Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4492
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4492, 512 aa
1>>>pF1KE4492 512 - 512 aa - 512 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4498+/-0.000911; mu= 16.9665+/- 0.055
mean_var=69.1285+/-14.321, 0's: 0 Z-trim(105.9): 78 B-trim: 3 in 1/48
Lambda= 0.154257
statistics sampled from 8599 (8680) to 8599 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 2.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41328.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 512) 3554 800.3 0
CCDS542.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 511) 3537 796.5 0
CCDS81318.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 497) 2702 610.7 1.2e-174
CCDS543.1 CYP4A11 gene_id:1579|Hs108|chr1 ( 519) 1804 410.9 1.8e-114
CCDS30707.1 CYP4A22 gene_id:284541|Hs108|chr1 ( 519) 1686 384.6 1.4e-106
CCDS544.1 CYP4X1 gene_id:260293|Hs108|chr1 ( 509) 1657 378.2 1.2e-104
CCDS545.1 CYP4Z1 gene_id:199974|Hs108|chr1 ( 505) 1578 360.6 2.4e-99
CCDS12336.1 CYP4F2 gene_id:8529|Hs108|chr19 ( 520) 1425 326.5 4.4e-89
CCDS74303.1 CYP4F8 gene_id:11283|Hs108|chr19 ( 520) 1413 323.9 2.8e-88
CCDS12337.1 CYP4F11 gene_id:57834|Hs108|chr19 ( 524) 1412 323.6 3.3e-88
CCDS59362.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 1396 320.1 3.8e-87
CCDS12332.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 1391 319.0 8.3e-87
CCDS12331.1 CYP4F22 gene_id:126410|Hs108|chr19 ( 531) 1388 318.3 1.3e-86
CCDS42517.1 CYP4F12 gene_id:66002|Hs108|chr19 ( 524) 1373 315.0 1.3e-85
CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4 ( 525) 877 204.6 2.3e-52
CCDS76160.1 CYP4A22 gene_id:284541|Hs108|chr1 ( 357) 563 134.6 1.8e-31
CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 ( 503) 540 129.6 8.3e-30
CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 ( 535) 540 129.6 8.7e-30
CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7 ( 503) 538 129.1 1.1e-29
CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 502) 536 128.7 1.5e-29
CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 503) 533 128.0 2.4e-29
CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 504) 524 126.0 9.8e-29
CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 393) 454 110.4 3.9e-24
CCDS7818.1 CYP2R1 gene_id:120227|Hs108|chr11 ( 501) 427 104.4 3.1e-22
CCDS9954.1 CYP46A1 gene_id:10858|Hs108|chr14 ( 500) 417 102.2 1.4e-21
CCDS55175.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 466) 379 93.7 4.8e-19
CCDS5855.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 534) 379 93.8 5.3e-19
CCDS55174.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 580) 379 93.8 5.7e-19
CCDS5677.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 420) 375 92.8 8.1e-19
CCDS34047.1 CYP2U1 gene_id:113612|Hs108|chr4 ( 544) 374 92.6 1.2e-18
CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 514) 353 88.0 2.9e-17
CCDS2423.1 CYP27A1 gene_id:1593|Hs108|chr2 ( 531) 350 87.3 4.7e-17
CCDS613.1 CYP2J2 gene_id:1573|Hs108|chr1 ( 502) 342 85.5 1.5e-16
CCDS8954.1 CYP27B1 gene_id:1594|Hs108|chr12 ( 508) 341 85.3 1.8e-16
CCDS55123.1 CYP51A1 gene_id:1595|Hs108|chr7 ( 404) 339 84.8 2e-16
CCDS5623.1 CYP51A1 gene_id:1595|Hs108|chr7 ( 509) 339 84.8 2.5e-16
CCDS46721.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 497) 321 80.8 3.9e-15
CCDS7541.1 CYP17A1 gene_id:1586|Hs108|chr10 ( 508) 319 80.4 5.4e-15
CCDS7686.1 CYP2E1 gene_id:1571|Hs108|chr10 ( 493) 316 79.7 8.3e-15
CCDS33657.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 446) 310 78.4 1.9e-14
CCDS47406.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 465) 306 77.5 3.7e-14
CCDS4735.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 495) 300 76.2 9.8e-14
CCDS12573.1 CYP2S1 gene_id:29785|Hs108|chr19 ( 504) 298 75.7 1.4e-13
CCDS12572.1 CYP2F1 gene_id:1572|Hs108|chr19 ( 491) 297 75.5 1.5e-13
CCDS10268.1 CYP1A1 gene_id:1543|Hs108|chr15 ( 512) 294 74.8 2.5e-13
CCDS7427.1 CYP26A1 gene_id:1592|Hs108|chr10 ( 428) 293 74.6 2.6e-13
CCDS7426.1 CYP26A1 gene_id:1592|Hs108|chr10 ( 497) 293 74.6 2.9e-13
CCDS62934.1 CYP26B1 gene_id:56603|Hs108|chr2 ( 437) 290 73.9 4.1e-13
CCDS1919.1 CYP26B1 gene_id:56603|Hs108|chr2 ( 512) 290 73.9 4.7e-13
CCDS12570.1 CYP2B6 gene_id:1555|Hs108|chr19 ( 491) 281 71.9 1.8e-12
>>CCDS41328.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 (512 aa)
initn: 3554 init1: 3554 opt: 3554 Z-score: 4273.5 bits: 800.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3554; 100.0% identity (100.0% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MVPSFLSLSFSSLGLWASGLILVLGFLKLIHLLLRRQTLAKAMDKFPGPPTHWLFGHALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MVPSFLSLSFSSLGLWASGLILVLGFLKLIHLLLRRQTLAKAMDKFPGPPTHWLFGHALE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 IQETGSLDKVVSWAHQFPYAHPLWFGQFIGFLNIYEPDYAKAVYSRGDPKAPDVYDFFLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IQETGSLDKVVSWAHQFPYAHPLWFGQFIGFLNIYEPDYAKAVYSRGDPKAPDVYDFFLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 WIGRGLLVLEGPKWLQHRKLLTPGFHYDVLKPYVAVFTESTRIMLDKWEEKAREGKSFDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 WIGRGLLVLEGPKWLQHRKLLTPGFHYDVLKPYVAVFTESTRIMLDKWEEKAREGKSFDI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 FCDVGHMALNTLMKCTFGRGDTGLGHSRDSSYYLAVSDLTLLMQQRLVSFQYHNDFIYWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FCDVGHMALNTLMKCTFGRGDTGLGHSRDSSYYLAVSDLTLLMQQRLVSFQYHNDFIYWL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TPHGRRFLRACQVAHDHTDQVIRERKAALQDEKVRKKIQNRRHLDFLDILLGARDEDDIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TPHGRRFLRACQVAHDHTDQVIRERKAALQDEKVRKKIQNRRHLDFLDILLGARDEDDIK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LSDADLRAEVDTFMFEGHDTTTSGISWFLYCMALYPEHQHRCREEVREILGDQDFFQWDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LSDADLRAEVDTFMFEGHDTTTSGISWFLYCMALYPEHQHRCREEVREILGDQDFFQWDD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LGKMTYLTMCIKESFRLYPPVPQVYRQLSKPVTFVDGRSLPAGSLISMHIYALHRNSAVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LGKMTYLTMCIKESFRLYPPVPQVYRQLSKPVTFVDGRSLPAGSLISMHIYALHRNSAVW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 PDPEVFDSLRFSTENASKRHPFAFMPFSAGPRNCIGQQFAMSEMKVVTAMCLLRFEFSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PDPEVFDSLRFSTENASKRHPFAFMPFSAGPRNCIGQQFAMSEMKVVTAMCLLRFEFSLD
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE4 PSRLPIKMPQLVLRSKNGFHLHLKPLGPGSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PSRLPIKMPQLVLRSKNGFHLHLKPLGPGSGK
490 500 510
>>CCDS542.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 (511 aa)
initn: 2106 init1: 2106 opt: 3537 Z-score: 4253.1 bits: 796.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3537; 99.8% identity (99.8% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-511)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MVPSFLSLSFSSLGLWASGLILVLGFLKLIHLLLRRQTLAKAMDKFPGPPTHWLFGHALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MVPSFLSLSFSSLGLWASGLILVLGFLKLIHLLLRRQTLAKAMDKFPGPPTHWLFGHALE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 IQETGSLDKVVSWAHQFPYAHPLWFGQFIGFLNIYEPDYAKAVYSRGDPKAPDVYDFFLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IQETGSLDKVVSWAHQFPYAHPLWFGQFIGFLNIYEPDYAKAVYSRGDPKAPDVYDFFLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 WIGRGLLVLEGPKWLQHRKLLTPGFHYDVLKPYVAVFTESTRIMLDKWEEKAREGKSFDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WIGRGLLVLEGPKWLQHRKLLTPGFHYDVLKPYVAVFTESTRIMLDKWEEKAREGKSFDI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 FCDVGHMALNTLMKCTFGRGDTGLGHSRDSSYYLAVSDLTLLMQQRLVSFQYHNDFIYWL
:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FCDVGHMALNTLMKCTFGRGDTGLGH-RDSSYYLAVSDLTLLMQQRLVSFQYHNDFIYWL
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TPHGRRFLRACQVAHDHTDQVIRERKAALQDEKVRKKIQNRRHLDFLDILLGARDEDDIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TPHGRRFLRACQVAHDHTDQVIRERKAALQDEKVRKKIQNRRHLDFLDILLGARDEDDIK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LSDADLRAEVDTFMFEGHDTTTSGISWFLYCMALYPEHQHRCREEVREILGDQDFFQWDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSDADLRAEVDTFMFEGHDTTTSGISWFLYCMALYPEHQHRCREEVREILGDQDFFQWDD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LGKMTYLTMCIKESFRLYPPVPQVYRQLSKPVTFVDGRSLPAGSLISMHIYALHRNSAVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LGKMTYLTMCIKESFRLYPPVPQVYRQLSKPVTFVDGRSLPAGSLISMHIYALHRNSAVW
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 PDPEVFDSLRFSTENASKRHPFAFMPFSAGPRNCIGQQFAMSEMKVVTAMCLLRFEFSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PDPEVFDSLRFSTENASKRHPFAFMPFSAGPRNCIGQQFAMSEMKVVTAMCLLRFEFSLD
420 430 440 450 460 470
490 500 510
pF1KE4 PSRLPIKMPQLVLRSKNGFHLHLKPLGPGSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PSRLPIKMPQLVLRSKNGFHLHLKPLGPGSGK
480 490 500 510
>>CCDS81318.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 (497 aa)
initn: 2702 init1: 2702 opt: 2702 Z-score: 3249.0 bits: 610.7 E(32554): 1.2e-174
Smith-Waterman score: 3398; 97.1% identity (97.1% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MVPSFLSLSFSSLGLWASGLILVLGFLKLIHLLLRRQTLAKAMDKFPGPPTHWLFGHALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MVPSFLSLSFSSLGLWASGLILVLGFLKLIHLLLRRQTLAKAMDKFPGPPTHWLFGHALE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 IQETGSLDKVVSWAHQFPYAHPLWFGQFIGFLNIYEPDYAKAVYSRGDPKAPDVYDFFLQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IQETGSLDKVVSWAHQFPYAHPLWFGQFIGFLNIYEPDYAKAVYSRG-------------
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 WIGRGLLVLEGPKWLQHRKLLTPGFHYDVLKPYVAVFTESTRIMLDKWEEKAREGKSFDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 --GRGLLVLEGPKWLQHRKLLTPGFHYDVLKPYVAVFTESTRIMLDKWEEKAREGKSFDI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 FCDVGHMALNTLMKCTFGRGDTGLGHSRDSSYYLAVSDLTLLMQQRLVSFQYHNDFIYWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FCDVGHMALNTLMKCTFGRGDTGLGHSRDSSYYLAVSDLTLLMQQRLVSFQYHNDFIYWL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TPHGRRFLRACQVAHDHTDQVIRERKAALQDEKVRKKIQNRRHLDFLDILLGARDEDDIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TPHGRRFLRACQVAHDHTDQVIRERKAALQDEKVRKKIQNRRHLDFLDILLGARDEDDIK
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LSDADLRAEVDTFMFEGHDTTTSGISWFLYCMALYPEHQHRCREEVREILGDQDFFQWDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LSDADLRAEVDTFMFEGHDTTTSGISWFLYCMALYPEHQHRCREEVREILGDQDFFQWDD
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LGKMTYLTMCIKESFRLYPPVPQVYRQLSKPVTFVDGRSLPAGSLISMHIYALHRNSAVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LGKMTYLTMCIKESFRLYPPVPQVYRQLSKPVTFVDGRSLPAGSLISMHIYALHRNSAVW
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 PDPEVFDSLRFSTENASKRHPFAFMPFSAGPRNCIGQQFAMSEMKVVTAMCLLRFEFSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PDPEVFDSLRFSTENASKRHPFAFMPFSAGPRNCIGQQFAMSEMKVVTAMCLLRFEFSLD
410 420 430 440 450 460
490 500 510
pF1KE4 PSRLPIKMPQLVLRSKNGFHLHLKPLGPGSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PSRLPIKMPQLVLRSKNGFHLHLKPLGPGSGK
470 480 490
>>CCDS543.1 CYP4A11 gene_id:1579|Hs108|chr1 (519 aa)
initn: 1810 init1: 1537 opt: 1804 Z-score: 2168.7 bits: 410.9 E(32554): 1.8e-114
Smith-Waterman score: 1804; 52.6% identity (76.3% similar) in 506 aa overlap (1-506:6-509)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MVPSFLSLSFSSLGLWASGLILVLGFLKLIHLLLRRQTLAKAMDKFPGPPTHWLF
. :: : . :.. :: :::.: ..: ..: :.:: : ::...:: ::.::::
CCDS54 MSVSVLSPSRLLGDVSGILQAASLLILLLLLIKAVQLYLHRQWLLKALQQFPCPPSHWLF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GHALEIQETGSLDKVVSWAHQFPYAHPLWFGQFIGFLNIYEPDYAKAVYSRGDPKAPDVY
:: :.:. :... .:.. :: : : :. ...:.::: :.. .:.:::. :
CCDS54 GHIQELQQDQELQRIQKWVETFPSACPHWLWGGKVRVQLYDPDYMKVILGRSDPKSHGSY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 DFFLQWIGRGLLVLEGPKWLQHRKLLTPGFHYDVLKPYVAVFTESTRIMLDKWEEKAREG
:. ::: :::.:.: :.:::..:::.::::.:::::.....:.:.::::::: .
CCDS54 RFLAPWIGYGLLLLNGQTWFQHRRMLTPAFHYDILKPYVGLMADSVRVMLDKWEELLGQD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 KSFDIFCDVGHMALNTLMKCTFGRGDTGLGHSRDSSYYLAVSDLTLLMQQRLVSFQYHND
. ...: :. :.:.:.:::.:.. . ..:: :.:::. :. .:. . ..::
CCDS54 SPLEVFQHVSLMTLDTIMKCAFSHQGSIQVDRNSQSYIQAISDLNNLVFSRVRNAFHQND
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 FIYWLTPHGRRFLRACQVAHDHTDQVIRERKAALQDEKVRKKIQNRRHLDFLDILLGARD
:: :: :: ::::.::.::::::. ::: :: : .::. .:::::::::: :.
CCDS54 TIYSLTSAGRWTHRACQLAHQHTDQVIQLRKAQLQKEGELEKIKRKRHLDFLDILLLAKM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 EDDIKLSDADLRAEVDTFMFEGHDTTTSGISWFLYCMALYPEHQHRCREEVREILGDQDF
:. ::: :::::::::::::::::.:::::.:: .: .:.::.:::::.. .:::
CCDS54 ENGSILSDKDLRAEVDTFMFEGHDTTASGISWILYALATHPKHQERCREEIHSLLGDGAS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 FQWDDLGKMTYLTMCIKESFRLYPPVPQVYRQLSKPVTFVDGRSLPAGSLISMHIYALHR
. :. : .: : ::::::..::::::: . :.:: :::: :::::: : .. . ::.::.
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. ...: :. :.:.:.:: .:.. . ..:: :.:::. :. . . ..::
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.. .:. : . : :. :..::..:: .:.: :... ..:. :::::::.:..:.
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CCDS74 AEMKVVLALTLLRFRI-LPDHREPRRTPEIVLRAEDGLWLRVEPLG
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::::. .:: :.. :.:: : : ..: :. . .. :: :: .
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CCDS12 WFWGHQGLVTPTEEGMKTLTQLVTTYPQGFKLWLGPTFPLLILCHPDIIRPITSASAAVA
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CCDS12 PKDMIFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNKSVNIMHDKW
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