Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4472
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4472, 493 aa
1>>>pF1KE4472 493 - 493 aa - 493 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7549+/-0.00113; mu= 14.7631+/- 0.067
mean_var=56.5923+/-11.743, 0's: 0 Z-trim(100.6): 35 B-trim: 209 in 1/48
Lambda= 0.170489
statistics sampled from 6168 (6183) to 6168 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 2.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10772.1 CETP gene_id:1071|Hs108|chr16 ( 493) 3175 789.6 0
CCDS67032.1 CETP gene_id:1071|Hs108|chr16 ( 433) 1604 403.2 2.9e-112
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CCDS13387.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 441) 253 70.9 3.1e-12
CCDS56197.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 398) 249 70.0 5.6e-12
CCDS13906.1 BPIFC gene_id:254240|Hs108|chr22 ( 507) 249 70.0 7.1e-12
>>CCDS10772.1 CETP gene_id:1071|Hs108|chr16 (493 aa)
initn: 3175 init1: 3175 opt: 3175 Z-score: 4216.4 bits: 789.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3175; 99.4% identity (99.8% similar) in 493 aa overlap (1-493:1-493)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MLAATVLTLALLGNAHACSKGTSHEAGIVCRITKPALLVLNHETAKVIQTAFQRASYPDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MLAATVLTLALLGNAHACSKGTSHEAGIVCRITKPALLVLNHETAKVIQTAFQRASYPDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 TGEKAMMLLGQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLKYGYTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TGEKAMMLLGQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLKYGYTT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AWWLGIDQSIDFEIDSAIDLQINTQLTCDSGRVRTDAPDCYLSFHKLLLHLQGEREPGWI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KQLFTNFISFTLKLVLKGQICKEINVISNIMADFVQTRAASILSDGDIGVDISLTGDPVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TSSYLESHHKGHFIYKNVSEDLPLPTFSPTLLGDSRMLYFWFSERVFHSLAKVAFQDGRL
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TASYLESHHKGHFIYKNVSEDLPLPTFSPTLLGDSRMLYFWFSERVFHSLAKVAFQDGRL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 MLSLMGDEFKAVLETWGFNTNQEIFQEVVGGFPSQAQVTVHCLKMPKISCQNKGVVVNSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MLSLMGDEFKAVLETWGFNTNQEIFQEVVGGFPSQAQVTVHCLKMPKISCQNKGVVVNSS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIVTTVQASYSKKKLFLSLLDFQITPKTVSNLTESSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIVTTVQASYSKKKLFLSLLDFQITPKTVSNLTESSSE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SIQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNCKGVSLFDIINPEIITRDGFLLLQMDFGF
:.::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SVQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNSKGVSLFDIINPEIITRDGFLLLQMDFGF
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 PEHLLVDFLQSLS
:::::::::::::
CCDS10 PEHLLVDFLQSLS
490
>>CCDS67032.1 CETP gene_id:1071|Hs108|chr16 (433 aa)
initn: 1604 init1: 1604 opt: 1604 Z-score: 2129.1 bits: 403.2 E(32554): 2.9e-112
Smith-Waterman score: 2637; 87.2% identity (87.6% similar) in 493 aa overlap (1-493:1-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MLAATVLTLALLGNAHACSKGTSHEAGIVCRITKPALLVLNHETAKVIQTAFQRASYPDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MLAATVLTLALLGNAHACSKGTSHEAGIVCRITKPALLVLNHETAKVIQTAFQRASYPDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 TGEKAMMLLGQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLKYGYTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 TGEKAMMLLGQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLKYGYTT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AWWLGIDQSIDFEIDSAIDLQINTQLTCDSGRVRTDAPDCYLSFHKLLLHLQGEREPGWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 AWWLGIDQSIDFEIDSAIDLQINTQLTCDSGRVRTDAPDCYLSFHKLLLHLQGEREPGWI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 KQLFTNFISFTLKLVLKGQICKEINVISNIMADFVQTRAASILSDGDIGVDISLTGDPVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 KQLFTNFISFTLKLVLKGQICKEINVISNIMADFVQTRAASILSDGDIGVDISLTGDPVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TSSYLESHHKGHFIYKNVSEDLPLPTFSPTLLGDSRMLYFWFSERVFHSLAKVAFQDGRL
:.::::::::
CCDS67 TASYLESHHK--------------------------------------------------
250
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 MLSLMGDEFKAVLETWGFNTNQEIFQEVVGGFPSQAQVTVHCLKMPKISCQNKGVVVNSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 ----------AVLETWGFNTNQEIFQEVVGGFPSQAQVTVHCLKMPKISCQNKGVVVNSS
260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIVTTVQASYSKKKLFLSLLDFQITPKTVSNLTESSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIVTTVQASYSKKKLFLSLLDFQITPKTVSNLTESSSE
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SIQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNCKGVSLFDIINPEIITRDGFLLLQMDFGF
:.::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SVQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNSKGVSLFDIINPEIITRDGFLLLQMDFGF
370 380 390 400 410 420
490
pF1KE4 PEHLLVDFLQSLS
:::::::::::::
CCDS67 PEHLLVDFLQSLS
430
>>CCDS13303.1 BPI gene_id:671|Hs108|chr20 (487 aa)
initn: 137 init1: 109 opt: 410 Z-score: 541.0 bits: 109.6 E(32554): 8.2e-24
Smith-Waterman score: 410; 23.0% identity (57.8% similar) in 488 aa overlap (4-477:16-483)
10 20 30 40
pF1KE4 MLAATVLTLALLGNAHACSKGTSHEAGIVCRITKPALLVLNHETAKVI
:....:. .:.: . . . :.: ::.. .: ... . ..
CCDS13 MRENMARGPCNAPRWASLMVLVAIGTAVTAAV----NPGVVVRISQKGLDYASQQGTAAL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 QTAFQRASYPDITGEKAMMLLGQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSV
: ..: . :: . . ::. .:......: .... :::. .: .. ::.:...
CCDS13 QKELKRIKIPDYSDSFKIKHLGKGHYSFYSMDIREFQLPSSQISMVPNVGLKFSISNANI
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 VFKGTLKYGYTTAWWLGIDQSIDFEIDS---AIDLQINTQLTCDSGRVRTDAPDCYLSFH
..: : . .: .. ..:. :.. . ::..... : ::. .: ..
CCDS13 KISGKWK---AQKRFLKMSGNFDLSIEGMSISADLKLGSNPT--SGKPTITCSSCSSHIN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 KLLLHLQGEREPGWIKQLFTNFISFTLKLVLKGQICKEI-NVISNIMADFVQTRAASILS
.. .:.. . . ::. ::: . : .:. ...:.:... : .:. . . :: .
CCDS13 SVHVHIS-KSKVGWLIQLFHKKIESALRNKMNSQVCEKVTNSVSSELQPYFQTLPVMTKI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 DGDIGVDISLTGDPVITSSYLESHHKGHFIYKNVSEDLPLPTFSPTLL----GDSRMLYF
:. :.. .:.. :. :. :. . ::.: .: . : : :.: .. . .::.:.
CCDS13 DSVAGINYGLVAPPATTAETLDVQMKGEFYSEN--HHNP-PPFAPPVMEFPAAHDRMVYL
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE4 WFSERVFHSLAKVAFQDGRLMLSLMGD----EFKAVLETWGFNTNQEIFQEVVGGFPS-Q
.:. :.. . : . : : ..: : : : : : :.: .. ::. ::. .
CCDS13 GLSDYFFNTAGLVYQEAGVLKMTLRDDMIPKESKFRLTTKFFGT---FLPEVAKKFPNMK
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 AQVTVHCLKMPKISCQNKGVVVNSSVMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIVTTVQASYSKK
:. : :..: : :.. .: :. . :... . . . . ....: ..
CCDS13 IQIHVSASTPPHLSVQPTGLTFYPAVDVQAFAVLPNSSLASLFLIGMHTTGSMEVSAESN
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 KLFLSL-LDFQITPKTVSNLTESSSESIQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNCKG
.: : :: . ::. : .:.... .. . .:.: .:. : : .
CCDS13 RLVGELKLDRLLLELKHSNIGPFPVELLQDIMNYIVPILVLPRVNEKLQKGFP-LPTPAR
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490
pF1KE4 VSLFDIINPEIITRDGFLLLQMDFGFPEHLLVDFLQSLS
:.:.... . ...:::. :
CCDS13 VQLYNVV---LQPHQNFLLFGADVVYK
470 480
>>CCDS13386.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 (493 aa)
initn: 208 init1: 99 opt: 367 Z-score: 483.7 bits: 99.0 E(32554): 1.3e-20
Smith-Waterman score: 382; 22.4% identity (55.1% similar) in 490 aa overlap (7-484:7-468)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MLAATVLTLALLGNAHACSKGTSHEAGIVCRITKPALLVLNHETAKVIQTAFQRASYPDI
: ::::..::: : . :.:. :: ....: . .. .. . ::.
CCDS13 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCK------IRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIPDL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 TGEKAMMLLGQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLKYGYTT
:.. :. :.. ......:...::.... . . ..: :.:. : :..
CCDS13 RGKE-----GHFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASL---G-LRFRRQL
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE4 AWWLGIDQSIDFEIDSAIDLQINTQLTCD-SGRVRTDAPDCYLSFHKLLLHLQGEREPGW
.:. : . ..... . .:. : .::.... .: : .. . : .
CCDS13 LYWFFYDGGYINASAEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKK--
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 IKQLFTNFISFTLKLVLKGQICKEI----NVISNIMADFVQTRAASILSDGDIGVDISLT
. .....::. ....:. ::: . .:. : . : : .:. :. : .:.: ::
CCDS13 VYDFLSTFITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRS-SV--DELVGIDYSLM
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 GDPVITSSYLESHHKGHFI-YKNVSEDLPLPTFSPTLLGDSRMLYFWFSERVFHSLAKVA
::: ..: :. .: :. . . .:: . : : . ::.: ::: : : .
CCDS13 KDPVASTSNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESY
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 FQDGRLMLSLMGD----EFKAVLETWGFNTNQEIFQEVVGGFPSQAQVTVHCLKMPKISC
:. : :.: :.:: .. .:.. :.. . :. : .. .. : :. .
CCDS13 FRAGALQLLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIVLLSPAVID---SPLKLELRVLAPPRCTI
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KE4 QNKGVVVNSSVMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIVTTVQASYSKKKLF--LSLLDFQITP
. .:.... .. : . . ::: . .. : ... . : : :.: :.:
CCDS13 KPSGTTISVTASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYS
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 KTVSNLTESSSESIQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNCKGVSLFDIINPEIITR
. : : . .:. :..:. .:. .... . . .:... .. . ..
CCDS13 NH-SALESLALIPLQAPLKTMLQ-IGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINF---VHEVVTNH
400 410 420 430 440 450
470 480 490
pF1KE4 DGFLLLQMDFGFPEHLLVDFLQSLS
::: . :. : . :
CCDS13 AGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV
460 470 480 490
>>CCDS13304.1 LBP gene_id:3929|Hs108|chr20 (481 aa)
initn: 170 init1: 70 opt: 341 Z-score: 449.4 bits: 92.6 E(32554): 1e-18
Smith-Waterman score: 341; 23.0% identity (55.3% similar) in 461 aa overlap (7-460:11-461)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MLAATVLTLALLGNAHACSKGTSHEAGIVCRITKPALLVLNHETAKVIQTAFQRAS
. :::: .. . :.. :.: ::: .: .: ..:. . : .
CCDS13 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGAN--PGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 YPDITGEKAMMLLGQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLKY
::.::. . .:. .: .:...: . : .. : ......::.. :. .: :
CCDS13 LPDFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 GYTTAWWLGIDQSIDFEIDSAIDLQINTQLTCDS-GRVRTDAPDCYLSFHKLLLHLQGER
. .. .. :.: . ..:....: : .: :: . : .: .. . . ..:.
CCDS13 RKS---FFKLQGSFDVSV-KGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EPGWIKQLFTNFISFTLKLVLKGQICKEIN-VISNIMADFVQTRAASILSDGDIGVDISL
::. .:: : : .. ::...::. :. .:. . ..:: .. :. .: ::
CCDS13 --GWLLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 TGDPVITSSYLESHHKGHFIYKNVSEDLPLPTFSPTLLGD-SRMLYFWFSERVFHSLAKV
. : :...:: ::.....: . : . .: . ..:.:: .:. ::.. . :
CCDS13 VEAPRATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE4 AFQDGRLMLSLMGD----EFKAVLETWGFNTNQEIFQEVVGGFPSQAQVTVHCLKMPKIS
..: : .:. : . . : : .: . .. .. . : .: . ..:
CCDS13 YHEEGYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 CQNKGVVVNSSVMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIVTTVQASYSKKKLFLSLLDFQITPK
: .: . . :.: ... . .. .:. . :: ::. .. :
CCDS13 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 TVSNLTESSSESIQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNCKGVSLFDIINPEIITRD
:.. ..: ....:. .: . :. ..: : : : :.:.:.
CCDS13 E-SKVGLFNAELLEALLNYYILNTFYPKFNDKLAEGFP-LPLLKRVQLYDLGLQIHKDFL
420 430 440 450 460 470
470 480 490
pF1KE4 GFLLLQMDFGFPEHLLVDFLQSLS
CCDS13 FLGANVQYMRV
480
>>CCDS56196.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 (405 aa)
initn: 179 init1: 99 opt: 279 Z-score: 368.3 bits: 77.3 E(32554): 3.4e-14
Smith-Waterman score: 279; 21.9% identity (53.3% similar) in 383 aa overlap (114-484:11-380)
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 LSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLKYGYTTAWWLGIDQSIDFEIDSAIDLQIN
:.. .:. : . ..... .
CCDS56 MLQITNASLGLRFRRQLLYWFFYDGGYINASAEGVSIRTG
10 20 30 40
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 TQLTCD-SGRVRTDAPDCYLSFHKLLLHLQGEREPGWIKQLFTNFISFTLKLVLKGQICK
.:. : .::.... .: : .. . : . . .....::. ....:. :::
CCDS56 LELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKK--VYDFLSTFITSGMRFLLNQQICP
50 60 70 80 90
210 220 230 240 250
pF1KE4 EI----NVISNIMADFVQTRAASILSDGDIGVDISLTGDPVITSSYLESHHKGHFI-YKN
. .:. : . : : .:. :. : .:.: :: ::: ..: :. .: :. .
CCDS56 VLYHAGTVLLNSLLDTVPVRS-SV--DELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFFPLTE
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 VSEDLPLPTFSPTLLGDSRMLYFWFSERVFHSLAKVAFQDGRLMLSLMGD----EFKAVL
. .:: . : : . ::.: ::: : : . :. : :.: :.:: .. .:
CCDS56 RNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDLDMLL
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 ETWGFNTNQEIFQEVVGGFPSQAQVTVHCLKMPKISCQNKGVVVNSSVMVKFLFPRPDQQ
.. :.. . :. : .. .. : :. . . .:.... .. : . . :::
CCDS56 RATYFGSIVLLSPAVI---DSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPDQP
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 HSVAYTFEEDIVTTVQASYSKKKLF--LSLLDFQITPKTVSNLTESSSESIQSFLQSMIT
. .. : ... . : : :.: :.: . : : . .:. :..:.
CCDS56 EVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNH-SALESLALIPLQAPLKTMLQ
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 AVGIPEVMSRLEVVFTALMNCKGVSLFDIINPEIITRDGFLLLQMDFGFPEHLLVDFLQS
.:. .... . . .:... .. . .. ::: . :. : . :
CCDS56 -IGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINF---VHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKN
340 350 360 370 380
pF1KE4 LS
CCDS56 RPADVRASTAPTPSTAAV
390 400
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CCDS13 RGKE-----GHFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLY--
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...::. ....:. ::: . .:. : . : : .:. :. : .:.: ::
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CCDS13 DPVASTSNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYF
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. : :.: :.:: .. .:.. :.. . :. : .. .. : :. . .
CCDS13 RAGALQLLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIVLLSPAVID---SPLKLELRVLAPPRCTIK
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.:.... .. : . . ::: . .. : ... . : : :.: :.: .
CCDS13 PSGTTISVTASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSN
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: : . .:. :..:. .:. .... . . .:... .. . ..
CCDS13 H-SALESLALIPLQAPLKTMLQ-IGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINF---VHEVVTNHA
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::: . :. : . :
CCDS13 GFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV
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:. : . : : .:.. : .:.: :: ::: ..: :. .: :. . . .::
CCDS56 VLLNSLLDTVPVRSSV---DELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPN
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. : : . ::.: ::: : : . :. : :.: :.:: .. .:.. :..
CCDS56 RAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGS
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. :. . : . .. : : :. . . .:.... .. : . . ::: . ..
CCDS56 IVLLSPAVIDS-PLKLELRV--LAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPDQPEVQLSSM
220 230 240 250 260 270
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CCDS56 TMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNH-SALESLALIPLQAPLKTMLQ-IGVMPM
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CCDS56 LNERTWRGVQIPLPEGI---NFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADVRA
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CCDS56 STAPTPSTAAV
390
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pF1KE4 PDITGEKAMMLL--GQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLK
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CCDS13 PDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANI--STD
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.:. . . . :. .... : : :. ::: .. . . ..::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]