FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4420, 435 aa
1>>>pF1KE4420 435 - 435 aa - 435 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5174+/-0.000827; mu= 16.4869+/- 0.050
mean_var=74.3754+/-14.684, 0's: 0 Z-trim(108.4): 19 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.148717
statistics sampled from 10199 (10213) to 10199 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.314), width: 16
Scan time: 2.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2816.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 435) 3080 670.1 1.2e-192
CCDS2817.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 405) 2137 467.8 8.7e-132
CCDS46832.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 253) 1786 392.4 2.8e-109
CCDS46833.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 176) 1222 271.3 5.5e-73
CCDS5789.1 HYAL4 gene_id:23553|Hs108|chr7 ( 481) 1205 267.9 1.6e-71
CCDS2818.1 HYAL2 gene_id:8692|Hs108|chr3 ( 473) 1183 263.1 4.1e-70
CCDS5791.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 ( 509) 1130 251.8 1.2e-66
CCDS5790.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 ( 511) 1130 251.8 1.2e-66
CCDS2815.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 ( 417) 1056 235.9 5.9e-62
CCDS56257.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 ( 387) 805 182.0 9e-46
CCDS56260.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 ( 168) 375 89.5 2.7e-18
>>CCDS2816.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 (435 aa)
initn: 3080 init1: 3080 opt: 3080 Z-score: 3572.4 bits: 670.1 E(32554): 1.2e-192
Smith-Waterman score: 3080; 100.0% identity (100.0% similar) in 435 aa overlap (1-435:1-435)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAHLLPICALFLTLLDMAQGFRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 MAAHLLPICALFLTLLDMAQGFRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 NPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 NPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 DFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 AWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 AWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 ALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 DELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 DELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 ALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 ALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRC
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE4 YPGWQAPWCERKSMW
:::::::::::::::
CCDS28 YPGWQAPWCERKSMW
430
>>CCDS2817.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 (405 aa)
initn: 2894 init1: 2137 opt: 2137 Z-score: 2479.4 bits: 467.8 E(32554): 8.7e-132
Smith-Waterman score: 2812; 93.1% identity (93.1% similar) in 435 aa overlap (1-435:1-405)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAHLLPICALFLTLLDMAQGFRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 MAAHLLPICALFLTLLDMAQGFRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 NPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 NPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 DFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 AWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 AWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 ALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 DELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 ------------------------------ESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQ
310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 ALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 ALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRC
340 350 360 370 380 390
430
pF1KE4 YPGWQAPWCERKSMW
:::::::::::::::
CCDS28 YPGWQAPWCERKSMW
400
>>CCDS46832.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 (253 aa)
initn: 1786 init1: 1786 opt: 1786 Z-score: 2075.5 bits: 392.4 E(32554): 2.8e-109
Smith-Waterman score: 1786; 100.0% identity (100.0% similar) in 253 aa overlap (183-435:1-253)
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 ALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDF
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 LSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRV
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 AVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKES
100 110 120 130 140 150
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 CQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLT
160 170 180 190 200 210
400 410 420 430
pF1KE4 PGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW
220 230 240 250
>>CCDS46833.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 (176 aa)
initn: 1222 init1: 1222 opt: 1222 Z-score: 1423.8 bits: 271.3 E(32554): 5.5e-73
Smith-Waterman score: 1222; 100.0% identity (100.0% similar) in 176 aa overlap (260-435:1-176)
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 DQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQI
10 20 30
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 FYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFIL
40 50 60 70 80 90
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 NVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQ
100 110 120 130 140 150
410 420 430
pF1KE4 AQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW
::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW
160 170
>>CCDS5789.1 HYAL4 gene_id:23553|Hs108|chr7 (481 aa)
initn: 1129 init1: 815 opt: 1205 Z-score: 1397.7 bits: 267.9 E(32554): 1.6e-71
Smith-Waterman score: 1205; 41.4% identity (68.8% similar) in 430 aa overlap (4-429:18-446)
10 20 30 40
pF1KE4 MAAHLLPICALFLTLLDMA--QGFRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCL
:: .:. : ... . : :. .:: ..::: :. ::
CCDS57 MKVLSEGQLKLCVVQPVHLTSWLLIFFILKSISCLKPARLPIYQRKPFIAAWNAPTDQCL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 ERHGVDVDVSVFDVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIA
.... .....: :...: :: ..:::: ..:: ::.:: : :. :::::: :: .
CCDS57 IKYNLRLNLKMFPVIGSPLAKARGQNVTIFYVNRLGYYPWYTSQGVPINGGLPQNISLQV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 HLARTFQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPA
:: .. ::: ::: ::::::::::: :::.:: ::..::.:::.:: :.. . . :
CCDS57 HLEKADQDINYYIPAEDFSGLAVIDWEYWRPQWARNWNSKDVYRQKSRKLISDMGKNVSA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 PQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPSG
..: .:. :. .:.:.: :..:: ::.::::.: .:::.::. .:::.:.::
CCDS57 TDIEYLAKVTFEESAKAFMKETIKLGIKSRPKGLWGYYLYPDCHNYNVYAPNYSGSCPED
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 IRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVA-VAAGDPNLPV
.:..:.:::..: :::::: . : . . . . :: :..:.. ... : :::
CCDS57 EVLRNNELSWLWNSSAALYPSIGVWKSLGDSENILRFSKFRVHESMRISTMTSHDYALPV
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LPYVQIFY-DTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDT
. :... : : :: ..: ..::::: ::::.:.: . . : .: .: .:.....
CCDS57 FVYTRLGYRDEPLFFLSKQDLVSTIGESAALGAAGIVIWGDMNLTASKANCTKVKQFVSS
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 TLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRG
:: .: ::: .: .:: :: ..:::.:. . . : :::::. :. . : ....:
CCDS57 DLGSYIANVTRAAEVCSLHLCRNNGRCIRKMWNAPSYLHLNPASYHIEASEDG-EFTVKG
370 380 390 400 410
410 420 430
pF1KE4 ALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW
: : : :: :.:.:: :... :
CCDS57 KASDTDLAVMADTFSCHCYQGYEGADCREIKTADGCSGVSPSPGSLMTLCLLLLASYRSI
420 430 440 450 460 470
>>CCDS2818.1 HYAL2 gene_id:8692|Hs108|chr3 (473 aa)
initn: 1185 init1: 639 opt: 1183 Z-score: 1372.3 bits: 263.1 E(32554): 4.1e-70
Smith-Waterman score: 1183; 42.9% identity (70.0% similar) in 413 aa overlap (25-430:29-439)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAAHLLPICALFLTLLDMAQGFRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVF
:.. .:::...:.. :: : : : .:...:
CCDS28 MRAGPGPTVTLALVLAVSWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPRLKVPLDLNAF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 DVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAA
:: :.:.. : . ..:::: ..:: :: . .:. : ::.:::.:: :: . .
CCDS28 DVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDSAGRSVHGGVPQNVSLWAHRKMLQKRVEHY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQ
: . . .:::::::: ::: :. ::. ::.::. :: :: ..::::: .. :: .:.
CCDS28 IRTQESAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASRHPDWPPDRIVKQAQYEFE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLS--PNYTGQCPSGIRAQNDQLGW
::. .: ::. .:.::: ::::: ::::::.:... .:::.::. :.::::.:
CCDS28 FAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHDYVQNWESYTGRCPDVEVARNDQLAW
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVA-VAAGDPNLPVLPYVQIFYDT
::..: ::.::.:. .: .. ... .:. :: ::.::: . .. ::: ... :.
CCDS28 LWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALPVYVFTRPTYSR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 TNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTS
: .: ..::::: :::::.:: . : . :.:: .:.:. : :...::.
CCDS28 RLTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLTRLLVPYVVNVSW
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KE4 GALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPL--SLR--GALSLEDQ
.. ::.: : :::::::: .:.: .:. .. :..:.:: .: .:: : :: :
CCDS28 ATQYCSRAQCHGHGRCVRR--NPSASTFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLRPVGELSWADI
370 380 390 400 410
410 420 430
pF1KE4 AQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW
.. ..:.:.:: ::.. :.
CCDS28 DHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWAGSHLTSLLALAALAFTWTL
420 430 440 450 460 470
>>CCDS5791.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 (509 aa)
initn: 894 init1: 601 opt: 1130 Z-score: 1310.3 bits: 251.8 E(32554): 1.2e-66
Smith-Waterman score: 1130; 41.6% identity (69.4% similar) in 421 aa overlap (5-421:29-438)
10 20 30
pF1KE4 MAAHLLPICALFLTLLDMAQGFRGP-LLPNRPFTTV
:.: : ::: .::.: ..:: :: .
CCDS57 MGVLKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCC---LTL-----NFRAPPVIPNVPFLWA
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 WNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYY-TPTGEPVFG
::: ...:: . .:.:.:. ...: . : .:::: ..:: ::: . :: : :
CCDS57 WNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNG
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 GLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRAL
:.::. :: :: .. .:: .:. .. :.:::::: ::: :: :: ::.:..:: :
CCDS57 GIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNL-GMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIEL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 VQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLS
:: :. . .. :...:. :.. ... :..::. ::: :::.: ::::::. . .
CCDS57 VQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 PNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVA-
:.:.:.: . .::.:.:::..: :::::::. . .. . .::..:: ::.::.
CCDS57 PGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYL-NTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 VAAGDPNLPVLPYVQI-FYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKES
. . :::. :..: : : . .:: ::: ...::..: ::.:.:.: . :. .:
CCDS57 IPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 CQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLT
: . .::.: :.:.:.::: .: .:::.::. .: :.:.. . . : ::: .:.:::
CCDS57 CLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLE
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
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:: ...:: .::: :.. .: : ::
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CCDS57 MGVLKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCC---LTL-----NFRAPPVIPNVPFLWA
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40 50 60 70 80 90
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::: ...:: . .:.:.:. ...: . : .:::: ..:: ::: . :: : :
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160 170 180 190 200 210
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220 230 240 250 260 270
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280 290 300 310 320 330
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:: ...:: .::: :.. .: : ::
CCDS57 KGG-KFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFL
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420 430
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CCDS28 HCYWGWAGPTCQEPRPGPKEAV
400 410
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CCDS56 NRGQHFHGQNMTIFYKNQLGLYPYFGPRGTAHNGGIPQALPLDRHLALAAYQIHHSL-RP
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pF1KE4 DFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDW-PAPQVEAVAQDQFQGAA
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CCDS56 GFAGPAVLDWEEWCPLWAGNWGRRRAYQAASWAWAQQVFPDLDPQEQLYK-AYTGFEQAA
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CCDS56 RALMEDTLRVAQALRPHGLWGFYHYPACGNGWHSMASNYTGRCHAATLARNTQLHWLWAA
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CCDS56 ------------------------------SQEECWHLHDYLVDTLGPYVINVTRAAMAC
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]