Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4419
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4419, 432 aa
1>>>pF1KE4419 432 - 432 aa - 432 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2577+/-0.00102; mu= 17.0103+/- 0.061
mean_var=61.1233+/-12.413, 0's: 0 Z-trim(102.0): 36 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.164048
statistics sampled from 6719 (6737) to 6719 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 2.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13233.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20 ( 432) 2890 693.0 1.5e-199
CCDS54457.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20 ( 404) 2706 649.5 1.8e-186
CCDS55620.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1 ( 483) 1489 361.5 1e-99
CCDS818.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1 ( 530) 1489 361.5 1.1e-99
CCDS47707.2 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 ( 508) 1479 359.1 5.6e-99
CCDS47708.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 ( 508) 1479 359.1 5.6e-99
CCDS47706.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 ( 610) 1479 359.1 6.6e-99
CCDS5812.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 ( 611) 1479 359.1 6.6e-99
>>CCDS13233.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20 (432 aa)
initn: 2890 init1: 2890 opt: 2890 Z-score: 3696.2 bits: 693.0 E(32554): 1.5e-199
Smith-Waterman score: 2890; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (1-432:1-432)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMRERYSASKPLKGARIAGCLHMTVET
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CCDS13 MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMRERYSASKPLKGARIAGCLHMTVET
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTTGCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTTGCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRIILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRIILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SFTNQVMAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SFTNQVMAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE4 CDGPFKPDHYRY
::::::::::::
CCDS13 CDGPFKPDHYRY
430
>>CCDS54457.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20 (404 aa)
initn: 2706 init1: 2706 opt: 2706 Z-score: 3461.3 bits: 649.5 E(32554): 1.8e-186
Smith-Waterman score: 2706; 100.0% identity (100.0% similar) in 404 aa overlap (29-432:1-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMRERYSASKPLKGARIAGCLHMTVET
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MPGLMRMRERYSASKPLKGARIAGCLHMTVET
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVI
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTTGCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTTGCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRIILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRIILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSN
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SFTNQVMAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SFTNQVMAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMS
340 350 360 370 380 390
430
pF1KE4 CDGPFKPDHYRY
::::::::::::
CCDS54 CDGPFKPDHYRY
400
>>CCDS55620.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1 (483 aa)
initn: 1409 init1: 1409 opt: 1489 Z-score: 1903.5 bits: 361.5 E(32554): 1e-99
Smith-Waterman score: 1489; 50.8% identity (79.9% similar) in 427 aa overlap (7-432:58-483)
10 20 30
pF1KE4 MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMR
. : .: : .::. ..:::..: .:. .:
CCDS55 YSSAASYTDSSDDEVSPREKQQTNSKGSSNFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQDMSALISLR
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 ERYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAG
.: .. ::: ::.:.:: :.:..:::::::: .:::. .::.:::.:::...:::.:.::
CCDS55 KRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLIETLCALGAQCRWSACNIYSTQNEVAAALAEAG
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 IPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEE
. :.:::::..... :::.. . . :::::::::::. .. :::... :::: ::
CCDS55 VAVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNMDGWQANMILDDGGDLTHWVYKKYPNVFKKIRGIVEE
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 TTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVA
..:::: ::.. : : :::.::::::::.:::::: ::::..::.::.::::..:: .
CCDS55 SVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDVMFGGKQV
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 VVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTT
:: :::.::::: ::...:: : ::::::: :::: :.:..:. ..:. .. .. .: :
CCDS55 VVCGYGEVGKGCCAALKALGAIVYITEIDPICALQACMDGFRVVKLNEVIRQVDVVITCT
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 GCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRI
: ... .:...::.. ::::.:: ..:::: : . .. :::. .:.:.
CCDS55 GNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVTSLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRV
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 ILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVMAQIELWTHPD-KYPVGVHFLPKKLDEAVA
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CCDS55 VLLAEGRLLNLSCSTV-PTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVA
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430
pF1KE4 EAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMSCDGPFKPDHYRY
:: .....::.::. ::.:::.. .:::::..:::
CCDS55 SLHLPSFDAHLTELTDDQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
450 460 470 480
>>CCDS818.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1 (530 aa)
initn: 1409 init1: 1409 opt: 1489 Z-score: 1902.9 bits: 361.5 E(32554): 1.1e-99
Smith-Waterman score: 1489; 50.8% identity (79.9% similar) in 427 aa overlap (7-432:105-530)
10 20 30
pF1KE4 MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMR
. : .: : .::. ..:::..: .:. .:
CCDS81 YSSAASYTDSSDDEVSPREKQQTNSKGSSNFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQDMSALISLR
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 ERYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAG
.: .. ::: ::.:.:: :.:..:::::::: .:::. .::.:::.:::...:::.:.::
CCDS81 KRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLIETLCALGAQCRWSACNIYSTQNEVAAALAEAG
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 IPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEE
. :.:::::..... :::.. . . :::::::::::. .. :::... :::: ::
CCDS81 VAVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNMDGWQANMILDDGGDLTHWVYKKYPNVFKKIRGIVEE
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 TTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVA
..:::: ::.. : : :::.::::::::.:::::: ::::..::.::.::::..:: .
CCDS81 SVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDVMFGGKQV
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 VVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTT
:: :::.::::: ::...:: : ::::::: :::: :.:..:. ..:. .. .. .: :
CCDS81 VVCGYGEVGKGCCAALKALGAIVYITEIDPICALQACMDGFRVVKLNEVIRQVDVVITCT
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 GCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRI
: ... .:...::.. ::::.:: ..:::: : . .. :::. .:.:.
CCDS81 GNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVTSLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRV
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 ILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVMAQIELWTHPD-KYPVGVHFLPKKLDEAVA
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CCDS81 VLLAEGRLLNLSCSTV-PTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVA
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430
pF1KE4 EAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMSCDGPFKPDHYRY
:: .....::.::. ::.:::.. .:::::..:::
CCDS81 SLHLPSFDAHLTELTDDQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
500 510 520 530
>>CCDS47707.2 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 (508 aa)
initn: 1399 init1: 1399 opt: 1479 Z-score: 1890.4 bits: 359.1 E(32554): 5.6e-99
Smith-Waterman score: 1479; 50.4% identity (80.1% similar) in 427 aa overlap (7-432:83-508)
10 20 30
pF1KE4 MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMR
. : .: : .::. ..:::.:::.:: .:
CCDS47 YSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNSKGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALMALR
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 ERYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAG
.: .. ::: ::.:.:: :.:..::::.::: .:::. .:..:::.:: ...:::.:..:
CCDS47 KRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAALAESG
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 IPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEE
.::.:::::..... :::.. . . :::::::::::. :. :::... :.:: ::
CCDS47 FPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGIVEE
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 TTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVA
..:::: ::.. : : :::.::::::::.:::::: ::::..::.::.::.:..:: .
CCDS47 SVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFGGKQV
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 VVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTT
:: :::.::::: ::...:. : .:::::: :::: :.:.... ..:. .. .: .: :
CCDS47 VVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYVTEIDPICALQACMDGFRLVKLNEVIRQVDIVITCT
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 GCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRI
: ... .:...::.. ::::.:: ..:::: : . .. :::. .:.::
CCDS47 GNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRI
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 ILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVMAQIELWTHPD-KYPVGVHFLPKKLDEAVA
.:::::::.::.:. :.::.: . :.:..: :::.. :. .: :..::::.:: ::
CCDS47 VLLAEGRLLNLSCSTV-PTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVA
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430
pF1KE4 EAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMSCDGPFKPDHYRY
:: ....::.::..::.:::.. .:::::..:::
CCDS47 SLHLPTFDAHLTELTDEQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
480 490 500
>>CCDS47708.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 (508 aa)
initn: 1399 init1: 1399 opt: 1479 Z-score: 1890.4 bits: 359.1 E(32554): 5.6e-99
Smith-Waterman score: 1479; 50.4% identity (80.1% similar) in 427 aa overlap (7-432:83-508)
10 20 30
pF1KE4 MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMR
. : .: : .::. ..:::.:::.:: .:
CCDS47 YSSAASYTDSSDDETSPRDKQQKNSKGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALMALR
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 ERYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAG
.: .. ::: ::.:.:: :.:..::::.::: .:::. .:..:::.:: ...:::.:..:
CCDS47 KRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCRWAACNIYSTLNEVAAALAESG
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 IPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEE
.::.:::::..... :::.. . . :::::::::::. :. :::... :.:: ::
CCDS47 FPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGIVEE
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 TTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVA
..:::: ::.. : : :::.::::::::.:::::: ::::..::.::.::.:..:: .
CCDS47 SVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFGGKQV
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 VVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTT
:: :::.::::: ::...:. : .:::::: :::: :.:.... ..:. .. .: .: :
CCDS47 VVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYVTEIDPICALQACMDGFRLVKLNEVIRQVDIVITCT
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 GCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRI
: ... .:...::.. ::::.:: ..:::: : . .. :::. .:.::
CCDS47 GNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRI
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 ILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVMAQIELWTHPD-KYPVGVHFLPKKLDEAVA
.:::::::.::.:. :.::.: . :.:..: :::.. :. .: :..::::.:: ::
CCDS47 VLLAEGRLLNLSCSTV-PTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVA
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430
pF1KE4 EAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMSCDGPFKPDHYRY
:: ....::.::..::.:::.. .:::::..:::
CCDS47 SLHLPTFDAHLTELTDEQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
480 490 500
>>CCDS47706.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7 (610 aa)
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432 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 01:14:19 2016 done: Sun Nov 6 01:14:19 2016
Total Scan time: 2.210 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]