Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4451
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4451, 468 aa
1>>>pF1KE4451 468 - 468 aa - 468 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0122+/-0.000415; mu= 19.4132+/- 0.026
mean_var=66.3585+/-13.760, 0's: 0 Z-trim(110.6): 163 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.157444
statistics sampled from 18777 (18947) to 18777 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 8.380
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000736 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetylcho ( 468) 3131 720.5 2.4e-207
NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine re ( 458) 1809 420.2 5.8e-117
XP_016877370 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 245) 1648 383.5 3.6e-106
XP_005254199 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 243) 1630 379.4 6.1e-105
NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ac ( 627) 1406 328.8 2.7e-89
XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 1397 326.7 9.6e-89
XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 1397 326.7 9.6e-89
NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcho ( 529) 1397 326.7 9.6e-89
NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine re ( 494) 1324 310.1 8.9e-84
NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetyl ( 489) 1300 304.6 3.9e-82
NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcho ( 505) 1300 304.6 4e-82
NP_001269384 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetyl ( 514) 1247 292.6 1.7e-78
XP_011542692 (OMIM: 118508) PREDICTED: neuronal ac ( 329) 1241 291.1 3.1e-78
XP_006720445 (OMIM: 118503,612052) PREDICTED: neur ( 438) 1215 285.3 2.3e-76
NP_000070 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) acet ( 457) 1207 283.5 8.4e-76
XP_016858746 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 464) 1207 283.5 8.5e-76
XP_016883113 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 546) 1200 282.0 2.9e-75
XP_016877378 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 449) 1151 270.8 5.6e-72
XP_016877377 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 462) 1151 270.8 5.7e-72
XP_016877376 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 463) 1151 270.8 5.7e-72
XP_011519489 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 1151 270.8 6e-72
XP_011519488 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 1151 270.8 6e-72
NP_000741 (OMIM: 118509) neuronal acetylcholine re ( 498) 1151 270.8 6e-72
NP_001186208 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine ( 479) 1138 267.8 4.5e-71
XP_016877374 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 1131 266.2 1.3e-70
XP_016877375 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 1131 266.2 1.3e-70
NP_000739 (OMIM: 118507,605375) neuronal acetylcho ( 502) 1115 262.6 1.8e-69
XP_011519493 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 1046 246.9 8e-65
XP_011519492 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 1046 246.9 8e-65
NP_001034612 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) a ( 482) 1032 243.8 8.1e-64
XP_016858745 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 489) 1032 243.8 8.2e-64
NP_001294874 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetyl ( 160) 1024 241.6 1.2e-63
XP_011526826 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 556) 968 229.3 2.1e-59
NP_000737 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetylcho ( 502) 946 224.2 6.3e-58
NP_001177384 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetyl ( 531) 944 223.8 9.1e-58
NP_060051 (OMIM: 605116) neuronal acetylcholine re ( 479) 936 221.9 2.9e-57
XP_005273454 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 930 220.5 6.2e-57
XP_016868492 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 930 220.5 6.2e-57
NP_065135 (OMIM: 606372) neuronal acetylcholine re ( 450) 899 213.5 9.5e-55
XP_011519480 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 380) 862 205.1 2.8e-52
XP_011519478 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 486) 859 204.5 5.5e-52
XP_016883114 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 451) 756 181.0 5.7e-45
NP_001243502 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ( 451) 756 181.0 5.7e-45
XP_011542691 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 744 178.2 3e-44
XP_016868493 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 744 178.2 3e-44
NP_000860 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recep ( 484) 701 168.6 3.5e-41
NP_001155244 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine re ( 463) 698 167.9 5.4e-41
XP_011520455 (OMIM: 609756) PREDICTED: CHRNA7-FAM7 ( 412) 644 155.6 2.4e-37
NP_647536 (OMIM: 609756) CHRNA7-FAM7A fusion prote ( 412) 644 155.6 2.4e-37
XP_011519479 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 401) 641 154.9 3.8e-37
>>NP_000736 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetylcholine (468 aa)
initn: 3131 init1: 3131 opt: 3131 Z-score: 3843.6 bits: 720.5 E(85289): 2.4e-207
Smith-Waterman score: 3131; 100.0% identity (100.0% similar) in 468 aa overlap (1-468:1-468)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPYV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 EIIPSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EIIPSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 PKLLCMRSHVDRYFTQKEETESGSGPKSSRNTLEAALDSIRYITRHIMKENDVREVVEDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PKLLCMRSHVDRYFTQKEETESGSGPKSSRNTLEAALDSIRYITRHIMKENDVREVVEDW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE4 KFIAQVLDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHIGNANK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KFIAQVLDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHIGNANK
430 440 450 460
>>NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine recept (458 aa)
initn: 2051 init1: 1221 opt: 1809 Z-score: 2220.9 bits: 420.2 E(85289): 5.8e-117
Smith-Waterman score: 2029; 67.6% identity (84.7% similar) in 444 aa overlap (28-454:13-453)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER
: ..: :. .:::..::.::. ::: :..
NP_000 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGF---NSIAENEDALLRHLFQGYQK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV
::::: : :: ::. ::: :::::::::::::::::::::::: : ::::::::::::.
NP_000 WVRPVLHSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE4 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGT-STKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPF
:.:::.:.: ::::::.::::::::. ::.... ::::.:::::.::::::.:::::::
NP_000 IKVPSESLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DLQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPY
: ::::::::::::::..::.:: ...::..::::::::::..: : :::: :. ::.
NP_000 DRQNCSMKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYSYPF
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 VTYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVI
.:::::..::::::::::::::.::::::::::::::.::::. : ::::::::::::::
NP_000 ITYSFVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 EEIIPSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHT
::::::::::::::::::.: ::::::::.::::.::.:::::::.. ::: :...::.
NP_000 EEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQK
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KE4 LPKLLCMRSHVDRYFT-QKEETES---------------GSGPKSSRNTLEAALDSIRYI
:::::::..::::: . .:::.. ..: : :: : ::::::
NP_000 LPKLLCMKDHVDRYSSPEKEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYI
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 TRHIMKENDVREVVEDWKFIAQVLDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHI
.::. ::. . .::.::::.::::::.::: ::.::..::. .:.:.. :
NP_000 SRHVKKEHFISQVVQDWKFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH
410 420 430 440 450
pF1KE4 GNANK
>>XP_016877370 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neuronal (245 aa)
initn: 1648 init1: 1648 opt: 1648 Z-score: 2027.1 bits: 383.5 E(85289): 3.6e-106
Smith-Waterman score: 1648; 100.0% identity (100.0% similar) in 238 aa overlap (1-238:1-238)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIE
XP_016 KIGNS
>>XP_005254199 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neuronal (243 aa)
initn: 1630 init1: 1630 opt: 1630 Z-score: 2005.1 bits: 379.4 E(85289): 6.1e-105
Smith-Waterman score: 1630; 100.0% identity (100.0% similar) in 236 aa overlap (1-236:1-236)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWLLKI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIE
XP_005 GNS
>>NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal acetyl (627 aa)
initn: 1495 init1: 531 opt: 1406 Z-score: 1724.3 bits: 328.8 E(85289): 2.7e-89
Smith-Waterman score: 1406; 58.2% identity (78.0% similar) in 364 aa overlap (7-367:5-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER
:: : ::: . :. : : :. :. . :. :. ::: ::. :..
NP_000 MELGGPGAPRLLPPLLLLLGT--------GLLRASSHVETRAHAEERLLKKLFSGYNK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV
: ::: ...: . ..:::.:.::.:::::::.::::::.:::: : ::::.: :: ..
NP_000 WSRPVANISDVVLVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWVKQEWHDYKLRWDPADYENVTS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE4 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTS-TKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPF
::.::. .: :::::..:::: : : ::. . ..: : ::::: :::::.::::::::
NP_000 IRIPSELIWRPDIVLYNNADGDFAVTHLTKAHLFHDGRVQWTPPAIYKSSCSIDVTFFPF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DLQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCW--Y
: :::.::::::::: ...:.. . ::. ::...::: ::.:.:. ..: :: :
NP_000 DQQNCTMKFGSWTYDKAKIDLVNMHSRVDQLDFWESGEWVIVDAVGTYNTRKYECCAEIY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PYVTYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLL
: .::.:::.:::::::. :::::. .: ::::::::::. :::: :: :::.:::::::
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300 310 320 330 340 350
pF1KE4 VIEEIIPSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFL
.: :::::.: :::::::::.::::::::::..:::..:.:::: ::. : ::..::
NP_000 LITEIIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPRTHT-MPTWVRRVFL
300 310 320 330 340
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pF1KE4 HTLPKLLCMRSHVDRYFTQKEETESGSGPKSSRNTLEAALDSIRYITRHIMKENDVREVV
.:.:: :.
NP_000 DIVPRLLLMKRPSVVKDNCRRLIESMHKMASAPRFWPEPEGEPPATSGTQSLHPPSPSFC
350 360 370 380 390 400
>--
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320 330 340 350 360
pF1KE4 PLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHTLP-KLLCMR--
: .::.: : . : : : .
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pF1KE4 SHVDRYFTQKEETESGSGPKSSRN-TLEAALDSIRYITRHIMKENDVREVVEDWKFIAQV
: :. : : .. .. :. . .: :.....::. :. :. : ::::..:.:
NP_000 SSVSPSATVKTRSTKAPPPHLPLSPALTRAVEGVQYIADHLKAEDTDFSVKEDWKYVAMV
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pF1KE4 LDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHIGNANK
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. .: . ..:::.:.::.:::::::.::::::::::: : :::::: :.:.: .::::.
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::.: :::::::::.::::::::::..:::..:.:::: :::. : :: .: .:.
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: : ..:.:: : . .:: .
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390 400 410 420
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:: ::::. .. ::....::. :. .:. : ::::..:
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pF1KE4 QVLDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHIGNANK
.:.::.::: :..: ..:
XP_006 MVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI
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>>XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neuronal (529 aa)
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Smith-Waterman score: 1464; 51.1% identity (70.7% similar) in 468 aa overlap (37-442:49-515)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 GPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYERWVRPVE
: . .: .. :: :.: ::. :.::.:::
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pF1KE4 HLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKVIRVPSD
. .: . ..:::.:.::.:::::::.::::::::::: : :::::: :.:.: .::::.
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pF1KE4 SVWTPDIVLFDNADGRFEGTS-TKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFDLQNCS
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pF1KE4 MKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCW--YPYVTYS
::::::::: ...:. .: :: .:....::: ::.:::. ... .:: :: :::.
XP_011 MKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPDVTYA
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pF1KE4 FVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIEEII
:::.:::::::. :::::. .: ::::::::::. :::: :: :::.:::::::.: :::
XP_011 FVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLITEII
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pF1KE4 PSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHTLPKL
::.: :::::::::.::::::::::..:::..:.:::: :::. : :: .: .:.
XP_011 PSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPSTHT-MPHWVRGALLGCVPRW
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pF1KE4 L-----------C-------------MRSHVD---RYFTQKEETE---------------
: : ..:.:: : . .:: .
XP_011 LLMNRPPPPVELCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSVGTLC
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390 400 410 420
pF1KE4 ------SG-SGPKSS----------RNTLEAALDSIRYITRHIMKENDVREVVEDWKFIA
:: ::::. .. ::....::. :. .:. : ::::..:
XP_011 SHGHLHSGASGPKAEALLQEGELLLSPHMQKALEGVHYIADHLRSEDADSSVKEDWKYVA
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430 440 450 460
pF1KE4 QVLDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHIGNANK
.:.::.::: :..: ..:
XP_011 MVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI
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Smith-Waterman score: 1464; 51.1% identity (70.7% similar) in 468 aa overlap (37-442:49-515)
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pF1KE4 GPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYERWVRPVE
: . .: .. :: :.: ::. :.::.:::
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pF1KE4 HLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKVIRVPSD
. .: . ..:::.:.::.:::::::.::::::::::: : :::::: :.:.: .::::.
NP_000 NTSDVVIVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWLKQEWSDYKLRWNPTDFGNITSLRVPSE
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pF1KE4 SVWTPDIVLFDNADGRFEGTS-TKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFDLQNCS
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NP_000 MIWIPDIVLYNNADGEFAVTHMTKAHLFSTGTVHWVPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQQNCK
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pF1KE4 MKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCW--YPYVTYS
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NP_000 MKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPDVTYA
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pF1KE4 FVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIEEII
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NP_000 FVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLITEII
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pF1KE4 PSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHTLPKL
::.: :::::::::.::::::::::..:::..:.:::: :::. : :: .: .:.
NP_000 PSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPSTHT-MPHWVRGALLGCVPRW
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370 380
pF1KE4 L-----------C-------------MRSHVD---RYFTQKEETE---------------
: : ..:.:: : . .:: .
NP_000 LLMNRPPPPVELCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSVGTLC
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390 400 410 420
pF1KE4 ------SG-SGPKSS----------RNTLEAALDSIRYITRHIMKENDVREVVEDWKFIA
:: ::::. .. ::....::. :. .:. : ::::..:
NP_000 SHGHLHSGASGPKAEALLQEGELLLSPHMQKALEGVHYIADHLRSEDADSSVKEDWKYVA
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pF1KE4 QVLDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHIGNANK
.:.::.::: :..: ..:
NP_000 MVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI
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:. :.. ::. :....::::...: . ..:
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.:: : : :: .::....::: .:::::: .:::: .:.:::::: ::::.::::::::
NP_004 NNAVGDFQVEG-KTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWTYD
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pF1KE4 GSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCW--YPYVTYSFVIKRLPLF
...:... . :: ::..:.::::..:.: : . .:: : .:::: :.:::.:
NP_004 KAEIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKHDIKYNCCEEIYTDITYSFYIRRLPMF
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pF1KE4 YTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIEEIIPSSSKVIPL
::. :::::. .::::::::::::. :::. :: :::.::::::::: : :::.: :.::
NP_004 YTINLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVVPL
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pF1KE4 IGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHTLPKLLCMRSHVDR
.::::.::::::::::.::::..:::.:. .::. : :. .::. ::..: :: .:.
NP_004 VGEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHT-MPRWVKTVFLKLLPQVLLMRWPLDK
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pF1KE4 --------------YFTQKEETESGSGPK---------------SSRNTL----------
: . : . :. .:. :
NP_004 TRGTGSDAVPRGLARRPAKGKLASHGEPRHLKECFHCHKSNELATSKRRLSHQPLQWVVE
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pF1KE4 --------EAALDSIRYITRHIMKENDVREVVEDWKFIAQVLDRMFLWTFLFVSIVGSLG
: ...:...:.... ..:...:: .:::..:.:.::.:::.:..: . :. :
NP_004 NSEHSPEVEDVINSVQFIAENMKSHNETKEVEDDWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTAG
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450 460
pF1KE4 LFV-PVIYKWANILIPVHIGNANK
::. :..
NP_004 LFLQPLLGNTGKS
490
>>NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylchol (489 aa)
initn: 1332 init1: 523 opt: 1300 Z-score: 1595.7 bits: 304.6 E(85289): 3.9e-82
Smith-Waterman score: 1301; 53.6% identity (77.2% similar) in 364 aa overlap (6-366:13-356)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKD
: :: : :::: : ..: .: :.:. :..
NP_001 MGSGPLSLPLALSPPRLLLLLLLSLLPVAR-----------------ASEAEHR--LFER
10 20 30 40
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pF1KE4 LFQDYERWVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPD
::.::.. .::: ...: . :.: ...:::: ::: ::.: ::.:::: : : ::.:::.
NP_001 LFEDYNEIIRPVANVSDPVIIHFEVSMSQLVKVDEVNQIMETNLWLKQIWNDYKLKWNPS
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pF1KE4 DYGGIKVIRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFE-GTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTI
:::: . .:::....: :::::..:: : :. .::....:.: ::: ::: .:::: :
NP_001 DYGGAEFMRVPAQKIWKPDIVLYNNAVGDFQVDDKTKALLKYTGEVTWIPPAIFKSSCKI
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pF1KE4 DVTFFPFDLQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTD
:::.:::: :::.::::::.:: ...:..: .... .:....::: :..: : : .
NP_001 DVTYFPFDYQNCTMKFGSWSYDKAKIDLVLIGSSMNLKDYWESGEWAIIKAPGYKHDIKY
170 180 190 200 210 220
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pF1KE4 SCCW--YPYVTYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLV
.:: :: .:::. :.:::::::. :::::. .::::::::::::. :::. :: :::.
NP_001 NCCEEIYPDITYSLYIRRLPLFYTINLIIPCLLISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 SLTVFLLVIEEIIPSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAP
::::::::: : :::.: :::::::::.::::::::::..:::..:.:.:. .::. :
NP_001 SLTVFLLVITETIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHYRTPTTHT-MPS
290 300 310 320 330 340
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pF1KE4 LVRKIFLHTLPKLLCMRSHVDRYFTQKEETESGSGPKSSRNTLEAALDSIRYITRHIMKE
:. .::. ::... :
NP_001 WVKTVFLNLLPRVMFMTRPTSNEGNAQKPRPLYGAELSNLNCFSRAESKGCKEGYPCQDG
350 360 370 380 390 400
468 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 01:03:10 2016 done: Sun Nov 6 01:03:11 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]