Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4425
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4425, 440 aa
1>>>pF1KE4425 440 - 440 aa - 440 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7729+/-0.000788; mu= 14.4434+/- 0.047
mean_var=62.3197+/-12.533, 0's: 0 Z-trim(107.0): 43 B-trim: 91 in 1/51
Lambda= 0.162466
statistics sampled from 9263 (9305) to 9263 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16
Scan time: 2.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1675.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 ( 440) 2954 701.0 6.1e-202
CCDS62852.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 ( 437) 2934 696.3 1.6e-200
CCDS62853.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 ( 445) 2922 693.5 1.1e-199
CCDS62855.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 ( 488) 2922 693.5 1.2e-199
CCDS62854.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 ( 492) 2922 693.5 1.2e-199
CCDS5893.1 PDIA4 gene_id:9601|Hs108|chr7 ( 645) 332 86.4 8.9e-17
CCDS10101.1 PDIA3 gene_id:2923|Hs108|chr15 ( 505) 310 81.3 2.5e-15
CCDS32840.1 TMX3 gene_id:54495|Hs108|chr18 ( 454) 282 74.7 2.1e-13
CCDS3020.1 PDIA5 gene_id:10954|Hs108|chr3 ( 519) 281 74.5 2.9e-13
CCDS4505.1 TXNDC5 gene_id:81567|Hs108|chr6 ( 432) 259 69.3 8.6e-12
CCDS74613.1 DNAJC10 gene_id:54431|Hs108|chr2 ( 747) 248 66.8 8.6e-11
CCDS33345.1 DNAJC10 gene_id:54431|Hs108|chr2 ( 793) 248 66.8 9.1e-11
>>CCDS1675.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 (440 aa)
initn: 2954 init1: 2954 opt: 2954 Z-score: 3738.9 bits: 701.0 E(32554): 6.1e-202
Smith-Waterman score: 2954; 100.0% identity (100.0% similar) in 440 aa overlap (1-440:1-440)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MALLVLGLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MALLVLGLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LTPEWKKAATALKDVVKVGAVDADKHHSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRPEDYQGGRTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LTPEWKKAATALKDVVKVGAVDADKHHSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRPEDYQGGRTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 EAIVDAALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 EAIVDAALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 WMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 WMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 KIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 KIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VLPHILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWTEAGAQSELETALGIGGFGYPAMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 VLPHILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWTEAGAQSELETALGIGGFGYPAMA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTAPVGGGAFPTIVEREPWDGRDGELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 AINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTAPVGGGAFPTIVEREPWDGRDGELP
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE4 VEDDIDLSDVELDDLGKDEL
::::::::::::::::::::
CCDS16 VEDDIDLSDVELDDLGKDEL
430 440
>>CCDS62852.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 (437 aa)
initn: 2934 init1: 2934 opt: 2934 Z-score: 3713.6 bits: 696.3 E(32554): 1.6e-200
Smith-Waterman score: 2934; 99.5% identity (100.0% similar) in 437 aa overlap (4-440:1-437)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MALLVLGLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQR
..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MILGLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LTPEWKKAATALKDVVKVGAVDADKHHSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRPEDYQGGRTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LTPEWKKAATALKDVVKVGAVDADKHHSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRPEDYQGGRTG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 EAIVDAALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EAIVDAALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 WMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 WMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 KIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VLPHILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWTEAGAQSELETALGIGGFGYPAMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VLPHILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWTEAGAQSELETALGIGGFGYPAMA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTAPVGGGAFPTIVEREPWDGRDGELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTAPVGGGAFPTIVEREPWDGRDGELP
360 370 380 390 400 410
430 440
pF1KE4 VEDDIDLSDVELDDLGKDEL
::::::::::::::::::::
CCDS62 VEDDIDLSDVELDDLGKDEL
420 430
>>CCDS62853.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 (445 aa)
initn: 2922 init1: 2922 opt: 2922 Z-score: 3698.3 bits: 693.5 E(32554): 1.1e-199
Smith-Waterman score: 2922; 100.0% identity (100.0% similar) in 434 aa overlap (7-440:12-445)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MALLVLGLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MYPSTTMANAPGLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GHCQRLTPEWKKAATALKDVVKVGAVDADKHHSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRPEDYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GHCQRLTPEWKKAATALKDVVKVGAVDADKHHSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRPEDYQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 GGRTGEAIVDAALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GGRTGEAIVDAALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 DSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 GFPTIKIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRTCEEHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GFPTIKIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRTCEEHQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 LCVVAVLPHILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWTEAGAQSELETALGIGGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LCVVAVLPHILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWTEAGAQSELETALGIGGFG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 YPAMAAINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTAPVGGGAFPTIVEREPWDGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 YPAMAAINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTAPVGGGAFPTIVEREPWDGR
370 380 390 400 410 420
420 430 440
pF1KE4 DGELPVEDDIDLSDVELDDLGKDEL
:::::::::::::::::::::::::
CCDS62 DGELPVEDDIDLSDVELDDLGKDEL
430 440
>>CCDS62855.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 (488 aa)
initn: 2922 init1: 2922 opt: 2922 Z-score: 3697.6 bits: 693.5 E(32554): 1.2e-199
Smith-Waterman score: 2922; 100.0% identity (100.0% similar) in 434 aa overlap (7-440:55-488)
10 20 30
pF1KE4 MALLVLGLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SDRGSPTSPAHSLSRKSPIMYPSTTMANAPGLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFN
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 REVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKAATALKDVVKVGAVDADKHHSLGGQYGVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 REVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKAATALKDVVKVGAVDADKHHSLGGQYGVQ
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 GFPTIKIFGSNKNRPEDYQGGRTGEAIVDAALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GFPTIKIFGSNKNRPEDYQGGRTGEAIVDAALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDS
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 SSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVK
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 LAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTIKIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTIKIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPP
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 ELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVAVLPHILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVAVLPHILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLW
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 TEAGAQSELETALGIGGFGYPAMAAINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TEAGAQSELETALGIGGFGYPAMAAINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTA
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440
pF1KE4 PVGGGAFPTIVEREPWDGRDGELPVEDDIDLSDVELDDLGKDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 PVGGGAFPTIVEREPWDGRDGELPVEDDIDLSDVELDDLGKDEL
450 460 470 480
>>CCDS62854.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2 (492 aa)
initn: 2922 init1: 2922 opt: 2922 Z-score: 3697.6 bits: 693.5 E(32554): 1.2e-199
Smith-Waterman score: 2922; 100.0% identity (100.0% similar) in 434 aa overlap (7-440:59-492)
10 20 30
pF1KE4 MALLVLGLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 FQPCSPTSPAHSLSRKSPIMYPSTTMANAPGLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFN
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 REVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKAATALKDVVKVGAVDADKHHSLGGQYGVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 REVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKAATALKDVVKVGAVDADKHHSLGGQYGVQ
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 GFPTIKIFGSNKNRPEDYQGGRTGEAIVDAALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GFPTIKIFGSNKNRPEDYQGGRTGEAIVDAALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDS
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 SSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVK
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 LAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTIKIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTIKIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPP
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 ELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVAVLPHILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVAVLPHILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLW
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 TEAGAQSELETALGIGGFGYPAMAAINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TEAGAQSELETALGIGGFGYPAMAAINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTA
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440
pF1KE4 PVGGGAFPTIVEREPWDGRDGELPVEDDIDLSDVELDDLGKDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 PVGGGAFPTIVEREPWDGRDGELPVEDDIDLSDVELDDLGKDEL
450 460 470 480 490
>>CCDS5893.1 PDIA4 gene_id:9601|Hs108|chr7 (645 aa)
initn: 408 init1: 167 opt: 332 Z-score: 414.7 bits: 86.4 E(32554): 8.9e-17
Smith-Waterman score: 554; 37.5% identity (67.4% similar) in 261 aa overlap (25-281:62-293)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MALLVLGLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPW
. :. :. .::. : ..:.. :.::::::
CCDS58 SNRENAIEDEEEEEEEDDDEEEDDLEVKEENGVLVLNDANFDNFVADKDTV-LLEFYAPW
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 CGHCQRLTPEWKKAATALKDV---VKVGAVDADKHHSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRP
::::....::..: :. ::: . :. .:: . :.... :.:.:::::. .:..
CCDS58 CGHCKQFAPEYEKIANILKDKDPPIPVAKIDATSASVLASRFDVSGYPTIKIL--KKGQA
100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 EDYQGGRTGEAIVDAALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDV-IELTDDSF
::.:.:: : :: . .:.. .. : . .: . :: ..:
CCDS58 VDYEGSRTQEEIV----AKVREV-----------------SQPDWTPPPEVTLVLTKENF
150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DKNVLDSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLAS
:. :... :. .::::::::::::.: ::. ::.:..... . :: ::::.. ::.
CCDS58 DE-VVNDADIILVEFYAPWCGHCKKLAPEYEKAAKELSKRSP-PIPLAKVDATAETDLAK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 RYGIRGFPTIKIFQKGESPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRT
:. . :.::.:::.::. : ::.: : . ::. .. ... : :.: .
CCDS58 RFDVSGYPTLKIFRKGR-PYDYNGPREKYGIVDYMIE--QSGPPSKEILTLKQVQEFLKD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 CEEHQLCVVAVLPHILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWTEAGAQSELETALG
CCDS58 GDDVIIIGVFKGESDPAYQQYQDAANNLREDYKFHHTFSTEIAKFLKVSQGQLVVMQPEK
310 320 330 340 350 360
>--
initn: 265 init1: 165 opt: 274 Z-score: 341.2 bits: 72.8 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 274; 43.6% identity (72.3% similar) in 101 aa overlap (157-255:522-620)
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ALSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFY
..: : .. .::. :.: . ..:::
CCDS58 EFDSDTLREFVTAFKKGKLKPVIKSQPVPKNNKGPVKVVVGKTFDSIVMDPKKDVLIEFY
500 510 520 530 540 550
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 APWCGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTIKIFQKG
::::::::.::: . . :.. : : :: : .: .:::.:.: ..:: ..::::: . .:
CCDS58 APWCGHCKQLEPVYNSLAKKYKGQ-KGLV-IAKMDATANDVPSDRYKVEGFPTIYFAPSG
560 570 580 590 600
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 E--SPVDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVAVLPH
. .:: ..::
CCDS58 DKKNPVKFEGGDRDLEHLSKFIEEHATKLSRTKEEL
610 620 630 640
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.. .::.:::::.:.. . : : . .::
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190 200 210 220 230 240
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CCDS10 FFAPWCGHCKRLAPEYEAAATRLK----GIVPLAKVDCTANTNTCNKYGVSGYPTLKIFR
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:: ::: :: . :::. .. .: : . . .:. :. ... .:. .
CCDS10 DGEEAGAYDGPRTADGIVSH----LKKQAGPASV-PLRTEEEFKKFISDKDASIVGFFD-
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:. . ... .:.. .: :.:.
CCDS10 --DSFSEAHSEFLKAASNLRDNYRFAHTNVESLVNEYDDNGEGIILFRPSHLTNKFEDKT
170 180 190 200 210
>--
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::.....: . : : .: .:...
CCDS10 STAGEIPVVAIRTAKGEKFVMQEEFSRDGKALERFLQDYFDGNLKRYLKSEPIPESNDGP
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: :. ..::. : . . ..:::::::::::::::.. . ..... . . .:
CCDS10 VKVVVA---ENFDEIVNNENKDVLIEFYAPWCGHCKNLEPKYKELGEKLSKDPN--IVIA
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.:::.:.: : : .:::::: . .: .: :.::: ::..: : . . ::
CCDS10 KMDATANDV-PSPYEVRGFPTIYFSPANKKLNPKKYEGGRELSDFISY---LQREATNPP
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pF1KE4 ELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVAVLPHILDTGAAGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLW
.:.:. :.
CCDS10 ----VIQEEKPKKKKKAQEDL
490 500
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:::::.::: : .. :.: . . ::.. .::: . .::..:.::.::::.. ::.
CCDS32 CGHCKKLEPIWNEVGLEMK-SIGSPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLL-KGDLA
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CCDS32 YNYRGPRTKDDIIEFAHRVSGALIRPLPSQQMFEHMQKRHRVFFVYVGGESPLKEKYIDA
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CCDS30 YNRAVTFKSIVAFLKDPKGPPLWEEDPGAKDVVHLDSEKDFRRLLKKEEKPLLIMFYAPW
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CCDS30 CSMCKRMMPHFQKAATQLRGHAVLAGMNVYSSEFENIKEEYSVRGFPTICYFEKGRFLFQ
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CCDS30 DQFVKEHSSV-LVMFHAPWCGHCKKMKPEFEKAAEALHGEADSSGVLAAVDATVNKALAE
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CCDS45 WMLQTLNEEPVTPEPEVEPPSAPELKQGLYELSASNFELHVAQGDH--FIKFFAPWCGHC
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 00:41:36 2016 done: Sun Nov 6 00:41:36 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]