Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4459
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4459, 476 aa
1>>>pF1KE4459 476 - 476 aa - 476 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2025+/-0.000731; mu= 18.5972+/- 0.044
mean_var=67.9784+/-13.677, 0's: 0 Z-trim(109.1): 22 B-trim: 47 in 1/50
Lambda= 0.155557
statistics sampled from 10623 (10642) to 10623 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.327), width: 16
Scan time: 2.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3810.1 CPE gene_id:1363|Hs108|chr4 ( 476) 3239 735.8 2.4e-212
CCDS7486.1 CPN1 gene_id:1369|Hs108|chr10 ( 458) 1411 325.5 7.3e-89
CCDS43212.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 515) 1359 313.9 2.6e-85
CCDS3404.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 641) 1359 313.9 3.1e-85
CCDS33953.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 652) 1359 313.9 3.2e-85
CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 ( 734) 1339 309.5 7.8e-84
CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 ( 756) 1335 308.6 1.5e-83
CCDS56025.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1133) 828 194.9 3.7e-49
CCDS11257.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1380) 828 195.0 4.3e-49
CCDS8987.1 CPM gene_id:1368|Hs108|chr12 ( 443) 657 156.3 6.2e-38
CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7 (1158) 556 133.9 8.9e-31
>>CCDS3810.1 CPE gene_id:1363|Hs108|chr4 (476 aa)
initn: 3239 init1: 3239 opt: 3239 Z-score: 3925.7 bits: 735.8 E(32554): 2.4e-212
Smith-Waterman score: 3239; 100.0% identity (100.0% similar) in 476 aa overlap (1-476:1-476)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAGRGGSALLALCGALAACGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 MAGRGGSALLALCGALAACGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 EALVSVWLQCTAISRIYTVGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 EALVSVWLQCTAISRIYTVGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RELLIFLAQYLCNEYQKGNETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 RELLIFLAQYLCNEYQKGNETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NAQGIDLNRNFPDLDRIVYVNEKEGGPNNHLLKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMDIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 NAQGIDLNRNFPDLDRIVYVNEKEGGPNNHLLKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMDIP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FVLSANLHGGDLVANYPYDETRSGSAHEYSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 FVLSANLHGGDLVANYPYDETRSGSAHEYSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RKNDDDSSFVDGTTNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 RKNDDDSSFVDGTTNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWED
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 NKNSLISYLEQIHRGVKGFVRDLQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 NKNSLISYLEQIHRGVKGFVRDLQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE4 LTASAPGYLAITKKVAVPYSPAAGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 LTASAPGYLAITKKVAVPYSPAAGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
430 440 450 460 470
>>CCDS7486.1 CPN1 gene_id:1369|Hs108|chr10 (458 aa)
initn: 1441 init1: 694 opt: 1411 Z-score: 1708.9 bits: 325.5 E(32554): 7.3e-89
Smith-Waterman score: 1411; 52.8% identity (77.5% similar) in 409 aa overlap (49-450:21-416)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 CGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTAISRIYT
..:..::: .: ..: .: .: .:.:.:.
CCDS74 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYS
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 VGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLCNEYQKG
.::: :::.: :.:.::.::.::: ::: ::.::::::::.::::.. :...::.:...
CCDS74 IGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNR
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 NETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFPDLDRIV
:. ::.::..:::::.::.::::.: ::.: . ..:::.::.:.:::::::::. .
CCDS74 NQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNTYI
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 YVNEKEGGPNNHL-LKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDLVANYP
: ::: ::::.:: : . : ... :::.:::.:. .. :::::::::: .:::::
CCDS74 YYNEKYGGPNHHLPLPDNWK-----SQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYP
180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 YD---ETRSGSAHEYSSSP--DDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVDG
:: : : .... .:.: :: .::.::..:: . : . : . : ::
CCDS74 YDKSFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGWN--C-----GDYFPDG
230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 TTNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQI
:::..:::. :::::::: .::::::.::::.:::::: :. : :...::..:::.
CCDS74 ITNGASWYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQV
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 HRGVKGFVRDLQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAIT
:.:.::.: : . : .:::.::: ::.:::::. :::.:::.:: : ..:.:::: :
CCDS74 HQGIKGMVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPET
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470
pF1KE4 KKVAV-PYSPAAGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
:.: : :. :.:.:.
CCDS74 VTVTVGPAEPTL-VNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGP
400 410 420 430 440 450
>>CCDS43212.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 (515 aa)
initn: 1328 init1: 552 opt: 1359 Z-score: 1645.1 bits: 313.9 E(32554): 2.6e-85
Smith-Waterman score: 1359; 50.1% identity (74.0% similar) in 411 aa overlap (49-450:46-445)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 CGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTAISRIYT
: : .: : .. ..: . .:. ..: :.
CCDS43 EDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYS
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 VGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLCNEYQKG
.::::.::::::::.:. :: :: ::: : :::.::::..:::.::.::::::.:: :
CCDS43 IGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLG
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 NETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFPDLDRIV
: : :...::::..::.::::.: ::.. . . : ::.:::..:::::::::
CCDS43 NPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEY
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 Y-VNEKEGGPNNHLLKNMKKIVDQNT---KLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDLVA
: . : .:. ..:. . :. :.::::::...:.. :::::::.:::::::.
CCDS43 YRLAETRGARSDHI------PIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVV
200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 NYPYDETRSGSAHE-YSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVD-G
.::.: .. . .. .: .::. .:. :.:::.. .: : : .. : : :. :
CCDS43 SYPFDFSKHPQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGN-----FLKRG
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 TT-NGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQ
. ::. ::: :::.::::: .:::::::::.: ::::::.: :. ::.::....:
CCDS43 SIINGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVET
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 IHRGVKGFVRDLQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAI
.:::.:: : : :.:. :: :::.:: ::.:.: :::::::: :: . . :.:::: .
CCDS43 VHRGIKGVVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKV
370 380 390 400 410 420
440 450 460 470
pF1KE4 TKKVAVP--YSPAAGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
::: .: .. :. ::: :.
CCDS43 IKKVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRA
430 440 450 460 470 480
>>CCDS3404.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 (641 aa)
initn: 1328 init1: 552 opt: 1359 Z-score: 1643.7 bits: 313.9 E(32554): 3.1e-85
Smith-Waterman score: 1359; 50.1% identity (74.0% similar) in 411 aa overlap (49-450:172-571)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 CGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTAISRIYT
: : .: : .. ..: . .:. ..: :.
CCDS34 EDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYS
150 160 170 180 190 200
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 VGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLCNEYQKG
.::::.::::::::.:. :: :: ::: : :::.::::..:::.::.::::::.:: :
CCDS34 IGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLG
210 220 230 240 250 260
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 NETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFPDLDRIV
: : :...::::..::.::::.: ::.. . . : ::.:::..:::::::::
CCDS34 NPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEY
270 280 290 300 310 320
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 Y-VNEKEGGPNNHLLKNMKKIVDQNT---KLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDLVA
: . : .:. ..:. . :. :.::::::...:.. :::::::.:::::::.
CCDS34 YRLAETRGARSDHI------PIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVV
330 340 350 360 370
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 NYPYDETRSGSAHE-YSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVD-G
.::.: .. . .. .: .::. .:. :.:::.. .: : : .. : : :. :
CCDS34 SYPFDFSKHPQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGN-----FLKRG
380 390 400 410 420 430
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 TT-NGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQ
. ::. ::: :::.::::: .:::::::::.: ::::::.: :. ::.::....:
CCDS34 SIINGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVET
440 450 460 470 480 490
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 IHRGVKGFVRDLQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAI
.:::.:: : : :.:. :: :::.:: ::.:.: :::::::: :: . . :.:::: .
CCDS34 VHRGIKGVVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKV
500 510 520 530 540 550
440 450 460 470
pF1KE4 TKKVAVP--YSPAAGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
::: .: .. :. ::: :.
CCDS34 IKKVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRA
560 570 580 590 600 610
>>CCDS33953.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 (652 aa)
initn: 1328 init1: 552 opt: 1359 Z-score: 1643.6 bits: 313.9 E(32554): 3.2e-85
Smith-Waterman score: 1359; 50.1% identity (74.0% similar) in 411 aa overlap (49-450:183-582)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 CGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTAISRIYT
: : .: : .. ..: . .:. ..: :.
CCDS33 EDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYS
160 170 180 190 200 210
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 VGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLCNEYQKG
.::::.::::::::.:. :: :: ::: : :::.::::..:::.::.::::::.:: :
CCDS33 IGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLG
220 230 240 250 260 270
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 NETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFPDLDRIV
: : :...::::..::.::::.: ::.. . . : ::.:::..:::::::::
CCDS33 NPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEY
280 290 300 310 320 330
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 Y-VNEKEGGPNNHLLKNMKKIVDQNT---KLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDLVA
: . : .:. ..:. . :. :.::::::...:.. :::::::.:::::::.
CCDS33 YRLAETRGARSDHI------PIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVV
340 350 360 370 380
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 NYPYDETRSGSAHE-YSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVD-G
.::.: .. . .. .: .::. .:. :.:::.. .: : : .. : : :. :
CCDS33 SYPFDFSKHPQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGN-----FLKRG
390 400 410 420 430 440
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 TT-NGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQ
. ::. ::: :::.::::: .:::::::::.: ::::::.: :. ::.::....:
CCDS33 SIINGADWYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVET
450 460 470 480 490 500
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 IHRGVKGFVRDLQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAI
.:::.:: : : :.:. :: :::.:: ::.:.: :::::::: :: . . :.:::: .
CCDS33 VHRGIKGVVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKV
510 520 530 540 550 560
440 450 460 470
pF1KE4 TKKVAVP--YSPAAGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
::: .: .. :. ::: :.
CCDS33 IKKVIIPARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRA
570 580 590 600 610 620
>>CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 (734 aa)
initn: 1187 init1: 506 opt: 1339 Z-score: 1618.6 bits: 309.5 E(32554): 7.8e-84
Smith-Waterman score: 1339; 48.1% identity (74.5% similar) in 416 aa overlap (32-439:286-689)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 AGRGGSALLALCGALAACGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELRE
:::.: . : ..:..: : .:.
CCDS13 PQTWLQGGAPCLRAEILACPVSDPNDLFLEAPASG--------SSDPLDFQHHNYKAMRK
260 270 280 290 300
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ALVSVWLQCTAISRIYTVGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGR
. .: :: :.:::..:.:..: .: :.:.::.:: :: :::: .:...::::::.::
CCDS13 LMKQVQEQCPNITRIYSIGKSYQGLKLYVMEMSDKPGEHELGEPEVRYVAGMHGNEALGR
310 320 330 340 350 360
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ELLIFLAQYLCNEYQKGNETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSN
:::..: :.::.:. .:: .. :. :::..::.::::.: : . .:: : :: :
CCDS13 ELLLLLMQFLCHEFLRGNPRVTRLLSEMRIHLLPSMNPDGYEIAYHRGSELVGWAEGRWN
370 380 390 400 410 420
190 200 210 220 230
pF1KE4 AQGIDLNRNFPDLDRIVYVNEKEGG-----PNNHL-LKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHW
:.::::.:: ::. .. . .: ::.:: : .. . :. .::::.:::.:
CCDS13 NQSIDLNHNFADLNTPLWEAQDDGKVPHIVPNHHLPLPTYYTL--PNATVAPETRAVIKW
430 440 450 460 470 480
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 IMDIPFVLSANLHGGDLVANYPYDETRSG-SAHEYSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSD
. ::::::::::::.::..::.: ::. .:.: . .::::.:. :. .:.. : ::.:
CCDS13 MKRIPFVLSANLHGGELVVSYPFDMTRTPWAARELTPTPDDAVFRWLSTVYAGSNLAMQD
490 500 510 520 530 540
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 PNRPPCRKNDDDSSFVDGTTNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETL
.: :: ...: : . ::. :..:::.:.::.:: .::::.::::::.::: :. :
CCDS13 TSRRPC--HSQDFSVHGNIINGADWHTVPGSMNDFSYLHTNCFEVTVELSCDKFPHENEL
550 560 570 580 590 600
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 KTYWEDNKNSLISYLEQIHRGVKGFVRDLQGN-PIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRL
::.::..:..::::.. :. : ::: . . ::.:.:.:.::.::::.: ::::::
CCDS13 PQEWENNKDALLTYLEQVRMGIAGVVRDKDTELGIADAVIAVDGINHDVTTAWGGDYWRL
610 620 630 640 650 660
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LIPGNYKLTASAPGYLAITKKVAVPYSPAAGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSET
: ::.: .:::: :: ..:.. : .
CCDS13 LTPGDYMVTASAEGYHSVTRNCRVTFEEGPFPCNFVLTKTPKQRLRELLAAGAKVPPDLR
670 680 690 700 710 720
>>CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 (756 aa)
initn: 1222 init1: 526 opt: 1335 Z-score: 1613.5 bits: 308.6 E(32554): 1.5e-83
Smith-Waterman score: 1335; 45.3% identity (74.3% similar) in 439 aa overlap (33-465:298-731)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 GRGGSALLALCGALAACGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREA
: ..:: .. : ..:..: : :.:.
CCDS76 ARYIRINPQSWFDNGSICMRMEILGCPLPDPNNYYHRRNEMTTTDDLDFKHHNYKEMRQL
270 280 290 300 310 320
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LVSVWLQCTAISRIYTVGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRE
. : .: :.:::..:.: .: .: ..:.::.:: :: :::::.::.. ::::..:::
CCDS76 MKVVNEMCPNITRIYNIGKSHQGLKLYAVEISDHPGEHEVGEPEFHYIAGAHGNEVLGRE
330 340 350 360 370 380
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LLIFLAQYLCNEYQKGNETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNA
::..:.:..:.:: : ::.:.. ::::..:::::::.::: .:: : .:: .
CCDS76 LLLLLVQFVCQEYLARNARIVHLVEETRIHVLPSLNPDGYEKAYEGGSELGGWSLGRWTH
390 400 410 420 430 440
190 200 210 220 230
pF1KE4 QGIDLNRNFPDLDRIVYVNE-KEGGPN---NHLLKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMD
.:::.: :::::. ... : ... : :: . . ....:. .: ::.::: :.
CCDS76 DGIDINNNFPDLNTLLWEAEDRQNVPRKVPNHYIAIPEWFLSENATVAAETRAVIAWMEK
450 460 470 480 490 500
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 IPFVLSANLHGGDLVANYPYDETRSG-SAHEYSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNR
:::::..::.::.::. :::: .:: ...:.. .::: .:. :: .:.: . :.: :
CCDS76 IPFVLGGNLQGGELVVAYPYDLVRSPWKTQEHTPTPDDHVFRWLAYSYASTHRLMTDARR
510 520 530 540 550 560
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 PPCRKNDDDSSFVDGTTNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTY
:. .: .. .::.::..:..: :...::.:: .::::... ..:.:.: : :
CCDS76 RVCHTEDFQKE--EGTVNGASWHTVAGSLNDFSYLHTNCFELSIYVGCDKYPHESQLPEE
570 580 590 600 610 620
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 WEDNKNSLISYLEQIHRGVKGFVRDLQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPG
::.:..::: ..::.:::.::.::: .:. : :: ::::::.::. .:.:::::::: ::
CCDS76 WENNRESLIVFMEQVHRGIKGLVRDSHGKGIPNAIISVEGINHDIRTANDGDYWRLLNPG
630 640 650 660 670 680
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 NYKLTASAPGYLAITKKVAVPYSPAAG-VDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
.: .::.: :. : ::. : :. .: :: : :. . . .:.::
CCDS76 EYVVTAKAEGFTASTKNCMVGYDMGATRCDFTL---SKTNMARIREIMEKFGKQPVSLPA
690 700 710 720 730 740
CCDS76 RRLKLRGQKRRQRG
750
>>CCDS56025.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1133 aa)
initn: 882 init1: 366 opt: 828 Z-score: 996.0 bits: 194.9 E(32554): 3.7e-49
Smith-Waterman score: 1316; 49.4% identity (74.1% similar) in 421 aa overlap (43-461:249-636)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 CGALAACGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTA
.: .: :..:..:... : .
CCDS56 VIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKD---FHHHHFPDMEIFLRRFANEYPN
220 230 240 250 260 270
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 ISRIYTVGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLC
:.:.:..:.: :.::: :.:.::::::::::::::::::::::::.::::::. : .:::
CCDS56 ITRLYSLGKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLC
280 290 300 310 320 330
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 NEYQKGNETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFP
... : ...:.:.::::.:::.::::.:: :: :. . .::.:....:::::::
CCDS56 KNFGTDPE-VTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYEK--SQEGDSIS-VIGRNNSNNFDLNRNFP
340 350 360 370 380 390
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 DLDRIVYVNEKEGGPNNHLLKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDL
:..: ... :.. ::: ::. :. . :::::::::::.:
CCDS56 --DQFVQITD----PTQ-----------------PETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSL
400 410 420
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 VANYPYDETRSGSAHEYSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVDG
:.:::.:. ..: : ::.:::::.::..: .::. : : . ::.. . : :
CCDS56 VVNYPFDDDEQGLA-TYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQGR--PCKNMYPNEYFPHG
430 440 450 460 470 480
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 TTNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQI
:::..::.:::::::.:::..::::.:.::.: :.: :. : ..::.:. :::....:.
CCDS56 ITNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQV
490 500 510 520 530 540
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 HRGVKGFVRD-LQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAI
:.::.::: : .: : :::::: :.: ::. : :::::::.::.::.:::: :: .
CCDS56 HQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPV
550 560 570 580 590 600
440 450 460 470
pF1KE4 TKKVAVPYSPAAGVDFEL-ESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
::.:.: : :.: : .: .. ..: :.
CCDS56 TKNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKKGKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAE
610 620 630 640 650 660
CCDS56 NGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITNLTNLGQSTEYRHIWSLE
670 680 690 700 710 720
>--
initn: 677 init1: 338 opt: 726 Z-score: 872.3 bits: 172.0 E(32554): 2.9e-42
Smith-Waterman score: 726; 50.9% identity (78.3% similar) in 212 aa overlap (241-449:3-212)
220 230 240 250 260
pF1KE4 LLKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDLVANYPYDETRSGSAHE-Y
::::.:::::..::.::.:.. .: :
CCDS56 MRFVLSGNLHGGSVVASYPFDDSPEHKATGIY
10 20 30
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 SSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVDGTTNGGAWYSVPGGMQDF
:.. :: .:. ::.::.: .: :. ..: : .:.: .: :: :::. ::.: :::::.
CCDS56 SKTSDDEVFKYLAKAYASNHPIMKT-GEPHC-PGDEDETFKDGITNGAHWYDVEGGMQDY
40 50 60 70 80 90
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 NYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQIHRGVKGFVRD-LQGNPI
::. .::::::.:::: :.:: :. ::.:..:::. .:..: ::::::.: . :. .
CCDS56 NYVWANCFEITLELSCCKYPPASQLRQEWENNRESLITLIEKVHIGVKGFVKDSITGSGL
100 110 120 130 140 150
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 ANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAIT-KKVAVPYSPAAGVDF
:::::: ::.:..:... ::..:::.::.:.::. ::. .: .:.: .::. :::
CCDS56 ENATISVAGINHNITTGRFGDFYRLLVPGTYNLTVVLTGYMPLTVTNVVVKEGPATEVDF
160 170 180 190 200 210
450 460 470
pF1KE4 ELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
:
CCDS56 SLRPTVTSVIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFA
220 230 240 250 260 270
>--
initn: 549 init1: 233 opt: 435 Z-score: 519.4 bits: 106.7 E(32554): 1.3e-22
Smith-Waterman score: 724; 34.7% identity (61.8% similar) in 398 aa overlap (51-445:684-1036)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 WLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTAISRIYTVG
..:: : .: : : .. .. :. . ..:
CCDS56 EFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITNLTNLG
660 670 680 690 700 710
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 RSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLCNEYQKGNE
.: : :.. .:.:..:.: :: ::........::: :: :::. ::..:: .:.: :
CCDS56 QSTEYRHIWSLEISNKPNVSEPEEPKIRFVAGIHGNAPVGTELLLALAEFLCLNYKK-NP
720 730 740 750 760 770
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 TIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFPDLDRIVYV
....:. ::: :.::::::: :.: . : .:..::.: ::. .:
CCDS56 AVTQLVDRTRIVIVPSLNPDGRERAQEKDCTSK---IGQTNARGKDLDTDFT--------
780 790 800 810 820
210 220 230 240 250
pF1KE4 NEKEGGPNNHLLKNMKKIVDQNTKLAPETKAVI-HWIMDIPFVLSANLHGGDLVANYPYD
:. :::::.: . :. : ::. : ::.....::::
CCDS56 ---------------------NNASQPETKAIIENLIQKQDFSLSVALDGGSMLVTYPYD
830 840 850 860
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 ETRSGSAHEYSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVDGTTNGGAW
. .. . .. :: :.. .:.: ..: : : .: .. :. :. :
CCDS56 KP-------VQTVENKETLKHLASLYANNHPSMH-MGQPSC-PNKSDENIPGGVMRGAEW
870 880 890 900 910
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 YSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQIHRGVKGF
.: :.:.:.. ..: :::: :: :: : . : ::: ::.:.: ..:.::.::
CCDS56 HSHLGSMKDYSVTYGHCPEITVYTSCCYFPSAARLPSLWADNKRSLLSMLVEVHKGVHGF
920 930 940 950 960 970
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 VRDLQGNPIANATISV-EGIDHDVTSAKDGDYWR-LLIPGNYKLTASAPGYLAITKKVAV
:.: :.::..:.: . ::: ...:.: :.. :: :: ... : : :: ..: :
CCDS56 VKDKTGKPISKAVIVLNEGIK---VQTKEGGYFHVLLAPGVHNIIAIADGYQQQHSQVFV
980 990 1000 1010 1020
440 450 460 470
pF1KE4 PYSPAAGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
.. :..:
CCDS56 HHDAASSVVIVFDTDNRIFGLPRELVVTVSGATMSALILTACIIWCICSIKSNRHKDGFH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
>>CCDS11257.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1380 aa)
initn: 1132 init1: 366 opt: 828 Z-score: 994.8 bits: 195.0 E(32554): 4.3e-49
Smith-Waterman score: 1316; 49.4% identity (74.1% similar) in 421 aa overlap (43-461:496-883)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 CGALAACGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTA
.: .: :..:..:... : .
CCDS11 VIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKD---FHHHHFPDMEIFLRRFANEYPN
470 480 490 500 510 520
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 ISRIYTVGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLC
:.:.:..:.: :.::: :.:.::::::::::::::::::::::::.::::::. : .:::
CCDS11 ITRLYSLGKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLC
530 540 550 560 570 580
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 NEYQKGNETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFP
... : ...:.:.::::.:::.::::.:: :: :. . .::.:....:::::::
CCDS11 KNFGTDPE-VTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYEK--SQEGDSIS-VIGRNNSNNFDLNRNFP
590 600 610 620 630
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 DLDRIVYVNEKEGGPNNHLLKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDL
:..: ... :.. ::: ::. :. . :::::::::::.:
CCDS11 --DQFVQITD----PTQ-----------------PETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSL
640 650 660 670
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 VANYPYDETRSGSAHEYSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVDG
:.:::.:. ..: : ::.:::::.::..: .::. : : . ::.. . : :
CCDS11 VVNYPFDDDEQGLA-TYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQGR--PCKNMYPNEYFPHG
680 690 700 710 720 730
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 TTNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQI
:::..::.:::::::.:::..::::.:.::.: :.: :. : ..::.:. :::....:.
CCDS11 ITNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQV
740 750 760 770 780 790
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 HRGVKGFVRD-LQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAI
:.::.::: : .: : :::::: :.: ::. : :::::::.::.::.:::: :: .
CCDS11 HQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPV
800 810 820 830 840 850
440 450 460 470
pF1KE4 TKKVAVPYSPAAGVDFEL-ESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
::.:.: : :.: : .: .. ..: :.
CCDS11 TKNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKKGKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAE
860 870 880 890 900 910
CCDS11 NGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITNLTNLGQSTEYRHIWSLE
920 930 940 950 960 970
>--
initn: 1053 init1: 338 opt: 806 Z-score: 968.1 bits: 190.0 E(32554): 1.3e-47
Smith-Waterman score: 1065; 40.3% identity (64.5% similar) in 476 aa overlap (4-449:12-459)
10 20 30 40
pF1KE4 MAGRGGSALLALC----GALAACGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDG
: : :: .: :. : . . ::: . .:: . . : :
CCDS11 MASGRDERPPWRLGRLLLLMCLLLLGSSARAAHIKKAEATTT-TTSAGAEAAE--GQFDR
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KE4 ISFEYHRYPELREALVSVWLQCTAISRIYTVGRSFEGRELLVIELS--------------
: . :::: .. ...:....::: ::: : :..:.
CCDS11 YYHEEELESALREAAAA---GLPGLARLFSIGRSVEGRPLWVLRLTAGLGSLIPEGDAGP
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KE4 -----DNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLCNEYQKGNETIVNLIHST
: : ::.:. : .:::::.:.:.:..::.::. : :..:. .: :...:
CCDS11 DAAGPDAAGPLLPGRPQVKLVGNMHGDETVSRQVLIYLARELAAGYRRGDPRLVRLLNTT
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 RIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDW----FVGRSNAQGIDLNRNFPDLDRIVYVNEKEG
....:::::::::.: . : ::.:..: ::::.::: . . :
CCDS11 DVYLLPSLNPDGFERAREGDCGFGDGGPSGASGRDNSRGRDLNRSFPD-------QFSTG
180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 GPNNHLLKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDLVANYPYDETRSGS
: .:. .::..:.:.:: ::::.:::::..::.::.:.. .
CCDS11 EP---------PALDE----VPEVRALIEWIRRNKFVLSGNLHGGSVVASYPFDDSPEHK
230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 AHE-YSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVDGTTNGGAWYSVPG
: ::.. :: .:. ::.::.: .: :. ..: : .:.: .: :: :::. ::.: :
CCDS11 ATGIYSKTSDDEVFKYLAKAYASNHPIMKT-GEPHC-PGDEDETFKDGITNGAHWYDVEG
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 GMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQIHRGVKGFVRD-L
::::.::. .::::::.:::: :.:: :. ::.:..:::. .:..: ::::::.: .
CCDS11 GMQDYNYVWANCFEITLELSCCKYPPASQLRQEWENNRESLITLIEKVHIGVKGFVKDSI
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 QGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAIT-KKVAVPYSPA
:. . :::::: ::.:..:... ::..:::.::.:.::. ::. .: .:.: .::
CCDS11 TGSGLENATISVAGINHNITTGRFGDFYRLLVPGTYNLTVVLTGYMPLTVTNVVVKEGPA
400 410 420 430 440 450
450 460 470
pF1KE4 AGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
. ::: :
CCDS11 TEVDFSLRPTVTSVIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIF
460 470 480 490 500 510
>--
initn: 549 init1: 233 opt: 435 Z-score: 518.1 bits: 106.8 E(32554): 1.5e-22
Smith-Waterman score: 724; 34.7% identity (61.8% similar) in 398 aa overlap (51-445:931-1283)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 WLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTAISRIYTVG
..:: : .: : : .. .. :. . ..:
CCDS11 EFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITNLTNLG
910 920 930 940 950 960
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 RSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLCNEYQKGNE
.: : :.. .:.:..:.: :: ::........::: :: :::. ::..:: .:.: :
CCDS11 QSTEYRHIWSLEISNKPNVSEPEEPKIRFVAGIHGNAPVGTELLLALAEFLCLNYKK-NP
970 980 990 1000 1010
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 TIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFPDLDRIVYV
....:. ::: :.::::::: :.: . : .:..::.: ::. .:
CCDS11 AVTQLVDRTRIVIVPSLNPDGRERAQEKDCTSK---IGQTNARGKDLDTDFT--------
1020 1030 1040 1050 1060
210 220 230 240 250
pF1KE4 NEKEGGPNNHLLKNMKKIVDQNTKLAPETKAVI-HWIMDIPFVLSANLHGGDLVANYPYD
:. :::::.: . :. : ::. : ::.....::::
CCDS11 ---------------------NNASQPETKAIIENLIQKQDFSLSVALDGGSMLVTYPYD
1070 1080 1090 1100
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 ETRSGSAHEYSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVDGTTNGGAW
. .. . .. :: :.. .:.: ..: : : .: .. :. :. :
CCDS11 KP-------VQTVENKETLKHLASLYANNHPSMH-MGQPSC-PNKSDENIPGGVMRGAEW
1110 1120 1130 1140 1150
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 YSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQIHRGVKGF
.: :.:.:.. ..: :::: :: :: : . : ::: ::.:.: ..:.::.::
CCDS11 HSHLGSMKDYSVTYGHCPEITVYTSCCYFPSAARLPSLWADNKRSLLSMLVEVHKGVHGF
1160 1170 1180 1190 1200 1210
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 VRDLQGNPIANATISV-EGIDHDVTSAKDGDYWR-LLIPGNYKLTASAPGYLAITKKVAV
:.: :.::..:.: . ::: ...:.: :.. :: :: ... : : :: ..: :
CCDS11 VKDKTGKPISKAVIVLNEGIK---VQTKEGGYFHVLLAPGVHNIIAIADGYQQQHSQVFV
1220 1230 1240 1250 1260 1270
440 450 460 470
pF1KE4 PYSPAAGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
.. :..:
CCDS11 HHDAASSVVIVFDTDNRIFGLPRELVVTVSGATMSALILTACIIWCICSIKSNRHKDGFH
1280 1290 1300 1310 1320 1330
>>CCDS8987.1 CPM gene_id:1368|Hs108|chr12 (443 aa)
initn: 1053 init1: 364 opt: 657 Z-score: 794.6 bits: 156.3 E(32554): 6.2e-38
Smith-Waterman score: 1015; 42.9% identity (67.5% similar) in 394 aa overlap (49-438:18-379)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 CGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTAISRIYT
..:.::: .. : .: . ........
CCDS89 MDFPCLWLGLLLPLVAALDFNYHRQEGMEAFLKTVAQNYSSVTHLHS
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 VGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLCNEYQKG
.:.: .::.: :. .. : :. : :::::..::::.:.::::::. : .:: . :
CCDS89 IGKSVKGRNLWVLVVGRFPKEHRIGIPEFKYVANMHGDETVGRELLLHLIDYLVTSDGKD
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 NETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFPDLDRIV
: :.:::.:::::::::.:::::: :...: . .:: : . :::::::: .
CCDS89 PE-ITNLINSTRIHIMPSMNPDGFE-AVKKPDCY--YSIGRENYNQYDLNRNFPDA--FE
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 YVNEKEGGPNNHLLKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDLVANYPY
: .:.. ::: ::..:. :::::::::: :::.::.
CCDS89 Y---------------------NNVSRQPETVAVMKWLKTETFVLSANLHGGALVASYPF
170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 DE--TRSGSAHEYSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVDGTTNG
:. .:. . : .::: .:: ::..:.: :: :. .. :. . .: .:.:::
CCDS89 DNGVQATGALYSRSLTPDDDVFQYLAHTYASRNPNMKKGDE--CK---NKMNFPNGVTNG
210 220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 GAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQIHRGV
.:: . :::::.::. ..:::::.:::: :.: :: : ..:..:: ::: :..:.: ::
CCDS89 YSWYPLQGGMQDYNYIWAQCFEITLELSCCKYPREEKLPSFWNNNKASLIEYIKQVHLGV
260 270 280 290 300 310
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 KGFVRDLQGNPIANATISVEGIDH--DVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAITKK
:: : : .:::. :. . :. : . : :.:. ::.::.: .....::. :
CCDS89 KGQVFDQNGNPLPNVIVEVQDRKHICPYRTNKYGEYYLLLLPGSYIINVTVPGHDPHITK
320 330 340 350 360 370
440 450 460 470
pF1KE4 VAVPYSPAAGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
: .:
CCDS89 VIIPEKSQNFSALKKDILLPFQGQLDSIPVSNPSCPMIPLYRNLPDHSAATKPSLFLFLV
380 390 400 410 420 430
476 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:32:15 2016 done: Sun Nov 6 00:32:15 2016
Total Scan time: 2.930 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]