Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4452
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4452, 470 aa
1>>>pF1KE4452 470 - 470 aa - 470 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8697+/-0.00136; mu= -1.7828+/- 0.080
mean_var=329.6327+/-69.026, 0's: 0 Z-trim(108.9): 129 B-trim: 81 in 1/51
Lambda= 0.070641
statistics sampled from 10427 (10541) to 10427 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.324), width: 16
Scan time: 2.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 2947 314.5 1.5e-85
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 1817 199.4 6.8e-51
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 1664 183.8 3.4e-46
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 1580 175.2 1.2e-43
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 1470 164.0 2.9e-40
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 1458 162.8 6.7e-40
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 1192 135.7 1.1e-31
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 1150 131.5 2.2e-30
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 1074 124.0 6.8e-28
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22 (1020) 938 110.1 1.1e-23
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 831 98.9 1.2e-20
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 831 98.9 1.3e-20
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 799 95.7 1.3e-19
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 784 94.2 4e-19
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 768 92.6 1.2e-18
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 764 92.1 1.6e-18
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 759 91.6 2.2e-18
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 749 90.6 4.5e-18
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 746 90.3 5.3e-18
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 746 90.4 6.1e-18
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 739 89.5 8.1e-18
CCDS8826.1 KRT82 gene_id:3888|Hs108|chr12 ( 513) 732 88.8 1.4e-17
CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12 ( 644) 732 88.9 1.7e-17
CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 ( 628) 725 88.2 2.7e-17
CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12 ( 639) 719 87.6 4.1e-17
CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12 ( 535) 713 86.9 5.6e-17
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 ( 486) 709 86.5 6.9e-17
CCDS8832.1 KRT74 gene_id:121391|Hs108|chr12 ( 529) 709 86.5 7.3e-17
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 704 86.0 9.9e-17
CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12 ( 578) 704 86.0 1.1e-16
CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12 ( 505) 698 85.4 1.5e-16
CCDS8831.1 KRT71 gene_id:112802|Hs108|chr12 ( 523) 697 85.3 1.7e-16
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 695 85.1 1.9e-16
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 687 84.2 3.1e-16
CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12 ( 540) 685 84.1 4e-16
CCDS8833.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 511) 683 83.8 4.5e-16
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 678 83.3 5.6e-16
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 673 82.8 8.6e-16
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 667 82.2 1.3e-15
CCDS8840.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 520) 662 81.7 2e-15
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 651 80.5 3.8e-15
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 645 79.9 5.5e-15
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 645 80.0 7.2e-15
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 633 78.7 1.5e-14
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 632 78.6 1.5e-14
CCDS8821.2 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 452) 631 78.5 1.6e-14
CCDS41784.1 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 422) 628 78.2 1.9e-14
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 625 77.9 2.6e-14
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 617 77.1 4.4e-14
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 612 76.6 6.4e-14
>>CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 (470 aa)
initn: 2947 init1: 2947 opt: 2947 Z-score: 1649.5 bits: 314.5 E(32554): 1.5e-85
Smith-Waterman score: 2947; 100.0% identity (100.0% similar) in 470 aa overlap (1-470:1-470)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSQAYSSSQRVSSYRRTFGGAPGFPLGSPLSSPVFPRAGFGSKGSSSSVTSRVYQVSRTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSQAYSSSQRVSSYRRTFGGAPGFPLGSPLSSPVFPRAGFGSKGSSSSVTSRVYQVSRTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GGAGGLGSLRASRLGTTRTPSSYGAGELLDFSLADAVNQEFLTTRTNEKVELQELNDRFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GGAGGLGSLRASRLGTTRTPSSYGAGELLDFSLADAVNQEFLTTRTNEKVELQELNDRFA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 NYIEKVRFLEQQNAALAAEVNRLKGREPTRVAELYEEELRELRRQVEVLTNQRARVDVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NYIEKVRFLEQQNAALAAEVNRLKGREPTRVAELYEEELRELRRQVEVLTNQRARVDVER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DNLLDDLQRLKAKLQEEIQLKEEAENNLAAFRADVDAATLARIDLERRIESLNEEIAFLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DNLLDDLQRLKAKLQEEIQLKEEAENNLAAFRADVDAATLARIDLERRIESLNEEIAFLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 KVHEEEIRELQAQLQEQQVQVEMDMSKPDLTAALRDIRAQYETIAAKNISEAEEWYKSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KVHEEEIRELQAQLQEQQVQVEMDMSKPDLTAALRDIRAQYETIAAKNISEAEEWYKSKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 SDLTQAANKNNDALRQAKQEMMEYRHQIQSYTCEIDALKGTNDSLMRQMRELEDRFASEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SDLTQAANKNNDALRQAKQEMMEYRHQIQSYTCEIDALKGTNDSLMRQMRELEDRFASEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SGYQDNIARLEEEIRHLKDEMARHLREYQDLLNVKMALDVEIATYRKLLEGEESRINLPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SGYQDNIARLEEEIRHLKDEMARHLREYQDLLNVKMALDVEIATYRKLLEGEESRINLPI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE4 QTYSALNFRETSPEQRGSEVHTKKTVMIKTIETRDGEVVSEATQQQHEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QTYSALNFRETSPEQRGSEVHTKKTVMIKTIETRDGEVVSEATQQQHEVL
430 440 450 460 470
>>CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 (466 aa)
initn: 1836 init1: 1653 opt: 1817 Z-score: 1027.2 bits: 199.4 E(32554): 6.8e-51
Smith-Waterman score: 1817; 62.7% identity (84.7% similar) in 464 aa overlap (12-470:9-465)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSQAYSSSQRVSSYRRTFGGAPGFPLGSPLSSPVFPRAGFGSKGSSSSVTSRVYQVSRTS
::::: ::: :: : : :. .. . :. : . . :
CCDS71 MSTRSVSSSSYRRMFGG-PGTA-----SRPSSSRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE4 GGAGGLGSLRASRLGTTRTPSSYGAGELL----DFSLADAVNQEFLTTRTNEKVELQELN
:.. :.. :.: ...: :: . .:: :::::::.: :: .:::::::::::::
CCDS71 LYASSPGGVYATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 DRFANYIEKVRFLEQQNAALAAEVNRLKGREPTRVAELYEEELRELRRQVEVLTNQRARV
:::::::.::::::::: : ::...:::. .:...:::::.:::::::. :::..:::
CCDS71 DRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DVERDNLLDDLQRLKAKLQEEIQLKEEAENNLAAFRADVDAATLARIDLERRIESLNEEI
.:::::: .:..::. :::::. .:::::.: .:: ::: :.:::.::::..:::.:::
CCDS71 EVERDNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 AFLKKVHEEEIRELQAQLQEQQVQVEMDMSKPDLTAALRDIRAQYETIAAKNISEAEEWY
:::::.:::::.:::::.:::.::...:.:::::::::::.: :::..::::..::::::
CCDS71 AFLKKLHEEEIQELQAQIQEQHVQIDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 KSKVSDLTQAANKNNDALRQAKQEMMEYRHQIQSYTCEIDALKGTNDSLMRQMRELEDRF
::: .::..:::.::::::::::: :::.:.:: :::.:::::::.:: :::::.:. :
CCDS71 KSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 ASEASGYQDNIARLEEEIRHLKDEMARHLREYQDLLNVKMALDVEIATYRKLLEGEESRI
: ::..:::.:.::..::...:.::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS71 AVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 NLPIQTYSALNFRETSPEQRG-SEVHTKKTVMIKTIETRDGEVVSEATQQQHEVL
.::. ..:.::.:::. .. ..:.:.:..:::.:::::.:..: :.:.:. :
CCDS71 SLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINE-TSQHHDDLE
420 430 440 450 460
>>CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 (470 aa)
initn: 1683 init1: 821 opt: 1664 Z-score: 942.8 bits: 183.8 E(32554): 3.4e-46
Smith-Waterman score: 1687; 59.9% identity (82.7% similar) in 469 aa overlap (12-470:15-462)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSQAYSSSQRVSSYRRTFGGAPGFPLGSPLSSPVFPRAGFGSKGSSSSVTSRVYQVS
.::::::: :.. :: : : .::: .: :
CCDS87 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSL-------SP-----GAFSYSSSSRFSS-----S
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RTSGGAGGLGSLRASRLGTTRTPSSYGAGELL-------DFSLADAVNQEFLTTRTNEKV
: :.:. .:.: ::. :.: . ::: :: :::.:.:.:::::.::.:::
CCDS87 RLLGSASPSSSVR---LGSFRSPRA-GAGALLRLPSERLDFSMAEALNQEFLATRSNEKQ
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 ELQELNDRFANYIEKVRFLEQQNAALAAEVNRLKGREPTRVAELYEEELRELRRQVEVLT
:::::::::::.:::::::::::::: .:... .:.::.:. .: ..:::::::..:.:
CCDS87 ELQELNDRFANFIEKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQELRELRRELELLG
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 NQRARVDVERDNLLDDLQRLKAKLQEEIQLKEEAENNLAAFRADVDAATLARIDLERRIE
.: ::.::::.: .:: :: .:.:: . .:.::.::. :: ::: :::.:..:::.::
CCDS87 RERDRVQVERDGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIE
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KE4 SLNEEIAFLKKVHEEEIRELQAQLQEQQVQ-VEMDMS-KPDLTAALRDIRAQYETIAAKN
:: .:: ::::.::::.:.::.... :::: ::.. . ::.:::::::::::::.:::::
CCDS87 SLMDEIEFLKKLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYESIAAKN
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 ISEAEEWYKSKVSDLTQAANKNNDALRQAKQEMMEYRHQIQSYTCEIDALKGTNDSLMRQ
..::::::::: .::..:::.:..::::::::: : :.:::: :::.:.:.:::..:.::
CCDS87 LQEAEEWYKSKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQ
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 MRELEDRFASEASGYQDNIARLEEEIRHLKDEMARHLREYQDLLNVKMALDVEIATYRKL
.::::..:: ::.::: . ::::::.:.::.::::::::::.:::::::::.::::::::
CCDS87 LRELEEQFALEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKL
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 LEGEESRINLPIQTYSALNFRETSPE-QRGSEVHTKKTVMIKTIETRDGEVVSEATQQQH
::::::::..:......::.. : :: . .. :..:::.:::::::.::::.:. ..:.
CCDS87 LEGEESRISVPVHSFASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRNGEVVTESQKEQR
400 410 420 430 440 450
470
pF1KE4 EVL
:
CCDS87 SELDKSSAHSY
460 470
>>CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 (432 aa)
initn: 1559 init1: 1455 opt: 1580 Z-score: 897.0 bits: 175.2 E(32554): 1.2e-43
Smith-Waterman score: 1580; 58.0% identity (84.1% similar) in 429 aa overlap (47-470:7-432)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 TFGGAPGFPLGSPLSSPVFPRAGFGSKGSSSSVTSRVYQVSRTSGGAGGLGSLR----AS
.:.. : : :: .:::. : ..
CCDS11 MERRRITSAARRSY-VSSGEMMVGGLAPGRRLGPGT
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 RLGTTRTPSSYGAGELLDFSLADAVNQEFLTTRTNEKVELQELNDRFANYIEKVRFLEQQ
::. .: : . .::::: :.: : ::..:..:..:::::::.:::::::::::
CCDS11 RLSLARMPPPLPTR--VDFSLAGALNAGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQ
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 NAALAAEVNRLKGREPTRVAELYEEELRELRRQVEVLTNQRARVDVERDNLLDDLQRLKA
: :::::.:.:...:::..:..:. :::::: ... :: . ::..:::::: .:: ..
CCDS11 NKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAELRELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQ
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 KLQEEIQLKEEAENNLAAFRADVDAATLARIDLERRIESLNEEIAFLKKVHEEEIRELQA
:::.: .:. ::::::::.: ..: :::::.::::.::::.::: ::.:.::::.::::
CCDS11 KLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEATLARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQE
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 QLQEQQVQVEMDMSKPDLTAALRDIRAQYETIAAKNISEAEEWYKSKVSDLTQAANKNND
:: .:::.::.:..::::::::..::.:::..:..:. ::::::.:: .:::.:: .: .
CCDS11 QLARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAE
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 ALRQAKQEMMEYRHQIQSYTCEIDALKGTNDSLMRQMRELEDRFASEASGYQDNIARLEE
:::::.: .::.:.:: ::....:.:::.:: ::::: :.: . ::..::. .:::::
CCDS11 LLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLESLRGTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEE
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 EIRHLKDEMARHLREYQDLLNVKMALDVEIATYRKLLEGEESRINLPIQTYSALNFRETS
: . :::::::::.:::::::::.:::.:::::::::::::.::..:.::.: :..::::
CCDS11 EGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRETS
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470
pF1KE4 PEQRG-SEVHTKKTVMIKTIETRDGEVVSEATQQQHEVL
. .. :: : :.....::.: :::::..:. :....:.
CCDS11 LDTKSVSEGHLKRNIVVKTVEMRDGEVIKESKQEHKDVM
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::. .: : . .::::: :.: : ::..:..:..:::::::.:::::::::::
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CCDS45 EGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRGGK
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CCDS45 STKDG-ENH-KVTRYLKSLTIRVIPIQAHQIVNGTPPARG
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CCDS59 RLSLARMPPPLPT--RVDFSLAGALNAGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQ
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CCDS59 KLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEATLARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQE
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CCDS59 QLARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAE
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CCDS59 LLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLESLRGTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEE
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pF1KE4 EIRHLKDEMARHLREYQDLLNVKMALDVEIATYRKLLEGEESRINLPIQTYSALNFRETS
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CCDS59 EGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRGQY
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CCDS59 SRASWEGHWSPAPSSRACRLLQTGTEDQGKGIQLSLGAFVTLQRS
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CCDS75 FAVFIEKVHQLETQNRALEAELAALRQRHAEPSRVGELFQRELRDLRAQLEEASSARSQA
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CCDS75 AFVRQVHDEEVAELLATLQASSQAAAEVDVTVAKPDLTSALREIRAQYESLAAKNLQSAE
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CCDS75 EWYKSKFANLNEQAARSTEAIRASREEIHEYRRQLQARTIEIEGLRGANESLERQILELE
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.: ..:..::::.:..::...:. :.::::::::::::::::::::.:::.:::::::::
CCDS75 ERHSAEVAGYQDSIGQLENDLRNTKSEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEE
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CCDS75 TRFSTSGLSISGLNPLPNPSYLLPPRILSATTSKVSSTGLSLKKEEEEEEASKVASKKTS
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.:: . : .. . : . . : ::.: . :..... . ::.::..::.::::::..::.
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CCDS75 EEEIAELQAQIQYAQISVEMDVTKPDLSAALKDIRAQYEKLAAKNMQNAEEWFKSRFTVL
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:..: ::.::.: ::.:. : :. ... : ::.: .: :..: .:..::::. .. :..
CCDS75 TESAAKNTDAVRAAKDEVSESRRLLKAKTLEIEACRGMNEALEKQLQELEDKQNADISAM
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CCDS75 QDTINKLENELRTTKSEMARYLKEYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRLSFTSVGS
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CCDS75 ITSGYSQSSQVFGRSAYGGLQTSSYLMSTRSFPSYYTSHVQEEQIEVEETIEAAKAEEAK
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CCDS60 HEKAQVQLDSDHLEEDIHRLKERFEEEARLRDDTEAAIRALRKDIEEASLVKVELDKKVQ
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CCDS60 SLQDEVAFLRSNHEEEVADLLAQIQASHITVERKDYLKTDISTALKEIRSQLESHSDQNM
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CCDS60 HQAEEWFKCRYAKLTEAAEQNKEAIRSAKEEIAEYRRQLQSKSIELESVRGTKESLERQL
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CCDS60 SDIEERHNHDLSSYQDTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLL
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CCDS60 EGEETRFSTFAGSITGPLYTHRPPITISSKIQKPKVEAPKLKVQHKFVEEIIEETKVEDE
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pF1KE4 VL
CCDS60 KSEMEEALTAITEELAVSMKEEKKEAAEEKEEEPEAEEEEVAAKKSPVKATAPEVKEEEG
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CCDS13 MMSFGGADAL-LGAPFA----PLHGGGSLHYALARKGGAGGTRSAA
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CCDS13 GSSSGFHSWTRTSVSSVSASPSRFRGAGAASSTDSLDTLSNGPEGCMVAVATSRSEKEQL
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pF1KE4 QELNDRFANYIEKVRFLEQQNAALAAEVNRLKGREPTRVA--ELYEEELRELRRQVEVLT
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CCDS13 QALNDRFAGYIDKVRQLEAHNRSLEGEAAALRQQQAGRSAMGELYEREVREMRGAVLRLG
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pF1KE4 NQRARVDVERDNLLDDLQRLKAKLQEEIQLKEEAENNLAAFRADVDAATLARIDLERRIE
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CCDS13 AARGQLRLEQEHLLEDIAHVRQRLDDEARQREEAEAAARALARFAQEAEAARVDLQKKAQ
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CCDS13 ALQEECGYLRRHHQEEVGELLGQIQGSGAAQAQMQAETRDALKCDVTSALREIRAQLEGH
230 240 250 260 270 280
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CCDS13 AVQSTLQSEEWFRVRLDRLSEAAKVNTDAMRSAQEEITEYRRQLQARTTELEALKSTKDS
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: :: ::::: .. ..::. : .:. :.:. : ::: .:::::::::::::::.:::.
CCDS13 LERQRSELEDRHQADIASYQEAIQQLDAELRNTKWEMAAQLREYQDLLNVKMALDIEIAA
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pF1KE4 YRKLLEGEESRINL-PIQTYSALNFRETSPE--QRGSEVHTKKTVMIKTIETRDGEVV--
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CCDS13 YRKLLEGEECRIGFGPIP----FSLPEGLPKIPSVSTHIKVKSEEKIKVVEKSEKETVIV
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pF1KE4 ---SEATQQQHEVL
.: :: .::
CCDS13 EEQTEETQVTEEVTEEEEKEAKEEEGKEEEGGEEEEAEGGEEETKSPPAEEAASPEKEAK
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470 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]