Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4421
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4421, 437 aa
1>>>pF1KE4421 437 - 437 aa - 437 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5282+/-0.00129; mu= 11.7627+/- 0.077
mean_var=90.5343+/-17.790, 0's: 0 Z-trim(102.1): 29 B-trim: 6 in 1/48
Lambda= 0.134793
statistics sampled from 6795 (6810) to 6795 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 2.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6490.1 PLIN2 gene_id:123|Hs108|chr9 ( 437) 2754 546.2 2.4e-155
CCDS12137.1 PLIN3 gene_id:10226|Hs108|chr19 ( 434) 1170 238.2 1.3e-62
CCDS59338.1 PLIN3 gene_id:10226|Hs108|chr19 ( 433) 1157 235.6 7.3e-62
CCDS59337.1 PLIN3 gene_id:10226|Hs108|chr19 ( 422) 629 132.9 5.7e-31
CCDS10353.1 PLIN1 gene_id:5346|Hs108|chr15 ( 522) 429 94.1 3.5e-19
CCDS42473.1 PLIN5 gene_id:440503|Hs108|chr19 ( 463) 343 77.3 3.4e-14
>>CCDS6490.1 PLIN2 gene_id:123|Hs108|chr9 (437 aa)
initn: 2754 init1: 2754 opt: 2754 Z-score: 2902.5 bits: 546.2 E(32554): 2.4e-155
Smith-Waterman score: 2754; 100.0% identity (100.0% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-437)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVCEMAENGVKTITSV
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CCDS64 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVCEMAENGVKTITSV
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVANAKGAVTGAKDAVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSRMMQLVSSGVENAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLVQKPSYYVRLGSLSTKLHSRAYQQALSRVK
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CCDS64 TKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLVQKPSYYVRLGSLSTKLHSRAYQQALSRVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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CCDS64 EAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKLYLSWVEWKRSIGYDDTDES
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQDQAKHMGVMAGDIYSVFRNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQDQAKHMGVMAGDIYSVFRNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 ASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWLVGPFYPQLTESQNAQDQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWLVGPFYPQLTESQNAQDQGA
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE4 EMDKSSQETQRSEHKTH
:::::::::::::::::
CCDS64 EMDKSSQETQRSEHKTH
430
>>CCDS12137.1 PLIN3 gene_id:10226|Hs108|chr19 (434 aa)
initn: 1111 init1: 671 opt: 1170 Z-score: 1237.8 bits: 238.2 E(32554): 1.3e-62
Smith-Waterman score: 1170; 42.8% identity (80.7% similar) in 409 aa overlap (9-411:22-427)
10 20 30 40
pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVC
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CCDS12 MSADGAEADGSTQVTVEEPVQQPSVVDRVASMPLISSTCDMVSAAYASTKESYPHIKTVC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 EMAENGVKTITSVAMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVAN
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CCDS12 DAAEKGVRTLTAAAVSGAQPILSKLEPQIASASEYAHRGLDKLEENLPILQQPTEKVLAD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 AKGAVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSR
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CCDS12 TKELVSSKVSGAQEMVSSAKDTVATQLSEAVDATRGAVQSGVDKTKSVVTGGVQSVMGSR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 MMQLVSSGVENALTKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLV------QKPSYYVRLG
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CCDS12 LGQMVLSGVDTVLGKSEEWADNHLPLTDAELARIATSLDGFDVASVQQQRQEQSYFVRLG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SLSTKLHSRAYQQALSRVKEAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKL
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CCDS12 SLSERLRQHAYEHSLGKLRATKQRAQEALLQLSQVLSLMETVKQGV---DQKLVEGQEKL
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 YLSWVEWKRSIGYDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQD
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CCDS12 HQMWLSWNQKQLQGPEKEPPKPEQVESRALTMFRDIAQQLQATCTSLGSSIQGLPTNVKD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 QAKHMGVMAGDIYSVFRNAASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWL
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CCDS12 QVQQARRQVEDLQATFSSIHSFQDLSSSILAQSRERVASAREALDHMVEYVAQNTPVTWL
360 370 380 390 400 410
410 420 430
pF1KE4 VGPFYPQLTESQNAQDQGAEMDKSSQETQRSEHKTH
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CCDS12 VGPFAPGITEKAPEEKK
420 430
>>CCDS59338.1 PLIN3 gene_id:10226|Hs108|chr19 (433 aa)
initn: 1217 init1: 671 opt: 1157 Z-score: 1224.2 bits: 235.6 E(32554): 7.3e-62
Smith-Waterman score: 1157; 42.8% identity (80.4% similar) in 409 aa overlap (9-411:22-426)
10 20 30 40
pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVC
::::: ::...::.::: :..:.:: :::..::..:.::
CCDS59 MSADGAEADGSTQVTVEEPVQQPSVVDRVASMPLISSTCDMVSAAYASTKESYPHIKTVC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 EMAENGVKTITSVAMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVAN
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CCDS59 DAAEKGVRTLTAAAVSGAQPILSKLEPQIASASEYAHRGLDKLEENLPILQQPTEKVLAD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 AKGAVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSR
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CCDS59 TKELVSSKVSGAQEMVSSAKDTVATQLSEAVDATRGAVQSGVDKTKSVVTGGVQSVMGSR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 MMQLVSSGVENALTKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLV------QKPSYYVRLG
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CCDS59 LGQMVLSGVDTVLGKSEEWADNHLPLTDAELARIATSLDGFDVASVQQQRQEQSYFVRLG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SLSTKLHSRAYQQALSRVKEAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKL
::: .:...::...:.... .::..:... :: ... :.: ....: .::. ..:.::
CCDS59 SLSERLRQHAYEHSLGKLRATKQRAQEALLQLSQVLSLMETVKQGV---DQKLVEGQEKL
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 YLSWVEWKRSIGYDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQD
. :. :... : : .:::.:.. :...::::.:: .: :.:::.: :..:
CCDS59 HQMWLSWNQKQLQGPEKEPPKPE-VESRALTMFRDIAQQLQATCTSLGSSIQGLPTNVKD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 QAKHMGVMAGDIYSVFRNAASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWL
:... .. :. ..: . ::...:.:.:..:. .. . .:.:: ...:...:::..::
CCDS59 QVQQARRQVEDLQATFSSIHSFQDLSSSILAQSRERVASAREALDHMVEYVAQNTPVTWL
360 370 380 390 400 410
410 420 430
pF1KE4 VGPFYPQLTESQNAQDQGAEMDKSSQETQRSEHKTH
:::: : .::
CCDS59 VGPFAPGITEKAPEEKK
420 430
>>CCDS59337.1 PLIN3 gene_id:10226|Hs108|chr19 (422 aa)
initn: 1081 init1: 388 opt: 629 Z-score: 669.4 bits: 132.9 E(32554): 5.7e-31
Smith-Waterman score: 1138; 42.8% identity (79.2% similar) in 409 aa overlap (9-411:22-415)
10 20 30 40
pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVC
::::: ::...::.::: :..:.:: :::..::..:.::
CCDS59 MSADGAEADGSTQVTVEEPVQQPSVVDRVASMPLISSTCDMVSAAYASTKESYPHIKTVC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 EMAENGVKTITSVAMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVAN
. ::.::.:.:..:...: ::..::::::: :. :: .:::..:: ::::.::. .
CCDS59 DAAEKGVRTLTAAAVSGAQPILSKLEPQIASASEYAHRGLDKLEENLPILQQPTEK----
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 AKGAVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSR
:.::.. :.. :::.::. .. ..: :.::: ..:.::::::.:....:.:::
CCDS59 ----VSGAQEMVSS----AKDTVATQLSEAVDATRGAVQSGVDKTKSVVTGGVQSVMGSR
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 MMQLVSSGVENALTKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLV------QKPSYYVRLG
. :.: :::...: ::: ....::::. :: . : ...:::.. :. ::.::::
CCDS59 LGQMVLSGVDTVLGKSEEWADNHLPLTDAELARIATSLDGFDVASVQQQRQEQSYFVRLG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SLSTKLHSRAYQQALSRVKEAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKL
::: .:...::...:.... .::..:... :: ... :.: ....: .::. ..:.::
CCDS59 SLSERLRQHAYEHSLGKLRATKQRAQEALLQLSQVLSLMETVKQGV---DQKLVEGQEKL
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 YLSWVEWKRSIGYDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQD
. :. :... : :..:::.:.. :...::::.:: .: :.:::.: :..:
CCDS59 HQMWLSWNQKQLQGPEKEPPKPEQVESRALTMFRDIAQQLQATCTSLGSSIQGLPTNVKD
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 QAKHMGVMAGDIYSVFRNAASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWL
:... .. :. ..: . ::...:.:.:..:. .. . .:.:: ...:...:::..::
CCDS59 QVQQARRQVEDLQATFSSIHSFQDLSSSILAQSRERVASAREALDHMVEYVAQNTPVTWL
350 360 370 380 390 400
410 420 430
pF1KE4 VGPFYPQLTESQNAQDQGAEMDKSSQETQRSEHKTH
:::: : .::
CCDS59 VGPFAPGITEKAPEEKK
410 420
>>CCDS10353.1 PLIN1 gene_id:5346|Hs108|chr15 (522 aa)
initn: 294 init1: 269 opt: 429 Z-score: 457.8 bits: 94.1 E(32554): 3.5e-19
Smith-Waterman score: 461; 26.7% identity (58.9% similar) in 453 aa overlap (9-432:17-436)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVCEMAEN
: .:. ::..::.::.: . ....: :::. .: . :::. :.
CCDS10 MAVNKGLTLLDGDLPEQENVLQRVLQLPVVSGTCECFQKTYTSTKEAHPLVASVCNAYEK
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pF1KE4 GVKTITSVAMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVANAKGAV
::.. .:.: : :....: :...:: ::.:::..::..: :. : .:...
CCDS10 GVQSASSLAAWSMEPVVRRLSTQFTAANELACRGLDHLEEKIPALQYPPEKIASE-----
70 80 90 100 110
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pF1KE4 TGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSRMMQLV
::...: . .:..:.. :... ::. ::. .. : . .:. . . . ..: .:.
CCDS10 --LKDTISTRLRSARNSISVPIASTSDKVLGAALAGCELAWGVARDTAEFAANTRAGRLA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE4 SSGVENALTKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLVQK-----PSYYVRLGSLSTKL
:.:.. :: . : .:: :: .:: . . : . .:: :: :.:.:.. :
CCDS10 SGGADLALGSIEKVVEYLLPPDKEE----SAPAPGHQQAQKSPKAKPSLLSRVGALTNTL
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 HSRAYQQALSRVKEAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKLYLSWV-
:: :...: : .... . . ..: : .:. .. : : .. .... . :.
CCDS10 -SRYTVQTMAR---ALEQGHTVAMWIPGVVPLSSLAQWGASVAMQAVSRRRSEVRVPWLH
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320
pF1KE4 ----------EWKRSIGYDDTDESHCAEHIESRTLAIA-----RNL----TQQLQTTCHT
: . . .::.: . : :.. .: :.: .. :: : .:
CCDS10 SLAAAQEEDHEDQTDTEGEDTEEEEELETEENKFSEVAALPGPRGLLGGVAHTLQKTLQT
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 LLSNIQGVPQNIQDQAKHMGVMAGDIYSVFRNAASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESL--
.: . .: . .: ::: . . : ..:.::. ......:
CCDS10 TISAVTWAPAAV------LG-MAGRVLHLTPAPA---------VSSTKGRAMSLSDALKG
350 360 370 380
390 400 410 420 430
pF1KE4 --DDVMDYLVNNTPLNWLVGPFYPQLTESQNAQDQGAEMDKSSQETQRSEHKTH
:.:.: .:. .:: : . . :. .: .. .. ::... : . :
CCDS10 VTDNVVDTVVHYVPLPRL-SLMEPE-SEFRDIDNPPAEVERREAERRASGAPSAGPEPAP
390 400 410 420 430 440
CCDS10 RLAQPRRSLRSAQSPGAPPGPGLEDEVATPAAPRPGFPAVPREKPKRRVSDSFFRPSVME
450 460 470 480 490 500
>>CCDS42473.1 PLIN5 gene_id:440503|Hs108|chr19 (463 aa)
initn: 816 init1: 328 opt: 343 Z-score: 368.2 bits: 77.3 E(32554): 3.4e-14
Smith-Waterman score: 747; 34.1% identity (64.7% similar) in 416 aa overlap (2-411:12-384)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVCEMA
.:: . : .:: ::: :::: .: . ..: ..::..: : :.:..:
CCDS42 MSEEEAAQIPRSSVWEQDQQNVVQRVVALPLVRATCTAVCDVYSAAKDRHPLLGSACRLA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ENGVKTITSVAMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVANAKG
:: : .:. :. : :....:.::.:. :. ::.:::..::.::.:.:::
CCDS42 ENCVCGLTTRALDHAQPLLEHLQPQLATMNSLACRGLDKLEEKLPFLQQPSE--------
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 AVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSRMMQ
:.::.::: :::..:::.: .. . ::: .::
CCDS42 ----------TVVTSAKDVVASSVTGVVDLARRGRRWSVELKRSV---------------
120 130 140
180 190 200 210 220
pF1KE4 LVSSGVENALTKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEG------FDLVQKPSYYVRLGSLS
: .:. .: ::: ::...::.::::: : ..:: : .. .:.:::::::
CCDS42 --SHAVDVVLEKSEELVDHFLPMTEEELAALAAEAEGPEVGSVEDQRRQQGYFVRLGSLS
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 TKLHSRAYQQALSRVKEAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKLYLS
.... ::..........:...:.:..::. :..::. . .: . :..
CCDS42 ARIRHLAYEHSVGKLRQSKHRAQDTLAQLQETLELIDHMQCGVTPTAPA---CPGKVHEL
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 WVEWKRSIGYDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQDQAK
: :: . ::. . : .::...:.:::.:: : ..: :...:.: . :...
CCDS42 WGEWGQR-----PPESRRRSQAELETLVLSRSLTQELQGTVEALESSVRGLPAGAQEKVA
270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 HMGVMAGDIYSVFRNAASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWLVGP
.. . . ..: .: :..: . :. ..:.. . . .:.... .:. .:: :::::
CCDS42 EVRRSVDALQTAFADARCFRDVPAAALAEGRGRVAHAHACVDELLELVVQAVPLPWLVGP
320 330 340 350 360 370
410 420 430
pF1KE4 FYPQLTESQNAQDQGAEMDKSSQETQRSEHKTH
: : :.:
CCDS42 FAPILVERPEPLPDLADLVDEVIGGPDPRWAHLDWPAQQRAWEAEHRDGSGNGDGDRMGV
380 390 400 410 420 430
437 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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