Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4430
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4430, 448 aa
1>>>pF1KE4430 448 - 448 aa - 448 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4573+/-0.000707; mu= 14.3527+/- 0.043
mean_var=126.4434+/-24.707, 0's: 0 Z-trim(114.2): 87 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.114058
statistics sampled from 14676 (14769) to 14676 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.782), E-opt: 0.2 (0.454), width: 16
Scan time: 3.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12902.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 ( 448) 3061 514.4 9e-146
CCDS42618.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 ( 447) 3042 511.3 7.9e-145
CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 652) 1700 290.6 3.1e-78
CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 1695 289.8 5.5e-78
CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 1681 287.5 2.7e-77
CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 650) 1676 286.7 4.8e-77
CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 634) 1126 196.2 8.3e-50
CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 482) 1123 195.6 9.5e-50
CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 598) 1123 195.6 1.1e-49
CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 632) 1010 177.1 4.6e-44
CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19 ( 481) 983 172.5 8.2e-43
CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 631) 979 172.0 1.6e-42
CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 299) 937 164.8 1.1e-40
CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 287) 834 147.8 1.3e-35
CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19 ( 499) 800 142.4 9.7e-34
CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 289) 795 141.4 1.2e-33
CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 590) 791 141.0 3.1e-33
CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 591) 791 141.0 3.1e-33
CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 491) 789 140.6 3.4e-33
CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 489) 772 137.8 2.3e-32
CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 510) 702 126.3 7.1e-29
CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 597) 702 126.4 8e-29
CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 483) 623 113.3 5.6e-25
CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 303) 613 111.5 1.2e-24
CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 304) 613 111.5 1.2e-24
CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 454) 612 111.4 1.9e-24
CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 466) 612 111.5 1.9e-24
CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 287) 600 109.3 5.2e-24
CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 342) 478 89.3 6.6e-18
CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 273) 471 88.1 1.2e-17
CCDS58678.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 321) 472 88.3 1.2e-17
CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 ( 410) 470 88.0 1.9e-17
CCDS46184.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 339) 451 84.8 1.4e-16
CCDS42626.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 620) 451 85.1 2.2e-16
CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 ( 444) 422 80.2 4.7e-15
CCDS12907.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 287) 409 77.9 1.5e-14
CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 438) 407 77.7 2.6e-14
CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 455) 407 77.7 2.7e-14
CCDS55490.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1327) 397 76.5 1.8e-13
CCDS14629.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1336) 397 76.5 1.8e-13
CCDS55491.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1341) 397 76.5 1.9e-13
CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 271) 378 72.7 5e-13
CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 282) 378 72.8 5.1e-13
CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 286) 378 72.8 5.2e-13
CCDS46173.1 TARM1 gene_id:441864|Hs108|chr19 ( 271) 361 70.0 3.5e-12
CCDS42622.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 265) 352 68.5 9.5e-12
CCDS12909.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 275) 345 67.3 2.2e-11
CCDS14630.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX ( 242) 336 65.8 5.5e-11
CCDS12898.1 LAIR2 gene_id:3904|Hs108|chr19 ( 135) 328 64.3 8.9e-11
>>CCDS12902.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 (448 aa)
initn: 3061 init1: 3061 opt: 3061 Z-score: 2730.5 bits: 514.4 E(32554): 9e-146
Smith-Waterman score: 3061; 99.8% identity (99.8% similar) in 448 aa overlap (1-448:1-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MIPTFTALLCLGLSLGPRTDMQAGPLPKPTLWAEPGSVISWGNSVTIWCQGTLEAREYRL
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MIPTFTALLCLGLSLGPRTHMQAGPLPKPTLWAEPGSVISWGNSVTIWCQGTLEAREYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DKEESPAPWDRQNPLEPKNKARFSIPSMTEDYAGRYRCYYRSPVGWSQPSDPLELVMTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DKEESPAPWDRQNPLEPKNKARFSIPSMTEDYAGRYRCYYRSPVGWSQPSDPLELVMTGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YSKPTLSALPSPLVTSGKSVTLLCQSRSPMDTFLLIKERAAHPLLHLRSEHGAQQHQAEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YSKPTLSALPSPLVTSGKSVTLLCQSRSPMDTFLLIKERAAHPLLHLRSEHGAQQHQAEF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 PMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPRPSPTRSVSTAAGPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPRPSPTRSVSTAAGPED
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLVVSILLLSLLLFLLLQHWRQGKHRTLAQRQADFQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLVVSILLLSLLLFLLLQHWRQGKHRTLAQRQADFQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PPGAAEPEPKDGGLQRRSSPAADVQGENFCAAVKNTQPEDGVEMDTRQSPHDEDPQAVTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PPGAAEPEPKDGGLQRRSSPAADVQGENFCAAVKNTQPEDGVEMDTRQSPHDEDPQAVTY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AKVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDRQAEEDRQMDTEAAASEAPQDVTYARLHSFTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AKVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDRQAEEDRQMDTEAAASEAPQDVTYARLHSFTL
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE4 RQKATEPPPSQEGASPAEPSVYATLAIH
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RQKATEPPPSQEGASPAEPSVYATLAIH
430 440
>>CCDS42618.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 (447 aa)
initn: 2438 init1: 2388 opt: 3042 Z-score: 2713.6 bits: 511.3 E(32554): 7.9e-145
Smith-Waterman score: 3042; 99.6% identity (99.6% similar) in 448 aa overlap (1-448:1-447)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MIPTFTALLCLGLSLGPRTDMQAGPLPKPTLWAEPGSVISWGNSVTIWCQGTLEAREYRL
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MIPTFTALLCLGLSLGPRTHMQAGPLPKPTLWAEPGSVISWGNSVTIWCQGTLEAREYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DKEESPAPWDRQNPLEPKNKARFSIPSMTEDYAGRYRCYYRSPVGWSQPSDPLELVMTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DKEESPAPWDRQNPLEPKNKARFSIPSMTEDYAGRYRCYYRSPVGWSQPSDPLELVMTGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YSKPTLSALPSPLVTSGKSVTLLCQSRSPMDTFLLIKERAAHPLLHLRSEHGAQQHQAEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YSKPTLSALPSPLVTSGKSVTLLCQSRSPMDTFLLIKERAAHPLLHLRSEHGAQQHQAEF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 PMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPRPSPTRSVSTAAGPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPRPSPTRSVSTAAGPED
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLVVSILLLSLLLFLLLQHWRQGKHRTLAQRQADFQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLVVSILLLSLLLFLLLQHWRQGKHRTLAQRQADFQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PPGAAEPEPKDGGLQRRSSPAADVQGENFCAAVKNTQPEDGVEMDTRQSPHDEDPQAVTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS42 PPGAAEPEPKDGGLQRRSSPAADVQGENFCAAVKNTQPEDGVEMDTR-SPHDEDPQAVTY
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AKVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDRQAEEDRQMDTEAAASEAPQDVTYARLHSFTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AKVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDRQAEEDRQMDTEAAASEAPQDVTYARLHSFTL
360 370 380 390 400 410
430 440
pF1KE4 RQKATEPPPSQEGASPAEPSVYATLAIH
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RQKATEPPPSQEGASPAEPSVYATLAIH
420 430 440
>>CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 (652 aa)
initn: 1719 init1: 1006 opt: 1700 Z-score: 1518.0 bits: 290.6 E(32554): 3.1e-78
Smith-Waterman score: 1700; 61.8% identity (80.3% similar) in 432 aa overlap (24-448:221-652)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MIPTFTALLCLGLSLGPRTDMQAGPLPKPTLWAEPGSVISWGNSVTIWCQGTL
: ::.: ..:: ... ...:. : .
CCDS42 RRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEETLTLQCGSDA
200 210 220 230 240 250
60 70 80 90 100
pF1KE4 EAREYRL--DKEESPAPWDRQNPLEPKNKARFSIPSMTEDYAGRYRCYYRSPVG--WSQP
.. : : :.. .: ..: :.. ....:.:.:::: .. :: :
CCDS42 GYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSSEWSAP
260 270 280 290 300 310
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 SDPLELVMTGA-YSKPTLSALPSPLVTSGKSVTLLCQSRSPMDTFLLIKERAAHPLLHLR
::::.....: :.. .::. :.: :.::..:::::::.. :.:::: :: :: .::
CCDS42 SDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKEGAADDPWRLR
320 330 340 350 360 370
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 SEHGAQQHQAEFPMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPRPSP
: . .:..::::::.::::.:.:::::..:.. . :::.::::::::.::: ::
CCDS42 STYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVSGPSGGPSSPT
380 390 400 410 420 430
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 TRSVSTAAGPEDQPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLVVSILLLSLLL--FLLLQHWRQG
: .::.:::::::: :::: :.::: :: :.::.::. :::: ::: ::.:.: :::
CCDS42 TGPTSTSAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVILLLLLLLLLFLILRHRRQG
440 450 460 470 480 490
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 KHRTLAQRQADFQRPPGAAEPEPKDGGLQRRSSPAADVQGENFCAAVKNTQPEDGVEMDT
:: : .::.::::.: ::. ::: : ::: :::::::.: ::. ::::.:::::::::::
CCDS42 KHWTSTQRKADFQHPAGAVGPEPTDRGLQWRSSPAADAQEENLYAAVKHTQPEDGVEMDT
500 510 520 530 540 550
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 RQSPHDEDPQAVTYAKVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDRQAEEDRQMDTEAAASEA
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RQSPHDEDPQAVTYAEVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDRQAEEDRQMDTEAAASEA
560 570 580 590 600 610
410 420 430 440
pF1KE4 PQDVTYARLHSFTLRQKATEPPPSQEGASPAEPSVYATLAIH
:::::::.:::.:::..:::::::::: ::: ::.:::::::
CCDS42 PQDVTYAQLHSLTLRREATEPPPSQEGPSPAVPSIYATLAIH
620 630 640 650
>--
initn: 694 init1: 403 opt: 722 Z-score: 648.3 bits: 129.7 E(32554): 8.7e-30
Smith-Waterman score: 722; 53.4% identity (73.1% similar) in 219 aa overlap (1-217:1-219)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MIPTFTALLCLGLSLGPRTDMQAGPLPKPTLWAEPGSVISWGNSVTIWCQGTLEAREYRL
: : .:.:.:::::::::: .::: ::::::::::::::. :. ::. ::: :..::::
CCDS42 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 DKEESPAPWDRQNPLEPKNKARFSIPSMTEDYAGRYRCYYRSPV-GWSQPSDPLELVMTG
.:.. ::: . : : .:..: :::.: ...::::::: : . : :. :::::::.::
CCDS42 YREKKTAPWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGRSESSDPLELVVTG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 AYSKPTLSALPSPLVTSGKSVTLLCQSRSPMDTFLLIKE-RAAHPLLHLRSEHGAQQHQA
:: :::::: :::.:.:: .::: :.:. .: :.: :: . :: . :. . .:
CCDS42 AYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EFPMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPRPSPTRSVSTAAGP
: ..::. . :::.. . : : : ::: :::.:
CCDS42 IFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 EDQPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLVVSILLLSLLLFLLLQHWRQGKHRTLAQRQADF
CCDS42 TLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA
250 260 270 280 290 300
>>CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 (651 aa)
initn: 1719 init1: 1006 opt: 1695 Z-score: 1513.6 bits: 289.8 E(32554): 5.5e-78
Smith-Waterman score: 1695; 61.6% identity (80.8% similar) in 432 aa overlap (24-448:221-651)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MIPTFTALLCLGLSLGPRTDMQAGPLPKPTLWAEPGSVISWGNSVTIWCQGTL
: ::.: ..:: ... ...:. : .
CCDS42 RRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEETLTLQCGSDA
200 210 220 230 240 250
60 70 80 90 100
pF1KE4 EAREYRL--DKEESPAPWDRQNPLEPKNKARFSIPSMTEDYAGRYRCYYRSPVG--WSQP
.. : : :.. .: ..: :.. ....:.:.:::: .. :: :
CCDS42 GYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSSEWSAP
260 270 280 290 300 310
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 SDPLELVMTGA-YSKPTLSALPSPLVTSGKSVTLLCQSRSPMDTFLLIKERAAHPLLHLR
::::.....: :.. .::. :.: :.::..:::::::.. :.:::: :: :: .::
CCDS42 SDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKEGAADDPWRLR
320 330 340 350 360 370
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 SEHGAQQHQAEFPMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPRPSP
: . .:..::::::.::::.:.:::::..:.. . :::.::::::::.::: :: ::
CCDS42 STYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVSGPSGGPS-SP
380 390 400 410 420
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>--
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: ..::. . :::.. . : : : ::: :::.:
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pF1KE4 EDQPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLVVSILLLSLLLFLLLQHWRQGKHRTLAQRQADF
CCDS42 TLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA
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pF1KE4 SEHGAQQHQAEFPMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPRPSP
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CCDS42 STYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVSGPSGGPS-SP
380 390 400 410 420
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pF1KE4 TRSVSTAAGPEDQPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLVVSILLLSLLL--FLLLQHWRQG
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CCDS42 TTGPTSTSGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVILLLLLLLLLFLILRHRRQG
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CCDS42 KHWTSTQRKADFQHPAGAVGPEPTDRGLQWRSSPAADAQEENLYAAVKHTQPEDGVEMDT
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pF1KE4 RQSPHDEDPQAVTYAKVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDRQAEEDRQMDTEAAASEA
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CCDS42 YREKKTAPWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGRSESSDPLELVVTG
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CCDS62 GYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSSEWSAP
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CCDS62 SDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKEGAADDPWRLR
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pF1KE4 SEHGAQQHQAEFPMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPRPSP
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CCDS62 STYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVS----------
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pF1KE4 TRSVSTAAGPEDQPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLVVSILLLSLLL--FLLLQHWRQG
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CCDS62 -------AGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVILLLLLLLLLFLILRHRRQG
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pF1KE4 KHRTLAQRQADFQRPPGAAEPEPKDGGLQRRSSPAADVQGENFCAAVKNTQPEDGVEMDT
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pF1KE4 RQSPHDEDPQAVTYAKVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDRQAEEDRQMDTEAAASEA
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CCDS62 R-SPHDEDPQAVTYAEVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDRQAEEDRQMDTEAAASEA
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pF1KE4 PQDVTYARLHSFTLRQKATEPPPSQEGASPAEPSVYATLAIH
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pF1KE4 DKEESPAPWDRQNPLEPKNKARFSIPSMTEDYAGRYRCYYRSPV-GWSQPSDPLELVMTG
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CCDS62 YREKKTAPWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGRSESSDPLELVVTG
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pF1KE4 AYSKPTLSALPSPLVTSGKSVTLLCQSRSPMDTFLLIKE-RAAHPLLHLRSEHGAQQHQA
:: :::::: :::.:.:: .::: :.:. .: :.: :: . :: . :. . .:
CCDS62 AYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA
130 140 150 160 170 180
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pF1KE4 EFPMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPRPSPTRSVSTAAGP
: ..::. . :::.. . : : : ::: :::.:
CCDS62 IFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 EDQPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLVVSILLLSLLLFLLLQHWRQGKHRTLAQRQADF
CCDS62 TLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA
250 260 270 280 290 300
>>CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 (482 aa)
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Smith-Waterman score: 1216; 51.0% identity (66.7% similar) in 435 aa overlap (24-448:104-482)
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pF1KE4 MIPTFTALLCLGLSLGPRTDMQAGPLPKPTLWAEPGSVISWGNSVTIWCQGTL
: ::.: ..:: :.. :.:.:. : . .
CCDS62 RRWSHRCYGYDLNSPYVWSSPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPVMAPGESLTLQCVSDV
80 90 100 110 120 130
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pF1KE4 EAREYRLDKEESPAPWD-RQNP-LEPK---NKARFSIPSMTEDYAGRYRCYYRSPVGW--
.. : :: . : :: : .:. ..: :.. ....:.:.:::: ..
CCDS62 GYDRFVLYKE---GERDLRQLPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSSEC
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pF1KE4 SQPSDPLELVMTGAY-SKPTLSALPSPLVTSGKSVTLLCQSRSPMDTFLLIKERAAHPLL
: :::::....:: . : .:. :.: :.::..::::::: . :::: : :: :
CCDS62 SAPSDPLDILITGQIRGTPFISVQPGPTVASGENVTLLCQSWRQFHTFLLTKAGAADAPL
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 HLRSEHGAQQHQAEFPMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPR
.::: : ..:::::::::::.:.:::::..: . . :::::::.::::.::: :
CCDS62 RLRSIHEYPKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLNSDPYLLSHPSEPLELVVSGPSMGSS
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 PSPTRSVSTAAGPEDQPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLV--VSILLLSLLLFLLLQHW
: :: .:: :::::::: :::: :.::: :: :.::.:: : .::: :::::.:.:
CCDS62 PPPTGPISTPAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVVLLLLLLLLLFLILRHR
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 RQGKHRTLAQRQADFQRPPGAAEPEPKDGGLQRRSSPAADVQGENFCAAVKNTQPEDGVE
::::: : .::.::::.: ::. ::: : ::: :::::::.: ::. ::::.::::::::
CCDS62 RQGKHWTSTQRKADFQHPAGAVGPEPTDRGLQWRSSPAADAQEENLYAAVKDTQPEDGVE
380 390 400 410 420 430
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 MDTRQSPHDEDPQAVTYAKVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDRQAEEDRQMDTEAAA
:::: :::
CCDS62 MDTR-----------------------------------------------------AAA
410 420 430 440
pF1KE4 SEAPQDVTYARLHSFTLRQKATEPPPSQEGASPAEPSVYATLAIH
::::::::::.:::.:::.:::::::::: :::::.:::::::
CCDS62 SEAPQDVTYAQLHSLTLRRKATEPPPSQEREPPAEPSIYATLAIH
440 450 460 470 480
>>CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 (598 aa)
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Smith-Waterman score: 1216; 51.0% identity (66.7% similar) in 435 aa overlap (24-448:220-598)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MIPTFTALLCLGLSLGPRTDMQAGPLPKPTLWAEPGSVISWGNSVTIWCQGTL
: ::.: ..:: :.. :.:.:. : . .
CCDS12 RRWSHRCYGYDLNSPYVWSSPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPVMAPGESLTLQCVSDV
190 200 210 220 230 240
60 70 80 90 100
pF1KE4 EAREYRLDKEESPAPWD-RQNP-LEPK---NKARFSIPSMTEDYAGRYRCYYRSPVGW--
.. : :: . : :: : .:. ..: :.. ....:.:.:::: ..
CCDS12 GYDRFVLYKE---GERDLRQLPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSSEC
250 260 270 280 290 300
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 SQPSDPLELVMTGAY-SKPTLSALPSPLVTSGKSVTLLCQSRSPMDTFLLIKERAAHPLL
: :::::....:: . : .:. :.: :.::..::::::: . :::: : :: :
CCDS12 SAPSDPLDILITGQIRGTPFISVQPGPTVASGENVTLLCQSWRQFHTFLLTKAGAADAPL
310 320 330 340 350 360
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 HLRSEHGAQQHQAEFPMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPR
.::: : ..:::::::::::.:.:::::..: . . :::::::.::::.::: :
CCDS12 RLRSIHEYPKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLNSDPYLLSHPSEPLELVVSGPSMGSS
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 PSPTRSVSTAAGPEDQPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLV--VSILLLSLLLFLLLQHW
: :: .:: :::::::: :::: :.::: :: :.::.:: : .::: :::::.:.:
CCDS12 PPPTGPISTPAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVVLLLLLLLLLFLILRHR
430 440 450 460 470 480
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 RQGKHRTLAQRQADFQRPPGAAEPEPKDGGLQRRSSPAADVQGENFCAAVKNTQPEDGVE
::::: : .::.::::.: ::. ::: : ::: :::::::.: ::. ::::.::::::::
CCDS12 RQGKHWTSTQRKADFQHPAGAVGPEPTDRGLQWRSSPAADAQEENLYAAVKDTQPEDGVE
490 500 510 520 530 540
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 MDTRQSPHDEDPQAVTYAKVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDRQAEEDRQMDTEAAA
:::: :::
CCDS12 MDTR-----------------------------------------------------AAA
550
410 420 430 440
pF1KE4 SEAPQDVTYARLHSFTLRQKATEPPPSQEGASPAEPSVYATLAIH
::::::::::.:::.:::.:::::::::: :::::.:::::::
CCDS12 SEAPQDVTYAQLHSLTLRRKATEPPPSQEREPPAEPSIYATLAIH
560 570 580 590
>--
initn: 678 init1: 590 opt: 684 Z-score: 615.0 bits: 123.4 E(32554): 6.2e-28
Smith-Waterman score: 684; 51.6% identity (70.3% similar) in 219 aa overlap (1-217:1-218)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MIPTFTALLCLGLSLGPRTDMQAGPLPKPTLWAEPGSVISWGNSVTIWCQGTLEAREYRL
: : :.:.:::::::::: .:.: .::::::::: :::. :. ::. :::.:::.::::
CCDS12 MTPIVTVLICLGLSLGPRTRVQTGTIPKPTLWAEPDSVITQGSPVTLSCQGSLEAQEYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 DKEESPAPW-DRQNPLEPKNKARFSIPSMTEDYAGRYRCYYRSPVGWSQPSDPLELVMTG
.:.. : : : : :: ..: :::.: ...::: : : : . ::. :::: :::::
CCDS12 YREKKSASWITRIRPELVKN-GQFHIPSITWEHTGRYGCQYYSRARWSELSDPLVLVMTG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 AYSKPTLSALPSPLVTSGKSVTLLCQSRSPMDTFLLIKE-RAAHPLLHLRSEHGAQQHQA
:: :::::: :::.:::: ::: :.:. . :.: :: . :: . :. . .:
CCDS12 AYPKPTLSAQPSPVVTSGGRVTLQCESQVAFGGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EFPMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPRPSPTRSVSTAAGP
: ..::. . ..::.. : :. : ::: :::.:
CCDS12 IFSVGPVSPNRRWSHRCYGYDLNSPYVWSSPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPVMAPGE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 EDQPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLVVSILLLSLLLFLLLQHWRQGKHRTLAQRQADF
CCDS12 SLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDLRQLPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA
240 250 260 270 280 290
>>CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 (632 aa)
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Smith-Waterman score: 1559; 59.0% identity (76.0% similar) in 437 aa overlap (17-448:213-632)
10 20 30 40
pF1KE4 MIPTFTALLCLGLSLGPRTDMQAGPLPKPTLWAEPGSVISWGNSVT
: . .: ::.: . : :.. :.:.:
CCDS46 VGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLT
190 200 210 220 230 240
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 IWCQGTLEAREYRLDKEESPAPWDR--QNPLEPKNKARFSIPSMTEDYAGRYRCYYRSPV
. : . . .. : :: .: :.: ..: :.. ....:.:.:::: .
CCDS46 LQCGSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNL
250 260 270 280 290 300
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 G--WSQPSDPLELVMTGA-YSKPTLSALPSPLVTSGKSVTLLCQSRSPMDTFLLIKERAA
. :: :::::....:: :. .::: :.: :.::...:::::::. .::::: :: ::
CCDS46 SSEWSAPSDPLDILITGQIYDTVSLSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAA
310 320 330 340 350 360
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 HPLLHLRSEHGAQQHQAEFPMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSL
:: :.::: .::...:::::::::::.:.:::::..:.. . .::: ::.::::.:::
CCDS46 HPPLRLRSMYGAHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHS
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 EGPRPSPTRSVSTAAGPEDQPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLVVSILLLSLLLFLLLQ
: :: :: . : :: :. :::::: :. .::: :::::::
CCDS46 GGSSLPPT-------GPPSTP----------GLGRYLEVLIGVSVAFVLLLFLLLFLLLL
430 440 450 460
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 HWRQGKHRTLAQRQADFQRPPGAAEPEPKDGGLQRRSSPAADVQGENFCAAVKNTQPEDG
. :..:::: ::..::::: :::: :::: :: :::::::::: ::. ::::.:: ::
CCDS46 RQRHSKHRTSDQRKTDFQRPAGAAETEPKDRGLLRRSSPAADVQEENLYAAVKDTQSEDR
470 480 490 500 510 520
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 VEMDTRQSPHDEDPQAVTYAKVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDRQAEEDRQMDTEA
::.:..:::::::::::::: :::: :::::::::: ::::::::::::.::::::::::
CCDS46 VELDSQQSPHDEDPQAVTYAPVKHSSPRREMASPPSSLSGEFLDTKDRQVEEDRQMDTEA
530 540 550 560 570 580
410 420 430 440
pF1KE4 AASEAPQDVTYARLHSFTLRQKATEPPPSQEGASPAEPSVYATLAIH
::::: ::::::.:::.:::.::::::::::: :::::.:::::::
CCDS46 AASEASQDVTYAQLHSLTLRRKATEPPPSQEGEPPAEPSIYATLAIH
590 600 610 620 630
>--
initn: 940 init1: 855 opt: 938 Z-score: 840.5 bits: 165.2 E(32554): 1.7e-40
Smith-Waterman score: 938; 64.7% identity (80.5% similar) in 215 aa overlap (1-211:1-212)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MIPTFTALLCLGLSLGPRTDMQAGPLPKPTLWAEPGSVISWGNSVTIWCQGTLEAREYRL
: :..:::::::::::::: :::::.::::::::::::::::. :::::::.:::.::.:
CCDS46 MTPALTALLCLGLSLGPRTRMQAGPFPKPTLWAEPGSVISWGSPVTIWCQGSLEAQEYQL
10 20 30 40 50 60
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pF1KE4 DKEESPAPWDRQNPLEPKNKARFSIPSMTEDYAGRYRCYYRSPVGWSQPSDPLELVMTGA
::: :: ::::.:::::::::::::::::. .::::::.: : .:::.:::::::::::
CCDS46 DKEGSPEPWDRNNPLEPKNKARFSIPSMTQHHAGRYRCHYYSSAGWSEPSDPLELVMTGF
70 80 90 100 110 120
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pF1KE4 YSKPTLSALPSPLVTSGKSVTLLCQSRSPMDTFLLIKERAAHPLLHLRSEHGAQQH----
:.::::::::::.:.:: ..:: : :.. . :.:.:: . : : :. . : :
CCDS46 YNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQKGYHHFVLMKE-GEHQLP--RTLDSQQLHSGGF
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 QAEFPMSPVTSVHGGTYRCFSSHGFSHYLLSHPSDPLELIVSGSLEGPRPSPTRSVSTAA
:: ::..::: : . :. . . .. :::::
CCDS46 QALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 GPEDQPLMPTGSVPHSGLRRHWEVLIGVLVVSILLLSLLLFLLLQHWRQGKHRTLAQRQA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]