLLVSNLNPERVTPQSLFI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTVQL
::::::::::::::.:::..::.:::::::.::::.::::.:..:: ::.::::::.:::
CCDS32 LFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHLNGHKLHGKPIRITLSKHQNVQL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 PREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLRTLFAN
:::: .:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::..::..
CCDS32 PREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVSEEDLKVLFSS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 TGGTVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI
.::.::.:::::.:.::::.::..::::.::::::::..::::::::::::::::
CCDS32 NGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLHNHDLGENHHLRVSFSKSTI
480 490 500 510 520 530
>>CCDS45892.1 PTBP1 gene_id:5725|Hs108|chr19 (550 aa)
initn: 2518 init1: 1190 opt: 1248 Z-score: 1142.7 bits: 221.2 E(32554): 2.5e-57
Smith-Waterman score: 2597; 73.0% identity (90.4% similar) in 552 aa overlap (1-532:1-550)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
::::: ..:::.:::::::.: : ..: :. . .:::::::::::... :.::::
CCDS45 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
.:::::: .::: :::.::::::::::.::::::::::.:. ::::: ::::::..:::
CCDS45 IHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQ-RAQAVLQAVTAVQTANTPL--SGTTVSESAVTPAQ
::.::::::.:::::::::.. :: ::::.::::..::..: : :...:. . . .:
CCDS45 LRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SPVLRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLA
:::::::..:..::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:::.::.:::.
CCDS45 SPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAK-
::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.:: ..:::::.
CCDS45 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFASP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE4 -------------ETSLLAVP---GALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVL
... :.:: :::.:::::.::::::: :::...::....::.::
CCDS45 YAGAGFPPTFAIPQAAGLSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAA--AGRIAIPGLAGAGNSVL
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 LVSNLNEEMVTPQSLFTLFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKM
:::::: : ::::::: ::::::::::::::.:::..::.:::::::.::::.::::.:.
CCDS45 LVSNLNPERVTPQSLFILFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHLNGHKL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 YGKIIRVTLSKHQTVQLPREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLS
.:: ::.::::::.::::::: .:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HGKPIRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLS
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 NIPPSVAEEDLRTLFANTGGTVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGEN
::::::.::::..::...::.::.:::::.:.::::.::..::::.::::::::..::::
CCDS45 NIPPSVSEEDLKVLFSSNGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLHNHDLGEN
480 490 500 510 520 530
530
pF1KE4 HHLRVSFSKSTI
::::::::::::
CCDS45 HHLRVSFSKSTI
540 550
>>CCDS42456.1 PTBP1 gene_id:5725|Hs108|chr19 (557 aa)
initn: 2520 init1: 1190 opt: 1248 Z-score: 1142.6 bits: 221.2 E(32554): 2.5e-57
Smith-Waterman score: 2577; 71.9% identity (89.1% similar) in 559 aa overlap (1-532:1-557)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
::::: ..:::.:::::::.: : ..: :. . .:::::::::::... :.::::
CCDS42 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
.:::::: .::: :::.::::::::::.::::::::::.:. ::::: ::::::..:::
CCDS42 IHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQ-RAQAVLQAVTAVQTANTPL--SGTTVSESAVTPAQ
::.::::::.:::::::::.. :: ::::.::::..::..: : :...:. . . .:
CCDS42 LRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SPVLRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLA
:::::::..:..::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:::.::.:::.
CCDS42 SPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAK-
::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.:: ..::::.
CCDS42 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFGAP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330
pF1KE4 --------------------ETSLLAVP---GALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVS
... :.:: :::.:::::.::::::: :::...::..
CCDS42 GIISASPYAGAGFPPTFAIPQAAGLSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAA--AGRIAIPGLA
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 AGGNTVLLVSNLNEEMVTPQSLFTLFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMN
..::.:::::::: : ::::::: ::::::::::::::.:::..::.:::::::.::::.
CCDS42 GAGNSVLLVSNLNPERVTPQSLFILFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 HLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTVQLPREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPP
::::.:..:: ::.::::::.::::::: .:::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS42 HLNGHKLHGKPIRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 SATLHLSNIPPSVAEEDLRTLFANTGGTVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLH
:::::::::::::.::::..::...::.::.:::::.:.::::.::..::::.:::::::
CCDS42 SATLHLSNIPPSVSEEDLKVLFSSNGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLH
480 490 500 510 520 530
520 530
pF1KE4 NYNLGENHHLRVSFSKSTI
:..::::::::::::::::
CCDS42 NHDLGENHHLRVSFSKSTI
540 550
>>CCDS59140.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9 (457 aa)
initn: 2097 init1: 1053 opt: 1142 Z-score: 1047.6 bits: 203.3 E(32554): 5e-52
Smith-Waterman score: 2100; 69.7% identity (88.1% similar) in 462 aa overlap (97-532:2-457)
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 PGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPHLRNQPI
::::.:.::::.::::::. .:::::.::.
CCDS59 MAFLEMASEEAAVTMVNYYTPITPHLRSQPV
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YIQYSNHKELKTDNTLNQ-RAQAVLQAVTAVQTANTPLSGTTVSESAVTPAQSPVLRIII
:::::::.:::::: :: ::::.::::.:::... ::: .:..: :.:::::::::
CCDS59 YIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAVSAVQSGSLALSGGPSNEGTVLPGQSPVLRIII
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLALDGQNIYN
.:..:::::.::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::. ::.:::::::::
CCDS59 ENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYAKMALDGQNIYN
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290
pF1KE4 ACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAF-----------
::::::::::::..::::::::::::.:: :::.:::::.:.: .::::
CCDS59 ACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYA
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340
pF1KE4 -------------AKETSLLAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSA-GGNTVL
: :. ::::::.::.: ...:..::...::.:. ::.::
CCDS59 GAAGFAPAIGFPQATGLSVPAVPGALGPLTI------TSSAVTGRMAIPGASGIPGNSVL
220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 LVSNLNEEMVTPQSLFTLFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKM
::.::: ...::..:: ::::::::.::::..:::..::.::::.::.:::::::.::..
CCDS59 LVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRL
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 YGKIIRVTLSKHQTVQLPREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLS
:::..:.::::::.::::::: .::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLS
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 NIPPSVAEEDLRTLFANTGGTVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGEN
::::::. .::..:: ..: .::::::::.:.::::.:...:::::::::.:::..::::
CCDS59 NIPPSVTVDDLKNLFIEAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALIELHNHDLGEN
390 400 410 420 430 440
530
pF1KE4 HHLRVSFSKSTI
::::::::::::
CCDS59 HHLRVSFSKSTI
450
>>CCDS55332.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9 (524 aa)
initn: 2312 init1: 1053 opt: 1142 Z-score: 1046.8 bits: 203.4 E(32554): 5.5e-52
Smith-Waterman score: 2387; 69.4% identity (87.7% similar) in 530 aa overlap (29-532:2-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
::. : : :::::::::: .:. .::::
CCDS55 MNSSTPSTGVYANGNDSKKFK-RDRPPCSPSRV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
::.::.: .:::.:.:.::::::::::.::::::.:::::.:.::::.::::::. .:::
CCDS55 LHLRKIPCDVTEAEIISLGLPFGKVTNLLMLKGKSQAFLEMASEEAAVTMVNYYTPITPH
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KE4 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQ-RAQAVLQAVTAVQTANTPLSGTTVSESAVTPAQSP
::.::.:::::::.:::::: :: ::::.::::.:::... ::: .:..: :.:::
CCDS55 LRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAVSAVQSGSLALSGGPSNEGTVLPGQSP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 VLRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLALD
::::::.:..:::::.::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::. ::.:::
CCDS55 VLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYAKMALD
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 GQNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAF-----
::::::::::::::::::..::::::::::::.:: :::.:::::.:.: .::::
CCDS55 GQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGI
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330
pF1KE4 -------------------AKETSLLAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSA-
: :. ::::::.::.: ...:..::...::.:.
CCDS55 ISSPYAGAAGFAPAIGFPQATGLSVPAVPGALGPLTI------TSSAVTGRMAIPGASGI
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 GGNTVLLVSNLNEEMVTPQSLFTLFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNH
::.::::.::: ...::..:: ::::::::.::::..:::..::.::::.::.::::::
CCDS55 PGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNH
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 LNGQKMYGKIIRVTLSKHQTVQLPREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPS
:.::..:::..:.::::::.::::::: .::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS55 LSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPS
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 ATLHLSNIPPSVAEEDLRTLFANTGGTVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLHN
::::::::::::. .::..:: ..: .::::::::.:.::::.:...:::::::::.:::
CCDS55 ATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFIEAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALIELHN
450 460 470 480 490 500
520 530
pF1KE4 YNLGENHHLRVSFSKSTI
..::::::::::::::::
CCDS55 HDLGENHHLRVSFSKSTI
510 520
>>CCDS6784.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9 (552 aa)
initn: 1896 init1: 1053 opt: 1142 Z-score: 1046.5 bits: 203.4 E(32554): 5.7e-52
Smith-Waterman score: 2493; 68.7% identity (88.0% similar) in 559 aa overlap (1-532:1-552)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDGIVTE-VAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSR
:::.::. ..::.:::::::::......: . :: ::::::::::: .:. .:::
CCDS67 MDGVVTDLITVGLKRGSDELLSSGIINGPFTMNSSTPSTANGNDSKKFK-RDRPPCSPSR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 VLHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTP
:::.::.: .:::.:.:.::::::::::.::::::.:::::.:.::::.::::::. .::
CCDS67 VLHLRKIPCDVTEAEIISLGLPFGKVTNLLMLKGKSQAFLEMASEEAAVTMVNYYTPITP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 HLRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQ-RAQAVLQAVTAVQTANTPLSGTTVSESAVTPAQS
:::.::.:::::::.:::::: :: ::::.::::.:::... ::: .:..: :.::
CCDS67 HLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAVSAVQSGSLALSGGPSNEGTVLPGQS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 PVLRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLAL
:::::::.:..:::::.::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::. ::.::
CCDS67 PVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYAKMAL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 DGQNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAF----
:::::::::::::::::::..::::::::::::.:: :::.:::::.:.: .::::
CCDS67 DGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE4 --------------------AKETSLLAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSA
: :. ::::::.::.: ...:..::...::.:.
CCDS67 IISSPYAGAAGFAPAIGFPQATGLSVPAVPGALGPLTI------TSSAVTGRMAIPGASG
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 -GGNTVLLVSNLNEEMVTPQSLFTLFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMN
::.::::.::: ...::..:: ::::::::.::::..:::..::.::::.::.:::::
CCDS67 IPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMN
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 HLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTVQLPREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPP
::.::..:::..:.::::::.::::::: .::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS67 HLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 SATLHLSNIPPSVAEEDLRTLFANTGGTVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLH
:::::::::::::. .::..:: ..: .::::::::.:.::::.:...:::::::::.::
CCDS67 SATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFIEAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALIELH
480 490 500 510 520 530
520 530
pF1KE4 NYNLGENHHLRVSFSKSTI
:..::::::::::::::::
CCDS67 NHDLGENHHLRVSFSKSTI
540 550
532 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:22:42 2016 done: Sun Nov 6 00:22:42 2016
Total Scan time: 2.250 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]