Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4485
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4485, 501 aa
1>>>pF1KE4485 501 - 501 aa - 501 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0504+/-0.000458; mu= 14.0140+/- 0.028
mean_var=74.2371+/-14.904, 0's: 0 Z-trim(109.8): 44 B-trim: 101 in 1/49
Lambda= 0.148855
statistics sampled from 18033 (18073) to 18033 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 9.190
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001340 (OMIM: 603084,615281) aspartate--tRNA li ( 501) 3310 720.8 2.3e-207
XP_016858978 (OMIM: 603084,615281) PREDICTED: aspa ( 468) 3101 675.9 7e-194
NP_001280241 (OMIM: 603084,615281) aspartate--tRNA ( 401) 2666 582.4 8.1e-166
XP_005266757 (OMIM: 108410) PREDICTED: asparagine- ( 547) 523 122.2 3.7e-27
NP_004530 (OMIM: 108410) asparagine--tRNA ligase, ( 548) 523 122.2 3.7e-27
NP_078954 (OMIM: 612803,616239) probable asparagin ( 477) 394 94.5 7.1e-19
XP_011543555 (OMIM: 612803,616239) PREDICTED: prob ( 468) 373 90.0 1.6e-17
XP_016873792 (OMIM: 612803,616239) PREDICTED: prob ( 250) 336 82.0 2.2e-15
NP_001230180 (OMIM: 612803,616239) probable aspara ( 250) 336 82.0 2.2e-15
XP_016873793 (OMIM: 612803,616239) PREDICTED: prob ( 241) 315 77.5 4.9e-14
XP_011508013 (OMIM: 610956,611105) PREDICTED: aspa ( 482) 226 58.5 5.2e-08
XP_016873791 (OMIM: 612803,616239) PREDICTED: prob ( 310) 195 51.7 3.5e-06
XP_006711490 (OMIM: 610956,611105) PREDICTED: aspa ( 594) 178 48.2 8e-05
NP_060592 (OMIM: 610956,611105) aspartate--tRNA li ( 645) 178 48.2 8.6e-05
XP_016878706 (OMIM: 601421,613641,613916) PREDICTE ( 441) 153 42.8 0.0025
NP_005539 (OMIM: 601421,613641,613916) lysine--tRN ( 597) 153 42.8 0.0033
NP_001123561 (OMIM: 601421,613641,613916) lysine-- ( 625) 153 42.8 0.0035
>>NP_001340 (OMIM: 603084,615281) aspartate--tRNA ligase (501 aa)
initn: 3310 init1: 3310 opt: 3310 Z-score: 3843.8 bits: 720.8 E(85289): 2.3e-207
Smith-Waterman score: 3310; 100.0% identity (100.0% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPSASASRKSQEKPREIMDAAEDYAKERYGISSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTIQKADEVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPSASASRKSQEKPREIMDAAEDYAKERYGISSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTIQKADEVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 WVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISLAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISLAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 KNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 EVMEEIADTMVQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVMEEIADTMVQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 EMGDEDDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EMGDEDDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 RGEEILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGEEILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLF
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE4 LGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
:::::::::::::::::::::
NP_001 LGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
490 500
>>XP_016858978 (OMIM: 603084,615281) PREDICTED: aspartat (468 aa)
initn: 3101 init1: 3101 opt: 3101 Z-score: 3601.7 bits: 675.9 E(85289): 7e-194
Smith-Waterman score: 3101; 100.0% identity (100.0% similar) in 468 aa overlap (34-501:1-468)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 ASASRKSQEKPREIMDAAEDYAKERYGISSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTIQKADEVVWVR
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MIQSQEKPDRVLVRVRDLTIQKADEVVWVR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGVVRKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGVVRKV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 NQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISLAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRLDNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISLAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRLDNR
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VIDLRTSTSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYFKNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIDLRTSTSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYFKNN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 AYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYHEVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYHEVM
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 EEIADTMVQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGVEMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EEIADTMVQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGVEMG
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 DEDDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFMRGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DEDDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFMRGE
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGL
400 410 420 430 440 450
490 500
pF1KE4 HNVRQTSMFPRDPKRLTP
::::::::::::::::::
XP_016 HNVRQTSMFPRDPKRLTP
460
>>NP_001280241 (OMIM: 603084,615281) aspartate--tRNA lig (401 aa)
initn: 2666 init1: 2666 opt: 2666 Z-score: 3098.0 bits: 582.4 E(85289): 8.1e-166
Smith-Waterman score: 2666; 100.0% identity (100.0% similar) in 401 aa overlap (101-501:1-401)
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 AKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGVVRKVNQKIGSC
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVKFAANINKESIVDVEGVVRKVNQKIGSC
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 TQQDVELHVQKIYVISLAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TQQDVELHVQKIYVISLAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRTS
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 TSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYFKNNAYLAQSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYFKNNAYLAQSP
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 QLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYHEVMEEIADTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYHEVMEEIADTM
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 VQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGVEMGDEDDLST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGVEMGDEDDLST
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 PNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFMRGEEILSGAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFMRGEEILSGAQ
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 RIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGLHNVRQTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGLHNVRQTS
340 350 360 370 380 390
500
pF1KE4 MFPRDPKRLTP
:::::::::::
NP_001 MFPRDPKRLTP
400
>>XP_005266757 (OMIM: 108410) PREDICTED: asparagine--tRN (547 aa)
initn: 439 init1: 182 opt: 523 Z-score: 608.6 bits: 122.2 E(85289): 3.7e-27
Smith-Waterman score: 529; 26.9% identity (58.5% similar) in 472 aa overlap (41-501:109-547)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 QEKPREIMDAAEDYAKERYGISSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTIQKADEVVWVRARVHTSR
:. :.. : ....: : . :: :
XP_005 REKKEAEDSLRREKNLEEAKKITIKNDPSLPEPKCVKIGALEGYRGQRVK-VFGWVHRLR
80 90 100 110 120 130
80 90 100 110 120
pF1KE4 AKGKQC-FLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGVVRKVNQKIGS
.::. :::::. .: ..: :. . . .. .. :: : : :.. ... : :.
XP_005 RQGKNLMFLVLRDGTGYLQCVLA--DELCQCYN--GVLLSTESSVAVYGML-NLTPK-GK
140 150 160 170 180 190
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 CTQQDVELHVQKIYVISLAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRT
. :: . .:.:: :. . :.. :..:.:: . .:
XP_005 QAPGGHELSCDFWELIGLAPAG---GADNLINEESD----------VDVQLNNRHMMIRG
200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 STSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYFKNNAYLAQS
. . ... .: . . ::. ....:. :. : .... ::::..: ..:: ..:.:.::
XP_005 ENMSKILKARSMVTRCFRDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGATLFKLDYFGEEAFLTQS
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 PQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYHEVMEEIADT
::: . :. : . :: :. .:::.: :.:::.:.. .. : : . ...... :
XP_005 SQLYLETCLPA-LGDVFCIAQSYRAEQSRTRRHLAEYTHVEAECPF-LTFDDLLNRLEDL
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 MVQIF-KGLQERFQTEIQTVNKQF--PCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGVEMGDE-
. .. . :. . .. .: .: : .::: :..: .:.. :.: :. :
XP_005 VCDVVDRILKSPAGSIVHELNPNFQPPKRPFK------RMNYSDAIVWLKEHDVKKEDGT
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 -----DDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFM
.:. :.:. ..: .: ..:. .. :: . :.. . ..: :..:
XP_005 FYEFGEDIPEAPERLMTDTINEPI-----LLCRFPVEIKSFYMQRCPEDSRLTESVDVLM
420 430 440 450 460
430 440 450 460 470
pF1KE4 RGE-EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTML
. ::..:..:: : . . ..::: : :. ..:. ::.: :.::::
XP_005 PNVGEIVGGSMRIFDSEEILAGYKREGIDPTPYYWYTDQRKYGTCPHGGYGLGLERFLTW
470 480 490 500 510 520
480 490 500
pF1KE4 FLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
.:. ...:.. ..:: .: ::
XP_005 ILNRYHIRDVCLYPRFVQRCTP
530 540
>>NP_004530 (OMIM: 108410) asparagine--tRNA ligase, cyto (548 aa)
initn: 439 init1: 182 opt: 523 Z-score: 608.6 bits: 122.2 E(85289): 3.7e-27
Smith-Waterman score: 529; 26.9% identity (58.5% similar) in 472 aa overlap (41-501:110-548)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 QEKPREIMDAAEDYAKERYGISSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTIQKADEVVWVRARVHTSR
:. :.. : ....: : . :: :
NP_004 REKKEAEDSLRREKNLEEAKKITIKNDPSLPEPKCVKIGALEGYRGQRVK-VFGWVHRLR
80 90 100 110 120 130
80 90 100 110 120
pF1KE4 AKGKQC-FLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGVVRKVNQKIGS
.::. :::::. .: ..: :. . . .. .. :: : : :.. ... : :.
NP_004 RQGKNLMFLVLRDGTGYLQCVLA--DELCQCYN--GVLLSTESSVAVYGML-NLTPK-GK
140 150 160 170 180 190
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 CTQQDVELHVQKIYVISLAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRT
. :: . .:.:: :. . :.. :..:.:: . .:
NP_004 QAPGGHELSCDFWELIGLAPAG---GADNLINEESD----------VDVQLNNRHMMIRG
200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 STSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYFKNNAYLAQS
. . ... .: . . ::. ....:. :. : .... ::::..: ..:: ..:.:.::
NP_004 ENMSKILKARSMVTRCFRDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGATLFKLDYFGEEAFLTQS
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 PQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYHEVMEEIADT
::: . :. : . :: :. .:::.: :.:::.:.. .. : : . ...... :
NP_004 SQLYLETCLPA-LGDVFCIAQSYRAEQSRTRRHLAEYTHVEAECPF-LTFDDLLNRLEDL
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 MVQIF-KGLQERFQTEIQTVNKQF--PCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGVEMGDE-
. .. . :. . .. .: .: : .::: :..: .:.. :.: :. :
NP_004 VCDVVDRILKSPAGSIVHELNPNFQPPKRPFK------RMNYSDAIVWLKEHDVKKEDGT
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 -----DDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFM
.:. :.:. ..: .: ..:. .. :: . :.. . ..: :..:
NP_004 FYEFGEDIPEAPERLMTDTINEPI-----LLCRFPVEIKSFYMQRCPEDSRLTESVDVLM
420 430 440 450 460
430 440 450 460 470
pF1KE4 RGE-EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTML
. ::..:..:: : . . ..::: : :. ..:. ::.: :.::::
NP_004 PNVGEIVGGSMRIFDSEEILAGYKREGIDPTPYYWYTDQRKYGTCPHGGYGLGLERFLTW
470 480 490 500 510 520
480 490 500
pF1KE4 FLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
.:. ...:.. ..:: .: ::
NP_004 ILNRYHIRDVCLYPRFVQRCTP
530 540
>>NP_078954 (OMIM: 612803,616239) probable asparagine--t (477 aa)
initn: 400 init1: 137 opt: 394 Z-score: 459.8 bits: 94.5 E(85289): 7.1e-19
Smith-Waterman score: 460; 27.0% identity (57.7% similar) in 492 aa overlap (32-496:15-472)
10 20 30 40 50
pF1KE4 PSASASRKSQEKPREIMDAAEDYAKERYGISSMIQSQEKPDRVLVRVRD-LTIQKAD-EV
:: ..::. : ::: : :.:. :
NP_078 MLGVRCLLRSVRFCSSAPFPKHKPSAKL-SVRDALGAQNASGER
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 VWVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGV
. ... ... :.. . :: . . . ....: .:.: . . ..: : :.:.:
NP_078 IKIQGWIRSVRSQKEVLFLHVNDGS-SLESLQVVADSGLD-----SRELNFGSSVEVQGQ
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISLAEPR-LPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDT
. : .: .:.:::...:: ::. . . .:.. . : : . :
NP_078 LIKSPSK-----RQNVELKAEKIKVIGNCDAKDFPIKYKE--RHPLE-------YLRQYP
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RLDNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTV-
.. : :.. ...:..: .. . ..:::.:.:: : : :::....: .
NP_078 HFRCR-----TNVLGSILRIRSEATAAIHSFFKDSGFVHIHTPIITSNDSEGAGELFQLE
150 160 170 180 190
240 250 260 270 280
pF1KE4 ----------SYFKNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFV
..:. :.:. : ::. .. . . : .::..::.::::.:...:::.::
NP_078 PSGKLKVPEENFFNVPAFLTVSGQLHLEV-MSGAFTQVFTFGPTFRAENSQSRRHLAEFY
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 GLDIEMAFNYHYHEVMEEIADTMVQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLR--
.. :..: ...:. : . . . . ... .: . :: :.
NP_078 MIEAEISFVDSLQDLMQVIEELFKATTMMVLSKCPEDVELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNN
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390
pF1KE4 ---LEYCEALAMLREAGV------EMGDEDDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPL
. : ::. .:..:. : : :: : .:: .:::. . .... :::
NP_078 FLIISYTEAVEILKQASQNFTFTPEWGA--DLRTEHEK---YLVKHCGNIPVFVIN-YPL
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 AVRPFYTMPDPRNPKQS-NSYDMFMRGE-EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKA
...::: . .:... . :... : :...:. : . ..: :: . :. : .
NP_078 TLKPFYMRDNEDGPQHTVAAVDLLVPGVGELFGGGLREERYHFLEERLARSGLT-EVYQW
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500
pF1KE4 YIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
:.: :::. ::.: :.:.:: . .::. :.... ::: :
NP_078 YLDLRRFGSVPHGGFGMGFERYLQCILGVDNIKDVIPFPRFPHSCLL
440 450 460 470
>>XP_011543555 (OMIM: 612803,616239) PREDICTED: probable (468 aa)
initn: 400 init1: 137 opt: 373 Z-score: 435.6 bits: 90.0 E(85289): 1.6e-17
Smith-Waterman score: 439; 26.8% identity (57.3% similar) in 492 aa overlap (32-496:15-463)
10 20 30 40 50
pF1KE4 PSASASRKSQEKPREIMDAAEDYAKERYGISSMIQSQEKPDRVLVRVRD-LTIQKAD-EV
:: ..::. : ::: : :.:. :
XP_011 MLGVRCLLRSVRFCSSAPFPKHKPSAKL-SVRDALGAQNASGER
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 VWVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGV
. ... ... :.. . :: . . . ....: .:.: . . ..: : :.:.:
XP_011 IKIQGWIRSVRSQKEVLFLHVNDGS-SLESLQVVADSGLD-----SRELNFGSSVEVQGQ
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISLAEPR-LPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDT
. : .: .:.:::...:: ::. . . .:.. . : : . :
XP_011 LIKSPSK-----RQNVELKAEKIKVIGNCDAKDFPIKYKE--RHPLE-------YLRQYP
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RLDNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTV-
.. : :.. ...:..: .. . ..:::.:.:: : : :::....: .
XP_011 HFRCR-----TNVLGSILRIRSEATAAIHSFFKDSGFVHIHTPIITSNDSEGAGELFQLE
150 160 170 180 190
240 250 260 270 280
pF1KE4 ----------SYFKNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFV
..:. :.:. : ::. .. . . : .::..::.::::.:...:::.::
XP_011 PSGKLKVPEENFFNVPAFLTVSGQLHLEV-MSGAFTQVFTFGPTFRAENSQSRRHLAEFY
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 GLDIEMAFNYHYHEVMEEIADTMVQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLR--
.. :..: ...:. : . . . . ... .: . :: :.
XP_011 MIEAEISFVDSLQDLMQVIEELFKATTMMVLSKCPEDVELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNN
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390
pF1KE4 ---LEYCEALAMLREAGV------EMGDEDDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPL
. : ::. .:..:. : : :: : .:: .:::. . .... :::
XP_011 FLIISYTEAVEILKQASQNFTFTPEWGA--DLRTEHEK---YLVKHCGNIPVFVIN-YPL
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 AVRPFYTMPDPRNPKQS-NSYDMFMRGE-EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKA
...::: . .:... . :... : :...:. : :: .: .. :..
XP_011 TLKPFYMRDNEDGPQHTVAAVDLLVPGVGELFGGGLR-------EER--YHFLE-ERLAR
380 390 400 410 420
460 470 480 490 500
pF1KE4 YIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
:.: :::. ::.: :.:.:: . .::. :.... ::: :
XP_011 YLDLRRFGSVPHGGFGMGFERYLQCILGVDNIKDVIPFPRFPHSCLL
430 440 450 460
>>XP_016873792 (OMIM: 612803,616239) PREDICTED: probable (250 aa)
initn: 291 init1: 137 opt: 336 Z-score: 397.0 bits: 82.0 E(85289): 2.2e-15
Smith-Waterman score: 355; 29.8% identity (60.1% similar) in 248 aa overlap (262-496:5-245)
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ANVFTVSYFKNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDI
: .::..::.::::.:...:::.:: ..
XP_016 MSGAFTQVFTFGPTFRAENSQSRRHLAEFYMIEA
10 20 30
300 310 320 330 340
pF1KE4 EMAFNYHYHEVMEEIADTMVQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLR-----L
:..: ...:. : . . . . ... .: . :: :. .
XP_016 EISFVDSLQDLMQVIEELFKATTMMVLSKCPEDVELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNNFLII
40 50 60 70 80 90
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 EYCEALAMLREAGV------EMGDEDDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRP
: ::. .:..:. : : :: : .:: .:::. . .... :::...:
XP_016 SYTEAVEILKQASQNFTFTPEWGA--DLRTEHEK---YLVKHCGNIPVFVIN-YPLTLKP
100 110 120 130 140
410 420 430 440 450
pF1KE4 FYTMPDPRNPKQS-NSYDMFMRGE-EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDS
:: . .:... . :... : :...:. : . ..: :: . :. : . :.:
XP_016 FYMRDNEDGPQHTVAAVDLLVPGVGELFGGGLREERYHFLEERLARSGLT-EVYQWYLDL
150 160 170 180 190 200
460 470 480 490 500
pF1KE4 FRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
:::. ::.: :.:.:: . .::. :.... ::: :
XP_016 RRFGSVPHGGFGMGFERYLQCILGVDNIKDVIPFPRFPHSCLL
210 220 230 240 250
>>NP_001230180 (OMIM: 612803,616239) probable asparagine (250 aa)
initn: 291 init1: 137 opt: 336 Z-score: 397.0 bits: 82.0 E(85289): 2.2e-15
Smith-Waterman score: 355; 29.8% identity (60.1% similar) in 248 aa overlap (262-496:5-245)
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ANVFTVSYFKNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDI
: .::..::.::::.:...:::.:: ..
NP_001 MSGAFTQVFTFGPTFRAENSQSRRHLAEFYMIEA
10 20 30
300 310 320 330 340
pF1KE4 EMAFNYHYHEVMEEIADTMVQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLR-----L
:..: ...:. : . . . . ... .: . :: :. .
NP_001 EISFVDSLQDLMQVIEELFKATTMMVLSKCPEDVELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNNFLII
40 50 60 70 80 90
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 EYCEALAMLREAGV------EMGDEDDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRP
: ::. .:..:. : : :: : .:: .:::. . .... :::...:
NP_001 SYTEAVEILKQASQNFTFTPEWGA--DLRTEHEK---YLVKHCGNIPVFVIN-YPLTLKP
100 110 120 130 140
410 420 430 440 450
pF1KE4 FYTMPDPRNPKQS-NSYDMFMRGE-EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDS
:: . .:... . :... : :...:. : . ..: :: . :. : . :.:
NP_001 FYMRDNEDGPQHTVAAVDLLVPGVGELFGGGLREERYHFLEERLARSGLT-EVYQWYLDL
150 160 170 180 190 200
460 470 480 490 500
pF1KE4 FRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
:::. ::.: :.:.:: . .::. :.... ::: :
NP_001 RRFGSVPHGGFGMGFERYLQCILGVDNIKDVIPFPRFPHSCLL
210 220 230 240 250
>>XP_016873793 (OMIM: 612803,616239) PREDICTED: probable (241 aa)
initn: 291 init1: 137 opt: 315 Z-score: 372.9 bits: 77.5 E(85289): 4.9e-14
Smith-Waterman score: 334; 29.4% identity (59.3% similar) in 248 aa overlap (262-496:5-236)
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ANVFTVSYFKNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDI
: .::..::.::::.:...:::.:: ..
XP_016 MSGAFTQVFTFGPTFRAENSQSRRHLAEFYMIEA
10 20 30
300 310 320 330 340
pF1KE4 EMAFNYHYHEVMEEIADTMVQIFKGLQERFQTEIQTVNKQFPCEPFKFLEPTLR-----L
:..: ...:. : . . . . ... .: . :: :. .
XP_016 EISFVDSLQDLMQVIEELFKATTMMVLSKCPEDVELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNNFLII
40 50 60 70 80 90
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 EYCEALAMLREAGV------EMGDEDDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRP
: ::. .:..:. : : :: : .:: .:::. . .... :::...:
XP_016 SYTEAVEILKQASQNFTFTPEWGA--DLRTEHEK---YLVKHCGNIPVFVIN-YPLTLKP
100 110 120 130 140
410 420 430 440 450
pF1KE4 FYTMPDPRNPKQS-NSYDMFMRGE-EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDS
:: . .:... . :... : :...:. : :: .: .. :.. :.:
XP_016 FYMRDNEDGPQHTVAAVDLLVPGVGELFGGGLR-------EER--YHFLE-ERLARYLDL
150 160 170 180 190
460 470 480 490 500
pF1KE4 FRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
:::. ::.: :.:.:: . .::. :.... ::: :
XP_016 RRFGSVPHGGFGMGFERYLQCILGVDNIKDVIPFPRFPHSCLL
200 210 220 230 240
501 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:50:20 2016 done: Sun Nov 6 00:50:21 2016
Total Scan time: 9.190 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]